MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 41420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018610	CAGTGG	2	12	27678	27689	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	406025888
502	NC_018610	TG	3	6	27731	27736	0 %	50 %	50 %	0 %	406025888
503	NC_018610	AAG	2	6	27754	27759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025888
504	NC_018610	CAT	2	6	27954	27959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025888
505	NC_018610	ACG	2	6	28019	28024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025888
506	NC_018610	TCA	2	6	28050	28055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025888
507	NC_018610	TAA	2	6	28056	28061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025888
508	NC_018610	TCA	2	6	28118	28123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025888
509	NC_018610	ATA	2	6	28316	28321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025888
510	NC_018610	ATT	2	6	28438	28443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025888
511	NC_018610	GGC	2	6	28599	28604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025889
512	NC_018610	TTAC	2	8	28609	28616	25 %	50 %	0 %	25 %	406025889
513	NC_018610	AAC	2	6	28635	28640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025889
514	NC_018610	AAT	3	9	28641	28649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025889
515	NC_018610	TGT	2	6	28766	28771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025889
516	NC_018610	TTA	2	6	28777	28782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025889
517	NC_018610	CGA	2	6	28805	28810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025889
518	NC_018610	GGT	2	6	28842	28847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025889
519	NC_018610	AGA	2	6	28861	28866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025889
520	NC_018610	GCG	2	6	28870	28875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025889
521	NC_018610	AAG	2	6	28914	28919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025889
522	NC_018610	CAA	2	6	28946	28951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025889
523	NC_018610	ATT	2	6	28983	28988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025889
524	NC_018610	CAC	2	6	29146	29151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025889
525	NC_018610	ATT	2	6	29187	29192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025889
526	NC_018610	AG	3	6	29225	29230	50 %	0 %	50 %	0 %	406025889
527	NC_018610	CAA	2	6	29235	29240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025889
528	NC_018610	TGC	2	6	29270	29275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025889
529	NC_018610	TGG	2	6	29294	29299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025889
530	NC_018610	CAG	2	6	29361	29366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025889
531	NC_018610	TCCG	2	8	29455	29462	0 %	25 %	25 %	50 %	406025889
532	NC_018610	AGC	3	9	29503	29511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025889
533	NC_018610	CAA	2	6	29649	29654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025889
534	NC_018610	TAT	2	6	29712	29717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025889
535	NC_018610	AAG	2	6	29730	29735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025889
536	NC_018610	AAT	2	6	29794	29799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025889
537	NC_018610	GCT	2	6	30024	30029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025890
538	NC_018610	TGC	2	6	30041	30046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025890
539	NC_018610	AGC	2	6	30158	30163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025890
540	NC_018610	ACC	2	6	30210	30215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025890
541	NC_018610	CAAG	2	8	30250	30257	50 %	0 %	25 %	25 %	406025890
542	NC_018610	AACC	2	8	30284	30291	50 %	0 %	0 %	50 %	406025890
543	NC_018610	TAT	2	6	30303	30308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025890
544	NC_018610	GGT	2	6	30311	30316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025890
545	NC_018610	CAG	2	6	30405	30410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025890
546	NC_018610	ACTC	2	8	30412	30419	25 %	25 %	0 %	50 %	406025890
547	NC_018610	TGA	2	6	30422	30427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025890
548	NC_018610	AAT	2	6	30474	30479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025890
549	NC_018610	AGC	2	6	30496	30501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025890
550	NC_018610	CCA	2	6	30628	30633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025890
551	NC_018610	GAA	2	6	30680	30685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025890
552	NC_018610	CAAC	2	8	30688	30695	50 %	0 %	0 %	50 %	406025890
553	NC_018610	AGTT	2	8	30733	30740	25 %	50 %	25 %	0 %	406025890
554	NC_018610	CAC	2	6	30892	30897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025890
555	NC_018610	ATTA	2	8	31044	31051	50 %	50 %	0 %	0 %	406025890
556	NC_018610	GGTG	2	8	31091	31098	0 %	25 %	75 %	0 %	406025890
557	NC_018610	GGC	2	6	31124	31129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025890
558	NC_018610	GCT	2	6	31140	31145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025890
559	NC_018610	AGTT	2	8	31156	31163	25 %	50 %	25 %	0 %	406025890
560	NC_018610	CAA	2	6	31199	31204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025890
561	NC_018610	CAA	2	6	31221	31226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025890
562	NC_018610	TTG	2	6	31318	31323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025890
563	NC_018610	CAA	2	6	31348	31353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025890
564	NC_018610	TGC	2	6	31433	31438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025890
565	NC_018610	GAA	2	6	31445	31450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025890
566	NC_018610	TGC	2	6	31457	31462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025890
567	NC_018610	TGC	2	6	31523	31528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025890
568	NC_018610	GTTG	2	8	31574	31581	0 %	50 %	50 %	0 %	406025890
569	NC_018610	TGC	2	6	31784	31789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025890
570	NC_018610	TAC	2	6	31818	31823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025890
571	NC_018610	GCA	2	6	31824	31829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025890
572	NC_018610	TAA	2	6	32006	32011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025890
573	NC_018610	ATG	2	6	32077	32082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025890
574	NC_018610	CAA	2	6	32117	32122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025890
575	NC_018610	GTT	2	6	32147	32152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025890
576	NC_018610	TCC	2	6	32324	32329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406025891
577	NC_018610	GCA	2	6	32337	32342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025891
578	NC_018610	CGT	2	6	32352	32357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025891
579	NC_018610	TTTG	2	8	32407	32414	0 %	75 %	25 %	0 %	406025891
580	NC_018610	TAA	2	6	32429	32434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025891
581	NC_018610	GTT	2	6	32986	32991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025892
582	NC_018610	AAG	2	6	33140	33145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025892
583	NC_018610	ATAAA	2	10	33161	33170	80 %	20 %	0 %	0 %	406025892
584	NC_018610	TGG	2	6	33288	33293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025892
585	NC_018610	TGA	2	6	33374	33379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025892
586	NC_018610	CCATA	2	10	33433	33442	40 %	20 %	0 %	40 %	406025892
587	NC_018610	GGTT	2	8	33779	33786	0 %	50 %	50 %	0 %	406025893
588	NC_018610	TAG	2	6	33994	33999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025893
589	NC_018610	ATG	2	6	34022	34027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025893
590	NC_018610	GTAG	2	8	34076	34083	25 %	25 %	50 %	0 %	406025893
591	NC_018610	ATC	2	6	34089	34094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025893
592	NC_018610	TGGGA	2	10	34190	34199	20 %	20 %	60 %	0 %	406025893
593	NC_018610	GCA	2	6	34240	34245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025893
594	NC_018610	TCA	2	6	34261	34266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025893
595	NC_018610	ATCC	2	8	34362	34369	25 %	25 %	0 %	50 %	406025893
596	NC_018610	TGA	2	6	34509	34514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025893
597	NC_018610	TTC	2	6	34521	34526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025893
598	NC_018610	TAA	2	6	34532	34537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025893
599	NC_018610	CCT	2	6	34555	34560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406025894
600	NC_018610	GCC	2	6	34653	34658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025894
601	NC_018610	TCC	2	6	34705	34710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406025894
602	NC_018610	CTT	2	6	34824	34829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025894
603	NC_018610	TTG	2	6	34842	34847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025894
604	NC_018610	GTGA	2	8	34852	34859	25 %	25 %	50 %	0 %	406025894
605	NC_018610	GTT	2	6	34878	34883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025895
606	NC_018610	TGAG	2	8	34892	34899	25 %	25 %	50 %	0 %	406025895
607	NC_018610	CCG	2	6	34974	34979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025895
608	NC_018610	T	6	6	35044	35049	0 %	100 %	0 %	0 %	406025895
609	NC_018610	TAA	2	6	35080	35085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025895
610	NC_018610	AAT	2	6	35116	35121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025895
611	NC_018610	CTG	2	6	35209	35214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025895
612	NC_018610	CTT	2	6	35226	35231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025895
613	NC_018610	TGA	2	6	35246	35251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025895
614	NC_018610	GAT	2	6	35258	35263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025895
615	NC_018610	TTAA	2	8	35404	35411	50 %	50 %	0 %	0 %	406025896
616	NC_018610	ATTGA	2	10	35415	35424	40 %	40 %	20 %	0 %	406025896
617	NC_018610	GTTGC	2	10	35492	35501	0 %	40 %	40 %	20 %	406025896
618	NC_018610	GCG	2	6	35508	35513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025896
619	NC_018610	TTCAG	2	10	35537	35546	20 %	40 %	20 %	20 %	406025896
620	NC_018610	GGTT	2	8	35554	35561	0 %	50 %	50 %	0 %	406025896
621	NC_018610	CAA	2	6	35634	35639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025896
622	NC_018610	TTAA	2	8	35657	35664	50 %	50 %	0 %	0 %	406025896
623	NC_018610	TGA	2	6	35711	35716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025896
624	NC_018610	TTC	2	6	35719	35724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025896
625	NC_018610	GTG	2	6	35730	35735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025896
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627	NC_018610	AGAA	2	8	35948	35955	75 %	0 %	25 %	0 %	406025896
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755	NC_018610	GCGTC	2	10	43814	43823	0 %	20 %	40 %	40 %	406025905
756	NC_018610	CAT	2	6	44021	44026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025905
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759	NC_018610	GTCA	2	8	44178	44185	25 %	25 %	25 %	25 %	406025905
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