MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 35998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018528	GAT	3	9	290023	290031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514307
5002	NC_018528	TGCT	2	8	290261	290268	0 %	50 %	25 %	25 %	403514307
5003	NC_018528	CAC	2	6	290272	290277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514307
5004	NC_018528	ACT	2	6	290339	290344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514307
5005	NC_018528	GTGAAG	2	12	290369	290380	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	403514307
5006	NC_018528	CTG	2	6	290399	290404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514307
5007	NC_018528	AAG	2	6	290479	290484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514307
5008	NC_018528	TAC	2	6	290520	290525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514307
5009	NC_018528	ATT	2	6	290550	290555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514307
5010	NC_018528	GAT	2	6	290560	290565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514307
5011	NC_018528	GAA	2	6	290590	290595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514307
5012	NC_018528	AAT	2	6	290602	290607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514307
5013	NC_018528	CTT	2	6	290625	290630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514307
5014	NC_018528	TGA	2	6	290661	290666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514307
5015	NC_018528	GAT	2	6	290674	290679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514307
5016	NC_018528	AGT	2	6	290701	290706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514307
5017	NC_018528	CTA	2	6	290726	290731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514307
5018	NC_018528	TAC	2	6	290740	290745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514307
5019	NC_018528	GAT	2	6	290773	290778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514307
5020	NC_018528	GAA	2	6	290781	290786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514307
5021	NC_018528	ACT	2	6	290806	290811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514307
5022	NC_018528	ATGA	2	8	290830	290837	50 %	25 %	25 %	0 %	403514307
5023	NC_018528	TCAC	2	8	291009	291016	25 %	25 %	0 %	50 %	403514307
5024	NC_018528	GGT	2	6	291118	291123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514307
5025	NC_018528	AAGG	2	8	291154	291161	50 %	0 %	50 %	0 %	403514307
5026	NC_018528	TCAG	2	8	291237	291244	25 %	25 %	25 %	25 %	403514307
5027	NC_018528	TCG	2	6	291255	291260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514307
5028	NC_018528	GTTG	2	8	291261	291268	0 %	50 %	50 %	0 %	403514307
5029	NC_018528	TTA	2	6	291284	291289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514307
5030	NC_018528	ATG	2	6	291296	291301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514307
5031	NC_018528	ATT	2	6	291366	291371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514307
5032	NC_018528	TGGT	2	8	291380	291387	0 %	50 %	50 %	0 %	403514307
5033	NC_018528	CTG	2	6	291395	291400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514307
5034	NC_018528	ATG	2	6	291451	291456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514307
5035	NC_018528	GAA	2	6	291583	291588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514307
5036	NC_018528	TCAA	2	8	291624	291631	50 %	25 %	0 %	25 %	403514307
5037	NC_018528	GGT	2	6	291676	291681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514307
5038	NC_018528	ATTCA	2	10	291791	291800	40 %	40 %	0 %	20 %	403514307
5039	NC_018528	CAG	2	6	291809	291814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514307
5040	NC_018528	GTG	2	6	291917	291922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514307
5041	NC_018528	ACT	2	6	291982	291987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514307
5042	NC_018528	TTA	2	6	292175	292180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514307
5043	NC_018528	TGG	2	6	292185	292190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514307
5044	NC_018528	GCT	2	6	292264	292269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514307
5045	NC_018528	ACT	2	6	292282	292287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514307
5046	NC_018528	CTT	2	6	292330	292335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514307
5047	NC_018528	TTA	2	6	292352	292357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514307
5048	NC_018528	ATT	2	6	292366	292371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514307
5049	NC_018528	CTG	2	6	292373	292378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514307
5050	NC_018528	AAG	2	6	292426	292431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514307
5051	NC_018528	GAAA	2	8	292473	292480	75 %	0 %	25 %	0 %	403514307
5052	NC_018528	AGTA	2	8	292489	292496	50 %	25 %	25 %	0 %	403514307
5053	NC_018528	T	6	6	295463	295468	0 %	100 %	0 %	0 %	403514308
5054	NC_018528	GATAGT	2	12	295520	295531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514308
5055	NC_018528	CAT	2	6	295535	295540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514308
5056	NC_018528	A	6	6	295554	295559	100 %	0 %	0 %	0 %	403514308
5057	NC_018528	TAA	2	6	295560	295565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514308
5058	NC_018528	AAG	2	6	295570	295575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514308
5059	NC_018528	CAA	2	6	295681	295686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514308
5060	NC_018528	A	6	6	295685	295690	100 %	0 %	0 %	0 %	403514308
5061	NC_018528	AAT	2	6	295695	295700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514308
5062	NC_018528	ATA	2	6	295784	295789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514308
5063	NC_018528	AGA	2	6	295831	295836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514308
5064	NC_018528	AGGAA	2	10	295838	295847	60 %	0 %	40 %	0 %	403514308
5065	NC_018528	TCC	2	6	295902	295907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403514308
5066	NC_018528	TTGC	2	8	295944	295951	0 %	50 %	25 %	25 %	403514308
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5068	NC_018528	CAG	2	6	296004	296009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514308
5069	NC_018528	A	6	6	296048	296053	100 %	0 %	0 %	0 %	403514308
5070	NC_018528	TAAAT	2	10	296137	296146	60 %	40 %	0 %	0 %	403514308
5071	NC_018528	A	7	7	296149	296155	100 %	0 %	0 %	0 %	403514308
5072	NC_018528	AAGTCA	2	12	296385	296396	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514309
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5079	NC_018528	CAT	2	6	296660	296665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514309
5080	NC_018528	GTG	2	6	296668	296673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514309
5081	NC_018528	AAAGC	2	10	296702	296711	60 %	0 %	20 %	20 %	403514309
5082	NC_018528	AAGA	2	8	296730	296737	75 %	0 %	25 %	0 %	403514309
5083	NC_018528	AAT	2	6	296753	296758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514310
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5086	NC_018528	AG	3	6	296860	296865	50 %	0 %	50 %	0 %	403514310
5087	NC_018528	CAAGA	2	10	296907	296916	60 %	0 %	20 %	20 %	403514310
5088	NC_018528	GAA	2	6	296943	296948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514310
5089	NC_018528	AAC	2	6	296955	296960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514310
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5091	NC_018528	AGA	2	6	297039	297044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514310
5092	NC_018528	ACT	2	6	297045	297050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514310
5093	NC_018528	AC	3	6	297095	297100	50 %	0 %	0 %	50 %	403514310
5094	NC_018528	ACA	2	6	297142	297147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514310
5095	NC_018528	AAG	2	6	297162	297167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514310
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5097	NC_018528	ACT	4	12	297337	297348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514311
5098	NC_018528	TAC	2	6	297361	297366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514311
5099	NC_018528	TGGA	2	8	297421	297428	25 %	25 %	50 %	0 %	403514311
5100	NC_018528	GAA	2	6	297430	297435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514311
5101	NC_018528	ACT	2	6	297469	297474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514311
5102	NC_018528	ATT	2	6	297502	297507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514311
5103	NC_018528	AACGCT	2	12	297733	297744	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403514311
5104	NC_018528	TTAA	2	8	297799	297806	50 %	50 %	0 %	0 %	403514311
5105	NC_018528	ACG	2	6	297824	297829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514311
5106	NC_018528	GAA	2	6	297883	297888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514311
5107	NC_018528	CGT	2	6	297898	297903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514311
5108	NC_018528	AATT	2	8	297908	297915	50 %	50 %	0 %	0 %	403514311
5109	NC_018528	GAC	2	6	297934	297939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514311
5110	NC_018528	CAT	2	6	297942	297947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514311
5111	NC_018528	GAA	2	6	297967	297972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514311
5112	NC_018528	ACG	2	6	297980	297985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514311
5113	NC_018528	TTC	2	6	298027	298032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514311
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5115	NC_018528	ACT	2	6	298097	298102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514311
5116	NC_018528	CAC	2	6	298109	298114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514311
5117	NC_018528	GAC	2	6	298177	298182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514311
5118	NC_018528	AAG	2	6	298183	298188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514311
5119	NC_018528	GAA	2	6	298407	298412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514311
5120	NC_018528	CAC	2	6	298413	298418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514311
5121	NC_018528	GATG	2	8	298533	298540	25 %	25 %	50 %	0 %	403514311
5122	NC_018528	GAA	2	6	298561	298566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514311
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5125	NC_018528	TGT	2	6	298860	298865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514311
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5194	NC_018528	TTA	2	6	302541	302546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514317
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5227	NC_018528	TAC	2	6	304585	304590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514322
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5231	NC_018528	A	6	6	304895	304900	100 %	0 %	0 %	0 %	403514323
5232	NC_018528	CGT	2	6	304946	304951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514323
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5235	NC_018528	AAG	2	6	305182	305187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514324
5236	NC_018528	TTCT	2	8	305194	305201	0 %	75 %	0 %	25 %	403514324
5237	NC_018528	AAG	2	6	305211	305216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514324
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5239	NC_018528	AAG	2	6	305250	305255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514324
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5241	NC_018528	A	6	6	305343	305348	100 %	0 %	0 %	0 %	403514324
5242	NC_018528	GAA	2	6	305393	305398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514325
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5339	NC_018528	AGTT	2	8	310173	310180	25 %	50 %	25 %	0 %	403514334
5340	NC_018528	GAA	2	6	310181	310186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514334
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5347	NC_018528	GAT	2	6	310463	310468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514334
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5349	NC_018528	AAAG	2	8	310540	310547	75 %	0 %	25 %	0 %	403514334
5350	NC_018528	TAAT	2	8	310560	310567	50 %	50 %	0 %	0 %	403514334
5351	NC_018528	TAA	2	6	310618	310623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514334
5352	NC_018528	GAT	2	6	310711	310716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514335
5353	NC_018528	TACCT	2	10	310746	310755	20 %	40 %	0 %	40 %	403514335
5354	NC_018528	CTA	2	6	310790	310795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514335
5355	NC_018528	TTG	3	9	311127	311135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514337
5356	NC_018528	ACAT	2	8	311141	311148	50 %	25 %	0 %	25 %	403514337
5357	NC_018528	AAG	2	6	311174	311179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514337
5358	NC_018528	GTTC	2	8	311210	311217	0 %	50 %	25 %	25 %	403514337
5359	NC_018528	AGA	2	6	311233	311238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514337
5360	NC_018528	CCG	2	6	311356	311361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403514337
5361	NC_018528	AAT	2	6	311393	311398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514337
5362	NC_018528	CTCGTA	2	12	311400	311411	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403514337
5363	NC_018528	CGT	2	6	311486	311491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514338
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5385	NC_018528	TCAA	2	8	312494	312501	50 %	25 %	0 %	25 %	403514339
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5479	NC_018528	T	6	6	316643	316648	0 %	100 %	0 %	0 %	403514344
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5483	NC_018528	GTC	2	6	316876	316881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514345
5484	NC_018528	AC	3	6	316930	316935	50 %	0 %	0 %	50 %	403514345
5485	NC_018528	CTA	2	6	317018	317023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514345
5486	NC_018528	CCA	2	6	317024	317029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514345
5487	NC_018528	GTG	2	6	317041	317046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514345
5488	NC_018528	TTGC	2	8	317073	317080	0 %	50 %	25 %	25 %	403514345
5489	NC_018528	TCA	2	6	317144	317149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514345
5490	NC_018528	CAA	2	6	317225	317230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514345
5491	NC_018528	TTAAT	2	10	317232	317241	40 %	60 %	0 %	0 %	403514345
5492	NC_018528	AAT	2	6	317252	317257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514346
5493	NC_018528	CAA	2	6	317262	317267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514346
5494	NC_018528	CGC	2	6	317289	317294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403514346
5495	NC_018528	AAC	2	6	317404	317409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514346
5496	NC_018528	AACTGA	2	12	317420	317431	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514346
5497	NC_018528	ACG	2	6	317440	317445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514346
5498	NC_018528	GGT	3	9	317463	317471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514346
5499	NC_018528	CTT	2	6	317517	317522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514346
5500	NC_018528	AAG	2	6	317553	317558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514346

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