MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 35998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018528	TCT	2	6	31284	31289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514064
502	NC_018528	AT	3	6	31468	31473	50 %	50 %	0 %	0 %	403514064
503	NC_018528	TCT	2	6	31485	31490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514064
504	NC_018528	AT	3	6	31513	31518	50 %	50 %	0 %	0 %	403514064
505	NC_018528	AT	3	6	31553	31558	50 %	50 %	0 %	0 %	403514064
506	NC_018528	CAATA	2	10	31602	31611	60 %	20 %	0 %	20 %	403514064
507	NC_018528	TTAA	2	8	31613	31620	50 %	50 %	0 %	0 %	403514064
508	NC_018528	AAAT	2	8	31786	31793	75 %	25 %	0 %	0 %	403514064
509	NC_018528	CAA	2	6	31794	31799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514064
510	NC_018528	CAC	2	6	31815	31820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514064
511	NC_018528	ACT	2	6	31825	31830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514064
512	NC_018528	TTC	2	6	31912	31917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514064
513	NC_018528	TA	3	6	32466	32471	50 %	50 %	0 %	0 %	403514065
514	NC_018528	TTTTA	2	10	32522	32531	20 %	80 %	0 %	0 %	403514065
515	NC_018528	CTT	2	6	32693	32698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514066
516	NC_018528	CTA	2	6	32813	32818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514066
517	NC_018528	AAAAT	2	10	32927	32936	80 %	20 %	0 %	0 %	403514066
518	NC_018528	ATAG	2	8	33005	33012	50 %	25 %	25 %	0 %	403514066
519	NC_018528	AAT	2	6	34241	34246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514067
520	NC_018528	TAC	2	6	34288	34293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514067
521	NC_018528	AAT	2	6	34313	34318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514067
522	NC_018528	ACC	2	6	34401	34406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514067
523	NC_018528	A	7	7	34409	34415	100 %	0 %	0 %	0 %	403514067
524	NC_018528	AAT	2	6	34489	34494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514068
525	NC_018528	A	6	6	34499	34504	100 %	0 %	0 %	0 %	403514068
526	NC_018528	AGA	2	6	34629	34634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514068
527	NC_018528	TAC	2	6	34813	34818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514068
528	NC_018528	CAT	2	6	34859	34864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514068
529	NC_018528	CTT	2	6	34918	34923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514068
530	NC_018528	GTAA	2	8	35093	35100	50 %	25 %	25 %	0 %	403514068
531	NC_018528	TTGA	2	8	35123	35130	25 %	50 %	25 %	0 %	403514068
532	NC_018528	ATA	2	6	35196	35201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514068
533	NC_018528	TAA	2	6	35218	35223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514068
534	NC_018528	ATG	2	6	35310	35315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514068
535	NC_018528	TAT	2	6	35374	35379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514068
536	NC_018528	TTC	2	6	35383	35388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514068
537	NC_018528	TG	4	8	35479	35486	0 %	50 %	50 %	0 %	403514068
538	NC_018528	ACTC	2	8	35610	35617	25 %	25 %	0 %	50 %	403514068
539	NC_018528	ATTA	2	8	36102	36109	50 %	50 %	0 %	0 %	403514069
540	NC_018528	TAT	2	6	36121	36126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514069
541	NC_018528	GCA	2	6	36240	36245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514069
542	NC_018528	TAG	2	6	36247	36252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514069
543	NC_018528	GTT	2	6	36320	36325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514069
544	NC_018528	ATC	2	6	36455	36460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514069
545	NC_018528	CAA	2	6	36463	36468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514069
546	NC_018528	GTT	2	6	36509	36514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514069
547	NC_018528	TCA	2	6	36525	36530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514069
548	NC_018528	AAT	2	6	36548	36553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514069
549	NC_018528	GTA	2	6	36581	36586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514069
550	NC_018528	TCT	2	6	36639	36644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514069
551	NC_018528	AGCAAT	2	12	36677	36688	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514069
552	NC_018528	CTT	2	6	36745	36750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514069
553	NC_018528	ACC	2	6	36776	36781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514069
554	NC_018528	TCA	2	6	36783	36788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514069
555	NC_018528	CTT	2	6	36811	36816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514069
556	NC_018528	TTC	2	6	36825	36830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514069
557	NC_018528	ACC	2	6	36938	36943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514069
558	NC_018528	TAA	2	6	36946	36951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514069
559	NC_018528	ACC	2	6	36986	36991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514069
560	NC_018528	ATC	2	6	37110	37115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514069
561	NC_018528	CTT	2	6	37249	37254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514069
562	NC_018528	AAG	2	6	37801	37806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514070
563	NC_018528	TAA	2	6	37807	37812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514070
564	NC_018528	AGT	2	6	37827	37832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514070
565	NC_018528	TA	3	6	37887	37892	50 %	50 %	0 %	0 %	403514070
566	NC_018528	ATT	2	6	37896	37901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514070
567	NC_018528	CTG	2	6	37942	37947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514070
568	NC_018528	TAA	2	6	37967	37972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514070
569	NC_018528	TCT	2	6	37995	38000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514070
570	NC_018528	TTG	2	6	38003	38008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514070
571	NC_018528	CATCCC	2	12	38011	38022	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	403514071
572	NC_018528	T	7	7	38166	38172	0 %	100 %	0 %	0 %	403514071
573	NC_018528	ATT	2	6	38374	38379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514072
574	NC_018528	ATG	2	6	38426	38431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514072
575	NC_018528	T	6	6	38457	38462	0 %	100 %	0 %	0 %	403514072
576	NC_018528	TTGG	2	8	38467	38474	0 %	50 %	50 %	0 %	403514072
577	NC_018528	CAG	2	6	38534	38539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514072
578	NC_018528	T	6	6	38546	38551	0 %	100 %	0 %	0 %	403514072
579	NC_018528	CAG	2	6	38617	38622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514072
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581	NC_018528	AATTT	2	10	38653	38662	40 %	60 %	0 %	0 %	403514072
582	NC_018528	AAGC	2	8	38680	38687	50 %	0 %	25 %	25 %	403514072
583	NC_018528	A	6	6	38696	38701	100 %	0 %	0 %	0 %	403514072
584	NC_018528	AATTT	2	10	38806	38815	40 %	60 %	0 %	0 %	403514072
585	NC_018528	TGA	3	9	38859	38867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514072
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588	NC_018528	ATC	2	6	38995	39000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514072
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591	NC_018528	ATT	2	6	39132	39137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514073
592	NC_018528	TCA	2	6	39145	39150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514073
593	NC_018528	TCA	2	6	39217	39222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514073
594	NC_018528	TAA	2	6	39245	39250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514073
595	NC_018528	T	6	6	39334	39339	0 %	100 %	0 %	0 %	403514073
596	NC_018528	GAT	2	6	39386	39391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514073
597	NC_018528	TGG	2	6	39406	39411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514073
598	NC_018528	GTTA	2	8	39581	39588	25 %	50 %	25 %	0 %	403514073
599	NC_018528	GAT	2	6	39599	39604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514073
600	NC_018528	ATT	2	6	39730	39735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514073
601	NC_018528	ATTT	2	8	40883	40890	25 %	75 %	0 %	0 %	403514074
602	NC_018528	GAA	2	6	41070	41075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514074
603	NC_018528	ATT	2	6	41077	41082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514074
604	NC_018528	TTTG	2	8	41151	41158	0 %	75 %	25 %	0 %	403514074
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606	NC_018528	AAG	2	6	41203	41208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514074
607	NC_018528	GTT	2	6	41215	41220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514074
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609	NC_018528	ACT	2	6	41329	41334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514074
610	NC_018528	AAG	2	6	41407	41412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514074
611	NC_018528	CAA	2	6	41514	41519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514074
612	NC_018528	GCA	2	6	41703	41708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514074
613	NC_018528	TCAA	2	8	41817	41824	50 %	25 %	0 %	25 %	403514074
614	NC_018528	ATGGTG	2	12	42022	42033	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	403514074
615	NC_018528	ATG	2	6	42233	42238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514075
616	NC_018528	GTT	2	6	42240	42245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514075
617	NC_018528	T	6	6	42271	42276	0 %	100 %	0 %	0 %	403514075
618	NC_018528	ATT	2	6	42369	42374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514075
619	NC_018528	CAT	2	6	42399	42404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514075
620	NC_018528	CAG	2	6	42443	42448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514075
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622	NC_018528	AGA	2	6	42474	42479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514075
623	NC_018528	CG	3	6	42529	42534	0 %	0 %	50 %	50 %	403514075
624	NC_018528	ATG	2	6	42566	42571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514075
625	NC_018528	A	6	6	42776	42781	100 %	0 %	0 %	0 %	403514076
626	NC_018528	ATATT	2	10	42805	42814	40 %	60 %	0 %	0 %	403514076
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