MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC1

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018674	ACA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719063
2	NC_018674	ATT	2	6	525	530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719063
3	NC_018674	TAA	2	6	602	607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719063
4	NC_018674	TAC	2	6	689	694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719063
5	NC_018674	CCA	2	6	832	837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719063
6	NC_018674	AGT	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719063
7	NC_018674	GAA	2	6	1075	1080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719063
8	NC_018674	TAC	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719064
9	NC_018674	GAT	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719064
10	NC_018674	CAG	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719064
11	NC_018674	TTA	2	6	1485	1490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719064
12	NC_018674	GAA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719064
13	NC_018674	AAT	2	6	1567	1572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719064
14	NC_018674	CAT	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719065
15	NC_018674	TAG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719065
16	NC_018674	CTA	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719065
17	NC_018674	TCA	2	6	1971	1976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719065
18	NC_018674	CAC	2	6	1977	1982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719065
19	NC_018674	GAC	2	6	2208	2213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719065
20	NC_018674	CCA	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719065
21	NC_018674	AAT	2	6	2317	2322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719065
22	NC_018674	ACC	2	6	2336	2341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719065
23	NC_018674	CGA	2	6	2448	2453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719065
24	NC_018674	AAC	2	6	3030	3035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719066
25	NC_018674	AGT	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719066
26	NC_018674	ATC	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719066
27	NC_018674	TCG	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719066
28	NC_018674	ACT	2	6	3114	3119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719066
29	NC_018674	TTG	2	6	3131	3136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719066
30	NC_018674	TAA	2	6	3150	3155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719066
31	NC_018674	CGC	2	6	3212	3217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719066
32	NC_018674	ATG	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719066
33	NC_018674	TCG	2	6	3727	3732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719066
34	NC_018674	CCA	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719066
35	NC_018674	AAG	2	6	3798	3803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719066
36	NC_018674	ACT	2	6	3891	3896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719066
37	NC_018674	GCT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719066
38	NC_018674	GCC	2	6	4154	4159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719066
39	NC_018674	CCA	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719066
40	NC_018674	CAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719066
41	NC_018674	CTT	2	6	4359	4364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719067
42	NC_018674	CAA	2	6	4410	4415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719067
43	NC_018674	TTC	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719067
44	NC_018674	CAT	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719067
45	NC_018674	AAG	2	6	4607	4612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719067
46	NC_018674	AGC	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719067
47	NC_018674	TTG	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719067
48	NC_018674	TGC	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719067
49	NC_018674	CAC	2	6	4896	4901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719067
50	NC_018674	TCA	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719067
51	NC_018674	CTT	2	6	4990	4995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719067
52	NC_018674	CGT	2	6	5188	5193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719067
53	NC_018674	CCT	2	6	5331	5336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719068
54	NC_018674	CTT	2	6	5389	5394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719068
55	NC_018674	TCA	2	6	5502	5507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719068
56	NC_018674	GAA	2	6	5530	5535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719068
57	NC_018674	TCT	2	6	5685	5690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719068
58	NC_018674	CAT	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719068
59	NC_018674	ATG	2	6	5788	5793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719068
60	NC_018674	TTG	2	6	5797	5802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719068
61	NC_018674	ATT	2	6	5995	6000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719068
62	NC_018674	GCT	2	6	6084	6089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719068
63	NC_018674	CCA	2	6	6182	6187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719068
64	NC_018674	ACC	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719068
65	NC_018674	CAG	2	6	6268	6273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719068
66	NC_018674	TGA	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719068
67	NC_018674	AAT	2	6	6400	6405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719068
68	NC_018674	AAC	2	6	6470	6475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719068
69	NC_018674	CGG	2	6	6504	6509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719068
70	NC_018674	CTG	2	6	6597	6602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719068
71	NC_018674	TAA	2	6	6685	6690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719068
72	NC_018674	GTC	2	6	6708	6713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719068
73	NC_018674	ATG	2	6	6762	6767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719068
74	NC_018674	GAA	2	6	7443	7448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719069
75	NC_018674	ATT	2	6	7732	7737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719069
76	NC_018674	AAG	2	6	7790	7795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719069
77	NC_018674	AAT	2	6	8422	8427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719070
78	NC_018674	ATG	2	6	8535	8540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719070
79	NC_018674	TCT	2	6	8543	8548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719070
80	NC_018674	CAT	2	6	8572	8577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719070
81	NC_018674	TGT	2	6	8653	8658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719070
82	NC_018674	CAA	2	6	9491	9496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719071
83	NC_018674	AGG	2	6	9648	9653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719071
84	NC_018674	CAG	2	6	9737	9742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719071
85	NC_018674	TAA	2	6	9783	9788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719071
86	NC_018674	CAC	2	6	9797	9802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719071
87	NC_018674	TAA	2	6	9863	9868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719071
88	NC_018674	ATC	2	6	9879	9884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719071
89	NC_018674	AAT	2	6	10077	10082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719071
90	NC_018674	ATA	2	6	10093	10098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719071
91	NC_018674	ATT	2	6	10306	10311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719072
92	NC_018674	TTG	2	6	10318	10323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719072
93	NC_018674	TAA	2	6	10349	10354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719072
94	NC_018674	ATT	2	6	12674	12679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719073
95	NC_018674	CAT	2	6	12698	12703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719073
96	NC_018674	CAA	2	6	12839	12844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719073
97	NC_018674	CAA	2	6	13044	13049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719073
98	NC_018674	ATA	2	6	13096	13101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719073
99	NC_018674	CAC	2	6	13175	13180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719073
100	NC_018674	TTA	2	6	13207	13212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719073
101	NC_018674	AGA	2	6	13290	13295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719073
102	NC_018674	TTA	2	6	13327	13332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719073
103	NC_018674	AAG	2	6	13396	13401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719073
104	NC_018674	TTG	2	6	13443	13448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719073
105	NC_018674	CAG	2	6	13604	13609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719074
106	NC_018674	TCA	2	6	13645	13650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719074
107	NC_018674	CTG	2	6	13679	13684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719074
108	NC_018674	ATT	2	6	13756	13761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719075
109	NC_018674	ATT	2	6	13835	13840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719075
110	NC_018674	TAA	2	6	14012	14017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719075
111	NC_018674	TAA	2	6	14077	14082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719075
112	NC_018674	GCT	2	6	14124	14129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719075
113	NC_018674	AGG	2	6	14135	14140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719075
114	NC_018674	ATC	2	6	14168	14173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719075
115	NC_018674	AAG	2	6	14204	14209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719075
116	NC_018674	TCA	2	6	14287	14292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719075
117	NC_018674	ATA	2	6	14312	14317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719075
118	NC_018674	TGA	2	6	14325	14330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719075
119	NC_018674	TGA	2	6	14550	14555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719075
120	NC_018674	CAA	2	6	14620	14625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719075
121	NC_018674	GCA	2	6	14691	14696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719075
122	NC_018674	ATA	2	6	14697	14702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719075
123	NC_018674	AGT	2	6	14768	14773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719075
124	NC_018674	ATA	2	6	15076	15081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719075
125	NC_018674	ATA	2	6	15092	15097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719075
126	NC_018674	TTG	2	6	15107	15112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719075
127	NC_018674	TCA	2	6	15114	15119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719075
128	NC_018674	ATC	2	6	15132	15137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719075
129	NC_018674	TTA	2	6	15138	15143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719075
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.