MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 35998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018528	TGT	2	6	179374	179379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514212
3002	NC_018528	GAA	2	6	179413	179418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514212
3003	NC_018528	CAA	2	6	179500	179505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514212
3004	NC_018528	TAT	2	6	179528	179533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514212
3005	NC_018528	AT	3	6	179551	179556	50 %	50 %	0 %	0 %	403514212
3006	NC_018528	TAG	2	6	179704	179709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514213
3007	NC_018528	GC	3	6	179742	179747	0 %	0 %	50 %	50 %	403514213
3008	NC_018528	ATT	2	6	179784	179789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514213
3009	NC_018528	ATCTA	2	10	179855	179864	40 %	40 %	0 %	20 %	403514213
3010	NC_018528	TTGATT	2	12	179902	179913	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403514213
3011	NC_018528	A	6	6	179924	179929	100 %	0 %	0 %	0 %	403514213
3012	NC_018528	GCC	2	6	180072	180077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403514213
3013	NC_018528	TGA	2	6	180085	180090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514213
3014	NC_018528	CAG	2	6	180172	180177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514213
3015	NC_018528	TGG	2	6	180230	180235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514213
3016	NC_018528	ATT	2	6	180258	180263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514213
3017	NC_018528	TGT	2	6	180265	180270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514213
3018	NC_018528	TGC	2	6	180272	180277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514213
3019	NC_018528	TTG	2	6	180288	180293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514213
3020	NC_018528	ACT	2	6	180342	180347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514213
3021	NC_018528	GCT	2	6	180458	180463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514213
3022	NC_018528	CTA	2	6	180478	180483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514213
3023	NC_018528	TTC	2	6	180513	180518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514213
3024	NC_018528	TTC	2	6	180528	180533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514213
3025	NC_018528	TTAT	2	8	180618	180625	25 %	75 %	0 %	0 %	403514213
3026	NC_018528	AGA	2	6	180670	180675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514213
3027	NC_018528	TGG	2	6	180686	180691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514213
3028	NC_018528	AGA	2	6	180854	180859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514213
3029	NC_018528	TTG	2	6	180883	180888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514213
3030	NC_018528	AAG	2	6	180963	180968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514213
3031	NC_018528	CG	3	6	181086	181091	0 %	0 %	50 %	50 %	403514213
3032	NC_018528	AAAAG	2	10	181124	181133	80 %	0 %	20 %	0 %	403514213
3033	NC_018528	TGA	2	6	181243	181248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514213
3034	NC_018528	GAT	2	6	181253	181258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514213
3035	NC_018528	GAA	2	6	181295	181300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514213
3036	NC_018528	GAA	2	6	181322	181327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514213
3037	NC_018528	GTC	2	6	181342	181347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514213
3038	NC_018528	TCT	2	6	181459	181464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514213
3039	NC_018528	TTG	2	6	181500	181505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514213
3040	NC_018528	ATT	2	6	182697	182702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514214
3041	NC_018528	TCA	2	6	182762	182767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514214
3042	NC_018528	TTGA	2	8	182785	182792	25 %	50 %	25 %	0 %	403514214
3043	NC_018528	ACTC	2	8	182814	182821	25 %	25 %	0 %	50 %	403514214
3044	NC_018528	TGC	2	6	182925	182930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514214
3045	NC_018528	GAAC	2	8	182947	182954	50 %	0 %	25 %	25 %	403514214
3046	NC_018528	GCA	2	6	183095	183100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514214
3047	NC_018528	CAC	2	6	183135	183140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514214
3048	NC_018528	T	6	6	183145	183150	0 %	100 %	0 %	0 %	403514214
3049	NC_018528	AAGG	2	8	183181	183188	50 %	0 %	50 %	0 %	403514214
3050	NC_018528	TTC	2	6	183256	183261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514214
3051	NC_018528	TCT	2	6	183267	183272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514214
3052	NC_018528	T	6	6	183322	183327	0 %	100 %	0 %	0 %	403514214
3053	NC_018528	TTC	2	6	183346	183351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514214
3054	NC_018528	TTC	2	6	183490	183495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514214
3055	NC_018528	A	6	6	183570	183575	100 %	0 %	0 %	0 %	403514214
3056	NC_018528	AAT	2	6	183646	183651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514214
3057	NC_018528	TTTCTT	2	12	183676	183687	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	403514215
3058	NC_018528	GTT	2	6	183688	183693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514215
3059	NC_018528	AGT	2	6	183697	183702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514215
3060	NC_018528	AAG	2	6	183743	183748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514215
3061	NC_018528	GACC	2	8	183777	183784	25 %	0 %	25 %	50 %	403514215
3062	NC_018528	TCA	2	6	183792	183797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514215
3063	NC_018528	TTC	2	6	183848	183853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514215
3064	NC_018528	ACT	2	6	183854	183859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514215
3065	NC_018528	GTG	2	6	183938	183943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514215
3066	NC_018528	GCT	2	6	183959	183964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514215
3067	NC_018528	T	6	6	183964	183969	0 %	100 %	0 %	0 %	403514215
3068	NC_018528	ACA	2	6	184198	184203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514216
3069	NC_018528	TTTG	2	8	184238	184245	0 %	75 %	25 %	0 %	403514216
3070	NC_018528	ATG	2	6	184262	184267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514216
3071	NC_018528	AAT	2	6	184283	184288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514216
3072	NC_018528	T	7	7	184300	184306	0 %	100 %	0 %	0 %	403514216
3073	NC_018528	T	6	6	184358	184363	0 %	100 %	0 %	0 %	403514217
3074	NC_018528	TTC	2	6	184376	184381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514217
3075	NC_018528	GAA	2	6	184421	184426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514217
3076	NC_018528	CTT	2	6	184427	184432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514217
3077	NC_018528	TTCA	2	8	184468	184475	25 %	50 %	0 %	25 %	403514217
3078	NC_018528	TAT	2	6	184641	184646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514217
3079	NC_018528	AAAG	2	8	184787	184794	75 %	0 %	25 %	0 %	403514217
3080	NC_018528	TCG	2	6	184820	184825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514217
3081	NC_018528	ATT	2	6	184841	184846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514217
3082	NC_018528	TAA	2	6	184862	184867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514217
3083	NC_018528	ACTA	2	8	184981	184988	50 %	25 %	0 %	25 %	403514218
3084	NC_018528	ATG	2	6	185007	185012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514218
3085	NC_018528	ATC	2	6	185055	185060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514218
3086	NC_018528	AAAG	2	8	185298	185305	75 %	0 %	25 %	0 %	403514219
3087	NC_018528	T	6	6	185793	185798	0 %	100 %	0 %	0 %	403514220
3088	NC_018528	TCT	2	6	185894	185899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514220
3089	NC_018528	CAT	2	6	185906	185911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514220
3090	NC_018528	ATCAAC	2	12	185958	185969	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	403514220
3091	NC_018528	CAT	2	6	185996	186001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514220
3092	NC_018528	AGT	2	6	186021	186026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514220
3093	NC_018528	T	6	6	186060	186065	0 %	100 %	0 %	0 %	403514220
3094	NC_018528	GTT	2	6	186066	186071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514220
3095	NC_018528	GTT	2	6	186093	186098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514220
3096	NC_018528	TTGT	2	8	186120	186127	0 %	75 %	25 %	0 %	403514220
3097	NC_018528	ATG	2	6	186176	186181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514220
3098	NC_018528	GTC	2	6	186202	186207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514220
3099	NC_018528	T	6	6	186368	186373	0 %	100 %	0 %	0 %	403514220
3100	NC_018528	GCAT	2	8	186385	186392	25 %	25 %	25 %	25 %	403514220
3101	NC_018528	T	6	6	186467	186472	0 %	100 %	0 %	0 %	403514220
3102	NC_018528	T	6	6	186525	186530	0 %	100 %	0 %	0 %	403514220
3103	NC_018528	GGTTG	2	10	186772	186781	0 %	40 %	60 %	0 %	403514221
3104	NC_018528	GAA	2	6	186808	186813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514221
3105	NC_018528	AAG	2	6	186817	186822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514221
3106	NC_018528	ATT	2	6	186876	186881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514221
3107	NC_018528	GAA	2	6	186916	186921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514221
3108	NC_018528	AACG	2	8	186964	186971	50 %	0 %	25 %	25 %	403514221
3109	NC_018528	AAG	3	9	187000	187008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514221
3110	NC_018528	CTG	2	6	187010	187015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514221
3111	NC_018528	CGT	2	6	187048	187053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514221
3112	NC_018528	CCA	2	6	187069	187074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514221
3113	NC_018528	TGA	3	9	187080	187088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514221
3114	NC_018528	CGT	2	6	187114	187119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514221
3115	NC_018528	CA	3	6	187136	187141	50 %	0 %	0 %	50 %	403514221
3116	NC_018528	ATGT	2	8	187166	187173	25 %	50 %	25 %	0 %	403514221
3117	NC_018528	ACTT	2	8	187217	187224	25 %	50 %	0 %	25 %	403514221
3118	NC_018528	GAC	3	9	187300	187308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514221
3119	NC_018528	GTT	2	6	187342	187347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514221
3120	NC_018528	CGA	2	6	187356	187361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514221
3121	NC_018528	TGT	2	6	187371	187376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514221
3122	NC_018528	GAC	2	6	187393	187398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514221
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3242	NC_018528	TCT	2	6	194860	194865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514227
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3244	NC_018528	ATG	2	6	195036	195041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514227
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3359	NC_018528	GGT	2	6	202494	202499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514232
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3365	NC_018528	GAT	2	6	202680	202685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514232
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3369	NC_018528	ACT	2	6	202950	202955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514232
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3376	NC_018528	A	7	7	203226	203232	100 %	0 %	0 %	0 %	403514233
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3481	NC_018528	GATT	2	8	208513	208520	25 %	50 %	25 %	0 %	403514237
3482	NC_018528	AGA	2	6	208563	208568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514237
3483	NC_018528	A	6	6	208682	208687	100 %	0 %	0 %	0 %	403514237
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3485	NC_018528	GAA	2	6	208742	208747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514237
3486	NC_018528	GGT	2	6	208778	208783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514237
3487	NC_018528	TATTGC	2	12	208801	208812	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403514237
3488	NC_018528	TTG	2	6	208835	208840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514237
3489	NC_018528	ACT	2	6	208853	208858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514237
3490	NC_018528	AG	3	6	208914	208919	50 %	0 %	50 %	0 %	403514237
3491	NC_018528	ATT	2	6	208931	208936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514237
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3498	NC_018528	AGAAA	2	10	209200	209209	80 %	0 %	20 %	0 %	403514237
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