MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 35998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_018528	ATG	2	6	2096324	2096329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403516018
35502	NC_018528	TTG	2	6	2097733	2097738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403516019
35503	NC_018528	CTA	2	6	2097848	2097853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516019
35504	NC_018528	T	6	6	2097875	2097880	0 %	100 %	0 %	0 %	403516019
35505	NC_018528	ACC	2	6	2097901	2097906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403516019
35506	NC_018528	ATCA	2	8	2097918	2097925	50 %	25 %	0 %	25 %	403516019
35507	NC_018528	TCTA	2	8	2097960	2097967	25 %	50 %	0 %	25 %	403516019
35508	NC_018528	TTC	2	6	2097981	2097986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516019
35509	NC_018528	GAC	2	6	2098038	2098043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403516019
35510	NC_018528	ATG	2	6	2098056	2098061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403516019
35511	NC_018528	AAG	2	6	2098086	2098091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403516019
35512	NC_018528	TAC	2	6	2098200	2098205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516019
35513	NC_018528	ACG	2	6	2098246	2098251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403516019
35514	NC_018528	TGA	2	6	2098334	2098339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403516019
35515	NC_018528	TGA	2	6	2098390	2098395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403516020
35516	NC_018528	CTT	2	6	2098562	2098567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516020
35517	NC_018528	AAC	2	6	2098611	2098616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403516020
35518	NC_018528	AGA	2	6	2098688	2098693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403516020
35519	NC_018528	TACT	2	8	2098700	2098707	25 %	50 %	0 %	25 %	403516020
35520	NC_018528	TTG	2	6	2098713	2098718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403516020
35521	NC_018528	ATG	2	6	2098725	2098730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403516020
35522	NC_018528	AAG	2	6	2098752	2098757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403516020
35523	NC_018528	CTTG	2	8	2098766	2098773	0 %	50 %	25 %	25 %	403516020
35524	NC_018528	AGA	2	6	2098862	2098867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403516020
35525	NC_018528	TTA	2	6	2098889	2098894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403516020
35526	NC_018528	ATT	2	6	2098918	2098923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403516020
35527	NC_018528	CAT	2	6	2100629	2100634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516021
35528	NC_018528	ATT	2	6	2100636	2100641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403516021
35529	NC_018528	TCT	2	6	2100668	2100673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516021
35530	NC_018528	CTT	2	6	2100719	2100724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516021
35531	NC_018528	TCA	2	6	2100736	2100741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516021
35532	NC_018528	TTC	2	6	2100789	2100794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516021
35533	NC_018528	CTTGC	2	10	2100814	2100823	0 %	40 %	20 %	40 %	403516021
35534	NC_018528	TAC	2	6	2100837	2100842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516021
35535	NC_018528	GAT	2	6	2100859	2100864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403516021
35536	NC_018528	TTC	2	6	2100921	2100926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516021
35537	NC_018528	GTC	2	6	2100985	2100990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403516021
35538	NC_018528	AGC	2	6	2100993	2100998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403516021
35539	NC_018528	TCT	2	6	2101015	2101020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516021
35540	NC_018528	T	6	6	2101040	2101045	0 %	100 %	0 %	0 %	403516021
35541	NC_018528	ATT	2	6	2101095	2101100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403516021
35542	NC_018528	AGT	2	6	2101242	2101247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403516021
35543	NC_018528	TAA	2	6	2101295	2101300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403516021
35544	NC_018528	CTG	2	6	2101302	2101307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403516021
35545	NC_018528	A	6	6	2101376	2101381	100 %	0 %	0 %	0 %	403516021
35546	NC_018528	ACT	2	6	2101652	2101657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516022
35547	NC_018528	TATTT	2	10	2101734	2101743	20 %	80 %	0 %	0 %	403516022
35548	NC_018528	GAAT	2	8	2101772	2101779	50 %	25 %	25 %	0 %	403516022
35549	NC_018528	AGC	2	6	2101809	2101814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403516022
35550	NC_018528	CAT	2	6	2101830	2101835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516022
35551	NC_018528	CTT	2	6	2101890	2101895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516022
35552	NC_018528	TCT	2	6	2102047	2102052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516022
35553	NC_018528	CTT	2	6	2102073	2102078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516022
35554	NC_018528	TTGG	2	8	2102122	2102129	0 %	50 %	50 %	0 %	403516022
35555	NC_018528	TTA	2	6	2102176	2102181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403516022
35556	NC_018528	CA	3	6	2102282	2102287	50 %	0 %	0 %	50 %	403516022
35557	NC_018528	ATT	2	6	2102290	2102295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403516022
35558	NC_018528	CAA	2	6	2102440	2102445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403516022
35559	NC_018528	AAC	2	6	2102461	2102466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403516022
35560	NC_018528	GCT	2	6	2102494	2102499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403516022
35561	NC_018528	TTG	2	6	2102555	2102560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403516022
35562	NC_018528	TGG	2	6	2102583	2102588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403516022
35563	NC_018528	TCT	3	9	2102621	2102629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516022
35564	NC_018528	GT	3	6	2102660	2102665	0 %	50 %	50 %	0 %	403516022
35565	NC_018528	ATC	2	6	2102695	2102700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516022
35566	NC_018528	ATT	2	6	2102776	2102781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403516022
35567	NC_018528	GAT	2	6	2102886	2102891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403516022
35568	NC_018528	TCT	2	6	2102918	2102923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516022
35569	NC_018528	AAT	2	6	2103031	2103036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403516023
35570	NC_018528	TGA	2	6	2103041	2103046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403516023
35571	NC_018528	ATG	2	6	2103047	2103052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403516023
35572	NC_018528	CAT	2	6	2103117	2103122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516023
35573	NC_018528	ATA	2	6	2103178	2103183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403516023
35574	NC_018528	CAA	2	6	2103207	2103212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403516023
35575	NC_018528	TTTC	2	8	2103219	2103226	0 %	75 %	0 %	25 %	403516023
35576	NC_018528	AAT	2	6	2103266	2103271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403516023
35577	NC_018528	CAA	2	6	2103273	2103278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403516023
35578	NC_018528	ATT	2	6	2103316	2103321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403516023
35579	NC_018528	GTA	2	6	2103358	2103363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403516023
35580	NC_018528	CAC	2	6	2103432	2103437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403516023
35581	NC_018528	GCT	2	6	2103541	2103546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403516023
35582	NC_018528	ATT	2	6	2103557	2103562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403516023
35583	NC_018528	CAA	2	6	2103600	2103605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403516023
35584	NC_018528	TA	4	8	2103627	2103634	50 %	50 %	0 %	0 %	403516023
35585	NC_018528	ACC	2	6	2103694	2103699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403516023
35586	NC_018528	ATA	2	6	2103837	2103842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403516023
35587	NC_018528	ATTG	2	8	2103898	2103905	25 %	50 %	25 %	0 %	403516023
35588	NC_018528	CTG	2	6	2103967	2103972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403516023
35589	NC_018528	ATAA	2	8	2104048	2104055	75 %	25 %	0 %	0 %	403516023
35590	NC_018528	ATTT	2	8	2104062	2104069	25 %	75 %	0 %	0 %	403516023
35591	NC_018528	TGT	2	6	2104100	2104105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403516023
35592	NC_018528	AATG	2	8	2104165	2104172	50 %	25 %	25 %	0 %	403516023
35593	NC_018528	GATT	2	8	2104173	2104180	25 %	50 %	25 %	0 %	403516023
35594	NC_018528	ATC	2	6	2104205	2104210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516023
35595	NC_018528	TGG	2	6	2104379	2104384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403516024
35596	NC_018528	TCT	2	6	2104402	2104407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516024
35597	NC_018528	A	6	6	2104428	2104433	100 %	0 %	0 %	0 %	403516024
35598	NC_018528	AT	3	6	2104481	2104486	50 %	50 %	0 %	0 %	403516024
35599	NC_018528	A	6	6	2104514	2104519	100 %	0 %	0 %	0 %	403516024
35600	NC_018528	TTGCT	2	10	2104583	2104592	0 %	60 %	20 %	20 %	403516024
35601	NC_018528	AAC	2	6	2104649	2104654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403516024
35602	NC_018528	TCT	2	6	2104663	2104668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516024
35603	NC_018528	T	6	6	2104690	2104695	0 %	100 %	0 %	0 %	403516024
35604	NC_018528	CAT	2	6	2104806	2104811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516024
35605	NC_018528	TTC	2	6	2104813	2104818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516024
35606	NC_018528	ATA	2	6	2104954	2104959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403516024
35607	NC_018528	T	7	7	2105000	2105006	0 %	100 %	0 %	0 %	403516024
35608	NC_018528	CGT	2	6	2105029	2105034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403516024
35609	NC_018528	T	6	6	2105278	2105283	0 %	100 %	0 %	0 %	403516025
35610	NC_018528	CTT	2	6	2105303	2105308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516025
35611	NC_018528	ACT	2	6	2105335	2105340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516025
35612	NC_018528	CT	3	6	2105429	2105434	0 %	50 %	0 %	50 %	403516025
35613	NC_018528	GCA	2	6	2105437	2105442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403516025
35614	NC_018528	TG	3	6	2105449	2105454	0 %	50 %	50 %	0 %	403516025
35615	NC_018528	TTC	2	6	2105515	2105520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516025
35616	NC_018528	ATT	2	6	2105599	2105604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403516025
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35733	NC_018528	TGC	2	6	2113966	2113971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403516033
35734	NC_018528	GAA	2	6	2114009	2114014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403516033
35735	NC_018528	CAT	2	6	2114137	2114142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516033
35736	NC_018528	ACT	2	6	2114198	2114203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516033
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35740	NC_018528	ATC	2	6	2114438	2114443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516033
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35848	NC_018528	TTC	2	6	2121429	2121434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516037
35849	NC_018528	TTG	2	6	2121588	2121593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403516037
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35852	NC_018528	GCA	2	6	2121838	2121843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403516038
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35964	NC_018528	AATT	2	8	2126383	2126390	50 %	50 %	0 %	0 %	403516040
35965	NC_018528	TTC	2	6	2126419	2126424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516040
35966	NC_018528	TGA	2	6	2126497	2126502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403516040
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35982	NC_018528	TTG	2	6	2127815	2127820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403516041
35983	NC_018528	CTT	2	6	2127857	2127862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516041
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35995	NC_018528	TCA	2	6	2128357	2128362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516042
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