MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 35998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018528	AT	3	6	62870	62875	50 %	50 %	0 %	0 %	403514099
1002	NC_018528	GTT	3	9	63028	63036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514100
1003	NC_018528	AAC	2	6	63046	63051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514100
1004	NC_018528	AGT	2	6	63070	63075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514100
1005	NC_018528	GT	3	6	63086	63091	0 %	50 %	50 %	0 %	403514100
1006	NC_018528	CTTCGT	2	12	63183	63194	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	403514100
1007	NC_018528	CAA	2	6	63258	63263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514100
1008	NC_018528	TTACAA	2	12	63282	63293	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403514100
1009	NC_018528	TTTCA	2	10	63301	63310	20 %	60 %	0 %	20 %	403514100
1010	NC_018528	GTGAA	2	10	63361	63370	40 %	20 %	40 %	0 %	403514100
1011	NC_018528	GCTT	2	8	63380	63387	0 %	50 %	25 %	25 %	403514100
1012	NC_018528	GTC	2	6	63394	63399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514100
1013	NC_018528	GTA	2	6	63412	63417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514100
1014	NC_018528	CTT	2	6	63421	63426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514100
1015	NC_018528	CAA	2	6	63522	63527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514100
1016	NC_018528	AGC	2	6	63643	63648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514100
1017	NC_018528	TGT	2	6	63729	63734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514100
1018	NC_018528	TTG	2	6	63814	63819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514100
1019	NC_018528	ACA	3	9	63824	63832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514100
1020	NC_018528	CTTC	2	8	63912	63919	0 %	50 %	0 %	50 %	403514100
1021	NC_018528	CATT	2	8	63920	63927	25 %	50 %	0 %	25 %	403514100
1022	NC_018528	TTC	2	6	63937	63942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514100
1023	NC_018528	ATAA	2	8	64111	64118	75 %	25 %	0 %	0 %	403514101
1024	NC_018528	A	6	6	64145	64150	100 %	0 %	0 %	0 %	403514101
1025	NC_018528	CGG	2	6	64173	64178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514101
1026	NC_018528	ATGA	2	8	64183	64190	50 %	25 %	25 %	0 %	403514101
1027	NC_018528	CTG	2	6	64208	64213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514101
1028	NC_018528	T	6	6	64258	64263	0 %	100 %	0 %	0 %	403514101
1029	NC_018528	A	6	6	64271	64276	100 %	0 %	0 %	0 %	403514101
1030	NC_018528	AAATG	2	10	64284	64293	60 %	20 %	20 %	0 %	403514101
1031	NC_018528	ATC	2	6	64433	64438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514101
1032	NC_018528	A	7	7	64482	64488	100 %	0 %	0 %	0 %	403514101
1033	NC_018528	A	6	6	64561	64566	100 %	0 %	0 %	0 %	403514101
1034	NC_018528	A	6	6	64604	64609	100 %	0 %	0 %	0 %	403514101
1035	NC_018528	TGG	2	6	64610	64615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514101
1036	NC_018528	ATT	2	6	64628	64633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514101
1037	NC_018528	A	6	6	64638	64643	100 %	0 %	0 %	0 %	403514101
1038	NC_018528	TGG	2	6	64678	64683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514101
1039	NC_018528	AAAAG	2	10	64701	64710	80 %	0 %	20 %	0 %	403514101
1040	NC_018528	GAC	2	6	64767	64772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514101
1041	NC_018528	ATG	2	6	64790	64795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514101
1042	NC_018528	CGG	2	6	64846	64851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514101
1043	NC_018528	CTA	2	6	64869	64874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514101
1044	NC_018528	TGCA	2	8	64879	64886	25 %	25 %	25 %	25 %	403514101
1045	NC_018528	TTTG	2	8	64893	64900	0 %	75 %	25 %	0 %	403514101
1046	NC_018528	GAA	2	6	64903	64908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514101
1047	NC_018528	AAT	2	6	65292	65297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514102
1048	NC_018528	AGA	2	6	65361	65366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514102
1049	NC_018528	ATT	2	6	65410	65415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514102
1050	NC_018528	TG	3	6	65502	65507	0 %	50 %	50 %	0 %	403514102
1051	NC_018528	GAA	2	6	65518	65523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514102
1052	NC_018528	AAG	2	6	65563	65568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514102
1053	NC_018528	CAG	2	6	65579	65584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514102
1054	NC_018528	AT	3	6	65739	65744	50 %	50 %	0 %	0 %	403514102
1055	NC_018528	A	7	7	65768	65774	100 %	0 %	0 %	0 %	403514102
1056	NC_018528	ATC	2	6	65843	65848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514102
1057	NC_018528	TGA	2	6	65865	65870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514102
1058	NC_018528	TGG	2	6	65959	65964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514102
1059	NC_018528	CAA	2	6	65991	65996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514102
1060	NC_018528	ATT	2	6	66014	66019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514102
1061	NC_018528	AGT	2	6	66048	66053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514102
1062	NC_018528	AAAT	2	8	66110	66117	75 %	25 %	0 %	0 %	403514102
1063	NC_018528	A	6	6	67679	67684	100 %	0 %	0 %	0 %	403514103
1064	NC_018528	T	6	6	67749	67754	0 %	100 %	0 %	0 %	403514103
1065	NC_018528	TTA	2	6	67853	67858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514103
1066	NC_018528	TGG	2	6	67917	67922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514103
1067	NC_018528	AAT	2	6	67926	67931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514103
1068	NC_018528	ATT	2	6	67940	67945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514103
1069	NC_018528	AAT	2	6	67954	67959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514103
1070	NC_018528	CG	3	6	67961	67966	0 %	0 %	50 %	50 %	403514103
1071	NC_018528	CTAT	2	8	68040	68047	25 %	50 %	0 %	25 %	403514103
1072	NC_018528	ATA	2	6	68201	68206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514103
1073	NC_018528	GGC	2	6	68252	68257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514103
1074	NC_018528	TAA	2	6	68304	68309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514103
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1076	NC_018528	TAG	2	6	68345	68350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514103
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1080	NC_018528	TATT	2	8	68572	68579	25 %	75 %	0 %	0 %	403514103
1081	NC_018528	CGA	2	6	68582	68587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514103
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1085	NC_018528	TGA	2	6	68754	68759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514103
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1089	NC_018528	ATT	2	6	68960	68965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514103
1090	NC_018528	T	6	6	68999	69004	0 %	100 %	0 %	0 %	403514103
1091	NC_018528	GCA	2	6	69005	69010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514103
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1096	NC_018528	AT	3	6	69141	69146	50 %	50 %	0 %	0 %	403514103
1097	NC_018528	ATTT	2	8	69158	69165	25 %	75 %	0 %	0 %	403514103
1098	NC_018528	ATT	2	6	69199	69204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514103
1099	NC_018528	AAT	2	6	69319	69324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514103
1100	NC_018528	CAA	2	6	69416	69421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514103
1101	NC_018528	TAA	2	6	69429	69434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514103
1102	NC_018528	ATA	2	6	69482	69487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514103
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1105	NC_018528	TAA	2	6	69629	69634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514103
1106	NC_018528	T	6	6	69684	69689	0 %	100 %	0 %	0 %	403514103
1107	NC_018528	GC	3	6	69714	69719	0 %	0 %	50 %	50 %	403514103
1108	NC_018528	TGC	2	6	69743	69748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514103
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1111	NC_018528	AT	3	6	69842	69847	50 %	50 %	0 %	0 %	403514103
1112	NC_018528	ACC	2	6	69883	69888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514103
1113	NC_018528	AAG	2	6	69889	69894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514103
1114	NC_018528	GTA	2	6	69916	69921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514103
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1116	NC_018528	AAAT	2	8	69981	69988	75 %	25 %	0 %	0 %	403514103
1117	NC_018528	TTTA	2	8	69999	70006	25 %	75 %	0 %	0 %	403514103
1118	NC_018528	TAT	3	9	70028	70036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514103
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1120	NC_018528	TA	3	6	70070	70075	50 %	50 %	0 %	0 %	403514103
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1122	NC_018528	GAT	2	6	70195	70200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514103
1123	NC_018528	AGA	2	6	70290	70295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514103
1124	NC_018528	AAG	2	6	70347	70352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514103
1125	NC_018528	GCAA	2	8	70364	70371	50 %	0 %	25 %	25 %	403514103
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1127	NC_018528	ATT	2	6	70422	70427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514103
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1253	NC_018528	GGC	2	6	84411	84416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514113
1254	NC_018528	GAT	2	6	84520	84525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514113
1255	NC_018528	T	6	6	84591	84596	0 %	100 %	0 %	0 %	403514113
1256	NC_018528	AAAG	2	8	84600	84607	75 %	0 %	25 %	0 %	403514113
1257	NC_018528	A	6	6	84649	84654	100 %	0 %	0 %	0 %	403514113
1258	NC_018528	ATA	2	6	84784	84789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514114
1259	NC_018528	TTCA	2	8	84814	84821	25 %	50 %	0 %	25 %	403514114
1260	NC_018528	GAC	2	6	84921	84926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514114
1261	NC_018528	TGG	2	6	85002	85007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514114
1262	NC_018528	T	6	6	85075	85080	0 %	100 %	0 %	0 %	403514114
1263	NC_018528	TGAT	2	8	85116	85123	25 %	50 %	25 %	0 %	403514114
1264	NC_018528	GCC	2	6	85150	85155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403514114
1265	NC_018528	T	6	6	85223	85228	0 %	100 %	0 %	0 %	403514114
1266	NC_018528	GTGA	2	8	85241	85248	25 %	25 %	50 %	0 %	403514114
1267	NC_018528	CG	3	6	85391	85396	0 %	0 %	50 %	50 %	403514114
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1270	NC_018528	TCG	2	6	85487	85492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514114
1271	NC_018528	GTA	2	6	85504	85509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514114
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1273	NC_018528	TTTG	2	8	85764	85771	0 %	75 %	25 %	0 %	403514115
1274	NC_018528	ATG	2	6	85788	85793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514115
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1277	NC_018528	A	6	6	85869	85874	100 %	0 %	0 %	0 %	403514115
1278	NC_018528	T	6	6	85983	85988	0 %	100 %	0 %	0 %	403514116
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1281	NC_018528	CATA	2	8	86115	86122	50 %	25 %	0 %	25 %	403514116
1282	NC_018528	GTA	2	6	86135	86140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514116
1283	NC_018528	CTT	2	6	86205	86210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514116
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1287	NC_018528	TGT	2	6	86361	86366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514116
1288	NC_018528	GTA	2	6	86377	86382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514116
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1290	NC_018528	T	7	7	86397	86403	0 %	100 %	0 %	0 %	403514116
1291	NC_018528	ATAA	2	8	86418	86425	75 %	25 %	0 %	0 %	403514116
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1341	NC_018528	CGT	2	6	89438	89443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514119
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1366	NC_018528	ATT	2	6	90907	90912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514120
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1370	NC_018528	TAC	2	6	91312	91317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514120
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1378	NC_018528	AGA	2	6	91715	91720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514120
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1383	NC_018528	ACAA	2	8	92231	92238	75 %	0 %	0 %	25 %	403514121
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