MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC2

Total Repeats: 436

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018698	GGT	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407719129
2	NC_018698	ACT	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719129
3	NC_018698	TTGATC	2	12	1483	1494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407719129
4	NC_018698	A	6	6	1567	1572	100 %	0 %	0 %	0 %	407719129
5	NC_018698	TGA	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719129
6	NC_018698	ATT	2	6	1623	1628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719129
7	NC_018698	ATTT	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	407719129
8	NC_018698	GAA	2	6	1665	1670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719129
9	NC_018698	ATTTTT	2	12	1717	1728	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407719129
10	NC_018698	AAAG	2	8	1749	1756	75 %	0 %	25 %	0 %	407719129
11	NC_018698	ATT	4	12	1764	1775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719129
12	NC_018698	CCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719129
13	NC_018698	TAAA	2	8	1897	1904	75 %	25 %	0 %	0 %	407719129
14	NC_018698	ATCTAA	2	12	1921	1932	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407719129
15	NC_018698	A	6	6	1961	1966	100 %	0 %	0 %	0 %	407719129
16	NC_018698	TGA	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719129
17	NC_018698	AT	3	6	1985	1990	50 %	50 %	0 %	0 %	407719129
18	NC_018698	CAA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719129
19	NC_018698	TAG	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719130
20	NC_018698	AGAAA	2	10	2277	2286	80 %	0 %	20 %	0 %	407719130
21	NC_018698	A	6	6	2341	2346	100 %	0 %	0 %	0 %	407719130
22	NC_018698	TAA	2	6	2349	2354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719130
23	NC_018698	TCAA	2	8	2366	2373	50 %	25 %	0 %	25 %	407719130
24	NC_018698	AACAA	2	10	2434	2443	80 %	0 %	0 %	20 %	407719130
25	NC_018698	ATT	2	6	2466	2471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719130
26	NC_018698	A	6	6	2510	2515	100 %	0 %	0 %	0 %	407719130
27	NC_018698	CTT	2	6	3036	3041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719131
28	NC_018698	CTT	2	6	3051	3056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719131
29	NC_018698	ATAG	2	8	3100	3107	50 %	25 %	25 %	0 %	407719131
30	NC_018698	TAT	2	6	3156	3161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719131
31	NC_018698	AAT	3	9	3166	3174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719131
32	NC_018698	TC	3	6	3213	3218	0 %	50 %	0 %	50 %	407719131
33	NC_018698	TAAA	3	12	3256	3267	75 %	25 %	0 %	0 %	407719131
34	NC_018698	ATG	2	6	3280	3285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719131
35	NC_018698	CAC	2	6	3303	3308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719131
36	NC_018698	T	6	6	3380	3385	0 %	100 %	0 %	0 %	407719131
37	NC_018698	GCC	2	6	3389	3394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719131
38	NC_018698	ATT	2	6	3458	3463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719131
39	NC_018698	A	7	7	3689	3695	100 %	0 %	0 %	0 %	407719132
40	NC_018698	ACG	2	6	3729	3734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719132
41	NC_018698	TAT	2	6	3736	3741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719132
42	NC_018698	GTT	2	6	3755	3760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719132
43	NC_018698	CTGG	2	8	3803	3810	0 %	25 %	50 %	25 %	407719132
44	NC_018698	CAA	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719132
45	NC_018698	GTAT	2	8	3856	3863	25 %	50 %	25 %	0 %	407719132
46	NC_018698	AAG	2	6	3910	3915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719132
47	NC_018698	TAA	2	6	3925	3930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719132
48	NC_018698	AAG	2	6	3939	3944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719132
49	NC_018698	ACA	2	6	3958	3963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719132
50	NC_018698	CAA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719132
51	NC_018698	ACGC	2	8	4050	4057	25 %	0 %	25 %	50 %	407719132
52	NC_018698	GAT	2	6	4073	4078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719132
53	NC_018698	GCT	2	6	4097	4102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719132
54	NC_018698	ATG	2	6	4112	4117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719132
55	NC_018698	GTC	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719132
56	NC_018698	A	8	8	4258	4265	100 %	0 %	0 %	0 %	407719132
57	NC_018698	TTA	2	6	4328	4333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719132
58	NC_018698	A	6	6	4356	4361	100 %	0 %	0 %	0 %	407719133
59	NC_018698	ATT	2	6	4386	4391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719133
60	NC_018698	ATT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719133
61	NC_018698	AAT	2	6	4470	4475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719133
62	NC_018698	GTC	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719133
63	NC_018698	GTTT	2	8	4541	4548	0 %	75 %	25 %	0 %	407719133
64	NC_018698	ATG	2	6	4630	4635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719133
65	NC_018698	TA	3	6	4643	4648	50 %	50 %	0 %	0 %	407719133
66	NC_018698	AAC	2	6	4654	4659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719133
67	NC_018698	TGA	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719133
68	NC_018698	ATG	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719133
69	NC_018698	ATC	2	6	4790	4795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719133
70	NC_018698	TGG	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407719133
71	NC_018698	TAC	2	6	4846	4851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719133
72	NC_018698	T	7	7	4900	4906	0 %	100 %	0 %	0 %	407719133
73	NC_018698	AAT	2	6	4943	4948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719133
74	NC_018698	CTA	2	6	5146	5151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719134
75	NC_018698	TTG	2	6	5152	5157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719134
76	NC_018698	CAA	2	6	5170	5175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719134
77	NC_018698	ATC	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719134
78	NC_018698	AAT	2	6	5201	5206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719134
79	NC_018698	TGA	2	6	5210	5215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719134
80	NC_018698	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719134
81	NC_018698	TGCC	2	8	5263	5270	0 %	25 %	25 %	50 %	407719134
82	NC_018698	CAA	2	6	5329	5334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719134
83	NC_018698	TTATC	2	10	5377	5386	20 %	60 %	0 %	20 %	407719134
84	NC_018698	AGAA	2	8	5443	5450	75 %	0 %	25 %	0 %	407719134
85	NC_018698	AGT	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719134
86	NC_018698	CTA	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719134
87	NC_018698	CAAA	2	8	5596	5603	75 %	0 %	0 %	25 %	407719134
88	NC_018698	GCC	2	6	5625	5630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719134
89	NC_018698	T	8	8	5663	5670	0 %	100 %	0 %	0 %	407719134
90	NC_018698	AACAC	2	10	5715	5724	60 %	0 %	0 %	40 %	407719134
91	NC_018698	TATAT	2	10	5744	5753	40 %	60 %	0 %	0 %	407719134
92	NC_018698	GTA	3	9	5791	5799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719134
93	NC_018698	A	7	7	5886	5892	100 %	0 %	0 %	0 %	407719134
94	NC_018698	CAA	2	6	5983	5988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719134
95	NC_018698	AAACC	2	10	5997	6006	60 %	0 %	0 %	40 %	407719134
96	NC_018698	ATT	2	6	6069	6074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719134
97	NC_018698	ATTT	2	8	6631	6638	25 %	75 %	0 %	0 %	407719135
98	NC_018698	GTT	2	6	6640	6645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719135
99	NC_018698	ATAA	2	8	6697	6704	75 %	25 %	0 %	0 %	407719135
100	NC_018698	TCT	2	6	6757	6762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719135
101	NC_018698	TCT	2	6	6815	6820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719135
102	NC_018698	ACC	2	6	6826	6831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719135
103	NC_018698	GGA	2	6	6862	6867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719135
104	NC_018698	TTTTC	2	10	6886	6895	0 %	80 %	0 %	20 %	407719135
105	NC_018698	TAA	2	6	6907	6912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719135
106	NC_018698	AT	3	6	6919	6924	50 %	50 %	0 %	0 %	407719135
107	NC_018698	ACT	2	6	6947	6952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719135
108	NC_018698	CTA	2	6	6960	6965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719135
109	NC_018698	AAT	2	6	7024	7029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719135
110	NC_018698	AT	3	6	7131	7136	50 %	50 %	0 %	0 %	407719135
111	NC_018698	GAT	2	6	7252	7257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719135
112	NC_018698	CTT	2	6	7278	7283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719135
113	NC_018698	ATT	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719135
114	NC_018698	TAATA	2	10	7456	7465	60 %	40 %	0 %	0 %	407719135
115	NC_018698	CAA	2	6	7474	7479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719135
116	NC_018698	CAAA	2	8	7542	7549	75 %	0 %	0 %	25 %	407719135
117	NC_018698	TCC	2	6	7628	7633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719135
118	NC_018698	CAC	2	6	7692	7697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719135
119	NC_018698	GATT	2	8	7715	7722	25 %	50 %	25 %	0 %	407719135
120	NC_018698	ATG	2	6	7740	7745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719135
121	NC_018698	TTGAA	2	10	7774	7783	40 %	40 %	20 %	0 %	407719135
122	NC_018698	ACC	2	6	7857	7862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719135
123	NC_018698	AAT	2	6	7883	7888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719135
124	NC_018698	AT	3	6	7920	7925	50 %	50 %	0 %	0 %	407719135
125	NC_018698	A	6	6	7958	7963	100 %	0 %	0 %	0 %	407719135
126	NC_018698	AAATT	2	10	7965	7974	60 %	40 %	0 %	0 %	407719135
127	NC_018698	AAC	2	6	8080	8085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719135
128	NC_018698	A	6	6	8096	8101	100 %	0 %	0 %	0 %	407719135
129	NC_018698	ATA	2	6	8118	8123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719135
130	NC_018698	T	7	7	8157	8163	0 %	100 %	0 %	0 %	407719135
131	NC_018698	GTGTAT	2	12	8350	8361	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407719136
132	NC_018698	AATA	2	8	8368	8375	75 %	25 %	0 %	0 %	407719136
133	NC_018698	A	7	7	8375	8381	100 %	0 %	0 %	0 %	407719136
134	NC_018698	TCA	2	6	8451	8456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719136
135	NC_018698	GTC	2	6	8468	8473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719136
136	NC_018698	GCC	2	6	8476	8481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719136
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381	NC_018698	AAC	2	6	25213	25218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719162
382	NC_018698	GTC	2	6	25234	25239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719162
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392	NC_018698	TTG	2	6	25827	25832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719163
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.