MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 30451

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018610	GCA	2	6	309	314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025866
2	NC_018610	ATT	2	6	417	422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025866
3	NC_018610	TAA	2	6	514	519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025866
4	NC_018610	ATC	2	6	597	602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025866
5	NC_018610	TAT	2	6	631	636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025866
6	NC_018610	GCT	2	6	665	670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025866
7	NC_018610	GAA	2	6	683	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025866
8	NC_018610	TGG	2	6	721	726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025866
9	NC_018610	CAA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025866
10	NC_018610	ATC	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025866
11	NC_018610	TCA	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025866
12	NC_018610	GAA	2	6	866	871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025866
13	NC_018610	CGC	2	6	875	880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025866
14	NC_018610	TGA	2	6	910	915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025866
15	NC_018610	AAG	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025866
16	NC_018610	AAG	2	6	948	953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025866
17	NC_018610	TTC	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025866
18	NC_018610	CCG	2	6	1094	1099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025866
19	NC_018610	TCG	2	6	1338	1343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025866
20	NC_018610	GGC	2	6	1499	1504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025866
21	NC_018610	ATC	2	6	1550	1555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025866
22	NC_018610	GAT	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025867
23	NC_018610	TTC	2	6	2039	2044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025867
24	NC_018610	GAT	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025867
25	NC_018610	ATC	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025867
26	NC_018610	GCT	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025867
27	NC_018610	ATT	2	6	2231	2236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025867
28	NC_018610	GAT	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025867
29	NC_018610	GAT	2	6	2444	2449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025867
30	NC_018610	GAA	2	6	2738	2743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025867
31	NC_018610	CAA	2	6	2835	2840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025867
32	NC_018610	AGA	2	6	3301	3306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025868
33	NC_018610	ATT	2	6	3311	3316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025868
34	NC_018610	GGC	2	6	3323	3328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025868
35	NC_018610	ACA	2	6	3353	3358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025868
36	NC_018610	CAC	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025869
37	NC_018610	CGG	2	6	3865	3870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025869
38	NC_018610	CAC	2	6	4149	4154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025869
39	NC_018610	TGC	2	6	4215	4220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025869
40	NC_018610	CCA	2	6	4247	4252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025869
41	NC_018610	TGA	2	6	4272	4277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025869
42	NC_018610	AAG	2	6	4301	4306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025869
43	NC_018610	CAG	2	6	4330	4335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025869
44	NC_018610	TGA	2	6	4376	4381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025869
45	NC_018610	TAT	2	6	4409	4414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025869
46	NC_018610	TGA	2	6	4437	4442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025869
47	NC_018610	TTA	2	6	4459	4464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025869
48	NC_018610	ACC	3	9	4498	4506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025869
49	NC_018610	CAG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025869
50	NC_018610	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025870
51	NC_018610	ATG	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025870
52	NC_018610	AAC	2	6	4719	4724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025870
53	NC_018610	TCA	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025870
54	NC_018610	TTG	2	6	4760	4765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025870
55	NC_018610	TGA	2	6	4776	4781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025870
56	NC_018610	CCA	2	6	4799	4804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025870
57	NC_018610	ACA	2	6	4829	4834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025870
58	NC_018610	TGA	2	6	4848	4853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025870
59	NC_018610	TTC	2	6	4922	4927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025870
60	NC_018610	GGT	2	6	4933	4938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025870
61	NC_018610	GGC	3	9	4945	4953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025870
62	NC_018610	TGG	2	6	4968	4973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025870
63	NC_018610	GTT	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025870
64	NC_018610	TAC	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025870
65	NC_018610	GTC	2	6	5098	5103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025870
66	NC_018610	GAT	2	6	5116	5121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025870
67	NC_018610	ACT	2	6	5176	5181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025870
68	NC_018610	TTG	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025870
69	NC_018610	TTG	2	6	5350	5355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025870
70	NC_018610	TAA	2	6	5454	5459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025870
71	NC_018610	GAA	2	6	5488	5493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025870
72	NC_018610	ACG	2	6	5599	5604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025870
73	NC_018610	TGT	2	6	5607	5612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025870
74	NC_018610	TTG	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025870
75	NC_018610	TCG	2	6	5909	5914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025870
76	NC_018610	CGG	2	6	5928	5933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025870
77	NC_018610	GAA	2	6	6037	6042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025870
78	NC_018610	ATT	2	6	6051	6056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025870
79	NC_018610	ATC	2	6	6121	6126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025870
80	NC_018610	TGT	2	6	6167	6172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025870
81	NC_018610	GAT	3	9	6286	6294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025870
82	NC_018610	TCC	2	6	6433	6438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406025870
83	NC_018610	TCT	2	6	6461	6466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025870
84	NC_018610	ACG	2	6	6495	6500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025870
85	NC_018610	ATG	2	6	6643	6648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
86	NC_018610	TTG	2	6	6730	6735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025871
87	NC_018610	TCG	2	6	6779	6784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025871
88	NC_018610	CCG	2	6	6892	6897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025871
89	NC_018610	TGC	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025871
90	NC_018610	CAA	2	6	7058	7063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025871
91	NC_018610	ATG	2	6	7090	7095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
92	NC_018610	TCA	2	6	7213	7218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025871
93	NC_018610	TGA	2	6	7234	7239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
94	NC_018610	CAG	2	6	7258	7263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025871
95	NC_018610	CGG	2	6	7301	7306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025871
96	NC_018610	ATT	2	6	7362	7367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025871
97	NC_018610	CGG	2	6	7400	7405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025871
98	NC_018610	CAA	2	6	7445	7450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025871
99	NC_018610	TCG	2	6	7562	7567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025871
100	NC_018610	TAT	2	6	7698	7703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025871
101	NC_018610	ACG	2	6	7730	7735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025871
102	NC_018610	TGA	2	6	7811	7816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
103	NC_018610	TGA	2	6	7981	7986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
104	NC_018610	GAA	2	6	7995	8000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025871
105	NC_018610	ATT	2	6	8054	8059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025871
106	NC_018610	ACG	2	6	8087	8092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025871
107	NC_018610	TGG	2	6	8104	8109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025871
108	NC_018610	GAA	3	9	8145	8153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025871
109	NC_018610	GTG	2	6	8227	8232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025871
110	NC_018610	GTG	2	6	8236	8241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025871
111	NC_018610	GAT	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
112	NC_018610	TGT	2	6	8311	8316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025871
113	NC_018610	AAC	2	6	8463	8468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025871
114	NC_018610	GTA	2	6	8548	8553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
115	NC_018610	GAT	3	9	8580	8588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
116	NC_018610	ATC	2	6	8631	8636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025871
117	NC_018610	TGC	2	6	8669	8674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025871
118	NC_018610	GCT	2	6	8820	8825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025871
119	NC_018610	CAT	2	6	8930	8935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025871
120	NC_018610	GAT	2	6	9075	9080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
121	NC_018610	TGA	2	6	9128	9133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
122	NC_018610	TGT	2	6	9368	9373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025872
123	NC_018610	GAA	2	6	9399	9404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025872
124	NC_018610	GAA	2	6	9435	9440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025872
125	NC_018610	TCG	2	6	9481	9486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025872
126	NC_018610	AAC	2	6	9498	9503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025872
127	NC_018610	ATG	2	6	9627	9632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025872
128	NC_018610	TGG	2	6	9704	9709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025872
129	NC_018610	TCA	2	6	9732	9737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025872
130	NC_018610	CTG	2	6	9754	9759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025872
131	NC_018610	TTC	2	6	9783	9788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025872
132	NC_018610	ACT	2	6	9820	9825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025872
133	NC_018610	GAC	2	6	9906	9911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025872
134	NC_018610	GCT	2	6	10011	10016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025872
135	NC_018610	AAG	2	6	10041	10046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025872
136	NC_018610	AGA	2	6	10097	10102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025872
137	NC_018610	TGG	2	6	10154	10159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025872
138	NC_018610	CAT	2	6	10183	10188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025872
139	NC_018610	ATC	2	6	10236	10241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025872
140	NC_018610	GGT	2	6	10344	10349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025872
141	NC_018610	AAG	2	6	10440	10445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025872
142	NC_018610	GTT	2	6	10706	10711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025873
143	NC_018610	AGT	2	6	10821	10826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025873
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146	NC_018610	ATC	2	6	11301	11306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025874
147	NC_018610	GAA	2	6	11319	11324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025874
148	NC_018610	CGT	2	6	11412	11417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025874
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150	NC_018610	GTT	2	6	11550	11555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025874
151	NC_018610	GAC	2	6	11559	11564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025874
152	NC_018610	TAA	2	6	11565	11570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025874
153	NC_018610	TTG	2	6	11810	11815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025875
154	NC_018610	GTA	2	6	11887	11892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025875
155	NC_018610	GCT	2	6	11904	11909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025875
156	NC_018610	AAC	2	6	11929	11934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025875
157	NC_018610	CTC	2	6	11960	11965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406025875
158	NC_018610	CAA	2	6	12036	12041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025875
159	NC_018610	AAT	2	6	12052	12057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025875
160	NC_018610	CTA	2	6	12059	12064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025875
161	NC_018610	TGG	2	6	12069	12074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025875
162	NC_018610	TAA	2	6	12084	12089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025875
163	NC_018610	AAT	2	6	12097	12102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025875
164	NC_018610	GAT	3	9	12148	12156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025875
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169	NC_018610	CGT	2	6	12343	12348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025876
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171	NC_018610	TTG	2	6	12582	12587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025877
172	NC_018610	GAA	2	6	12660	12665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025877
173	NC_018610	AGT	2	6	12743	12748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025877
174	NC_018610	ATT	2	6	12924	12929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025877
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252	NC_018610	CCA	2	6	17386	17391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025879
253	NC_018610	ATC	2	6	17418	17423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025879
254	NC_018610	CAG	2	6	17456	17461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025879
255	NC_018610	AGA	2	6	17507	17512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025879
256	NC_018610	ATT	2	6	17544	17549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025879
257	NC_018610	ACC	2	6	17551	17556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025879
258	NC_018610	CAT	2	6	17614	17619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025879
259	NC_018610	GAA	3	9	17664	17672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025879
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261	NC_018610	TGA	2	6	17801	17806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025879
262	NC_018610	GCA	2	6	17810	17815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025879
263	NC_018610	TTC	2	6	17877	17882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025879
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270	NC_018610	GTG	2	6	18103	18108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025879
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276	NC_018610	GAA	2	6	18405	18410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025880
277	NC_018610	GGA	2	6	18416	18421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406025880
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280	NC_018610	GAC	2	6	19083	19088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025881
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284	NC_018610	CAC	2	6	19250	19255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025881
285	NC_018610	GAT	2	6	19263	19268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025881
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287	NC_018610	AAG	2	6	19375	19380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025881
288	NC_018610	GTA	2	6	19609	19614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025881
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