MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2372

Total Repeats: 1067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018588	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404282436
2	NC_018588	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404282437
3	NC_018588	TTATTT	2	12	10918	10929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404282438
4	NC_018588	CACATT	2	12	11199	11210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404282438
5	NC_018588	ATTTTC	2	12	19878	19889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404282445
6	NC_018588	CTTCAT	2	12	20895	20906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404282447
7	NC_018588	TTTTGG	2	12	21259	21270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404282447
8	NC_018588	AGTTGC	2	12	23648	23659	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404282449
9	NC_018588	TAAAGC	2	12	23701	23712	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404282449
10	NC_018588	ATTGAA	2	12	24908	24919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404282450
11	NC_018588	TCGATT	2	12	32437	32448	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404282459
12	NC_018588	TCACCA	2	12	32719	32730	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404282460
13	NC_018588	CGATTA	2	12	38149	38160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404282464
14	NC_018588	TTATGT	2	12	42635	42646	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404282467
15	NC_018588	AAAGAT	2	12	46288	46299	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404282470
16	NC_018588	TGAAAT	2	12	47125	47136	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404282471
17	NC_018588	TGGCGG	2	12	50260	50271	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404282475
18	NC_018588	TCAAAA	2	12	50380	50391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404282475
19	NC_018588	ACAGTG	2	12	51964	51975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404282478
20	NC_018588	AAAAAT	2	12	52828	52839	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404282480
21	NC_018588	TTTATA	2	12	55306	55317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404282482
22	NC_018588	GCAGAA	2	12	56753	56764	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404282482
23	NC_018588	AGGTAA	2	12	56844	56855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404282483
24	NC_018588	TGATCG	2	12	58232	58243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404282484
25	NC_018588	TGATTT	2	12	63577	63588	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404282488
26	NC_018588	TTTTGC	2	12	64182	64193	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404282489
27	NC_018588	GATACA	2	12	75076	75087	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404282498
28	NC_018588	TAAATT	2	12	76948	76959	50 %	50 %	0 %	0 %	404282501
29	NC_018588	TGATAT	2	12	85327	85338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404282511
30	NC_018588	ATCACT	2	12	89486	89497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404282515
31	NC_018588	AAACAC	2	12	89919	89930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404282515
32	NC_018588	AAGATA	2	12	92918	92929	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404282515
33	NC_018588	TATAAA	2	12	95136	95147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404282516
34	NC_018588	TATTAG	2	12	105367	105378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404282526
35	NC_018588	TAAAAT	2	12	115201	115212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404282537
36	NC_018588	CAAAAT	2	12	115342	115353	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404282537
37	NC_018588	GTCCGC	2	12	115474	115485	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	404282537
38	NC_018588	GTTTTA	2	12	122110	122121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404282545
39	NC_018588	TGATTT	2	12	124124	124135	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404282549
40	NC_018588	AAGTAA	2	12	128095	128106	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404282552
41	NC_018588	ATCTGT	2	12	132253	132264	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404282559
42	NC_018588	TCTATT	2	12	134192	134203	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404282561
43	NC_018588	GATATT	2	12	144220	144231	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404282573
44	NC_018588	TCTGAA	2	12	145456	145467	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404282576
45	NC_018588	GTTGCA	2	12	152291	152302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404282586
46	NC_018588	GATTGC	2	12	152353	152364	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404282586
47	NC_018588	TTAAAA	2	12	153026	153037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404282587
48	NC_018588	GGCGGT	2	12	158003	158014	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404282590
49	NC_018588	CGAATT	2	12	160936	160947	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404282591
50	NC_018588	GTAAAA	2	12	164088	164099	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404282594
51	NC_018588	TTTTAC	2	12	166135	166146	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404282598
52	NC_018588	TTTTTA	2	12	167173	167184	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404282600
53	NC_018588	AAAGTG	2	12	168385	168396	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404282601
54	NC_018588	TACTAG	2	12	173392	173403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404282606
55	NC_018588	AAGCGA	2	12	175896	175907	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404282608
56	NC_018588	CAATCC	2	12	179211	179222	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404282610
57	NC_018588	AAAGAT	2	12	181221	181232	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404282612
58	NC_018588	ATGGCT	2	12	182346	182357	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404282613
59	NC_018588	CAGAAA	2	12	183020	183031	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404282613
60	NC_018588	AAAAGA	2	12	183096	183107	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404282613
61	NC_018588	AAAAAC	2	12	183426	183437	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404282613
62	NC_018588	TGAAGT	2	12	185466	185477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404282613
63	NC_018588	CATTGA	2	12	193600	193611	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404282620
64	NC_018588	TGCAGC	2	12	194255	194266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404282621
65	NC_018588	TAAAAA	2	12	196493	196504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404282623
66	NC_018588	TTCTTT	2	12	214503	214514	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404282641
67	NC_018588	GAAAAA	2	12	216593	216604	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404282643
68	NC_018588	AGGAAA	2	12	216912	216923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404282643
69	NC_018588	GAAAAA	2	12	217818	217829	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404282645
70	NC_018588	AAGGAG	2	12	221755	221766	50 %	0 %	50 %	0 %	404282646
71	NC_018588	GCAAGT	2	12	223645	223656	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404282648
72	NC_018588	TTAAAG	2	12	225588	225599	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404282650
73	NC_018588	TGTCGG	2	12	227564	227575	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404282651
74	NC_018588	TCTCCA	2	12	231431	231442	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	404282654
75	NC_018588	GGTTTT	2	12	233143	233154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404282656
76	NC_018588	ATTGAT	2	12	234090	234101	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404282658
77	NC_018588	AGAACC	2	12	235116	235127	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404282659
78	NC_018588	TTTACC	2	12	248891	248902	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404282661
79	NC_018588	AGTAAA	2	12	256148	256159	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404282667
80	NC_018588	AAAGGT	2	12	258274	258285	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404282669
81	NC_018588	ACAGTA	2	12	263575	263586	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404282676
82	NC_018588	AAAACA	2	12	263950	263961	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404282677
83	NC_018588	GCATGG	2	12	264131	264142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404282677
84	NC_018588	CTGTAG	2	12	267075	267086	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404282682
85	NC_018588	GACAAT	2	12	271444	271455	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404282688
86	NC_018588	AAGAAA	2	12	274028	274039	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404282689
87	NC_018588	TACACT	2	12	278272	278283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404282690
88	NC_018588	TTCGTG	2	12	279784	279795	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404282690
89	NC_018588	GAATTA	2	12	286469	286480	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404282695
90	NC_018588	CGAAAT	2	12	290768	290779	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404282699
91	NC_018588	TCTTTT	2	12	293731	293742	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404282701
92	NC_018588	ATCAAT	2	12	296138	296149	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404282703
93	NC_018588	ATGAAA	2	12	296496	296507	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404282704
94	NC_018588	CTTTTA	2	12	298369	298380	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404282706
95	NC_018588	TAGAAA	2	12	299315	299326	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404282707
96	NC_018588	ACGTTG	2	12	301246	301257	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404282709
97	NC_018588	GAAAAC	2	12	303153	303164	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404282710
98	NC_018588	GCTGCG	2	12	308526	308537	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	404282717
99	NC_018588	TTTTGA	2	12	308926	308937	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404282717
100	NC_018588	AAATAA	2	12	312233	312244	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404282720
101	NC_018588	GAAGGG	2	12	314030	314041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404282721
102	NC_018588	GATTCA	2	12	317673	317684	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404282724
103	NC_018588	GCAATT	2	12	317703	317714	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404282724
104	NC_018588	GAACCA	2	12	324494	324505	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404282730
105	NC_018588	TCCATT	2	12	327102	327113	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404282733
106	NC_018588	CTTTTT	2	12	331361	331372	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404282738
107	NC_018588	GTAGAT	2	12	332268	332279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404282739
108	NC_018588	TATCTG	2	12	337302	337313	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404282744
109	NC_018588	ATATGA	2	12	338453	338464	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404282745
110	NC_018588	TGCGGG	2	12	339960	339971	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404282746
111	NC_018588	GGACAT	2	12	343816	343827	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404282751
112	NC_018588	TATATT	2	12	348834	348845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404282756
113	NC_018588	AGAAAA	2	12	350170	350181	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404282757
114	NC_018588	TGAAAC	2	12	351568	351579	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404282759
115	NC_018588	CAAGAA	2	12	355981	355992	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404282760
116	NC_018588	TAGATT	2	12	357940	357951	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404282761
117	NC_018588	TGCAGA	2	12	362243	362254	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404282763
118	NC_018588	GAGAAA	2	12	362931	362942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404282763
119	NC_018588	AAGCAA	2	12	364675	364686	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404282763
120	NC_018588	CATTAA	2	12	372743	372754	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404282775
121	NC_018588	ACCAAA	2	12	374355	374366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404282777
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455	NC_018588	ATTTAG	2	12	1397352	1397363	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404283842
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