MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes ATCC 19117

Total Repeats: 1078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018584	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405748340
2	NC_018584	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405748341
3	NC_018584	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405748341
4	NC_018584	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405748341
5	NC_018584	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405748342
6	NC_018584	AAAAGC	2	12	11269	11280	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405748343
7	NC_018584	AATTTA	2	12	16219	16230	50 %	50 %	0 %	0 %	405748348
8	NC_018584	CTTCAA	2	12	16606	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405748348
9	NC_018584	ATTTTC	2	12	21960	21971	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405748353
10	NC_018584	CTTCAT	2	12	22976	22987	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405748355
11	NC_018584	TTTTGG	2	12	23340	23351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405748355
12	NC_018584	ATTGAA	2	12	26989	27000	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405748358
13	NC_018584	CCAAAA	2	12	37141	37152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405748370
14	NC_018584	AATTAT	2	12	37755	37766	50 %	50 %	0 %	0 %	405748371
15	NC_018584	TCACCA	2	12	38901	38912	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405748373
16	NC_018584	CGATTA	2	12	44331	44342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748377
17	NC_018584	TTATGT	2	12	48823	48834	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405748380
18	NC_018584	AAAGAT	2	12	52475	52486	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748383
19	NC_018584	TGAAAT	2	12	53312	53323	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405748384
20	NC_018584	TGGCGG	2	12	56445	56456	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	405748388
21	NC_018584	TCAAAA	2	12	56565	56576	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405748388
22	NC_018584	AAAAAT	2	12	59012	59023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405748393
23	NC_018584	GCAGAA	2	12	62937	62948	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405748395
24	NC_018584	AGGTAA	2	12	63028	63039	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405748396
25	NC_018584	TGATTG	2	12	64416	64427	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405748397
26	NC_018584	TGATTT	2	12	69747	69758	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405748402
27	NC_018584	TTTTGC	2	12	70352	70363	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405748403
28	NC_018584	AAAATA	2	12	79384	79395	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405748412
29	NC_018584	CTTTTT	2	12	94918	94929	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405748432
30	NC_018584	ATCACT	2	12	97978	97989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405748435
31	NC_018584	GATATT	2	12	98037	98048	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405748435
32	NC_018584	CAGATT	2	12	101554	101565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748435
33	NC_018584	AACTAT	2	12	104330	104341	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405748436
34	NC_018584	AACCAG	2	12	109568	109579	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405748441
35	NC_018584	TATTAG	2	12	113861	113872	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405748446
36	NC_018584	TAGCAG	2	12	113924	113935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405748446
37	NC_018584	ATTACA	2	12	121592	121603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405748455
38	NC_018584	TAAAAT	2	12	125316	125327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405748459
39	NC_018584	CAAAAT	2	12	125457	125468	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405748459
40	NC_018584	CAAGCG	2	12	126458	126469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405748459
41	NC_018584	TGATTT	2	12	134240	134251	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405748471
42	NC_018584	AAGTAA	2	12	138211	138222	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748474
43	NC_018584	CCGTTA	2	12	141718	141729	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405748481
44	NC_018584	CAACTG	2	12	151465	151476	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405748490
45	NC_018584	TCTGAA	2	12	154447	154458	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748495
46	NC_018584	GTTGCA	2	12	160194	160205	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405748503
47	NC_018584	GATTGC	2	12	160256	160267	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405748503
48	NC_018584	AGGCGG	2	12	165904	165915	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	405748507
49	NC_018584	CGTAAC	2	12	168740	168751	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405748508
50	NC_018584	AGTACC	2	12	168785	168796	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405748508
51	NC_018584	GTTTTC	2	12	169771	169782	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405748509
52	NC_018584	GTTGAT	2	12	171387	171398	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405748511
53	NC_018584	GTAAAA	2	12	171750	171761	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748511
54	NC_018584	TTTTAC	2	12	173794	173805	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405748515
55	NC_018584	TTTTTA	2	12	174831	174842	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405748517
56	NC_018584	GCATTA	2	12	175061	175072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748517
57	NC_018584	AAAGTA	2	12	176043	176054	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748518
58	NC_018584	TTGCAC	2	12	178937	178948	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405748520
59	NC_018584	AGAAGT	2	12	181085	181096	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405748521
60	NC_018584	CAATCC	2	12	183002	183013	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405748523
61	NC_018584	AAAGAT	2	12	185013	185024	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748525
62	NC_018584	TGAAGT	2	12	189258	189269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405748526
63	NC_018584	CATTGA	2	12	197382	197393	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748533
64	NC_018584	TGCAGC	2	12	198037	198048	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405748534
65	NC_018584	TAAAAA	2	12	200275	200286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405748536
66	NC_018584	AAAGCA	2	12	213065	213076	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405748547
67	NC_018584	TTCTTT	2	12	217869	217880	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405748552
68	NC_018584	GAAAAA	2	12	219958	219969	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405748554
69	NC_018584	GAAAAA	2	12	221182	221193	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405748556
70	NC_018584	GCAAGT	2	12	227009	227020	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405748559
71	NC_018584	TGTCGG	2	12	230929	230940	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	405748562
72	NC_018584	AAAAAC	2	12	232402	232413	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405748563
73	NC_018584	GCAGAA	2	12	233946	233957	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405748564
74	NC_018584	TAAAAT	2	12	237258	237269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405748569
75	NC_018584	CCAGAA	2	12	238471	238482	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405748570
76	NC_018584	TTTACC	2	12	252245	252256	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405748572
77	NC_018584	AGTAAA	2	12	259502	259513	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748578
78	NC_018584	GTACGT	2	12	260308	260319	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405748580
79	NC_018584	ACAGTA	2	12	266931	266942	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405748587
80	NC_018584	AAAACA	2	12	267306	267317	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405748588
81	NC_018584	GCATGG	2	12	267487	267498	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405748588
82	NC_018584	CTGTAG	2	12	270431	270442	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405748593
83	NC_018584	GACAAT	2	12	271942	271953	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405748595
84	NC_018584	GTGAGC	2	12	272397	272408	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405748595
85	NC_018584	ATTGAT	2	12	272591	272602	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405748595
86	NC_018584	TAAAAA	2	12	273661	273672	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405748596
87	NC_018584	TGAATC	2	12	274446	274457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748597
88	NC_018584	GCTACT	2	12	276138	276149	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405748598
89	NC_018584	TTCTGA	2	12	279212	279223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405748600
90	NC_018584	AAGAAA	2	12	282428	282439	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405748603
91	NC_018584	TTCGTG	2	12	288184	288195	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	405748604
92	NC_018584	TAACAA	2	12	291490	291501	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405748607
93	NC_018584	TTTAAC	2	12	292563	292574	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405748608
94	NC_018584	GTTGAG	2	12	294417	294428	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	405748609
95	NC_018584	ATTTTT	2	12	294690	294701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405748609
96	NC_018584	TTTATA	2	12	295234	295245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405748610
97	NC_018584	CCAAAT	2	12	297223	297234	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	405748612
98	NC_018584	AGAACT	2	12	299836	299847	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405748615
99	NC_018584	TACAAG	2	12	304080	304091	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405748619
100	NC_018584	CGAAAT	2	12	304134	304145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405748619
101	NC_018584	CATTAT	2	12	307864	307875	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405748622
102	NC_018584	TCTTTT	2	12	308325	308336	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405748622
103	NC_018584	ATCAAT	2	12	310732	310743	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405748624
104	NC_018584	ATGAAA	2	12	311090	311101	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748625
105	NC_018584	GCTTTT	2	12	312433	312444	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405748627
106	NC_018584	CTTTTA	2	12	312962	312973	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405748627
107	NC_018584	TAGAAA	2	12	313908	313919	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748628
108	NC_018584	ACGTTG	2	12	315837	315848	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405748630
109	NC_018584	GAAAAC	2	12	317744	317755	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405748631
110	NC_018584	TTTTGA	2	12	323406	323417	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405748638
111	NC_018584	GAAGGG	2	12	328508	328519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405748642
112	NC_018584	AGAACC	2	12	331542	331553	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405748645
113	NC_018584	GATTCA	2	12	332149	332160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748645
114	NC_018584	GCAATT	2	12	332179	332190	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748645
115	NC_018584	TCTGTT	2	12	337089	337100	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405748650
116	NC_018584	GAACCA	2	12	338984	338995	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405748651
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228	NC_018584	GGTCCA	2	12	669112	669123	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405748973
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