MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 1252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018528	TGGAA	2	10	246	255	40 %	20 %	40 %	0 %	403514033
2	NC_018528	TATTT	2	10	3482	3491	20 %	80 %	0 %	0 %	403514036
3	NC_018528	ATGAA	2	10	4774	4783	60 %	20 %	20 %	0 %	403514037
4	NC_018528	AGAAT	2	10	4888	4897	60 %	20 %	20 %	0 %	403514037
5	NC_018528	TGGCT	2	10	12859	12868	0 %	40 %	40 %	20 %	403514044
6	NC_018528	CAAAT	2	10	13383	13392	60 %	20 %	0 %	20 %	403514045
7	NC_018528	AGCCA	2	10	15038	15047	40 %	0 %	20 %	40 %	403514046
8	NC_018528	ATATC	2	10	15956	15965	40 %	40 %	0 %	20 %	403514047
9	NC_018528	AAGGT	2	10	20799	20808	40 %	20 %	40 %	0 %	403514052
10	NC_018528	CATGA	2	10	24294	24303	40 %	20 %	20 %	20 %	403514057
11	NC_018528	AATCA	2	10	24693	24702	60 %	20 %	0 %	20 %	403514057
12	NC_018528	GCAAA	2	10	29530	29539	60 %	0 %	20 %	20 %	403514062
13	NC_018528	CAATA	2	10	31602	31611	60 %	20 %	0 %	20 %	403514064
14	NC_018528	TTTTA	2	10	32522	32531	20 %	80 %	0 %	0 %	403514065
15	NC_018528	AAAAT	2	10	32927	32936	80 %	20 %	0 %	0 %	403514066
16	NC_018528	AATTT	2	10	38653	38662	40 %	60 %	0 %	0 %	403514072
17	NC_018528	AATTT	2	10	38806	38815	40 %	60 %	0 %	0 %	403514072
18	NC_018528	ATATT	2	10	42805	42814	40 %	60 %	0 %	0 %	403514076
19	NC_018528	TGAAA	2	10	45674	45683	60 %	20 %	20 %	0 %	403514079
20	NC_018528	AAATT	2	10	46907	46916	60 %	40 %	0 %	0 %	403514081
21	NC_018528	ATATG	2	10	47124	47133	40 %	40 %	20 %	0 %	403514082
22	NC_018528	ACTAA	2	10	48319	48328	60 %	20 %	0 %	20 %	403514082
23	NC_018528	AAATA	2	10	48511	48520	80 %	20 %	0 %	0 %	403514082
24	NC_018528	AAGAT	2	10	49860	49869	60 %	20 %	20 %	0 %	403514084
25	NC_018528	CAATG	2	10	50238	50247	40 %	20 %	20 %	20 %	403514085
26	NC_018528	ACGCA	2	10	53754	53763	40 %	0 %	20 %	40 %	403514088
27	NC_018528	TAATT	2	10	54981	54990	40 %	60 %	0 %	0 %	403514089
28	NC_018528	AAAGG	2	10	57561	57570	60 %	0 %	40 %	0 %	403514093
29	NC_018528	GTTAA	2	10	59679	59688	40 %	40 %	20 %	0 %	403514095
30	NC_018528	ATTTA	2	10	60448	60457	40 %	60 %	0 %	0 %	403514096
31	NC_018528	TTTCA	2	10	63301	63310	20 %	60 %	0 %	20 %	403514100
32	NC_018528	GTGAA	2	10	63361	63370	40 %	20 %	40 %	0 %	403514100
33	NC_018528	AAATG	2	10	64284	64293	60 %	20 %	20 %	0 %	403514101
34	NC_018528	AAAAG	2	10	64701	64710	80 %	0 %	20 %	0 %	403514101
35	NC_018528	AAGAT	2	10	68825	68834	60 %	20 %	20 %	0 %	403514103
36	NC_018528	GCTCT	2	10	70781	70790	0 %	40 %	20 %	40 %	403514104
37	NC_018528	TTCAG	2	10	71294	71303	20 %	40 %	20 %	20 %	403514104
38	NC_018528	AAGCA	2	10	71977	71986	60 %	0 %	20 %	20 %	403514105
39	NC_018528	GAGAA	2	10	74416	74425	60 %	0 %	40 %	0 %	403514106
40	NC_018528	TTTGC	2	10	81297	81306	0 %	60 %	20 %	20 %	403514110
41	NC_018528	AGCAT	2	10	81701	81710	40 %	20 %	20 %	20 %	403514110
42	NC_018528	TTTTC	2	10	81953	81962	0 %	80 %	0 %	20 %	403514111
43	NC_018528	AAAGA	2	10	82119	82128	80 %	0 %	20 %	0 %	403514111
44	NC_018528	ATTGA	2	10	83740	83749	40 %	40 %	20 %	0 %	403514112
45	NC_018528	ATTTA	2	10	87854	87863	40 %	60 %	0 %	0 %	403514118
46	NC_018528	AAAAG	2	10	95255	95264	80 %	0 %	20 %	0 %	403514124
47	NC_018528	CAATA	2	10	96412	96421	60 %	20 %	0 %	20 %	403514125
48	NC_018528	TTTTA	2	10	97333	97342	20 %	80 %	0 %	0 %	403514127
49	NC_018528	ACAAA	2	10	98929	98938	80 %	0 %	0 %	20 %	403514129
50	NC_018528	TAAAG	2	10	101808	101817	60 %	20 %	20 %	0 %	403514132
51	NC_018528	ACGGC	2	10	102260	102269	20 %	0 %	40 %	40 %	403514132
52	NC_018528	TTTGT	2	10	103008	103017	0 %	80 %	20 %	0 %	403514133
53	NC_018528	ACAAA	2	10	104224	104233	80 %	0 %	0 %	20 %	403514134
54	NC_018528	ATGCC	2	10	105300	105309	20 %	20 %	20 %	40 %	403514135
55	NC_018528	AACTT	2	10	105838	105847	40 %	40 %	0 %	20 %	403514136
56	NC_018528	AACCA	2	10	111782	111791	60 %	0 %	0 %	40 %	403514144
57	NC_018528	GAAAA	2	10	112976	112985	80 %	0 %	20 %	0 %	403514146
58	NC_018528	ATTTT	2	10	113230	113239	20 %	80 %	0 %	0 %	403514147
59	NC_018528	ATGCC	2	10	113417	113426	20 %	20 %	20 %	40 %	403514147
60	NC_018528	TAATT	2	10	113967	113976	40 %	60 %	0 %	0 %	403514147
61	NC_018528	AAGCA	2	10	115202	115211	60 %	0 %	20 %	20 %	403514148
62	NC_018528	ATTAA	2	10	116804	116813	60 %	40 %	0 %	0 %	403514150
63	NC_018528	TTTTC	2	10	120387	120396	0 %	80 %	0 %	20 %	403514153
64	NC_018528	TTAAT	2	10	121147	121156	40 %	60 %	0 %	0 %	403514155
65	NC_018528	AATTT	2	10	121455	121464	40 %	60 %	0 %	0 %	403514155
66	NC_018528	TTAGG	2	10	123713	123722	20 %	40 %	40 %	0 %	403514160
67	NC_018528	TTTCA	2	10	126410	126419	20 %	60 %	0 %	20 %	403514163
68	NC_018528	CAAAA	2	10	126500	126509	80 %	0 %	0 %	20 %	403514163
69	NC_018528	TGATT	2	10	128021	128030	20 %	60 %	20 %	0 %	403514165
70	NC_018528	TTCAT	2	10	128227	128236	20 %	60 %	0 %	20 %	403514165
71	NC_018528	TGCTT	2	10	129004	129013	0 %	60 %	20 %	20 %	403514166
72	NC_018528	ATGGA	2	10	132905	132914	40 %	20 %	40 %	0 %	403514171
73	NC_018528	GCAAC	2	10	133172	133181	40 %	0 %	20 %	40 %	403514171
74	NC_018528	ATTTT	2	10	136874	136883	20 %	80 %	0 %	0 %	403514174
75	NC_018528	TAATT	2	10	138352	138361	40 %	60 %	0 %	0 %	403514175
76	NC_018528	TCAAA	2	10	139604	139613	60 %	20 %	0 %	20 %	403514176
77	NC_018528	GAAAT	2	10	140758	140767	60 %	20 %	20 %	0 %	403514177
78	NC_018528	CAATT	2	10	142587	142596	40 %	40 %	0 %	20 %	403514179
79	NC_018528	TGATC	2	10	144029	144038	20 %	40 %	20 %	20 %	403514181
80	NC_018528	AGCTT	2	10	145175	145184	20 %	40 %	20 %	20 %	403514181
81	NC_018528	GAAGT	2	10	147516	147525	40 %	20 %	40 %	0 %	403514183
82	NC_018528	TTGGT	2	10	152692	152701	0 %	60 %	40 %	0 %	403514189
83	NC_018528	CAAGA	2	10	153665	153674	60 %	0 %	20 %	20 %	403514190
84	NC_018528	TAATT	2	10	157588	157597	40 %	60 %	0 %	0 %	403514192
85	NC_018528	TATGG	2	10	157689	157698	20 %	40 %	40 %	0 %	403514193
86	NC_018528	GATAA	2	10	162562	162571	60 %	20 %	20 %	0 %	403514196
87	NC_018528	ATTTC	2	10	163825	163834	20 %	60 %	0 %	20 %	403514197
88	NC_018528	TTGGA	2	10	164149	164158	20 %	40 %	40 %	0 %	403514198
89	NC_018528	CATTA	2	10	164968	164977	40 %	40 %	0 %	20 %	403514198
90	NC_018528	ACTTT	2	10	165732	165741	20 %	60 %	0 %	20 %	403514199
91	NC_018528	CATAA	2	10	170889	170898	60 %	20 %	0 %	20 %	403514202
92	NC_018528	TTCTT	2	10	171668	171677	0 %	80 %	0 %	20 %	403514203
93	NC_018528	GCAAT	2	10	174620	174629	40 %	20 %	20 %	20 %	403514207
94	NC_018528	GGCAA	2	10	175004	175013	40 %	0 %	40 %	20 %	403514207
95	NC_018528	GCTTG	2	10	177704	177713	0 %	40 %	40 %	20 %	403514211
96	NC_018528	ATCTA	2	10	179855	179864	40 %	40 %	0 %	20 %	403514213
97	NC_018528	AAAAG	2	10	181124	181133	80 %	0 %	20 %	0 %	403514213
98	NC_018528	GGTTG	2	10	186772	186781	0 %	40 %	60 %	0 %	403514221
99	NC_018528	TAATT	2	10	187399	187408	40 %	60 %	0 %	0 %	403514221
100	NC_018528	GCCAA	2	10	188127	188136	40 %	0 %	20 %	40 %	403514222
101	NC_018528	AATTG	2	10	190396	190405	40 %	40 %	20 %	0 %	403514224
102	NC_018528	CAAAG	2	10	190708	190717	60 %	0 %	20 %	20 %	403514225
103	NC_018528	ATATG	2	10	195236	195245	40 %	40 %	20 %	0 %	403514227
104	NC_018528	ATGGA	2	10	195598	195607	40 %	20 %	40 %	0 %	403514228
105	NC_018528	TTCAC	2	10	197173	197182	20 %	40 %	0 %	40 %	403514229
106	NC_018528	TACTT	2	10	197843	197852	20 %	60 %	0 %	20 %	403514229
107	NC_018528	TTGTT	2	10	200162	200171	0 %	80 %	20 %	0 %	403514230
108	NC_018528	TTCAA	2	10	202399	202408	40 %	40 %	0 %	20 %	403514232
109	NC_018528	GCTTG	2	10	203049	203058	0 %	40 %	40 %	20 %	403514232
110	NC_018528	TTAAA	2	10	205127	205136	60 %	40 %	0 %	0 %	403514234
111	NC_018528	CGAAG	2	10	206429	206438	40 %	0 %	40 %	20 %	403514235
112	NC_018528	ATTAG	2	10	207222	207231	40 %	40 %	20 %	0 %	403514235
113	NC_018528	AGAAA	2	10	209200	209209	80 %	0 %	20 %	0 %	403514237
114	NC_018528	GCATA	2	10	211245	211254	40 %	20 %	20 %	20 %	403514239
115	NC_018528	AAAGT	2	10	211445	211454	60 %	20 %	20 %	0 %	403514239
116	NC_018528	AAACC	2	10	212226	212235	60 %	0 %	0 %	40 %	403514240
117	NC_018528	ATTTT	2	10	213199	213208	20 %	80 %	0 %	0 %	403514242
118	NC_018528	AATCA	2	10	218489	218498	60 %	20 %	0 %	20 %	403514247
119	NC_018528	CTTTA	2	10	219616	219625	20 %	60 %	0 %	20 %	403514247
120	NC_018528	TTACA	2	10	219819	219828	40 %	40 %	0 %	20 %	403514248
121	NC_018528	TTAAG	2	10	222980	222989	40 %	40 %	20 %	0 %	403514250
122	NC_018528	ATTAC	2	10	223500	223509	40 %	40 %	0 %	20 %	403514251
123	NC_018528	TGGAA	2	10	226628	226637	40 %	20 %	40 %	0 %	403514253
124	NC_018528	TTTTG	2	10	227389	227398	0 %	80 %	20 %	0 %	403514254
125	NC_018528	CACTA	2	10	229407	229416	40 %	20 %	0 %	40 %	403514256
126	NC_018528	AACTC	2	10	232718	232727	40 %	20 %	0 %	40 %	403514259
127	NC_018528	CAATT	2	10	233166	233175	40 %	40 %	0 %	20 %	403514259
128	NC_018528	CTCAA	2	10	233549	233558	40 %	20 %	0 %	40 %	403514260
129	NC_018528	AAATC	2	10	236597	236606	60 %	20 %	0 %	20 %	403514263
130	NC_018528	AATGT	2	10	238936	238945	40 %	40 %	20 %	0 %	403514266
131	NC_018528	ATGAA	2	10	238985	238994	60 %	20 %	20 %	0 %	403514266
132	NC_018528	TGGTA	2	10	239868	239877	20 %	40 %	40 %	0 %	403514266
133	NC_018528	TAGTG	2	10	243547	243556	20 %	40 %	40 %	0 %	403514270
134	NC_018528	TGGAT	2	10	244573	244582	20 %	40 %	40 %	0 %	403514271
135	NC_018528	TCACA	2	10	256324	256333	40 %	20 %	0 %	40 %	403514281
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138	NC_018528	TGGCA	2	10	259094	259103	20 %	20 %	40 %	20 %	403514283
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166	NC_018528	TGATT	2	10	315835	315844	20 %	60 %	20 %	0 %	403514343
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168	NC_018528	TTAAT	2	10	317232	317241	40 %	60 %	0 %	0 %	403514345
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174	NC_018528	GTCTT	2	10	327919	327928	0 %	60 %	20 %	20 %	403514357
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