MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2755

Total Repeats: 1060

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018587	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404279557
2	NC_018587	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404279558
3	NC_018587	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404279558
4	NC_018587	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404279558
5	NC_018587	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404279559
6	NC_018587	ATTTTC	2	12	19877	19888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404279567
7	NC_018587	CTTCAT	2	12	20895	20906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404279569
8	NC_018587	TTTTGG	2	12	21259	21270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404279569
9	NC_018587	ATTGAA	2	12	24908	24919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404279572
10	NC_018587	CCAAAA	2	12	35059	35070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404279584
11	NC_018587	AATTAT	2	12	35673	35684	50 %	50 %	0 %	0 %	404279585
12	NC_018587	TCACCA	2	12	36820	36831	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404279587
13	NC_018587	CGATTA	2	12	42250	42261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404279591
14	NC_018587	TTATGT	2	12	46741	46752	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404279594
15	NC_018587	AAAGAT	2	12	50393	50404	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279597
16	NC_018587	TGAAAT	2	12	51230	51241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404279598
17	NC_018587	TGGCGG	2	12	54362	54373	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404279602
18	NC_018587	TCAAAA	2	12	54482	54493	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404279602
19	NC_018587	AAAAAT	2	12	56929	56940	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404279607
20	NC_018587	GCAGAA	2	12	60854	60865	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404279609
21	NC_018587	AGGTAA	2	12	60945	60956	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404279610
22	NC_018587	TGATTG	2	12	62333	62344	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404279611
23	NC_018587	TGATTT	2	12	67664	67675	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404279616
24	NC_018587	TTTTGC	2	12	68269	68280	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404279617
25	NC_018587	AAGTAA	2	12	74988	74999	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279621
26	NC_018587	CAAACG	2	12	75963	75974	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404279623
27	NC_018587	TTGGAT	2	12	76818	76829	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404279623
28	NC_018587	AAAATA	2	12	80581	80592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404279630
29	NC_018587	CTTTTT	2	12	91373	91384	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404279642
30	NC_018587	ATCACT	2	12	94433	94444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404279645
31	NC_018587	GATATT	2	12	94492	94503	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404279645
32	NC_018587	CAGATT	2	12	98009	98020	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404279645
33	NC_018587	AACTAT	2	12	100785	100796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404279646
34	NC_018587	AACCAG	2	12	106023	106034	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404279651
35	NC_018587	TATTAG	2	12	110316	110327	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404279656
36	NC_018587	TAGCAG	2	12	110379	110390	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404279656
37	NC_018587	ATTACA	2	12	116428	116439	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404279664
38	NC_018587	TAAAAT	2	12	123543	123554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404279672
39	NC_018587	CAAAAT	2	12	123684	123695	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404279672
40	NC_018587	CAAGCG	2	12	124685	124696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404279672
41	NC_018587	GTTTTA	2	12	130451	130462	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404279680
42	NC_018587	TGATTT	2	12	132467	132478	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404279684
43	NC_018587	AAGTAA	2	12	136438	136449	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279687
44	NC_018587	CCGTTA	2	12	139945	139956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404279694
45	NC_018587	CAACTG	2	12	149692	149703	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404279703
46	NC_018587	GAATAA	2	12	151784	151795	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279705
47	NC_018587	GTTGCA	2	12	156043	156054	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404279710
48	NC_018587	GATTGC	2	12	156105	156116	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404279710
49	NC_018587	AGGCGG	2	12	161753	161764	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	404279714
50	NC_018587	CGTAAC	2	12	164589	164600	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404279715
51	NC_018587	AGTACC	2	12	164634	164645	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404279715
52	NC_018587	GTTTTC	2	12	165610	165621	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404279716
53	NC_018587	GTTGAT	2	12	167226	167237	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404279718
54	NC_018587	GTAAAA	2	12	167589	167600	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279718
55	NC_018587	TTTTAC	2	12	169633	169644	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404279722
56	NC_018587	TTTTTA	2	12	170670	170681	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404279724
57	NC_018587	GCATTA	2	12	170900	170911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404279724
58	NC_018587	AAAGTA	2	12	171882	171893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279725
59	NC_018587	TTGCAC	2	12	174776	174787	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404279727
60	NC_018587	AGAAGT	2	12	176924	176935	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404279728
61	NC_018587	CAATCC	2	12	178839	178850	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404279730
62	NC_018587	AAAGAT	2	12	180850	180861	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279732
63	NC_018587	TGAAGT	2	12	185095	185106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404279733
64	NC_018587	CATTGA	2	12	193216	193227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404279740
65	NC_018587	TGCAGC	2	12	193871	193882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404279741
66	NC_018587	TAAAAA	2	12	196109	196120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404279743
67	NC_018587	AAAGCA	2	12	209325	209336	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404279755
68	NC_018587	TTCTTT	2	12	214129	214140	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404279760
69	NC_018587	GAAAAA	2	12	216218	216229	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404279762
70	NC_018587	GAAAAA	2	12	217442	217453	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404279764
71	NC_018587	GCAAGT	2	12	223269	223280	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404279767
72	NC_018587	TGTCGG	2	12	227189	227200	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404279770
73	NC_018587	AAAAAC	2	12	228674	228685	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404279771
74	NC_018587	GCAGAA	2	12	230218	230229	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404279772
75	NC_018587	TAAAAT	2	12	233530	233541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404279776
76	NC_018587	CCAGAA	2	12	234743	234754	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404279777
77	NC_018587	TTTACC	2	12	248517	248528	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404279779
78	NC_018587	AGTAAA	2	12	255774	255785	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279785
79	NC_018587	GTACGT	2	12	256580	256591	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404279787
80	NC_018587	AAGTCG	2	12	261849	261860	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404279792
81	NC_018587	ACAGTA	2	12	263202	263213	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404279794
82	NC_018587	AAAACA	2	12	263577	263588	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404279795
83	NC_018587	GCATGG	2	12	263758	263769	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404279795
84	NC_018587	CTGTAG	2	12	266702	266713	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404279800
85	NC_018587	GACAAT	2	12	268214	268225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404279802
86	NC_018587	GTGAGC	2	12	268669	268680	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404279802
87	NC_018587	ATTGAT	2	12	268863	268874	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404279802
88	NC_018587	TAAAAA	2	12	269932	269943	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404279803
89	NC_018587	TGAATC	2	12	270717	270728	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404279804
90	NC_018587	GCTACT	2	12	272409	272420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404279805
91	NC_018587	TTCTGA	2	12	275483	275494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404279807
92	NC_018587	AAGAAA	2	12	278699	278710	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404279810
93	NC_018587	TTCGTG	2	12	284455	284466	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404279811
94	NC_018587	TAACAA	2	12	287761	287772	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404279814
95	NC_018587	TTTAAC	2	12	288834	288845	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404279815
96	NC_018587	GTTGAG	2	12	290688	290699	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	404279816
97	NC_018587	ATTTTT	2	12	290961	290972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404279816
98	NC_018587	TTTATA	2	12	291504	291515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404279817
99	NC_018587	CCAAAT	2	12	293493	293504	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	404279818
100	NC_018587	AGAACT	2	12	296103	296114	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404279820
101	NC_018587	TACAAG	2	12	300347	300358	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404279824
102	NC_018587	CGAAAT	2	12	300401	300412	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404279824
103	NC_018587	CATTAT	2	12	304131	304142	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404279827
104	NC_018587	TCTTTT	2	12	304592	304603	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404279827
105	NC_018587	ATCAAT	2	12	306999	307010	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404279829
106	NC_018587	ATGAAA	2	12	307357	307368	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279830
107	NC_018587	GCTTTT	2	12	308700	308711	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404279832
108	NC_018587	CTTTTA	2	12	309229	309240	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404279832
109	NC_018587	TAGAAA	2	12	310175	310186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279833
110	NC_018587	ACGTTG	2	12	312103	312114	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404279836
111	NC_018587	GAAAAC	2	12	314010	314021	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404279837
112	NC_018587	TTTTGA	2	12	319672	319683	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404279844
113	NC_018587	GAAGGG	2	12	324774	324785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404279848
114	NC_018587	AGAACC	2	12	327808	327819	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404279851
115	NC_018587	GATTCA	2	12	328415	328426	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404279851
116	NC_018587	GCAATT	2	12	328445	328456	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404279851
117	NC_018587	AATTAT	2	12	333726	333737	50 %	50 %	0 %	0 %	404279856
118	NC_018587	AAATAG	2	12	334279	334290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279857
119	NC_018587	TATTAG	2	12	335816	335827	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404279858
120	NC_018587	CAATTA	2	12	336391	336402	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404279858
121	NC_018587	TCTGTT	2	12	338215	338226	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404279860
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223	NC_018587	GGTCCA	2	12	651287	651298	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404280166
224	NC_018587	AGATGC	2	12	653289	653300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404280167
225	NC_018587	GTCAAA	2	12	656436	656447	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404280170
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228	NC_018587	TGCTGG	2	12	657186	657197	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404280171
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