MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2540

Total Repeats: 1077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018586	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405754084
2	NC_018586	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405754085
3	NC_018586	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405754085
4	NC_018586	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405754085
5	NC_018586	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405754086
6	NC_018586	ATTTTC	2	12	19877	19888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405754094
7	NC_018586	CTTCAT	2	12	20895	20906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405754096
8	NC_018586	TTTTGG	2	12	21259	21270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405754096
9	NC_018586	ATTGAA	2	12	24908	24919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405754099
10	NC_018586	CCAAAA	2	12	35061	35072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405754112
11	NC_018586	AATTAT	2	12	35675	35686	50 %	50 %	0 %	0 %	405754113
12	NC_018586	TCACCA	2	12	36822	36833	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405754115
13	NC_018586	CGATTA	2	12	42252	42263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754119
14	NC_018586	TTATGT	2	12	46744	46755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405754122
15	NC_018586	AAAGAT	2	12	50396	50407	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754125
16	NC_018586	TGAAAT	2	12	51233	51244	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405754126
17	NC_018586	TGGCGG	2	12	54365	54376	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	405754130
18	NC_018586	TCAAAA	2	12	54485	54496	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405754130
19	NC_018586	AAAAAT	2	12	56947	56958	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405754135
20	NC_018586	GCAGAA	2	12	60872	60883	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405754137
21	NC_018586	AGGTAA	2	12	60963	60974	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405754138
22	NC_018586	TGATTG	2	12	62351	62362	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405754139
23	NC_018586	TGATTT	2	12	67682	67693	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405754144
24	NC_018586	TTTTGC	2	12	68287	68298	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405754145
25	NC_018586	AAATAA	2	12	78235	78246	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405754154
26	NC_018586	TAAATT	2	12	81387	81398	50 %	50 %	0 %	0 %	405754158
27	NC_018586	TGATAT	2	12	89768	89779	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405754169
28	NC_018586	CTTTTT	2	12	90866	90877	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405754170
29	NC_018586	ATCACT	2	12	93926	93937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405754173
30	NC_018586	GATATT	2	12	93985	93996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405754173
31	NC_018586	CAGATT	2	12	97502	97513	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754173
32	NC_018586	AACTAT	2	12	100278	100289	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405754174
33	NC_018586	AACCAG	2	12	105516	105527	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405754179
34	NC_018586	TATTAG	2	12	109809	109820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405754184
35	NC_018586	TAGCAG	2	12	109872	109883	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405754184
36	NC_018586	ATTACA	2	12	115933	115944	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405754192
37	NC_018586	TAAAAT	2	12	119657	119668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405754195
38	NC_018586	CAAAAT	2	12	119798	119809	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405754195
39	NC_018586	CAAGCG	2	12	120799	120810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405754195
40	NC_018586	TGATTT	2	12	128581	128592	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405754207
41	NC_018586	AAGTAA	2	12	132552	132563	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754210
42	NC_018586	CCGTTA	2	12	136059	136070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405754217
43	NC_018586	CAACTG	2	12	145806	145817	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405754227
44	NC_018586	TCTGAA	2	12	148788	148799	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754232
45	NC_018586	GTTGCA	2	12	154535	154546	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405754240
46	NC_018586	GATTGC	2	12	154597	154608	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405754240
47	NC_018586	AGGCGG	2	12	160246	160257	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	405754244
48	NC_018586	CGTAAC	2	12	162785	162796	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405754245
49	NC_018586	AGTACC	2	12	162830	162841	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405754245
50	NC_018586	GTTTTC	2	12	163806	163817	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405754246
51	NC_018586	GTTGAT	2	12	165422	165433	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405754248
52	NC_018586	GTAAAA	2	12	165785	165796	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754248
53	NC_018586	TTTTAC	2	12	167829	167840	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405754252
54	NC_018586	TTTTTA	2	12	168866	168877	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405754254
55	NC_018586	GCATTA	2	12	169096	169107	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754254
56	NC_018586	AAAGTA	2	12	170078	170089	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754255
57	NC_018586	TTGCAC	2	12	172972	172983	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405754257
58	NC_018586	AGAAGT	2	12	175120	175131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405754258
59	NC_018586	CAATCC	2	12	177036	177047	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405754260
60	NC_018586	AAAGAT	2	12	179047	179058	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754262
61	NC_018586	TGAAGT	2	12	183292	183303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754263
62	NC_018586	CATTGA	2	12	191403	191414	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754271
63	NC_018586	TGCAGC	2	12	192058	192069	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405754272
64	NC_018586	TAAAAA	2	12	194296	194307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405754274
65	NC_018586	AAAGCA	2	12	207512	207523	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405754286
66	NC_018586	TTCTTT	2	12	212211	212222	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405754292
67	NC_018586	GAAAAA	2	12	214300	214311	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405754294
68	NC_018586	GAAAAA	2	12	215524	215535	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405754296
69	NC_018586	GCAAGT	2	12	221351	221362	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405754299
70	NC_018586	TGTCGG	2	12	225271	225282	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	405754302
71	NC_018586	AAAAAC	2	12	226768	226779	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405754303
72	NC_018586	GCAGAA	2	12	228312	228323	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405754304
73	NC_018586	TAAAAT	2	12	231619	231630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405754311
74	NC_018586	CCAGAA	2	12	232832	232843	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405754312
75	NC_018586	TTTACC	2	12	246607	246618	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405754314
76	NC_018586	AGTAAA	2	12	253864	253875	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754320
77	NC_018586	AAGTCG	2	12	259939	259950	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405754327
78	NC_018586	ACAGTA	2	12	261292	261303	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405754329
79	NC_018586	AAAACA	2	12	261667	261678	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405754330
80	NC_018586	GCATGG	2	12	261848	261859	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405754330
81	NC_018586	CTGTAG	2	12	264792	264803	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405754335
82	NC_018586	GACAAT	2	12	266303	266314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405754337
83	NC_018586	GTGAGC	2	12	266758	266769	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405754337
84	NC_018586	ATTGAT	2	12	266952	266963	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405754337
85	NC_018586	TAAAAA	2	12	268022	268033	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405754338
86	NC_018586	TGAATC	2	12	268807	268818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754339
87	NC_018586	GCTACT	2	12	270499	270510	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405754340
88	NC_018586	TTCTGA	2	12	273573	273584	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405754342
89	NC_018586	AAGAAA	2	12	276789	276800	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405754345
90	NC_018586	TTCGTG	2	12	282545	282556	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	405754346
91	NC_018586	TAACAA	2	12	285851	285862	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405754349
92	NC_018586	TTTAAC	2	12	286924	286935	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405754350
93	NC_018586	GTTGAG	2	12	288778	288789	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	405754351
94	NC_018586	ATTTTT	2	12	289051	289062	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405754351
95	NC_018586	TTTATA	2	12	289595	289606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754352
96	NC_018586	CCAAAT	2	12	291584	291595	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	405754353
97	NC_018586	AGAACT	2	12	294199	294210	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405754355
98	NC_018586	TACAAG	2	12	298443	298454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405754359
99	NC_018586	CGAAAT	2	12	298497	298508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405754359
100	NC_018586	CATTAT	2	12	302227	302238	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405754362
101	NC_018586	TCTTTT	2	12	302688	302699	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405754362
102	NC_018586	ATCAAT	2	12	305095	305106	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405754364
103	NC_018586	ATGAAA	2	12	305453	305464	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754365
104	NC_018586	GCTTTT	2	12	306796	306807	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405754367
105	NC_018586	CTTTTA	2	12	307325	307336	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405754367
106	NC_018586	TAGAAA	2	12	308271	308282	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754368
107	NC_018586	ACGTTG	2	12	310200	310211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405754370
108	NC_018586	GAAAAC	2	12	312107	312118	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405754371
109	NC_018586	TTTTGA	2	12	317769	317780	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405754378
110	NC_018586	GAAGGG	2	12	322871	322882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405754382
111	NC_018586	AGAACC	2	12	325905	325916	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405754385
112	NC_018586	GATTCA	2	12	326512	326523	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754385
113	NC_018586	GCAATT	2	12	326542	326553	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754385
114	NC_018586	GAACCA	2	12	333347	333358	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405754392
115	NC_018586	TCCATT	2	12	335955	335966	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405754395
116	NC_018586	TATAAT	2	12	337050	337061	50 %	50 %	0 %	0 %	405754397
117	NC_018586	TTCTAT	2	12	337191	337202	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405754397
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343	NC_018586	TTTTTA	2	12	1025198	1025209	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405755083
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345	NC_018586	AATTGC	2	12	1026346	1026357	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405755084
346	NC_018586	ATTATG	2	12	1034260	1034271	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405755093
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