MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 41420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_018610	GTG	2	6	2472377	2472382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028153
41002	NC_018610	TAA	2	6	2472430	2472435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406028153
41003	NC_018610	GCA	2	6	2472549	2472554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028153
41004	NC_018610	TGGT	2	8	2472657	2472664	0 %	50 %	50 %	0 %	406028153
41005	NC_018610	GCC	2	6	2472715	2472720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028153
41006	NC_018610	GGT	2	6	2473048	2473053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028153
41007	NC_018610	TTC	2	6	2473588	2473593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028154
41008	NC_018610	CTTG	2	8	2473653	2473660	0 %	50 %	25 %	25 %	406028154
41009	NC_018610	CTT	2	6	2473680	2473685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028154
41010	NC_018610	TTTG	2	8	2473692	2473699	0 %	75 %	25 %	0 %	406028154
41011	NC_018610	TGG	2	6	2473748	2473753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028154
41012	NC_018610	GCC	2	6	2473995	2474000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028154
41013	NC_018610	TGACAT	2	12	2474066	2474077	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406028154
41014	NC_018610	AAC	2	6	2474085	2474090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028154
41015	NC_018610	CAA	2	6	2474102	2474107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028154
41016	NC_018610	TGA	2	6	2474116	2474121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028154
41017	NC_018610	TTG	2	6	2474151	2474156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028154
41018	NC_018610	TTGC	2	8	2474275	2474282	0 %	50 %	25 %	25 %	406028154
41019	NC_018610	AACC	2	8	2474315	2474322	50 %	0 %	0 %	50 %	406028154
41020	NC_018610	GCT	2	6	2474370	2474375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028154
41021	NC_018610	GCT	2	6	2474410	2474415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028154
41022	NC_018610	A	7	7	2474432	2474438	100 %	0 %	0 %	0 %	406028154
41023	NC_018610	T	7	7	2474444	2474450	0 %	100 %	0 %	0 %	406028154
41024	NC_018610	ACT	2	6	2474700	2474705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028155
41025	NC_018610	GCC	2	6	2474707	2474712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028155
41026	NC_018610	ATC	2	6	2474750	2474755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028155
41027	NC_018610	CAA	2	6	2474761	2474766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028155
41028	NC_018610	GTC	2	6	2474776	2474781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028155
41029	NC_018610	AACTG	2	10	2474796	2474805	40 %	20 %	20 %	20 %	406028155
41030	NC_018610	TGC	2	6	2474861	2474866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028155
41031	NC_018610	T	6	6	2474907	2474912	0 %	100 %	0 %	0 %	406028155
41032	NC_018610	GAT	2	6	2474926	2474931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028155
41033	NC_018610	TCG	2	6	2474960	2474965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028155
41034	NC_018610	A	6	6	2474978	2474983	100 %	0 %	0 %	0 %	406028155
41035	NC_018610	CAG	2	6	2475022	2475027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028155
41036	NC_018610	TGG	2	6	2475047	2475052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028155
41037	NC_018610	GATT	2	8	2475066	2475073	25 %	50 %	25 %	0 %	406028155
41038	NC_018610	TAA	2	6	2475090	2475095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406028155
41039	NC_018610	ACC	2	6	2475211	2475216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028155
41040	NC_018610	ATT	2	6	2475232	2475237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406028155
41041	NC_018610	ATCGAA	2	12	2475268	2475279	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406028155
41042	NC_018610	A	6	6	2475282	2475287	100 %	0 %	0 %	0 %	406028155
41043	NC_018610	TATT	2	8	2475322	2475329	25 %	75 %	0 %	0 %	406028155
41044	NC_018610	GTC	2	6	2475622	2475627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028156
41045	NC_018610	CAT	2	6	2475663	2475668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028156
41046	NC_018610	TCA	2	6	2475677	2475682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028156
41047	NC_018610	TTGG	2	8	2475700	2475707	0 %	50 %	50 %	0 %	406028156
41048	NC_018610	AATG	2	8	2475725	2475732	50 %	25 %	25 %	0 %	406028156
41049	NC_018610	GTA	2	6	2475810	2475815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028156
41050	NC_018610	ATT	2	6	2475820	2475825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406028156
41051	NC_018610	GTT	2	6	2475829	2475834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028156
41052	NC_018610	TGA	2	6	2475927	2475932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028156
41053	NC_018610	ATG	2	6	2475946	2475951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028156
41054	NC_018610	TAAA	2	8	2476053	2476060	75 %	25 %	0 %	0 %	406028156
41055	NC_018610	TGG	2	6	2476100	2476105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028156
41056	NC_018610	GGC	2	6	2476225	2476230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028156
41057	NC_018610	AGG	2	6	2476287	2476292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028156
41058	NC_018610	ACGTGG	2	12	2476321	2476332	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	406028156
41059	NC_018610	TTGAT	2	10	2476540	2476549	20 %	60 %	20 %	0 %	406028157
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41062	NC_018610	CTG	2	6	2476742	2476747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028157
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41065	NC_018610	TTC	2	6	2476919	2476924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028157
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41067	NC_018610	GCC	2	6	2476995	2477000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028157
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41069	NC_018610	TGG	2	6	2477113	2477118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028157
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41072	NC_018610	CAT	2	6	2477272	2477277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028157
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41088	NC_018610	CAA	2	6	2478354	2478359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028158
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41098	NC_018610	CAA	2	6	2479802	2479807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028159
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41100	NC_018610	ATA	2	6	2479950	2479955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406028159
41101	NC_018610	GCC	2	6	2479978	2479983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028159
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41103	NC_018610	CGCT	2	8	2480023	2480030	0 %	25 %	25 %	50 %	406028159
41104	NC_018610	ATG	2	6	2480079	2480084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028159
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41106	NC_018610	ACG	2	6	2480174	2480179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028159
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41110	NC_018610	AAAG	2	8	2480429	2480436	75 %	0 %	25 %	0 %	406028159
41111	NC_018610	ATTTT	2	10	2480452	2480461	20 %	80 %	0 %	0 %	406028159
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41232	NC_018610	TAGCG	2	10	2489223	2489232	20 %	20 %	40 %	20 %	406028168
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41234	NC_018610	ATC	2	6	2489368	2489373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028168
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41239	NC_018610	CAT	2	6	2489605	2489610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028168
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41243	NC_018610	ATGG	2	8	2489777	2489784	25 %	25 %	50 %	0 %	406028168
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41347	NC_018610	AAC	2	6	2496205	2496210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028173
41348	NC_018610	GCA	2	6	2496314	2496319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028173
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41384	NC_018610	ACC	2	6	2498385	2498390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028176
41385	NC_018610	CCA	2	6	2498413	2498418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028176
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.