MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 41420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018610	GT	3	6	238999	239004	0 %	50 %	50 %	0 %	406026075
4002	NC_018610	TGG	2	6	239027	239032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026075
4003	NC_018610	CTG	2	6	239067	239072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026075
4004	NC_018610	AAG	2	6	239121	239126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026075
4005	NC_018610	TCA	2	6	239197	239202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026075
4006	NC_018610	GTT	2	6	239256	239261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026075
4007	NC_018610	CAG	2	6	239262	239267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026075
4008	NC_018610	AAG	2	6	239272	239277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026075
4009	NC_018610	TCTG	2	8	239340	239347	0 %	50 %	25 %	25 %	406026075
4010	NC_018610	CAA	2	6	239402	239407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026075
4011	NC_018610	AGC	2	6	239531	239536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026075
4012	NC_018610	CGG	2	6	239543	239548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406026075
4013	NC_018610	GGCT	2	8	239590	239597	0 %	25 %	50 %	25 %	406026075
4014	NC_018610	CAT	2	6	239633	239638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026075
4015	NC_018610	GCT	2	6	239664	239669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026075
4016	NC_018610	A	6	6	239673	239678	100 %	0 %	0 %	0 %	406026075
4017	NC_018610	ATG	2	6	239745	239750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026075
4018	NC_018610	AGA	2	6	240078	240083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026076
4019	NC_018610	TTA	2	6	240084	240089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026076
4020	NC_018610	AAT	2	6	240129	240134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026076
4021	NC_018610	GACC	2	8	240178	240185	25 %	0 %	25 %	50 %	406026076
4022	NC_018610	GCC	2	6	240267	240272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026076
4023	NC_018610	AAG	2	6	240273	240278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026076
4024	NC_018610	ATG	2	6	240369	240374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026076
4025	NC_018610	GATT	2	8	240398	240405	25 %	50 %	25 %	0 %	406026076
4026	NC_018610	TTGG	2	8	240606	240613	0 %	50 %	50 %	0 %	406026076
4027	NC_018610	GCG	2	6	240624	240629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406026076
4028	NC_018610	GTT	2	6	240647	240652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026076
4029	NC_018610	TCAA	2	8	240657	240664	50 %	25 %	0 %	25 %	406026076
4030	NC_018610	AGTT	2	8	240682	240689	25 %	50 %	25 %	0 %	406026076
4031	NC_018610	AAG	2	6	240729	240734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026076
4032	NC_018610	TTG	2	6	240888	240893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026076
4033	NC_018610	TTG	2	6	240949	240954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026076
4034	NC_018610	CGA	2	6	240967	240972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026076
4035	NC_018610	ATC	2	6	240981	240986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026076
4036	NC_018610	TCC	2	6	241018	241023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406026076
4037	NC_018610	TTC	2	6	241083	241088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026076
4038	NC_018610	TCC	2	6	241282	241287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406026076
4039	NC_018610	CAT	2	6	241312	241317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026076
4040	NC_018610	ATCA	2	8	241320	241327	50 %	25 %	0 %	25 %	406026076
4041	NC_018610	TCA	2	6	241330	241335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026076
4042	NC_018610	ACTC	2	8	241382	241389	25 %	25 %	0 %	50 %	406026076
4043	NC_018610	CAT	2	6	241400	241405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026076
4044	NC_018610	GTT	2	6	241475	241480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026076
4045	NC_018610	GAA	2	6	241502	241507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026076
4046	NC_018610	TTG	2	6	241619	241624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026077
4047	NC_018610	GTA	2	6	241655	241660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026077
4048	NC_018610	AT	3	6	241674	241679	50 %	50 %	0 %	0 %	406026077
4049	NC_018610	TGG	2	6	241689	241694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026077
4050	NC_018610	ACC	2	6	241719	241724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026077
4051	NC_018610	CATC	2	8	241726	241733	25 %	25 %	0 %	50 %	406026077
4052	NC_018610	GTG	2	6	241814	241819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026077
4053	NC_018610	GAT	2	6	241861	241866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026077
4054	NC_018610	ATCA	2	8	241931	241938	50 %	25 %	0 %	25 %	406026077
4055	NC_018610	CTT	2	6	241949	241954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026077
4056	NC_018610	GAT	2	6	241955	241960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026077
4057	NC_018610	ACC	2	6	242039	242044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026077
4058	NC_018610	AAT	2	6	242048	242053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026077
4059	NC_018610	GTA	2	6	242129	242134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026077
4060	NC_018610	TGA	2	6	242177	242182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026077
4061	NC_018610	GCC	2	6	242187	242192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026077
4062	NC_018610	CAGC	2	8	242219	242226	25 %	0 %	25 %	50 %	406026077
4063	NC_018610	AGA	2	6	242239	242244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026077
4064	NC_018610	TGAC	2	8	242274	242281	25 %	25 %	25 %	25 %	406026077
4065	NC_018610	CAC	2	6	242320	242325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026077
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4068	NC_018610	CCA	2	6	242503	242508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026077
4069	NC_018610	TGA	2	6	242512	242517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026077
4070	NC_018610	ATT	2	6	242852	242857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026077
4071	NC_018610	TAT	2	6	242868	242873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026078
4072	NC_018610	AATT	2	8	243029	243036	50 %	50 %	0 %	0 %	406026078
4073	NC_018610	ATC	3	9	243053	243061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026078
4074	NC_018610	TGT	2	6	243139	243144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026078
4075	NC_018610	TTG	2	6	243306	243311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026078
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4078	NC_018610	TGT	2	6	243550	243555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026078
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4080	NC_018610	TGCGC	2	10	243741	243750	0 %	20 %	40 %	40 %	406026078
4081	NC_018610	TCT	2	6	243783	243788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026078
4082	NC_018610	ACGCA	2	10	243815	243824	40 %	0 %	20 %	40 %	406026078
4083	NC_018610	TTG	2	6	243826	243831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026078
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4085	NC_018610	CGT	2	6	243929	243934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026078
4086	NC_018610	ATTA	2	8	244243	244250	50 %	50 %	0 %	0 %	406026079
4087	NC_018610	ATC	3	9	244259	244267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026079
4088	NC_018610	GCCA	2	8	244337	244344	25 %	0 %	25 %	50 %	406026079
4089	NC_018610	TTCAGC	2	12	244353	244364	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	406026079
4090	NC_018610	TGC	2	6	244377	244382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026079
4091	NC_018610	TTTG	2	8	244534	244541	0 %	75 %	25 %	0 %	406026079
4092	NC_018610	GAA	2	6	244598	244603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026079
4093	NC_018610	AAC	2	6	244670	244675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026079
4094	NC_018610	AAG	2	6	244761	244766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026079
4095	NC_018610	CAG	2	6	244827	244832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026080
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4098	NC_018610	CTTT	2	8	244861	244868	0 %	75 %	0 %	25 %	406026080
4099	NC_018610	GTT	2	6	244869	244874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026080
4100	NC_018610	ATTG	2	8	244938	244945	25 %	50 %	25 %	0 %	406026080
4101	NC_018610	TGA	2	6	245032	245037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026080
4102	NC_018610	GAC	2	6	245070	245075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026080
4103	NC_018610	GAT	2	6	245148	245153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026080
4104	NC_018610	TGCGGT	2	12	245198	245209	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	406026080
4105	NC_018610	ATG	2	6	245229	245234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026080
4106	NC_018610	ATC	2	6	245303	245308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026080
4107	NC_018610	GCCGGG	2	12	245337	245348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406026080
4108	NC_018610	CGA	2	6	245420	245425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026080
4109	NC_018610	TCA	2	6	245476	245481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026080
4110	NC_018610	CGG	2	6	245489	245494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406026080
4111	NC_018610	ATC	2	6	245499	245504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026080
4112	NC_018610	TCC	2	6	245533	245538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406026080
4113	NC_018610	TTAA	2	8	245613	245620	50 %	50 %	0 %	0 %	406026080
4114	NC_018610	A	6	6	245636	245641	100 %	0 %	0 %	0 %	406026080
4115	NC_018610	ACACC	2	10	245644	245653	40 %	0 %	0 %	60 %	406026080
4116	NC_018610	CAA	2	6	245657	245662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026080
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4119	NC_018610	TCT	2	6	246094	246099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026081
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4121	NC_018610	GCA	2	6	246307	246312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026081
4122	NC_018610	TGGC	2	8	246342	246349	0 %	25 %	50 %	25 %	406026081
4123	NC_018610	CAA	2	6	246472	246477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026081
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4129	NC_018610	CAG	2	6	246655	246660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026081
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4143	NC_018610	GGT	2	6	247505	247510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026081
4144	NC_018610	TGC	2	6	247517	247522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026081
4145	NC_018610	TGA	2	6	247542	247547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026081
4146	NC_018610	TGA	2	6	247651	247656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026081
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4233	NC_018610	CCAA	2	8	253250	253257	50 %	0 %	0 %	50 %	406026087
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4241	NC_018610	CAT	2	6	253958	253963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026087
4242	NC_018610	GAA	2	6	253966	253971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026087
4243	NC_018610	AGT	2	6	253991	253996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026087
4244	NC_018610	A	6	6	254359	254364	100 %	0 %	0 %	0 %	406026088
4245	NC_018610	CAA	2	6	254369	254374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026088
4246	NC_018610	CAA	2	6	254438	254443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026088
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4264	NC_018610	CCA	2	6	255529	255534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026089
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4272	NC_018610	GTC	2	6	256012	256017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026091
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4274	NC_018610	GGC	2	6	256178	256183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406026091
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4354	NC_018610	CAT	2	6	261995	262000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026095
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4358	NC_018610	GTC	2	6	262275	262280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026095
4359	NC_018610	AAATG	2	10	262504	262513	60 %	20 %	20 %	0 %	406026096
4360	NC_018610	A	6	6	262517	262522	100 %	0 %	0 %	0 %	406026096
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4362	NC_018610	GGC	2	6	262658	262663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406026096
4363	NC_018610	GAA	3	9	262768	262776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026096
4364	NC_018610	GAC	2	6	262811	262816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026096
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4366	NC_018610	GCT	2	6	262946	262951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026096
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4386	NC_018610	TTAA	2	8	264156	264163	50 %	50 %	0 %	0 %	406026097
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4401	NC_018610	AT	3	6	265162	265167	50 %	50 %	0 %	0 %	406026098
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4470	NC_018610	CTG	2	6	269775	269780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026101
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4472	NC_018610	TGA	2	6	269886	269891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026101
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4474	NC_018610	CATT	2	8	269937	269944	25 %	50 %	0 %	25 %	406026101
4475	NC_018610	ACC	2	6	270040	270045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026101
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4477	NC_018610	TGA	2	6	270156	270161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026101
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4480	NC_018610	TGC	2	6	270318	270323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026101
4481	NC_018610	TAC	2	6	270418	270423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026101
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4483	NC_018610	ATG	2	6	270870	270875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026102
4484	NC_018610	ATT	2	6	270899	270904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026102
4485	NC_018610	CCATC	2	10	270997	271006	20 %	20 %	0 %	60 %	406026102
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