MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-3

Total Repeats: 906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018611	TTATT	2	10	30130	30139	20 %	80 %	0 %	0 %	406025837
502	NC_018611	TGT	2	6	30180	30185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025837
503	NC_018611	CT	3	6	30242	30247	0 %	50 %	0 %	50 %	406025837
504	NC_018611	GTAT	2	8	30254	30261	25 %	50 %	25 %	0 %	406025837
505	NC_018611	TTCTT	2	10	30270	30279	0 %	80 %	0 %	20 %	406025837
506	NC_018611	TTA	2	6	30299	30304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025837
507	NC_018611	TGGA	2	8	30320	30327	25 %	25 %	50 %	0 %	406025837
508	NC_018611	CAA	2	6	30359	30364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025837
509	NC_018611	CAATT	2	10	30471	30480	40 %	40 %	0 %	20 %	406025837
510	NC_018611	TTTG	2	8	30541	30548	0 %	75 %	25 %	0 %	406025837
511	NC_018611	TATC	2	8	30554	30561	25 %	50 %	0 %	25 %	406025837
512	NC_018611	T	7	7	30600	30606	0 %	100 %	0 %	0 %	406025837
513	NC_018611	AAT	2	6	30616	30621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025837
514	NC_018611	A	6	6	30638	30643	100 %	0 %	0 %	0 %	406025837
515	NC_018611	ATT	2	6	30654	30659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025837
516	NC_018611	AAT	2	6	30660	30665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025837
517	NC_018611	ATT	2	6	30976	30981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025838
518	NC_018611	AT	3	6	31005	31010	50 %	50 %	0 %	0 %	406025838
519	NC_018611	AATC	2	8	31025	31032	50 %	25 %	0 %	25 %	406025838
520	NC_018611	ATG	2	6	31073	31078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025838
521	NC_018611	TCA	2	6	31125	31130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025838
522	NC_018611	A	7	7	31151	31157	100 %	0 %	0 %	0 %	406025838
523	NC_018611	AT	3	6	31209	31214	50 %	50 %	0 %	0 %	406025838
524	NC_018611	GCTC	2	8	31259	31266	0 %	25 %	25 %	50 %	406025838
525	NC_018611	CCAA	2	8	31366	31373	50 %	0 %	0 %	50 %	406025838
526	NC_018611	TTA	2	6	31454	31459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025838
527	NC_018611	ACA	2	6	31513	31518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025838
528	NC_018611	AGTT	2	8	31538	31545	25 %	50 %	25 %	0 %	406025838
529	NC_018611	AAC	2	6	31599	31604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025838
530	NC_018611	A	6	6	31616	31621	100 %	0 %	0 %	0 %	406025838
531	NC_018611	AGA	2	6	31632	31637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025838
532	NC_018611	TTA	2	6	31655	31660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025838
533	NC_018611	GAA	2	6	31675	31680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025838
534	NC_018611	GA	3	6	31728	31733	50 %	0 %	50 %	0 %	406025838
535	NC_018611	ATT	2	6	31744	31749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025838
536	NC_018611	GAA	2	6	31752	31757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025838
537	NC_018611	GTT	2	6	31784	31789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025838
538	NC_018611	TAA	2	6	31808	31813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025838
539	NC_018611	ATA	2	6	31819	31824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025838
540	NC_018611	A	6	6	31844	31849	100 %	0 %	0 %	0 %	406025838
541	NC_018611	ATT	2	6	31873	31878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025838
542	NC_018611	TAAA	2	8	32325	32332	75 %	25 %	0 %	0 %	406025839
543	NC_018611	TGG	2	6	32463	32468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025839
544	NC_018611	GTG	2	6	32469	32474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025839
545	NC_018611	TTA	2	6	32487	32492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025839
546	NC_018611	GTT	2	6	32615	32620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025839
547	NC_018611	TTCAGT	2	12	32631	32642	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406025839
548	NC_018611	GCT	2	6	32646	32651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025839
549	NC_018611	GGC	2	6	32660	32665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025839
550	NC_018611	GTC	2	6	32705	32710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025839
551	NC_018611	TCA	2	6	32728	32733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025839
552	NC_018611	ACA	2	6	32830	32835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025839
553	NC_018611	CAG	2	6	32870	32875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025839
554	NC_018611	CTT	2	6	32926	32931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025839
555	NC_018611	CTT	2	6	32971	32976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025839
556	NC_018611	AAGT	2	8	33003	33010	50 %	25 %	25 %	0 %	406025839
557	NC_018611	CAAC	2	8	33297	33304	50 %	0 %	0 %	50 %	406025840
558	NC_018611	CAG	2	6	33307	33312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025840
559	NC_018611	A	7	7	33338	33344	100 %	0 %	0 %	0 %	406025840
560	NC_018611	CTTC	2	8	33387	33394	0 %	50 %	0 %	50 %	406025840
561	NC_018611	ATG	2	6	33450	33455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025840
562	NC_018611	CATT	2	8	33520	33527	25 %	50 %	0 %	25 %	406025840
563	NC_018611	TGG	2	6	33622	33627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025840
564	NC_018611	ACC	2	6	33677	33682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025840
565	NC_018611	TCG	2	6	33772	33777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025840
566	NC_018611	CGC	2	6	33854	33859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025840
567	NC_018611	AAG	2	6	33884	33889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025841
568	NC_018611	AGT	2	6	33981	33986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025841
569	NC_018611	CAG	2	6	34023	34028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025841
570	NC_018611	GTT	2	6	34061	34066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025841
571	NC_018611	GTTAA	2	10	34142	34151	40 %	40 %	20 %	0 %	406025841
572	NC_018611	AGC	2	6	34268	34273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025841
573	NC_018611	GGT	2	6	34293	34298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025841
574	NC_018611	TTCA	2	8	34360	34367	25 %	50 %	0 %	25 %	406025841
575	NC_018611	TTAC	2	8	34537	34544	25 %	50 %	0 %	25 %	406025842
576	NC_018611	CAAA	2	8	34786	34793	75 %	0 %	0 %	25 %	406025843
577	NC_018611	TA	3	6	34806	34811	50 %	50 %	0 %	0 %	406025843
578	NC_018611	AGGCC	2	10	34885	34894	20 %	0 %	40 %	40 %	406025843
579	NC_018611	GAG	2	6	34961	34966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406025843
580	NC_018611	A	7	7	34978	34984	100 %	0 %	0 %	0 %	406025843
581	NC_018611	TAT	2	6	35098	35103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025844
582	NC_018611	AAC	2	6	35156	35161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025844
583	NC_018611	AGC	2	6	35189	35194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025844
584	NC_018611	CCA	2	6	35214	35219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025844
585	NC_018611	TGAAT	2	10	35220	35229	40 %	40 %	20 %	0 %	406025844
586	NC_018611	ACG	2	6	35265	35270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025844
587	NC_018611	CAT	2	6	35472	35477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025844
588	NC_018611	ACG	2	6	35490	35495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025844
589	NC_018611	A	6	6	35517	35522	100 %	0 %	0 %	0 %	406025844
590	NC_018611	GAT	2	6	35629	35634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025844
591	NC_018611	CTGCCG	2	12	35780	35791	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	406025844
592	NC_018611	GCC	2	6	35899	35904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025844
593	NC_018611	TTA	2	6	36093	36098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025845
594	NC_018611	A	8	8	36098	36105	100 %	0 %	0 %	0 %	406025845
595	NC_018611	TATT	2	8	36113	36120	25 %	75 %	0 %	0 %	406025845
596	NC_018611	TAT	2	6	36152	36157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025845
597	NC_018611	ATTGAT	2	12	36257	36268	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406025845
598	NC_018611	AAT	2	6	36292	36297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025845
599	NC_018611	AAAC	2	8	36303	36310	75 %	0 %	0 %	25 %	406025845
600	NC_018611	AGG	3	9	36328	36336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406025845
601	NC_018611	AGA	2	6	36364	36369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025845
602	NC_018611	CGT	2	6	36374	36379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025845
603	NC_018611	A	8	8	36397	36404	100 %	0 %	0 %	0 %	406025845
604	NC_018611	GAA	2	6	36465	36470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025845
605	NC_018611	ATA	2	6	36492	36497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025845
606	NC_018611	ATG	2	6	36531	36536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025845
607	NC_018611	ATT	2	6	36547	36552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025845
608	NC_018611	TAT	2	6	36585	36590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025845
609	NC_018611	A	6	6	36620	36625	100 %	0 %	0 %	0 %	406025845
610	NC_018611	TTA	2	6	36636	36641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025845
611	NC_018611	ATT	2	6	36643	36648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025845
612	NC_018611	GAAAA	2	10	36683	36692	80 %	0 %	20 %	0 %	406025845
613	NC_018611	A	7	7	36689	36695	100 %	0 %	0 %	0 %	406025845
614	NC_018611	A	6	6	36701	36706	100 %	0 %	0 %	0 %	406025845
615	NC_018611	TA	3	6	36708	36713	50 %	50 %	0 %	0 %	406025845
616	NC_018611	A	6	6	36713	36718	100 %	0 %	0 %	0 %	406025845
617	NC_018611	GAA	2	6	36791	36796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025845
618	NC_018611	TATT	2	8	36797	36804	25 %	75 %	0 %	0 %	406025845
619	NC_018611	AGTT	2	8	36834	36841	25 %	50 %	25 %	0 %	406025845
620	NC_018611	AT	3	6	36874	36879	50 %	50 %	0 %	0 %	406025845
621	NC_018611	AGATAT	2	12	36988	36999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406025845
622	NC_018611	ATT	2	6	37012	37017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025845
623	NC_018611	TAA	2	6	37065	37070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025845
624	NC_018611	CAA	2	6	37105	37110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025846
625	NC_018611	AAT	2	6	37130	37135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025846
626	NC_018611	TAT	2	6	37140	37145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025846
627	NC_018611	T	6	6	37180	37185	0 %	100 %	0 %	0 %	406025846
628	NC_018611	TA	3	6	37197	37202	50 %	50 %	0 %	0 %	406025846
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630	NC_018611	ACAA	2	8	37246	37253	75 %	0 %	0 %	25 %	406025846
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762	NC_018611	GAA	2	6	45601	45606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025853
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765	NC_018611	TAAC	2	8	45834	45841	50 %	25 %	0 %	25 %	406025853
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768	NC_018611	A	6	6	45888	45893	100 %	0 %	0 %	0 %	406025853
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776	NC_018611	AATG	2	8	46131	46138	50 %	25 %	25 %	0 %	406025854
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784	NC_018611	ACA	2	6	46585	46590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025854
785	NC_018611	ACC	2	6	46620	46625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025854
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