MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 35998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018528	AGA	2	6	150838	150843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514187
2502	NC_018528	GGT	2	6	150920	150925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514187
2503	NC_018528	CAA	3	9	150926	150934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514187
2504	NC_018528	ATT	2	6	150974	150979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514187
2505	NC_018528	AGT	2	6	151147	151152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514187
2506	NC_018528	ATG	2	6	151155	151160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514187
2507	NC_018528	GGA	2	6	151168	151173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403514187
2508	NC_018528	CGG	2	6	151207	151212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514187
2509	NC_018528	CAA	2	6	151219	151224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514187
2510	NC_018528	TGA	2	6	151256	151261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514187
2511	NC_018528	TGA	2	6	151286	151291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514188
2512	NC_018528	TATT	2	8	151325	151332	25 %	75 %	0 %	0 %	403514188
2513	NC_018528	ATTG	2	8	151452	151459	25 %	50 %	25 %	0 %	403514188
2514	NC_018528	ATTT	2	8	151509	151516	25 %	75 %	0 %	0 %	403514188
2515	NC_018528	ATT	2	6	151521	151526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514188
2516	NC_018528	TAT	2	6	151578	151583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514188
2517	NC_018528	CAT	2	6	151587	151592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514188
2518	NC_018528	T	6	6	151706	151711	0 %	100 %	0 %	0 %	403514188
2519	NC_018528	CTG	2	6	151757	151762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514188
2520	NC_018528	CAT	2	6	151789	151794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514188
2521	NC_018528	ACTT	2	8	151816	151823	25 %	50 %	0 %	25 %	403514188
2522	NC_018528	GGT	2	6	151894	151899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514188
2523	NC_018528	CAA	2	6	151915	151920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514188
2524	NC_018528	CAT	3	9	151956	151964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514188
2525	NC_018528	TTA	2	6	151967	151972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514188
2526	NC_018528	GTT	2	6	151981	151986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514188
2527	NC_018528	AAT	2	6	152030	152035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514188
2528	NC_018528	TAC	2	6	152039	152044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514189
2529	NC_018528	A	6	6	152049	152054	100 %	0 %	0 %	0 %	403514189
2530	NC_018528	AAT	2	6	152087	152092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514189
2531	NC_018528	ATTT	2	8	152303	152310	25 %	75 %	0 %	0 %	403514189
2532	NC_018528	TAT	2	6	152315	152320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514189
2533	NC_018528	ATT	2	6	152403	152408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514189
2534	NC_018528	TGCT	2	8	152509	152516	0 %	50 %	25 %	25 %	403514189
2535	NC_018528	ATT	2	6	152519	152524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514189
2536	NC_018528	TGT	2	6	152567	152572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514189
2537	NC_018528	GCT	2	6	152574	152579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514189
2538	NC_018528	GGT	2	6	152580	152585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514189
2539	NC_018528	TTGGT	2	10	152692	152701	0 %	60 %	40 %	0 %	403514189
2540	NC_018528	GGT	2	6	152709	152714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514189
2541	NC_018528	ATC	2	6	152784	152789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514189
2542	NC_018528	ATT	2	6	152802	152807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514189
2543	NC_018528	AGAA	2	8	152829	152836	75 %	0 %	25 %	0 %	403514189
2544	NC_018528	ATG	2	6	153635	153640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514190
2545	NC_018528	TGA	2	6	153646	153651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514190
2546	NC_018528	CAAGA	2	10	153665	153674	60 %	0 %	20 %	20 %	403514190
2547	NC_018528	TGAT	2	8	153720	153727	25 %	50 %	25 %	0 %	403514190
2548	NC_018528	AAT	2	6	153743	153748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514190
2549	NC_018528	GAA	3	9	153776	153784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514190
2550	NC_018528	TAC	2	6	153785	153790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514190
2551	NC_018528	TAAC	2	8	153864	153871	50 %	25 %	0 %	25 %	403514190
2552	NC_018528	GAT	2	6	153938	153943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514190
2553	NC_018528	TCAA	2	8	154006	154013	50 %	25 %	0 %	25 %	403514190
2554	NC_018528	TGC	2	6	154015	154020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514190
2555	NC_018528	AAG	2	6	154032	154037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514190
2556	NC_018528	TGC	2	6	154072	154077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514190
2557	NC_018528	CA	3	6	154089	154094	50 %	0 %	0 %	50 %	403514190
2558	NC_018528	A	6	6	154151	154156	100 %	0 %	0 %	0 %	403514191
2559	NC_018528	GCT	2	6	154239	154244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514191
2560	NC_018528	TAC	2	6	154263	154268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514191
2561	NC_018528	AGA	2	6	154293	154298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514191
2562	NC_018528	A	6	6	154315	154320	100 %	0 %	0 %	0 %	403514191
2563	NC_018528	AG	3	6	154377	154382	50 %	0 %	50 %	0 %	403514191
2564	NC_018528	TAC	2	6	154383	154388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514191
2565	NC_018528	ATA	2	6	154451	154456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514191
2566	NC_018528	GTC	2	6	154466	154471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514191
2567	NC_018528	TAG	2	6	154478	154483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514191
2568	NC_018528	TGA	2	6	154494	154499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514191
2569	NC_018528	TGAG	2	8	154505	154512	25 %	25 %	50 %	0 %	403514191
2570	NC_018528	A	6	6	154516	154521	100 %	0 %	0 %	0 %	403514191
2571	NC_018528	TAAAGA	2	12	154578	154589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403514191
2572	NC_018528	GCA	2	6	154620	154625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514191
2573	NC_018528	TTA	2	6	154733	154738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514191
2574	NC_018528	ATG	2	6	154796	154801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514191
2575	NC_018528	CAT	2	6	154822	154827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514191
2576	NC_018528	TGA	2	6	154944	154949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514191
2577	NC_018528	AT	3	6	154986	154991	50 %	50 %	0 %	0 %	403514191
2578	NC_018528	ATA	2	6	154997	155002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514191
2579	NC_018528	ATA	2	6	155021	155026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514191
2580	NC_018528	GAA	2	6	155059	155064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514191
2581	NC_018528	TCT	2	6	155086	155091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514191
2582	NC_018528	A	7	7	155095	155101	100 %	0 %	0 %	0 %	403514191
2583	NC_018528	GCAT	2	8	155216	155223	25 %	25 %	25 %	25 %	403514191
2584	NC_018528	CAG	2	6	155240	155245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514191
2585	NC_018528	GTCATC	2	12	155315	155326	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403514191
2586	NC_018528	AT	3	6	155358	155363	50 %	50 %	0 %	0 %	403514191
2587	NC_018528	AAC	2	6	155406	155411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514191
2588	NC_018528	ATA	2	6	155417	155422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514191
2589	NC_018528	ATA	2	6	155447	155452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514191
2590	NC_018528	AAG	2	6	155529	155534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514191
2591	NC_018528	TTTA	2	8	155545	155552	25 %	75 %	0 %	0 %	403514191
2592	NC_018528	AAAT	2	8	155700	155707	75 %	25 %	0 %	0 %	403514192
2593	NC_018528	GAT	2	6	155731	155736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514192
2594	NC_018528	CGA	2	6	155739	155744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514192
2595	NC_018528	TTA	2	6	155773	155778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514192
2596	NC_018528	ATG	2	6	155784	155789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514192
2597	NC_018528	AGA	2	6	155807	155812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514192
2598	NC_018528	ATC	2	6	155876	155881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514192
2599	NC_018528	AGA	2	6	155917	155922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514192
2600	NC_018528	ATTA	2	8	155923	155930	50 %	50 %	0 %	0 %	403514192
2601	NC_018528	T	6	6	155943	155948	0 %	100 %	0 %	0 %	403514192
2602	NC_018528	TTC	3	9	155970	155978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514192
2603	NC_018528	GAA	2	6	155987	155992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514192
2604	NC_018528	ATGG	2	8	155999	156006	25 %	25 %	50 %	0 %	403514192
2605	NC_018528	CTT	2	6	156008	156013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514192
2606	NC_018528	ACA	3	9	156054	156062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514192
2607	NC_018528	CTT	2	6	156085	156090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514192
2608	NC_018528	GAA	2	6	156239	156244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514192
2609	NC_018528	CTT	2	6	156247	156252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514192
2610	NC_018528	GAA	2	6	156362	156367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514192
2611	NC_018528	GAT	2	6	156386	156391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514192
2612	NC_018528	TCA	2	6	156464	156469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514192
2613	NC_018528	ACT	2	6	156476	156481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514192
2614	NC_018528	GAT	2	6	156494	156499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514192
2615	NC_018528	TGA	2	6	156517	156522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514192
2616	NC_018528	ATCA	2	8	156566	156573	50 %	25 %	0 %	25 %	403514192
2617	NC_018528	CTTT	2	8	156579	156586	0 %	75 %	0 %	25 %	403514192
2618	NC_018528	TGA	2	6	156604	156609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514192
2619	NC_018528	ATCA	2	8	156667	156674	50 %	25 %	0 %	25 %	403514192
2620	NC_018528	CT	3	6	156678	156683	0 %	50 %	0 %	50 %	403514192
2621	NC_018528	CAT	2	6	156793	156798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514192
2622	NC_018528	AAG	3	9	156833	156841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514192
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2867	NC_018528	TCT	2	6	171326	171331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514203
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2870	NC_018528	TGT	2	6	171435	171440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514203
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2985	NC_018528	AGCA	2	8	178814	178821	50 %	0 %	25 %	25 %	403514212
2986	NC_018528	GAA	2	6	178907	178912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514212
2987	NC_018528	CAG	2	6	178915	178920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514212
2988	NC_018528	GCT	2	6	178969	178974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514212
2989	NC_018528	TGA	2	6	179008	179013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514212
2990	NC_018528	CAC	2	6	179036	179041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514212
2991	NC_018528	GGT	2	6	179060	179065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514212
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3000	NC_018528	TAC	2	6	179348	179353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514212

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