MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-3

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018611	CAAA	2	8	7	14	75 %	0 %	0 %	25 %	406025808
2	NC_018611	ATTT	2	8	227	234	25 %	75 %	0 %	0 %	406025808
3	NC_018611	GATA	2	8	2007	2014	50 %	25 %	25 %	0 %	406025810
4	NC_018611	TTGA	2	8	2275	2282	25 %	50 %	25 %	0 %	406025811
5	NC_018611	AACG	2	8	2362	2369	50 %	0 %	25 %	25 %	406025811
6	NC_018611	GTCA	2	8	3586	3593	25 %	25 %	25 %	25 %	406025814
7	NC_018611	AGAA	2	8	3670	3677	75 %	0 %	25 %	0 %	406025814
8	NC_018611	AGAA	2	8	3753	3760	75 %	0 %	25 %	0 %	406025814
9	NC_018611	AAGA	2	8	4007	4014	75 %	0 %	25 %	0 %	406025814
10	NC_018611	GAAA	2	8	4169	4176	75 %	0 %	25 %	0 %	406025814
11	NC_018611	TTAA	2	8	4400	4407	50 %	50 %	0 %	0 %	406025814
12	NC_018611	TAAA	2	8	4491	4498	75 %	25 %	0 %	0 %	406025814
13	NC_018611	AACG	2	8	4625	4632	50 %	0 %	25 %	25 %	406025814
14	NC_018611	GCAA	2	8	5047	5054	50 %	0 %	25 %	25 %	406025814
15	NC_018611	TTAT	2	8	5101	5108	25 %	75 %	0 %	0 %	406025814
16	NC_018611	ATTG	2	8	6810	6817	25 %	50 %	25 %	0 %	406025815
17	NC_018611	AGCA	2	8	6878	6885	50 %	0 %	25 %	25 %	406025815
18	NC_018611	TAAA	2	8	6932	6939	75 %	25 %	0 %	0 %	406025815
19	NC_018611	AGCA	2	8	8440	8447	50 %	0 %	25 %	25 %	406025817
20	NC_018611	GCTG	2	8	9896	9903	0 %	25 %	50 %	25 %	406025818
21	NC_018611	CCAA	2	8	11002	11009	50 %	0 %	0 %	50 %	406025819
22	NC_018611	TGAT	2	8	11639	11646	25 %	50 %	25 %	0 %	406025820
23	NC_018611	TAGC	2	8	11990	11997	25 %	25 %	25 %	25 %	406025820
24	NC_018611	ATTG	2	8	12252	12259	25 %	50 %	25 %	0 %	406025821
25	NC_018611	ATCA	2	8	12618	12625	50 %	25 %	0 %	25 %	406025821
26	NC_018611	GTTT	2	8	12764	12771	0 %	75 %	25 %	0 %	406025821
27	NC_018611	AAAT	2	8	12861	12868	75 %	25 %	0 %	0 %	406025821
28	NC_018611	TAAA	2	8	13316	13323	75 %	25 %	0 %	0 %	406025821
29	NC_018611	AAAT	2	8	14918	14925	75 %	25 %	0 %	0 %	406025822
30	NC_018611	ATCA	2	8	15224	15231	50 %	25 %	0 %	25 %	406025822
31	NC_018611	GAAA	2	8	15972	15979	75 %	0 %	25 %	0 %	406025823
32	NC_018611	ATGA	2	8	16190	16197	50 %	25 %	25 %	0 %	406025824
33	NC_018611	ACTT	2	8	16682	16689	25 %	50 %	0 %	25 %	406025824
34	NC_018611	CCAA	2	8	17699	17706	50 %	0 %	0 %	50 %	406025825
35	NC_018611	AAAT	2	8	18187	18194	75 %	25 %	0 %	0 %	406025825
36	NC_018611	ATGA	2	8	19353	19360	50 %	25 %	25 %	0 %	406025826
37	NC_018611	ACTT	2	8	19845	19852	25 %	50 %	0 %	25 %	406025826
38	NC_018611	GATT	2	8	21276	21283	25 %	50 %	25 %	0 %	406025827
39	NC_018611	GATT	2	8	21491	21498	25 %	50 %	25 %	0 %	406025827
40	NC_018611	TTAA	2	8	22161	22168	50 %	50 %	0 %	0 %	406025828
41	NC_018611	TATT	2	8	22939	22946	25 %	75 %	0 %	0 %	406025829
42	NC_018611	AATT	2	8	23143	23150	50 %	50 %	0 %	0 %	406025829
43	NC_018611	TGAT	2	8	23465	23472	25 %	50 %	25 %	0 %	406025830
44	NC_018611	TAAA	2	8	23927	23934	75 %	25 %	0 %	0 %	406025830
45	NC_018611	AATT	2	8	24008	24015	50 %	50 %	0 %	0 %	406025830
46	NC_018611	TATT	2	8	24425	24432	25 %	75 %	0 %	0 %	406025831
47	NC_018611	GAAA	2	8	24823	24830	75 %	0 %	25 %	0 %	406025831
48	NC_018611	TTTG	2	8	24977	24984	0 %	75 %	25 %	0 %	406025832
49	NC_018611	CATT	2	8	25559	25566	25 %	50 %	0 %	25 %	406025833
50	NC_018611	ATGC	2	8	25629	25636	25 %	25 %	25 %	25 %	406025833
51	NC_018611	ATCT	2	8	26165	26172	25 %	50 %	0 %	25 %	406025834
52	NC_018611	GATA	2	8	26312	26319	50 %	25 %	25 %	0 %	406025834
53	NC_018611	GTTT	2	8	26610	26617	0 %	75 %	25 %	0 %	406025834
54	NC_018611	GTCA	2	8	28053	28060	25 %	25 %	25 %	25 %	406025835
55	NC_018611	AATT	2	8	29173	29180	50 %	50 %	0 %	0 %	406025836
56	NC_018611	TATT	2	8	29838	29845	25 %	75 %	0 %	0 %	406025837
57	NC_018611	GTAT	2	8	30254	30261	25 %	50 %	25 %	0 %	406025837
58	NC_018611	TGGA	2	8	30320	30327	25 %	25 %	50 %	0 %	406025837
59	NC_018611	TTTG	2	8	30541	30548	0 %	75 %	25 %	0 %	406025837
60	NC_018611	TATC	2	8	30554	30561	25 %	50 %	0 %	25 %	406025837
61	NC_018611	AATC	2	8	31025	31032	50 %	25 %	0 %	25 %	406025838
62	NC_018611	GCTC	2	8	31259	31266	0 %	25 %	25 %	50 %	406025838
63	NC_018611	CCAA	2	8	31366	31373	50 %	0 %	0 %	50 %	406025838
64	NC_018611	AGTT	2	8	31538	31545	25 %	50 %	25 %	0 %	406025838
65	NC_018611	TAAA	2	8	32325	32332	75 %	25 %	0 %	0 %	406025839
66	NC_018611	AAGT	2	8	33003	33010	50 %	25 %	25 %	0 %	406025839
67	NC_018611	CAAC	2	8	33297	33304	50 %	0 %	0 %	50 %	406025840
68	NC_018611	CTTC	2	8	33387	33394	0 %	50 %	0 %	50 %	406025840
69	NC_018611	CATT	2	8	33520	33527	25 %	50 %	0 %	25 %	406025840
70	NC_018611	TTCA	2	8	34360	34367	25 %	50 %	0 %	25 %	406025841
71	NC_018611	TTAC	2	8	34537	34544	25 %	50 %	0 %	25 %	406025842
72	NC_018611	CAAA	2	8	34786	34793	75 %	0 %	0 %	25 %	406025843
73	NC_018611	TATT	2	8	36113	36120	25 %	75 %	0 %	0 %	406025845
74	NC_018611	AAAC	2	8	36303	36310	75 %	0 %	0 %	25 %	406025845
75	NC_018611	TATT	2	8	36797	36804	25 %	75 %	0 %	0 %	406025845
76	NC_018611	AGTT	2	8	36834	36841	25 %	50 %	25 %	0 %	406025845
77	NC_018611	ACAA	2	8	37246	37253	75 %	0 %	0 %	25 %	406025846
78	NC_018611	CTAT	2	8	37613	37620	25 %	50 %	0 %	25 %	406025846
79	NC_018611	TTTA	2	8	37647	37654	25 %	75 %	0 %	0 %	406025846
80	NC_018611	TATT	2	8	38004	38011	25 %	75 %	0 %	0 %	406025846
81	NC_018611	TAGT	2	8	38487	38494	25 %	50 %	25 %	0 %	406025846
82	NC_018611	ACGC	2	8	39267	39274	25 %	0 %	25 %	50 %	406025847
83	NC_018611	ATTT	2	8	40320	40327	25 %	75 %	0 %	0 %	406025848
84	NC_018611	ATCT	2	8	41143	41150	25 %	50 %	0 %	25 %	406025849
85	NC_018611	TGCT	2	8	41201	41208	0 %	50 %	25 %	25 %	406025849
86	NC_018611	CGTT	2	8	41426	41433	0 %	50 %	25 %	25 %	406025849
87	NC_018611	GTTT	2	8	41609	41616	0 %	75 %	25 %	0 %	406025849
88	NC_018611	TTCA	2	8	41641	41648	25 %	50 %	0 %	25 %	406025849
89	NC_018611	CAAA	2	8	41658	41665	75 %	0 %	0 %	25 %	406025849
90	NC_018611	GCTG	2	8	42386	42393	0 %	25 %	50 %	25 %	406025850
91	NC_018611	TGGT	2	8	43427	43434	0 %	50 %	50 %	0 %	406025851
92	NC_018611	ATTG	2	8	44866	44873	25 %	50 %	25 %	0 %	406025852
93	NC_018611	TGAT	2	8	44956	44963	25 %	50 %	25 %	0 %	406025852
94	NC_018611	ATTT	2	8	45192	45199	25 %	75 %	0 %	0 %	406025852
95	NC_018611	TAAG	2	8	45805	45812	50 %	25 %	25 %	0 %	406025853
96	NC_018611	TAAC	2	8	45834	45841	50 %	25 %	0 %	25 %	406025853
97	NC_018611	GCAA	2	8	46093	46100	50 %	0 %	25 %	25 %	406025854
98	NC_018611	AATG	2	8	46131	46138	50 %	25 %	25 %	0 %	406025854
99	NC_018611	GTTG	2	8	46912	46919	0 %	50 %	50 %	0 %	406025854
100	NC_018611	CAAA	2	8	47933	47940	75 %	0 %	0 %	25 %	406025855
101	NC_018611	CCAA	2	8	49004	49011	50 %	0 %	0 %	50 %	406025856
102	NC_018611	GCTG	2	8	50229	50236	0 %	25 %	50 %	25 %	406025857
103	NC_018611	TGAT	2	8	51139	51146	25 %	50 %	25 %	0 %	406025858
104	NC_018611	GTTC	2	8	51368	51375	0 %	50 %	25 %	25 %	406025858
105	NC_018611	AATT	2	8	51419	51426	50 %	50 %	0 %	0 %	406025858
106	NC_018611	AAGC	2	8	51595	51602	50 %	0 %	25 %	25 %	406025859
107	NC_018611	TGTA	2	8	52313	52320	25 %	50 %	25 %	0 %	406025860
108	NC_018611	AACG	2	8	52498	52505	50 %	0 %	25 %	25 %	406025860
109	NC_018611	GATC	2	8	53566	53573	25 %	25 %	25 %	25 %	406025861
110	NC_018611	ATTA	2	8	53601	53608	50 %	50 %	0 %	0 %	406025861
111	NC_018611	TGGC	2	8	54480	54487	0 %	25 %	50 %	25 %	406025862
112	NC_018611	TTCT	2	8	55014	55021	0 %	75 %	0 %	25 %	406025863
113	NC_018611	AACT	2	8	55348	55355	50 %	25 %	0 %	25 %	406025864
114	NC_018611	AATA	2	8	55814	55821	75 %	25 %	0 %	0 %	406025864

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.