MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 1360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018610	AAGAA	2	10	1573	1582	80 %	0 %	20 %	0 %	406025866
2	NC_018610	TCTGC	2	10	2858	2867	0 %	40 %	20 %	40 %	406025867
3	NC_018610	AGTCG	2	10	4179	4188	20 %	20 %	40 %	20 %	406025869
4	NC_018610	CAACG	2	10	6516	6525	40 %	0 %	20 %	40 %	406025870
5	NC_018610	TCTTT	2	10	8483	8492	0 %	80 %	0 %	20 %	406025871
6	NC_018610	GATTC	2	10	8960	8969	20 %	40 %	20 %	20 %	406025871
7	NC_018610	TGGCT	2	10	10331	10340	0 %	40 %	40 %	20 %	406025872
8	NC_018610	GGCCA	2	10	12795	12804	20 %	0 %	40 %	40 %	406025877
9	NC_018610	GAATT	2	10	15247	15256	40 %	40 %	20 %	0 %	406025878
10	NC_018610	TTCAT	2	10	16257	16266	20 %	60 %	0 %	20 %	406025879
11	NC_018610	CCAAT	2	10	17155	17164	40 %	20 %	0 %	40 %	406025879
12	NC_018610	GCAAC	2	10	17846	17855	40 %	0 %	20 %	40 %	406025879
13	NC_018610	TTGAA	2	10	18466	18475	40 %	40 %	20 %	0 %	406025880
14	NC_018610	CAAAG	2	10	20788	20797	60 %	0 %	20 %	20 %	406025882
15	NC_018610	TCGGT	2	10	22043	22052	0 %	40 %	40 %	20 %	406025883
16	NC_018610	GTTAT	2	10	22391	22400	20 %	60 %	20 %	0 %	406025883
17	NC_018610	ATTTA	2	10	22935	22944	40 %	60 %	0 %	0 %	406025884
18	NC_018610	ATTGA	2	10	23347	23356	40 %	40 %	20 %	0 %	406025884
19	NC_018610	CAGAT	2	10	27269	27278	40 %	20 %	20 %	20 %	406025887
20	NC_018610	ATAAA	2	10	33161	33170	80 %	20 %	0 %	0 %	406025892
21	NC_018610	CCATA	2	10	33433	33442	40 %	20 %	0 %	40 %	406025892
22	NC_018610	TGGGA	2	10	34190	34199	20 %	20 %	60 %	0 %	406025893
23	NC_018610	ATTGA	2	10	35415	35424	40 %	40 %	20 %	0 %	406025896
24	NC_018610	GTTGC	2	10	35492	35501	0 %	40 %	40 %	20 %	406025896
25	NC_018610	TTCAG	2	10	35537	35546	20 %	40 %	20 %	20 %	406025896
26	NC_018610	TGTAA	2	10	37298	37307	40 %	40 %	20 %	0 %	406025898
27	NC_018610	ATCAA	2	10	39599	39608	60 %	20 %	0 %	20 %	406025902
28	NC_018610	CTGGA	2	10	40154	40163	20 %	20 %	40 %	20 %	406025902
29	NC_018610	ATTTC	2	10	40851	40860	20 %	60 %	0 %	20 %	406025902
30	NC_018610	CTGAC	2	10	43186	43195	20 %	20 %	20 %	40 %	406025905
31	NC_018610	GCGTC	2	10	43814	43823	0 %	20 %	40 %	40 %	406025905
32	NC_018610	ATTGG	2	10	50546	50555	20 %	40 %	40 %	0 %	406025910
33	NC_018610	TCTCA	2	10	51356	51365	20 %	40 %	0 %	40 %	406025911
34	NC_018610	AACGT	2	10	53367	53376	40 %	20 %	20 %	20 %	406025912
35	NC_018610	GGCCG	2	10	55815	55824	0 %	0 %	60 %	40 %	406025914
36	NC_018610	GCTGT	2	10	58478	58487	0 %	40 %	40 %	20 %	406025916
37	NC_018610	GGAAA	2	10	59050	59059	60 %	0 %	40 %	0 %	406025917
38	NC_018610	AAATC	2	10	59904	59913	60 %	20 %	0 %	20 %	406025918
39	NC_018610	TGGTT	2	10	60402	60411	0 %	60 %	40 %	0 %	406025918
40	NC_018610	TTGAG	2	10	63390	63399	20 %	40 %	40 %	0 %	406025921
41	NC_018610	AGCGC	2	10	63547	63556	20 %	0 %	40 %	40 %	406025921
42	NC_018610	AAGTT	2	10	64238	64247	40 %	40 %	20 %	0 %	406025922
43	NC_018610	ATGGA	2	10	64907	64916	40 %	20 %	40 %	0 %	406025923
44	NC_018610	TATAA	2	10	67669	67678	60 %	40 %	0 %	0 %	406025926
45	NC_018610	GTGAT	2	10	69861	69870	20 %	40 %	40 %	0 %	406025927
46	NC_018610	AAGCT	2	10	70696	70705	40 %	20 %	20 %	20 %	406025928
47	NC_018610	GATAA	2	10	71347	71356	60 %	20 %	20 %	0 %	406025928
48	NC_018610	TGTAT	2	10	74078	74087	20 %	60 %	20 %	0 %	406025931
49	NC_018610	TGAGT	2	10	74389	74398	20 %	40 %	40 %	0 %	406025931
50	NC_018610	GAATT	2	10	74419	74428	40 %	40 %	20 %	0 %	406025931
51	NC_018610	GGCTT	2	10	75918	75927	0 %	40 %	40 %	20 %	406025932
52	NC_018610	TTTCA	2	10	77133	77142	20 %	60 %	0 %	20 %	406025933
53	NC_018610	TGGAT	2	10	78378	78387	20 %	40 %	40 %	0 %	406025934
54	NC_018610	CTTGA	2	10	86362	86371	20 %	40 %	20 %	20 %	406025940
55	NC_018610	ACAAT	2	10	89126	89135	60 %	20 %	0 %	20 %	406025943
56	NC_018610	AATTT	2	10	90129	90138	40 %	60 %	0 %	0 %	406025944
57	NC_018610	AATCC	2	10	92495	92504	40 %	20 %	0 %	40 %	406025946
58	NC_018610	GATAT	2	10	92915	92924	40 %	40 %	20 %	0 %	406025946
59	NC_018610	AAACC	2	10	94095	94104	60 %	0 %	0 %	40 %	406025947
60	NC_018610	TTGAT	2	10	95412	95421	20 %	60 %	20 %	0 %	406025948
61	NC_018610	TGATT	2	10	96958	96967	20 %	60 %	20 %	0 %	406025949
62	NC_018610	AAAAG	2	10	100162	100171	80 %	0 %	20 %	0 %	406025952
63	NC_018610	CAGCT	2	10	100239	100248	20 %	20 %	20 %	40 %	406025952
64	NC_018610	TGGAA	2	10	100915	100924	40 %	20 %	40 %	0 %	406025953
65	NC_018610	TGGCT	2	10	101917	101926	0 %	40 %	40 %	20 %	406025954
66	NC_018610	AAAAG	2	10	103749	103758	80 %	0 %	20 %	0 %	406025955
67	NC_018610	GATCC	2	10	104182	104191	20 %	20 %	20 %	40 %	406025955
68	NC_018610	TTTTA	2	10	104465	104474	20 %	80 %	0 %	0 %	406025956
69	NC_018610	ATTGG	2	10	104643	104652	20 %	40 %	40 %	0 %	406025956
70	NC_018610	TGGAT	2	10	106349	106358	20 %	40 %	40 %	0 %	406025957
71	NC_018610	TGAAT	2	10	106735	106744	40 %	40 %	20 %	0 %	406025957
72	NC_018610	TTCGG	2	10	109271	109280	0 %	40 %	40 %	20 %	406025958
73	NC_018610	AATGC	2	10	111336	111345	40 %	20 %	20 %	20 %	406025960
74	NC_018610	AGGAC	2	10	117940	117949	40 %	0 %	40 %	20 %	406025964
75	NC_018610	TTAAC	2	10	119698	119707	40 %	40 %	0 %	20 %	406025965
76	NC_018610	TGTTT	2	10	120977	120986	0 %	80 %	20 %	0 %	406025965
77	NC_018610	GTGGA	2	10	123333	123342	20 %	20 %	60 %	0 %	406025968
78	NC_018610	TTGAT	2	10	126207	126216	20 %	60 %	20 %	0 %	406025971
79	NC_018610	ATTCA	2	10	130605	130614	40 %	40 %	0 %	20 %	406025975
80	NC_018610	GCATC	2	10	130958	130967	20 %	20 %	20 %	40 %	406025975
81	NC_018610	ACAGA	2	10	135084	135093	60 %	0 %	20 %	20 %	406025978
82	NC_018610	GCTTG	2	10	135653	135662	0 %	40 %	40 %	20 %	406025978
83	NC_018610	GAATC	2	10	137577	137586	40 %	20 %	20 %	20 %	406025980
84	NC_018610	ACATG	2	10	137653	137662	40 %	20 %	20 %	20 %	406025980
85	NC_018610	AACAA	2	10	138890	138899	80 %	0 %	0 %	20 %	406025981
86	NC_018610	CAACA	2	10	140137	140146	60 %	0 %	0 %	40 %	406025982
87	NC_018610	ACCAA	2	10	142119	142128	60 %	0 %	0 %	40 %	406025983
88	NC_018610	TGGGG	2	10	143814	143823	0 %	20 %	80 %	0 %	406025985
89	NC_018610	CAATT	2	10	148886	148895	40 %	40 %	0 %	20 %	406025987
90	NC_018610	GATAT	2	10	149346	149355	40 %	40 %	20 %	0 %	406025987
91	NC_018610	CAAAT	2	10	149599	149608	60 %	20 %	0 %	20 %	406025987
92	NC_018610	TTTCT	2	10	150909	150918	0 %	80 %	0 %	20 %	406025988
93	NC_018610	AAATT	2	10	151026	151035	60 %	40 %	0 %	0 %	406025988
94	NC_018610	GCCGC	2	10	154013	154022	0 %	0 %	40 %	60 %	406025990
95	NC_018610	TCGGC	2	10	156663	156672	0 %	20 %	40 %	40 %	406025992
96	NC_018610	ATTTG	2	10	158419	158428	20 %	60 %	20 %	0 %	406025993
97	NC_018610	CAACC	2	10	159378	159387	40 %	0 %	0 %	60 %	406025994
98	NC_018610	TTCTG	2	10	161073	161082	0 %	60 %	20 %	20 %	406025996
99	NC_018610	GCTGG	2	10	162416	162425	0 %	20 %	60 %	20 %	406025998
100	NC_018610	AACGG	2	10	162594	162603	40 %	0 %	40 %	20 %	406025998
101	NC_018610	TGCCA	2	10	163650	163659	20 %	20 %	20 %	40 %	406025999
102	NC_018610	GGCCA	2	10	164399	164408	20 %	0 %	40 %	40 %	406026000
103	NC_018610	TTGGT	2	10	168578	168587	0 %	60 %	40 %	0 %	406026005
104	NC_018610	TTCTT	2	10	172267	172276	0 %	80 %	0 %	20 %	406026008
105	NC_018610	GTGTA	2	10	172333	172342	20 %	40 %	40 %	0 %	406026008
106	NC_018610	GTTCA	2	10	172650	172659	20 %	40 %	20 %	20 %	406026008
107	NC_018610	AAGTT	2	10	179399	179408	40 %	40 %	20 %	0 %	406026014
108	NC_018610	TTGTC	2	10	179906	179915	0 %	60 %	20 %	20 %	406026015
109	NC_018610	TGGAA	2	10	182010	182019	40 %	20 %	40 %	0 %	406026018
110	NC_018610	AATTA	2	10	187467	187476	60 %	40 %	0 %	0 %	406026024
111	NC_018610	CGTGT	2	10	187491	187500	0 %	40 %	40 %	20 %	406026024
112	NC_018610	GAATC	2	10	187967	187976	40 %	20 %	20 %	20 %	406026025
113	NC_018610	ATTTG	2	10	188355	188364	20 %	60 %	20 %	0 %	406026025
114	NC_018610	TTAAC	2	10	192924	192933	40 %	40 %	0 %	20 %	406026030
115	NC_018610	GTGAC	2	10	195983	195992	20 %	20 %	40 %	20 %	406026033
116	NC_018610	CTTGG	2	10	198163	198172	0 %	40 %	40 %	20 %	406026035
117	NC_018610	TTCCA	2	10	198612	198621	20 %	40 %	0 %	40 %	406026035
118	NC_018610	TCGCC	2	10	200360	200369	0 %	20 %	20 %	60 %	406026036
119	NC_018610	TTGCC	2	10	203214	203223	0 %	40 %	20 %	40 %	406026039
120	NC_018610	TTTTG	2	10	204946	204955	0 %	80 %	20 %	0 %	406026041
121	NC_018610	CTTTG	2	10	206985	206994	0 %	60 %	20 %	20 %	406026042
122	NC_018610	ATATG	2	10	207300	207309	40 %	40 %	20 %	0 %	406026042
123	NC_018610	GGATT	2	10	209832	209841	20 %	40 %	40 %	0 %	406026045
124	NC_018610	TTTTG	2	10	210786	210795	0 %	80 %	20 %	0 %	406026046
125	NC_018610	AAATT	2	10	211430	211439	60 %	40 %	0 %	0 %	406026047
126	NC_018610	GAAAA	2	10	212394	212403	80 %	0 %	20 %	0 %	406026048
127	NC_018610	CTCAA	2	10	215534	215543	40 %	20 %	0 %	40 %	406026051
128	NC_018610	TTTGA	2	10	217147	217156	20 %	60 %	20 %	0 %	406026053
129	NC_018610	CGATG	2	10	217621	217630	20 %	20 %	40 %	20 %	406026053
130	NC_018610	TGGGT	2	10	220161	220170	0 %	40 %	60 %	0 %	406026056
131	NC_018610	CCAGA	2	10	220357	220366	40 %	0 %	20 %	40 %	406026056
132	NC_018610	GCTTG	2	10	220453	220462	0 %	40 %	40 %	20 %	406026056
133	NC_018610	AGAAA	2	10	222073	222082	80 %	0 %	20 %	0 %	406026058
134	NC_018610	GATAT	2	10	222135	222144	40 %	40 %	20 %	0 %	406026058
135	NC_018610	TGCCT	2	10	222598	222607	0 %	40 %	20 %	40 %	406026058
136	NC_018610	AAGAA	2	10	222768	222777	80 %	0 %	20 %	0 %	406026058
137	NC_018610	CTTTG	2	10	225944	225953	0 %	60 %	20 %	20 %	406026061
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142	NC_018610	CAATT	2	10	238603	238612	40 %	40 %	0 %	20 %	406026075
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