MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 41420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018610	GCA	2	6	309	314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025866
2	NC_018610	CACT	2	8	381	388	25 %	25 %	0 %	50 %	406025866
3	NC_018610	ATT	2	6	417	422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025866
4	NC_018610	TAA	2	6	514	519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025866
5	NC_018610	ATC	2	6	597	602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025866
6	NC_018610	TAT	2	6	631	636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025866
7	NC_018610	GCT	2	6	665	670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025866
8	NC_018610	GAA	2	6	683	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025866
9	NC_018610	TGG	2	6	721	726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025866
10	NC_018610	CAA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025866
11	NC_018610	ATC	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025866
12	NC_018610	TCA	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025866
13	NC_018610	GAA	2	6	866	871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025866
14	NC_018610	CGC	2	6	875	880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025866
15	NC_018610	TGA	2	6	910	915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025866
16	NC_018610	AAG	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025866
17	NC_018610	AAG	2	6	948	953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025866
18	NC_018610	TTC	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025866
19	NC_018610	CCG	2	6	1094	1099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025866
20	NC_018610	CGTG	2	8	1204	1211	0 %	25 %	50 %	25 %	406025866
21	NC_018610	CGAC	2	8	1272	1279	25 %	0 %	25 %	50 %	406025866
22	NC_018610	TCG	2	6	1338	1343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025866
23	NC_018610	GGC	2	6	1499	1504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025866
24	NC_018610	ATC	2	6	1550	1555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025866
25	NC_018610	AAGAA	2	10	1573	1582	80 %	0 %	20 %	0 %	406025866
26	NC_018610	GAT	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025867
27	NC_018610	TGCC	2	8	2028	2035	0 %	25 %	25 %	50 %	406025867
28	NC_018610	TTC	2	6	2039	2044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025867
29	NC_018610	GAT	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025867
30	NC_018610	ATC	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025867
31	NC_018610	GCT	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025867
32	NC_018610	ATT	2	6	2231	2236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025867
33	NC_018610	GAT	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025867
34	NC_018610	GAT	2	6	2444	2449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025867
35	NC_018610	CT	3	6	2632	2637	0 %	50 %	0 %	50 %	406025867
36	NC_018610	GAA	2	6	2738	2743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025867
37	NC_018610	CAA	2	6	2835	2840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025867
38	NC_018610	TCTGC	2	10	2858	2867	0 %	40 %	20 %	40 %	406025867
39	NC_018610	GACAGT	2	12	2894	2905	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406025867
40	NC_018610	A	6	6	3248	3253	100 %	0 %	0 %	0 %	406025868
41	NC_018610	AGA	2	6	3301	3306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025868
42	NC_018610	ATT	2	6	3311	3316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025868
43	NC_018610	GGC	2	6	3323	3328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025868
44	NC_018610	AG	3	6	3347	3352	50 %	0 %	50 %	0 %	406025868
45	NC_018610	ACA	2	6	3353	3358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025868
46	NC_018610	T	6	6	3443	3448	0 %	100 %	0 %	0 %	406025868
47	NC_018610	ATGA	2	8	3468	3475	50 %	25 %	25 %	0 %	406025868
48	NC_018610	TCTT	2	8	3551	3558	0 %	75 %	0 %	25 %	406025869
49	NC_018610	CAC	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025869
50	NC_018610	CGG	2	6	3865	3870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025869
51	NC_018610	CATGGA	2	12	3873	3884	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406025869
52	NC_018610	CAC	2	6	4149	4154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025869
53	NC_018610	AGTCG	2	10	4179	4188	20 %	20 %	40 %	20 %	406025869
54	NC_018610	TGC	2	6	4215	4220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025869
55	NC_018610	CCA	2	6	4247	4252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025869
56	NC_018610	TGA	2	6	4272	4277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025869
57	NC_018610	AAG	2	6	4301	4306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025869
58	NC_018610	CAG	2	6	4330	4335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025869
59	NC_018610	TGA	2	6	4376	4381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025869
60	NC_018610	AACA	2	8	4385	4392	75 %	0 %	0 %	25 %	406025869
61	NC_018610	TAT	2	6	4409	4414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025869
62	NC_018610	TGA	2	6	4437	4442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025869
63	NC_018610	TTA	2	6	4459	4464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025869
64	NC_018610	ACC	3	9	4498	4506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025869
65	NC_018610	CAG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025869
66	NC_018610	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025870
67	NC_018610	A	6	6	4627	4632	100 %	0 %	0 %	0 %	406025870
68	NC_018610	ATG	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025870
69	NC_018610	AAC	2	6	4719	4724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025870
70	NC_018610	TCA	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025870
71	NC_018610	TTG	2	6	4760	4765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025870
72	NC_018610	TGA	2	6	4776	4781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025870
73	NC_018610	CCA	2	6	4799	4804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025870
74	NC_018610	TTACCG	2	12	4808	4819	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	406025870
75	NC_018610	ACA	2	6	4829	4834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025870
76	NC_018610	TGA	2	6	4848	4853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025870
77	NC_018610	A	7	7	4880	4886	100 %	0 %	0 %	0 %	406025870
78	NC_018610	TTC	2	6	4922	4927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025870
79	NC_018610	GGT	2	6	4933	4938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025870
80	NC_018610	GGC	3	9	4945	4953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025870
81	NC_018610	TGG	2	6	4968	4973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025870
82	NC_018610	GTT	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025870
83	NC_018610	TAC	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025870
84	NC_018610	GTC	2	6	5098	5103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025870
85	NC_018610	GAT	2	6	5116	5121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025870
86	NC_018610	ACT	2	6	5176	5181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025870
87	NC_018610	TTG	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025870
88	NC_018610	CCGA	2	8	5275	5282	25 %	0 %	25 %	50 %	406025870
89	NC_018610	TATG	2	8	5292	5299	25 %	50 %	25 %	0 %	406025870
90	NC_018610	TTG	2	6	5350	5355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025870
91	NC_018610	TAA	2	6	5454	5459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025870
92	NC_018610	GAA	2	6	5488	5493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025870
93	NC_018610	ACG	2	6	5599	5604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025870
94	NC_018610	TGT	2	6	5607	5612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025870
95	NC_018610	TGAC	2	8	5687	5694	25 %	25 %	25 %	25 %	406025870
96	NC_018610	TTG	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025870
97	NC_018610	CCTG	2	8	5850	5857	0 %	25 %	25 %	50 %	406025870
98	NC_018610	TCG	2	6	5909	5914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025870
99	NC_018610	CGG	2	6	5928	5933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025870
100	NC_018610	GAA	2	6	6037	6042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025870
101	NC_018610	ATT	2	6	6051	6056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025870
102	NC_018610	ATTA	2	8	6103	6110	50 %	50 %	0 %	0 %	406025870
103	NC_018610	ATC	2	6	6121	6126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025870
104	NC_018610	CCGATG	2	12	6131	6142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406025870
105	NC_018610	TGT	2	6	6167	6172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025870
106	NC_018610	GAT	3	9	6286	6294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025870
107	NC_018610	TCC	2	6	6433	6438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406025870
108	NC_018610	TCT	2	6	6461	6466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025870
109	NC_018610	ACG	2	6	6495	6500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025870
110	NC_018610	CAACG	2	10	6516	6525	40 %	0 %	20 %	40 %	406025870
111	NC_018610	ATG	2	6	6643	6648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
112	NC_018610	ATCT	2	8	6679	6686	25 %	50 %	0 %	25 %	406025871
113	NC_018610	A	7	7	6687	6693	100 %	0 %	0 %	0 %	406025871
114	NC_018610	TTG	2	6	6730	6735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025871
115	NC_018610	TCG	2	6	6779	6784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025871
116	NC_018610	CCG	2	6	6892	6897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025871
117	NC_018610	TGATGG	2	12	6980	6991	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	406025871
118	NC_018610	TGC	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025871
119	NC_018610	CAA	2	6	7058	7063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025871
120	NC_018610	ATG	2	6	7090	7095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
121	NC_018610	TCA	2	6	7213	7218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025871
122	NC_018610	TGA	2	6	7234	7239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
123	NC_018610	CAG	2	6	7258	7263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025871
124	NC_018610	CGG	2	6	7301	7306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025871
125	NC_018610	ATT	2	6	7362	7367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025871
126	NC_018610	CGG	2	6	7400	7405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025871
127	NC_018610	CAA	2	6	7445	7450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025871
128	NC_018610	TGAT	2	8	7552	7559	25 %	50 %	25 %	0 %	406025871
129	NC_018610	TCG	2	6	7562	7567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025871
130	NC_018610	GAAA	2	8	7682	7689	75 %	0 %	25 %	0 %	406025871
131	NC_018610	TAT	2	6	7698	7703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025871
132	NC_018610	ACG	2	6	7730	7735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025871
133	NC_018610	TGA	2	6	7811	7816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
134	NC_018610	CAAT	2	8	7973	7980	50 %	25 %	0 %	25 %	406025871
135	NC_018610	TGA	2	6	7981	7986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
136	NC_018610	GAA	2	6	7995	8000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025871
137	NC_018610	ATT	2	6	8054	8059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025871
138	NC_018610	ACG	2	6	8087	8092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025871
139	NC_018610	TGG	2	6	8104	8109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025871
140	NC_018610	TGAAGA	2	12	8126	8137	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406025871
141	NC_018610	GAA	3	9	8145	8153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025871
142	NC_018610	GTG	2	6	8227	8232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025871
143	NC_018610	GTG	2	6	8236	8241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025871
144	NC_018610	GAT	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
145	NC_018610	TTCAAC	2	12	8288	8299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025871
146	NC_018610	TGT	2	6	8311	8316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025871
147	NC_018610	A	6	6	8428	8433	100 %	0 %	0 %	0 %	406025871
148	NC_018610	AAC	2	6	8463	8468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025871
149	NC_018610	TCTTT	2	10	8483	8492	0 %	80 %	0 %	20 %	406025871
150	NC_018610	GTA	2	6	8548	8553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
151	NC_018610	GAT	3	9	8580	8588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
152	NC_018610	ATC	2	6	8631	8636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025871
153	NC_018610	TGC	2	6	8669	8674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025871
154	NC_018610	CGTT	2	8	8678	8685	0 %	50 %	25 %	25 %	406025871
155	NC_018610	GCT	2	6	8820	8825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025871
156	NC_018610	CAT	2	6	8930	8935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025871
157	NC_018610	GATTC	2	10	8960	8969	20 %	40 %	20 %	20 %	406025871
158	NC_018610	GAT	2	6	9075	9080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
159	NC_018610	CAAG	2	8	9120	9127	50 %	0 %	25 %	25 %	406025871
160	NC_018610	TGA	2	6	9128	9133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025871
161	NC_018610	TCAGAT	2	12	9159	9170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406025871
162	NC_018610	TGT	2	6	9368	9373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025872
163	NC_018610	ACAA	2	8	9382	9389	75 %	0 %	0 %	25 %	406025872
164	NC_018610	GAA	2	6	9399	9404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025872
165	NC_018610	A	6	6	9403	9408	100 %	0 %	0 %	0 %	406025872
166	NC_018610	GAA	2	6	9435	9440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025872
167	NC_018610	TCG	2	6	9481	9486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025872
168	NC_018610	AAC	2	6	9498	9503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025872
169	NC_018610	ATG	2	6	9627	9632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025872
170	NC_018610	TGG	2	6	9704	9709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025872
171	NC_018610	TCA	2	6	9732	9737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025872
172	NC_018610	CTG	2	6	9754	9759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025872
173	NC_018610	TTC	2	6	9783	9788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025872
174	NC_018610	ACT	2	6	9820	9825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025872
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184	NC_018610	AAG	2	6	10440	10445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025872
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244	NC_018610	AAC	2	6	13583	13588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025877
245	NC_018610	CGG	2	6	13595	13600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025877
246	NC_018610	ACCA	2	8	13602	13609	50 %	0 %	0 %	50 %	406025877
247	NC_018610	GCG	2	6	13696	13701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025877
248	NC_018610	ATC	2	6	13714	13719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025877
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250	NC_018610	TAA	2	6	13845	13850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025877
251	NC_018610	CAA	2	6	13910	13915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025877
252	NC_018610	ACTC	2	8	13941	13948	25 %	25 %	0 %	50 %	406025877
253	NC_018610	TGCG	2	8	14629	14636	0 %	25 %	50 %	25 %	406025878
254	NC_018610	GAT	2	6	14657	14662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025878
255	NC_018610	TGG	2	6	14669	14674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025878
256	NC_018610	GTT	2	6	14690	14695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025878
257	NC_018610	TTTTTC	2	12	14766	14777	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406025878
258	NC_018610	ATG	2	6	14778	14783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025878
259	NC_018610	ACAT	2	8	14822	14829	50 %	25 %	0 %	25 %	406025878
260	NC_018610	ATTT	2	8	14837	14844	25 %	75 %	0 %	0 %	406025878
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379	NC_018610	TCG	2	6	20196	20201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025881
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382	NC_018610	CCA	2	6	20523	20528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025882
383	NC_018610	CTG	2	6	20535	20540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025882
384	NC_018610	ATG	2	6	20569	20574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025882
385	NC_018610	CTG	2	6	20581	20586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025882
386	NC_018610	CGT	2	6	20607	20612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025882
387	NC_018610	GCC	2	6	20644	20649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025882
388	NC_018610	CCA	2	6	20665	20670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025882
389	NC_018610	GCC	2	6	20721	20726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025882
390	NC_018610	CAAAG	2	10	20788	20797	60 %	0 %	20 %	20 %	406025882
391	NC_018610	AAT	2	6	20851	20856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025882
392	NC_018610	AAC	2	6	20862	20867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025882
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405	NC_018610	TTGG	2	8	21613	21620	0 %	50 %	50 %	0 %	406025882
406	NC_018610	ATTT	2	8	21701	21708	25 %	75 %	0 %	0 %	406025882
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495	NC_018610	CTC	2	6	27256	27261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406025887
496	NC_018610	CAGAT	2	10	27269	27278	40 %	20 %	20 %	20 %	406025887
497	NC_018610	CAAA	2	8	27574	27581	75 %	0 %	0 %	25 %	406025887
498	NC_018610	TGA	2	6	27583	27588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025887
499	NC_018610	AAT	2	6	27646	27651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025888
500	NC_018610	GAT	2	6	27652	27657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025888

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