MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 35998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018528	TTA	2	6	265169	265174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514289
4502	NC_018528	ATA	2	6	265203	265208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514289
4503	NC_018528	TTCA	2	8	265224	265231	25 %	50 %	0 %	25 %	403514289
4504	NC_018528	TGGAAT	2	12	265258	265269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514289
4505	NC_018528	TCT	2	6	265286	265291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514289
4506	NC_018528	CTT	2	6	265296	265301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514289
4507	NC_018528	TTGAAC	2	12	265323	265334	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403514289
4508	NC_018528	GAA	2	6	265421	265426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514289
4509	NC_018528	ATT	2	6	265433	265438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514289
4510	NC_018528	GGTAC	2	10	265439	265448	20 %	20 %	40 %	20 %	403514289
4511	NC_018528	GTA	2	6	265592	265597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514289
4512	NC_018528	ATT	2	6	265598	265603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514289
4513	NC_018528	AAT	2	6	265607	265612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514289
4514	NC_018528	GCT	2	6	265637	265642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514289
4515	NC_018528	TAT	2	6	265709	265714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514289
4516	NC_018528	ATA	2	6	265720	265725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514289
4517	NC_018528	AGCA	2	8	265868	265875	50 %	0 %	25 %	25 %	403514290
4518	NC_018528	TTAAAG	2	12	265886	265897	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403514290
4519	NC_018528	ATT	2	6	265900	265905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514290
4520	NC_018528	TAT	2	6	265964	265969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514290
4521	NC_018528	GAT	2	6	265981	265986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514290
4522	NC_018528	TAA	2	6	266069	266074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514290
4523	NC_018528	TTTC	2	8	266105	266112	0 %	75 %	0 %	25 %	403514290
4524	NC_018528	AAAAC	2	10	266120	266129	80 %	0 %	0 %	20 %	403514290
4525	NC_018528	T	6	6	266170	266175	0 %	100 %	0 %	0 %	403514290
4526	NC_018528	CAA	2	6	266196	266201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514290
4527	NC_018528	ATATTA	2	12	266300	266311	50 %	50 %	0 %	0 %	403514290
4528	NC_018528	AATT	2	8	266327	266334	50 %	50 %	0 %	0 %	403514290
4529	NC_018528	ATG	2	6	266342	266347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514290
4530	NC_018528	CGT	2	6	266368	266373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514290
4531	NC_018528	A	6	6	266431	266436	100 %	0 %	0 %	0 %	403514290
4532	NC_018528	T	6	6	266478	266483	0 %	100 %	0 %	0 %	403514291
4533	NC_018528	TG	3	6	266490	266495	0 %	50 %	50 %	0 %	403514291
4534	NC_018528	ATA	2	6	266531	266536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514291
4535	NC_018528	AAC	2	6	266569	266574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514291
4536	NC_018528	CTTT	2	8	266580	266587	0 %	75 %	0 %	25 %	403514291
4537	NC_018528	GGCA	2	8	266632	266639	25 %	0 %	50 %	25 %	403514291
4538	NC_018528	TTC	2	6	266652	266657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514291
4539	NC_018528	CTG	2	6	266682	266687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514291
4540	NC_018528	TTAA	2	8	266747	266754	50 %	50 %	0 %	0 %	403514291
4541	NC_018528	TCA	2	6	266876	266881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514291
4542	NC_018528	AT	3	6	266891	266896	50 %	50 %	0 %	0 %	403514291
4543	NC_018528	GAA	2	6	266914	266919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514291
4544	NC_018528	TAG	2	6	266955	266960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514291
4545	NC_018528	AAGT	2	8	266972	266979	50 %	25 %	25 %	0 %	403514291
4546	NC_018528	CA	3	6	267079	267084	50 %	0 %	0 %	50 %	403514291
4547	NC_018528	TTC	2	6	267097	267102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514291
4548	NC_018528	TGT	2	6	267145	267150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514291
4549	NC_018528	TCTT	2	8	267158	267165	0 %	75 %	0 %	25 %	403514291
4550	NC_018528	TAA	2	6	267180	267185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514291
4551	NC_018528	ATT	2	6	267366	267371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514292
4552	NC_018528	CTT	2	6	267415	267420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514292
4553	NC_018528	CTG	2	6	267429	267434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514292
4554	NC_018528	CAA	2	6	267504	267509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514292
4555	NC_018528	CCAT	2	8	267551	267558	25 %	25 %	0 %	50 %	403514292
4556	NC_018528	TAA	2	6	267660	267665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514292
4557	NC_018528	CTT	2	6	267687	267692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514292
4558	NC_018528	TGT	2	6	267723	267728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514292
4559	NC_018528	CCAC	2	8	267758	267765	25 %	0 %	0 %	75 %	403514292
4560	NC_018528	TTG	2	6	267767	267772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514292
4561	NC_018528	GAC	2	6	267873	267878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514292
4562	NC_018528	ACT	2	6	267974	267979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514292
4563	NC_018528	CAA	2	6	268005	268010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514292
4564	NC_018528	TGA	2	6	268024	268029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514292
4565	NC_018528	CAG	2	6	268092	268097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514292
4566	NC_018528	TAA	2	6	268098	268103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514292
4567	NC_018528	ATA	2	6	268226	268231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514292
4568	NC_018528	TTC	2	6	268237	268242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514292
4569	NC_018528	TTG	2	6	268252	268257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514292
4570	NC_018528	CT	3	6	268327	268332	0 %	50 %	0 %	50 %	403514292
4571	NC_018528	AAT	2	6	268478	268483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514293
4572	NC_018528	AGACAA	2	12	268583	268594	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	403514293
4573	NC_018528	A	6	6	268618	268623	100 %	0 %	0 %	0 %	403514293
4574	NC_018528	ATGA	2	8	268665	268672	50 %	25 %	25 %	0 %	403514293
4575	NC_018528	AGA	2	6	268721	268726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514293
4576	NC_018528	ATT	2	6	268734	268739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514293
4577	NC_018528	GAT	2	6	268743	268748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514293
4578	NC_018528	ATTAGA	2	12	268770	268781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403514293
4579	NC_018528	GCG	2	6	268795	268800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514293
4580	NC_018528	ACA	2	6	268887	268892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514293
4581	NC_018528	GTT	2	6	268893	268898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514293
4582	NC_018528	AAC	2	6	268927	268932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514293
4583	NC_018528	GAT	2	6	268944	268949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514293
4584	NC_018528	TGA	2	6	269011	269016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514293
4585	NC_018528	AGA	2	6	269055	269060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514294
4586	NC_018528	AAT	2	6	269071	269076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514294
4587	NC_018528	TAG	2	6	269189	269194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514294
4588	NC_018528	GAAAAT	2	12	269197	269208	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403514294
4589	NC_018528	AGTT	2	8	269304	269311	25 %	50 %	25 %	0 %	403514294
4590	NC_018528	T	6	6	269349	269354	0 %	100 %	0 %	0 %	403514294
4591	NC_018528	A	6	6	269362	269367	100 %	0 %	0 %	0 %	403514294
4592	NC_018528	A	6	6	269439	269444	100 %	0 %	0 %	0 %	403514294
4593	NC_018528	A	6	6	269512	269517	100 %	0 %	0 %	0 %	403514294
4594	NC_018528	TAG	2	6	269525	269530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514294
4595	NC_018528	TAGA	2	8	269582	269589	50 %	25 %	25 %	0 %	403514294
4596	NC_018528	GAATT	2	10	269603	269612	40 %	40 %	20 %	0 %	403514294
4597	NC_018528	TGA	2	6	269619	269624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514294
4598	NC_018528	TGCACC	2	12	269772	269783	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	403514294
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4601	NC_018528	TTA	2	6	269896	269901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514294
4602	NC_018528	TGA	2	6	269934	269939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514294
4603	NC_018528	TTA	2	6	269993	269998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514294
4604	NC_018528	AT	3	6	270088	270093	50 %	50 %	0 %	0 %	403514294
4605	NC_018528	TC	3	6	270095	270100	0 %	50 %	0 %	50 %	403514294
4606	NC_018528	TTC	2	6	270172	270177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514294
4607	NC_018528	AGCAA	2	10	270264	270273	60 %	0 %	20 %	20 %	403514294
4608	NC_018528	GTA	2	6	270355	270360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514294
4609	NC_018528	ATT	2	6	270423	270428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514294
4610	NC_018528	TGT	2	6	270519	270524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514294
4611	NC_018528	AAT	2	6	270574	270579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514294
4612	NC_018528	ATT	2	6	270627	270632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514294
4613	NC_018528	CAG	2	6	270638	270643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514294
4614	NC_018528	TAA	2	6	270699	270704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514294
4615	NC_018528	GGC	2	6	270709	270714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514294
4616	NC_018528	TGA	2	6	270768	270773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514294
4617	NC_018528	TTGA	2	8	270775	270782	25 %	50 %	25 %	0 %	403514294
4618	NC_018528	TCA	2	6	270823	270828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514294
4619	NC_018528	GAT	3	9	270829	270837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514294
4620	NC_018528	AGA	2	6	270912	270917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514294
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4622	NC_018528	ATA	2	6	271016	271021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514294
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4978	NC_018528	AAG	2	6	288928	288933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514307
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