MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC5850

Total Repeats: 1029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018592	GAAATT	2	12	6232	6243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404409245
2	NC_018592	TCGTAC	2	12	6621	6632	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404409245
3	NC_018592	TGAAGA	2	12	9550	9561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404409246
4	NC_018592	TTATTT	2	12	10919	10930	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404409247
5	NC_018592	CACATT	2	12	11200	11211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409247
6	NC_018592	ATTTTC	2	12	19879	19890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404409254
7	NC_018592	CTTCAT	2	12	20896	20907	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404409256
8	NC_018592	TTTTGG	2	12	21260	21271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404409256
9	NC_018592	AGTTGC	2	12	23649	23660	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404409258
10	NC_018592	TAAAGC	2	12	23702	23713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404409258
11	NC_018592	ATTGAA	2	12	24909	24920	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404409259
12	NC_018592	TCGATT	2	12	32439	32450	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404409268
13	NC_018592	TCACCA	2	12	32721	32732	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404409269
14	NC_018592	CGATTA	2	12	38151	38162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404409273
15	NC_018592	TTATGT	2	12	42637	42648	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404409276
16	NC_018592	AAAGAT	2	12	46290	46301	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404409279
17	NC_018592	TGAAAT	2	12	47127	47138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404409280
18	NC_018592	TGGCGG	2	12	50262	50273	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404409284
19	NC_018592	TCAAAA	2	12	50382	50393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404409284
20	NC_018592	ACAGTG	2	12	51965	51976	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404409287
21	NC_018592	AAAAAT	2	12	52829	52840	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404409289
22	NC_018592	TTTATA	2	12	55307	55318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409291
23	NC_018592	GCAGAA	2	12	56754	56765	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404409291
24	NC_018592	AGGTAA	2	12	56845	56856	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404409292
25	NC_018592	TGATCG	2	12	58233	58244	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404409293
26	NC_018592	TGATTT	2	12	63578	63589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404409297
27	NC_018592	TTTTGC	2	12	64183	64194	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404409298
28	NC_018592	TAAATT	2	12	76493	76504	50 %	50 %	0 %	0 %	404409311
29	NC_018592	ATTATA	2	12	81268	81279	50 %	50 %	0 %	0 %	404409316
30	NC_018592	ATCACT	2	12	86295	86306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409321
31	NC_018592	AAACAC	2	12	86728	86739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409321
32	NC_018592	AAGATA	2	12	89727	89738	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404409321
33	NC_018592	TATAAA	2	12	91945	91956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404409322
34	NC_018592	TATTAG	2	12	102176	102187	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404409332
35	NC_018592	TAAAAT	2	12	112011	112022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404409343
36	NC_018592	CAAAAT	2	12	112152	112163	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404409343
37	NC_018592	GTCCGC	2	12	112284	112295	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	404409343
38	NC_018592	GTTTTA	2	12	118919	118930	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404409351
39	NC_018592	TGATTT	2	12	120933	120944	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404409355
40	NC_018592	AAGTAA	2	12	124904	124915	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404409358
41	NC_018592	TAGAAA	2	12	131125	131136	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404409366
42	NC_018592	GTTGCA	2	12	147079	147090	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404409387
43	NC_018592	GATTGC	2	12	147141	147152	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404409387
44	NC_018592	TTAAAA	2	12	147815	147826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404409388
45	NC_018592	GGCGGT	2	12	152792	152803	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404409391
46	NC_018592	CGAATT	2	12	155443	155454	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404409392
47	NC_018592	GTAAAA	2	12	158595	158606	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404409395
48	NC_018592	TTTTAC	2	12	160642	160653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404409399
49	NC_018592	TTTTTA	2	12	161680	161691	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404409401
50	NC_018592	AAAGTG	2	12	162892	162903	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404409402
51	NC_018592	TACTAG	2	12	167905	167916	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404409407
52	NC_018592	AAGCGA	2	12	170409	170420	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404409409
53	NC_018592	CAATCC	2	12	173724	173735	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404409412
54	NC_018592	AAAGAT	2	12	175735	175746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404409414
55	NC_018592	ATGGCT	2	12	176860	176871	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404409415
56	NC_018592	CAGAAA	2	12	177534	177545	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404409415
57	NC_018592	AAAAGA	2	12	177610	177621	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404409415
58	NC_018592	AAAAAC	2	12	177940	177951	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404409415
59	NC_018592	TGAAGT	2	12	179980	179991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409415
60	NC_018592	CATTGA	2	12	188113	188124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404409422
61	NC_018592	TGCAGC	2	12	188768	188779	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404409423
62	NC_018592	TAAAAA	2	12	191006	191017	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404409425
63	NC_018592	TCCGGT	2	12	192106	192117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404409427
64	NC_018592	CGTTTG	2	12	199289	199300	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404409434
65	NC_018592	AAAGCA	2	12	203727	203738	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404409437
66	NC_018592	TTCTTT	2	12	208531	208542	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404409443
67	NC_018592	AGTATC	2	12	208783	208794	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404409443
68	NC_018592	GAAAAA	2	12	210626	210637	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404409445
69	NC_018592	AGGAAA	2	12	210945	210956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404409445
70	NC_018592	GAAAAA	2	12	211851	211862	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404409447
71	NC_018592	AAGGAG	2	12	215788	215799	50 %	0 %	50 %	0 %	404409448
72	NC_018592	GCAAGT	2	12	217678	217689	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404409450
73	NC_018592	TTAAAG	2	12	219621	219632	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404409452
74	NC_018592	TGTCGG	2	12	221597	221608	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404409453
75	NC_018592	GCAGAA	2	12	224626	224637	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404409455
76	NC_018592	TCTCCA	2	12	225464	225475	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	404409456
77	NC_018592	GGTTTT	2	12	227175	227186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404409457
78	NC_018592	ATTGAT	2	12	228122	228133	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404409459
79	NC_018592	CAGAAC	2	12	229147	229158	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404409460
80	NC_018592	TTTACC	2	12	242925	242936	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404409462
81	NC_018592	AGTAAA	2	12	250181	250192	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404409469
82	NC_018592	AAAGGA	2	12	253441	253452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404409472
83	NC_018592	ACAGTA	2	12	257608	257619	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404409478
84	NC_018592	AAAACA	2	12	257983	257994	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404409479
85	NC_018592	GCATGG	2	12	258164	258175	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404409479
86	NC_018592	CTGTAG	2	12	261108	261119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404409484
87	NC_018592	GACAAT	2	12	262926	262937	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404409487
88	NC_018592	AAGAAA	2	12	265509	265520	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404409488
89	NC_018592	TACACT	2	12	269753	269764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409489
90	NC_018592	TTCGTG	2	12	271265	271276	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404409489
91	NC_018592	CCAAAT	2	12	277253	277264	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	404409493
92	NC_018592	GAATTA	2	12	279861	279872	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404409495
93	NC_018592	CGAAAT	2	12	284161	284172	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404409499
94	NC_018592	TCTTTT	2	12	287124	287135	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404409501
95	NC_018592	AGTTCA	2	12	289388	289399	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404409503
96	NC_018592	ATCAAT	2	12	289531	289542	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404409503
97	NC_018592	ATGAAA	2	12	289889	289900	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404409504
98	NC_018592	CTTTTA	2	12	291762	291773	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404409506
99	NC_018592	TAGAAA	2	12	292708	292719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404409507
100	NC_018592	ACGTTG	2	12	294639	294650	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404409509
101	NC_018592	GAAAAC	2	12	296546	296557	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404409510
102	NC_018592	TCAATT	2	12	298381	298392	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404409512
103	NC_018592	GCTGCG	2	12	304633	304644	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	404409522
104	NC_018592	TTTTGA	2	12	305033	305044	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404409522
105	NC_018592	AAATAA	2	12	308340	308351	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404409525
106	NC_018592	GAAGGG	2	12	310137	310148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404409526
107	NC_018592	GATTCA	2	12	313781	313792	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404409529
108	NC_018592	GCAATT	2	12	313811	313822	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404409529
109	NC_018592	TCTTTA	2	12	317562	317573	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404409534
110	NC_018592	AGTAAC	2	12	318708	318719	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404409535
111	NC_018592	TCATAA	2	12	319942	319953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404409535
112	NC_018592	TTTTCA	2	12	324597	324608	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404409539
113	NC_018592	GAACCA	2	12	329127	329138	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404409543
114	NC_018592	TCCATT	2	12	331735	331746	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404409546
115	NC_018592	GTAGAT	2	12	336922	336933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409552
116	NC_018592	TTTTAC	2	12	340081	340092	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404409555
117	NC_018592	ATTATA	2	12	340226	340237	50 %	50 %	0 %	0 %	404409555
118	NC_018592	TAGTAT	2	12	340472	340483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404409555
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229	NC_018592	TATTTT	2	12	659843	659854	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404409871
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232	NC_018592	TATCGT	2	12	666004	666015	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404409878
233	NC_018592	TAAAAA	2	12	673040	673051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404409886
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457	NC_018592	GGACAA	2	12	1398197	1398208	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404410670
458	NC_018592	CGATTG	2	12	1400929	1400940	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404410672
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