MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC1

Total Repeats: 267

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018674	A	8	8	429	436	100 %	0 %	0 %	0 %	407719063
2	NC_018674	ACA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719063
3	NC_018674	ATT	2	6	525	530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719063
4	NC_018674	AAAC	2	8	590	597	75 %	0 %	0 %	25 %	407719063
5	NC_018674	TAA	2	6	602	607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719063
6	NC_018674	TAC	2	6	689	694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719063
7	NC_018674	A	8	8	734	741	100 %	0 %	0 %	0 %	407719063
8	NC_018674	TA	3	6	814	819	50 %	50 %	0 %	0 %	407719063
9	NC_018674	CCA	2	6	832	837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719063
10	NC_018674	AGT	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719063
11	NC_018674	AC	3	6	944	949	50 %	0 %	0 %	50 %	407719063
12	NC_018674	GAA	2	6	1075	1080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719063
13	NC_018674	A	6	6	1183	1188	100 %	0 %	0 %	0 %	407719063
14	NC_018674	TAAA	2	8	1235	1242	75 %	25 %	0 %	0 %	407719063
15	NC_018674	TAC	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719064
16	NC_018674	GAT	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719064
17	NC_018674	AG	3	6	1286	1291	50 %	0 %	50 %	0 %	407719064
18	NC_018674	CT	3	6	1331	1336	0 %	50 %	0 %	50 %	407719064
19	NC_018674	CAG	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719064
20	NC_018674	GAAA	2	8	1379	1386	75 %	0 %	25 %	0 %	407719064
21	NC_018674	AACA	2	8	1387	1394	75 %	0 %	0 %	25 %	407719064
22	NC_018674	TTAC	2	8	1443	1450	25 %	50 %	0 %	25 %	407719064
23	NC_018674	TTA	2	6	1485	1490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719064
24	NC_018674	GAA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719064
25	NC_018674	A	7	7	1545	1551	100 %	0 %	0 %	0 %	407719064
26	NC_018674	AAT	2	6	1567	1572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719064
27	NC_018674	CAT	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719065
28	NC_018674	TAG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719065
29	NC_018674	CTA	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719065
30	NC_018674	TCA	2	6	1971	1976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719065
31	NC_018674	CAC	2	6	1977	1982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719065
32	NC_018674	GAC	2	6	2208	2213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719065
33	NC_018674	CCA	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719065
34	NC_018674	AAT	2	6	2317	2322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719065
35	NC_018674	TTGA	2	8	2323	2330	25 %	50 %	25 %	0 %	407719065
36	NC_018674	ACC	2	6	2336	2341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719065
37	NC_018674	CGA	2	6	2448	2453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719065
38	NC_018674	AAC	2	6	3030	3035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719066
39	NC_018674	AGT	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719066
40	NC_018674	ATC	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719066
41	NC_018674	TCG	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719066
42	NC_018674	ACT	2	6	3114	3119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719066
43	NC_018674	TTG	2	6	3131	3136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719066
44	NC_018674	TAA	2	6	3150	3155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719066
45	NC_018674	CGC	2	6	3212	3217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719066
46	NC_018674	GCTGA	2	10	3504	3513	20 %	20 %	40 %	20 %	407719066
47	NC_018674	ATG	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719066
48	NC_018674	TCG	2	6	3727	3732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719066
49	NC_018674	CCA	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719066
50	NC_018674	AAG	2	6	3798	3803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719066
51	NC_018674	ACT	2	6	3891	3896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719066
52	NC_018674	CAAT	2	8	4038	4045	50 %	25 %	0 %	25 %	407719066
53	NC_018674	GCCCT	2	10	4064	4073	0 %	20 %	20 %	60 %	407719066
54	NC_018674	GCT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719066
55	NC_018674	GCC	2	6	4154	4159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719066
56	NC_018674	CCA	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719066
57	NC_018674	CAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719066
58	NC_018674	CTT	2	6	4359	4364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719067
59	NC_018674	CAA	2	6	4410	4415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719067
60	NC_018674	TTC	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719067
61	NC_018674	CAT	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719067
62	NC_018674	GCTCG	2	10	4592	4601	0 %	20 %	40 %	40 %	407719067
63	NC_018674	AAG	2	6	4607	4612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719067
64	NC_018674	AGC	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719067
65	NC_018674	TCAT	2	8	4721	4728	25 %	50 %	0 %	25 %	407719067
66	NC_018674	TTG	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719067
67	NC_018674	CATC	2	8	4833	4840	25 %	25 %	0 %	50 %	407719067
68	NC_018674	TGC	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719067
69	NC_018674	CAC	2	6	4896	4901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719067
70	NC_018674	TCA	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719067
71	NC_018674	CTT	2	6	4990	4995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719067
72	NC_018674	CGT	2	6	5188	5193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719067
73	NC_018674	CCT	2	6	5331	5336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719068
74	NC_018674	CTT	2	6	5389	5394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719068
75	NC_018674	TGTT	2	8	5480	5487	0 %	75 %	25 %	0 %	407719068
76	NC_018674	TCA	2	6	5502	5507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719068
77	NC_018674	GAA	2	6	5530	5535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719068
78	NC_018674	TAGCG	2	10	5636	5645	20 %	20 %	40 %	20 %	407719068
79	NC_018674	TCT	2	6	5685	5690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719068
80	NC_018674	CAT	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719068
81	NC_018674	ATG	2	6	5788	5793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719068
82	NC_018674	TTG	2	6	5797	5802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719068
83	NC_018674	CGTA	2	8	5826	5833	25 %	25 %	25 %	25 %	407719068
84	NC_018674	AAGT	2	8	5855	5862	50 %	25 %	25 %	0 %	407719068
85	NC_018674	ATT	2	6	5995	6000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719068
86	NC_018674	GCT	2	6	6084	6089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719068
87	NC_018674	CCA	2	6	6182	6187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719068
88	NC_018674	GGCGT	2	10	6223	6232	0 %	20 %	60 %	20 %	407719068
89	NC_018674	ACC	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719068
90	NC_018674	CAG	2	6	6268	6273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719068
91	NC_018674	TGA	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719068
92	NC_018674	CAAT	2	8	6303	6310	50 %	25 %	0 %	25 %	407719068
93	NC_018674	AAT	2	6	6400	6405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719068
94	NC_018674	AAC	2	6	6470	6475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719068
95	NC_018674	CGG	2	6	6504	6509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719068
96	NC_018674	CTG	2	6	6597	6602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719068
97	NC_018674	TAA	2	6	6685	6690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719068
98	NC_018674	GTC	2	6	6708	6713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719068
99	NC_018674	ATG	2	6	6762	6767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719068
100	NC_018674	GAA	2	6	7443	7448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719069
101	NC_018674	AGTT	2	8	7517	7524	25 %	50 %	25 %	0 %	407719069
102	NC_018674	A	6	6	7625	7630	100 %	0 %	0 %	0 %	407719069
103	NC_018674	ATT	2	6	7732	7737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719069
104	NC_018674	AAG	2	6	7790	7795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719069
105	NC_018674	A	7	7	7809	7815	100 %	0 %	0 %	0 %	407719069
106	NC_018674	AT	3	6	7908	7913	50 %	50 %	0 %	0 %	407719069
107	NC_018674	A	6	6	7915	7920	100 %	0 %	0 %	0 %	407719069
108	NC_018674	TATT	2	8	8354	8361	25 %	75 %	0 %	0 %	407719070
109	NC_018674	TTTG	2	8	8396	8403	0 %	75 %	25 %	0 %	407719070
110	NC_018674	AAT	2	6	8422	8427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719070
111	NC_018674	TAAAA	2	10	8441	8450	80 %	20 %	0 %	0 %	407719070
112	NC_018674	A	6	6	8447	8452	100 %	0 %	0 %	0 %	407719070
113	NC_018674	TTACC	2	10	8508	8517	20 %	40 %	0 %	40 %	407719070
114	NC_018674	ATG	2	6	8535	8540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719070
115	NC_018674	TCT	2	6	8543	8548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719070
116	NC_018674	CAT	2	6	8572	8577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719070
117	NC_018674	TGT	2	6	8653	8658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719070
118	NC_018674	CAA	2	6	9491	9496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719071
119	NC_018674	T	6	6	9521	9526	0 %	100 %	0 %	0 %	407719071
120	NC_018674	AGG	2	6	9648	9653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719071
121	NC_018674	ATGT	2	8	9658	9665	25 %	50 %	25 %	0 %	407719071
122	NC_018674	CAG	2	6	9737	9742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719071
123	NC_018674	TAA	2	6	9783	9788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719071
124	NC_018674	CAC	2	6	9797	9802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719071
125	NC_018674	TAA	2	6	9863	9868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719071
126	NC_018674	ATC	2	6	9879	9884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719071
127	NC_018674	AAT	2	6	10077	10082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719071
128	NC_018674	ATA	2	6	10093	10098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719071
129	NC_018674	ATT	2	6	10306	10311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719072
130	NC_018674	TTG	2	6	10318	10323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719072
131	NC_018674	TAA	2	6	10349	10354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719072
132	NC_018674	AT	3	6	10435	10440	50 %	50 %	0 %	0 %	407719072
133	NC_018674	ATT	2	6	12674	12679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719073
134	NC_018674	CAT	2	6	12698	12703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719073
135	NC_018674	GACA	2	8	12744	12751	50 %	0 %	25 %	25 %	407719073
136	NC_018674	CAA	2	6	12839	12844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719073
137	NC_018674	TAAA	2	8	12971	12978	75 %	25 %	0 %	0 %	407719073
138	NC_018674	A	6	6	13005	13010	100 %	0 %	0 %	0 %	407719073
139	NC_018674	CAA	2	6	13044	13049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719073
140	NC_018674	T	6	6	13090	13095	0 %	100 %	0 %	0 %	407719073
141	NC_018674	ATA	2	6	13096	13101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719073
142	NC_018674	TACG	2	8	13133	13140	25 %	25 %	25 %	25 %	407719073
143	NC_018674	CAC	2	6	13175	13180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719073
144	NC_018674	TTA	2	6	13207	13212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719073
145	NC_018674	AGA	2	6	13290	13295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719073
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147	NC_018674	T	6	6	13371	13376	0 %	100 %	0 %	0 %	407719073
148	NC_018674	AAG	2	6	13396	13401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719073
149	NC_018674	TTG	2	6	13443	13448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719073
150	NC_018674	CTAT	2	8	13475	13482	25 %	50 %	0 %	25 %	407719074
151	NC_018674	CTAA	2	8	13489	13496	50 %	25 %	0 %	25 %	407719074
152	NC_018674	TAAC	2	8	13568	13575	50 %	25 %	0 %	25 %	407719074
153	NC_018674	CAG	2	6	13604	13609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719074
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155	NC_018674	TCA	2	6	13645	13650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719074
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157	NC_018674	CTG	2	6	13679	13684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719074
158	NC_018674	ATT	2	6	13756	13761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719075
159	NC_018674	ATT	2	6	13835	13840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719075
160	NC_018674	AATA	2	8	13841	13848	75 %	25 %	0 %	0 %	407719075
161	NC_018674	T	6	6	13936	13941	0 %	100 %	0 %	0 %	407719075
162	NC_018674	ATTA	2	8	13964	13971	50 %	50 %	0 %	0 %	407719075
163	NC_018674	TAA	2	6	14012	14017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719075
164	NC_018674	TAA	2	6	14077	14082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719075
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263	NC_018674	ATC	2	6	19563	19568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719080
264	NC_018674	GATT	2	8	19599	19606	25 %	50 %	25 %	0 %	407719080
265	NC_018674	TAG	2	6	19714	19719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719080
266	NC_018674	CTT	2	6	20448	20453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719081
267	NC_018674	CG	3	6	20616	20621	0 %	0 %	50 %	50 %	407719081

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.