MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000 chromosome

Total Repeats: 1544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017949	AAAGT	2	10	3938	3947	60 %	20 %	20 %	0 %	389853201
2	NC_017949	GAGGT	2	10	7476	7485	20 %	20 %	60 %	0 %	389853202
3	NC_017949	ATTAT	2	10	9479	9488	40 %	60 %	0 %	0 %	389853202
4	NC_017949	AAGCA	2	10	10177	10186	60 %	0 %	20 %	20 %	389853204
5	NC_017949	ATGGT	2	10	12733	12742	20 %	40 %	40 %	0 %	389853207
6	NC_017949	GCATG	2	10	14852	14861	20 %	20 %	40 %	20 %	389853210
7	NC_017949	ATTTT	2	10	15682	15691	20 %	80 %	0 %	0 %	389853211
8	NC_017949	AAATG	2	10	15974	15983	60 %	20 %	20 %	0 %	389853211
9	NC_017949	TGCGA	2	10	16991	17000	20 %	20 %	40 %	20 %	389853211
10	NC_017949	TACTT	2	10	17636	17645	20 %	60 %	0 %	20 %	389853211
11	NC_017949	TGATT	2	10	19703	19712	20 %	60 %	20 %	0 %	389853214
12	NC_017949	TGGTA	2	10	24998	25007	20 %	40 %	40 %	0 %	389853218
13	NC_017949	TGGCT	2	10	26996	27005	0 %	40 %	40 %	20 %	389853219
14	NC_017949	ATTTT	2	10	27091	27100	20 %	80 %	0 %	0 %	389853219
15	NC_017949	AGAGA	2	10	28009	28018	60 %	0 %	40 %	0 %	389853219
16	NC_017949	CTATC	2	10	33228	33237	20 %	40 %	0 %	40 %	389853223
17	NC_017949	ATTTT	2	10	35005	35014	20 %	80 %	0 %	0 %	389853226
18	NC_017949	CTTTC	2	10	35845	35854	0 %	60 %	0 %	40 %	389853227
19	NC_017949	CAATC	2	10	37701	37710	40 %	20 %	0 %	40 %	389853229
20	NC_017949	TTTTC	2	10	38852	38861	0 %	80 %	0 %	20 %	389853233
21	NC_017949	TTTAC	2	10	39958	39967	20 %	60 %	0 %	20 %	389853236
22	NC_017949	CTAAT	2	10	40620	40629	40 %	40 %	0 %	20 %	389853237
23	NC_017949	AGAAA	2	10	40905	40914	80 %	0 %	20 %	0 %	389853238
24	NC_017949	CGGAG	2	10	41063	41072	20 %	0 %	60 %	20 %	389853238
25	NC_017949	ATGAA	2	10	42449	42458	60 %	20 %	20 %	0 %	389853241
26	NC_017949	TCATT	2	10	42860	42869	20 %	60 %	0 %	20 %	389853242
27	NC_017949	AAAAT	2	10	45004	45013	80 %	20 %	0 %	0 %	389853245
28	NC_017949	GAAAA	2	10	46591	46600	80 %	0 %	20 %	0 %	389853248
29	NC_017949	AATAA	2	10	51600	51609	80 %	20 %	0 %	0 %	389853253
30	NC_017949	TATAA	2	10	55279	55288	60 %	40 %	0 %	0 %	389853257
31	NC_017949	TAAGC	2	10	56129	56138	40 %	20 %	20 %	20 %	389853259
32	NC_017949	TGGAT	2	10	56689	56698	20 %	40 %	40 %	0 %	389853260
33	NC_017949	AAAAG	2	10	57154	57163	80 %	0 %	20 %	0 %	389853261
34	NC_017949	TCAAA	2	10	57322	57331	60 %	20 %	0 %	20 %	389853261
35	NC_017949	GTGAG	2	10	60219	60228	20 %	20 %	60 %	0 %	389853263
36	NC_017949	AATTA	2	10	61501	61510	60 %	40 %	0 %	0 %	389853264
37	NC_017949	ATTAT	2	10	61774	61783	40 %	60 %	0 %	0 %	389853264
38	NC_017949	AATCA	2	10	65834	65843	60 %	20 %	0 %	20 %	389853268
39	NC_017949	AATTT	2	10	66427	66436	40 %	60 %	0 %	0 %	389853268
40	NC_017949	GCTTG	2	10	69521	69530	0 %	40 %	40 %	20 %	389853271
41	NC_017949	TCCAT	2	10	69872	69881	20 %	40 %	0 %	40 %	389853271
42	NC_017949	AAAAT	2	10	73783	73792	80 %	20 %	0 %	0 %	389853275
43	NC_017949	ATTAA	2	10	75758	75767	60 %	40 %	0 %	0 %	389853277
44	NC_017949	CAAGC	2	10	81184	81193	40 %	0 %	20 %	40 %	389853282
45	NC_017949	CCATT	2	10	83425	83434	20 %	40 %	0 %	40 %	389853284
46	NC_017949	GAAGT	2	10	83869	83878	40 %	20 %	40 %	0 %	389853285
47	NC_017949	ACAAG	2	10	86149	86158	60 %	0 %	20 %	20 %	389853288
48	NC_017949	TCCAA	2	10	86305	86314	40 %	20 %	0 %	40 %	389853288
49	NC_017949	TGAGT	2	10	88657	88666	20 %	40 %	40 %	0 %	389853290
50	NC_017949	AATTT	2	10	90590	90599	40 %	60 %	0 %	0 %	389853293
51	NC_017949	ACTGG	2	10	91421	91430	20 %	20 %	40 %	20 %	389853294
52	NC_017949	TTATT	2	10	94209	94218	20 %	80 %	0 %	0 %	389853298
53	NC_017949	TTGCT	2	10	95696	95705	0 %	60 %	20 %	20 %	389853299
54	NC_017949	TGAGT	2	10	97071	97080	20 %	40 %	40 %	0 %	389853300
55	NC_017949	GCAGA	2	10	97686	97695	40 %	0 %	40 %	20 %	389853301
56	NC_017949	AAGCT	2	10	100413	100422	40 %	20 %	20 %	20 %	389853304
57	NC_017949	TGGAT	2	10	101408	101417	20 %	40 %	40 %	0 %	389853305
58	NC_017949	CAAGA	2	10	104794	104803	60 %	0 %	20 %	20 %	389853310
59	NC_017949	AAAGA	2	10	109285	109294	80 %	0 %	20 %	0 %	389853313
60	NC_017949	AGAGT	2	10	109695	109704	40 %	20 %	40 %	0 %	389853314
61	NC_017949	TGGTT	2	10	110368	110377	0 %	60 %	40 %	0 %	389853314
62	NC_017949	TCGTA	2	10	113435	113444	20 %	40 %	20 %	20 %	389853318
63	NC_017949	GAAGC	2	10	114682	114691	40 %	0 %	40 %	20 %	389853320
64	NC_017949	TACAA	2	10	115483	115492	60 %	20 %	0 %	20 %	389853321
65	NC_017949	GATTT	2	10	118537	118546	20 %	60 %	20 %	0 %	389853324
66	NC_017949	TCAAA	2	10	120967	120976	60 %	20 %	0 %	20 %	389853327
67	NC_017949	TCGCA	2	10	124595	124604	20 %	20 %	20 %	40 %	389853331
68	NC_017949	TATTC	2	10	125428	125437	20 %	60 %	0 %	20 %	389853332
69	NC_017949	TTTTA	2	10	127602	127611	20 %	80 %	0 %	0 %	389853334
70	NC_017949	AAATG	2	10	128859	128868	60 %	20 %	20 %	0 %	389853335
71	NC_017949	CAAAA	2	10	128988	128997	80 %	0 %	0 %	20 %	389853335
72	NC_017949	ATTTT	2	10	129698	129707	20 %	80 %	0 %	0 %	389853336
73	NC_017949	TTGTC	2	10	130078	130087	0 %	60 %	20 %	20 %	389853336
74	NC_017949	TGGAT	2	10	134083	134092	20 %	40 %	40 %	0 %	389853342
75	NC_017949	GAAGG	2	10	134162	134171	40 %	0 %	60 %	0 %	389853342
76	NC_017949	AATTA	2	10	135064	135073	60 %	40 %	0 %	0 %	389853342
77	NC_017949	ATTTT	2	10	135970	135979	20 %	80 %	0 %	0 %	389853343
78	NC_017949	TTTTC	2	10	137274	137283	0 %	80 %	0 %	20 %	389853344
79	NC_017949	ACCAG	2	10	137708	137717	40 %	0 %	20 %	40 %	389853344
80	NC_017949	CCAAA	2	10	137819	137828	60 %	0 %	0 %	40 %	389853344
81	NC_017949	TGGCT	2	10	138782	138791	0 %	40 %	40 %	20 %	389853346
82	NC_017949	TCAAA	2	10	139360	139369	60 %	20 %	0 %	20 %	389853347
83	NC_017949	TTTTA	2	10	139633	139642	20 %	80 %	0 %	0 %	389853347
84	NC_017949	CAGGT	2	10	141833	141842	20 %	20 %	40 %	20 %	389853350
85	NC_017949	GTTTG	2	10	141894	141903	0 %	60 %	40 %	0 %	389853350
86	NC_017949	AGGAT	2	10	142352	142361	40 %	20 %	40 %	0 %	389853351
87	NC_017949	TAAAA	2	10	145186	145195	80 %	20 %	0 %	0 %	389853356
88	NC_017949	TTAAC	2	10	152904	152913	40 %	40 %	0 %	20 %	389853366
89	NC_017949	AAACA	2	10	153660	153669	80 %	0 %	0 %	20 %	389853366
90	NC_017949	ATTTT	2	10	158192	158201	20 %	80 %	0 %	0 %	389853370
91	NC_017949	CCTTT	2	10	160628	160637	0 %	60 %	0 %	40 %	389853374
92	NC_017949	TAATT	2	10	162689	162698	40 %	60 %	0 %	0 %	389853375
93	NC_017949	TACAA	2	10	163631	163640	60 %	20 %	0 %	20 %	389853376
94	NC_017949	TGATT	2	10	166009	166018	20 %	60 %	20 %	0 %	389853378
95	NC_017949	GATTG	2	10	167401	167410	20 %	40 %	40 %	0 %	389853379
96	NC_017949	AGCCA	2	10	169507	169516	40 %	0 %	20 %	40 %	389853381
97	NC_017949	TTGGC	2	10	170402	170411	0 %	40 %	40 %	20 %	389853381
98	NC_017949	AAAGT	2	10	171276	171285	60 %	20 %	20 %	0 %	389853383
99	NC_017949	AATTT	2	10	171435	171444	40 %	60 %	0 %	0 %	389853383
100	NC_017949	CCAAA	2	10	176538	176547	60 %	0 %	0 %	40 %	389853389
101	NC_017949	GTAAA	2	10	178735	178744	60 %	20 %	20 %	0 %	389853392
102	NC_017949	AAATT	2	10	179889	179898	60 %	40 %	0 %	0 %	389853393
103	NC_017949	TAAAT	2	10	181682	181691	60 %	40 %	0 %	0 %	389853395
104	NC_017949	AAATA	2	10	187518	187527	80 %	20 %	0 %	0 %	389853400
105	NC_017949	TCCTT	2	10	188469	188478	0 %	60 %	0 %	40 %	389853402
106	NC_017949	AAAAT	2	10	188484	188493	80 %	20 %	0 %	0 %	389853402
107	NC_017949	ACTAA	2	10	188523	188532	60 %	20 %	0 %	20 %	389853402
108	NC_017949	AAAAG	2	10	189023	189032	80 %	0 %	20 %	0 %	389853402
109	NC_017949	TGGCT	2	10	195712	195721	0 %	40 %	40 %	20 %	389853409
110	NC_017949	TTCAA	2	10	197051	197060	40 %	40 %	0 %	20 %	389853411
111	NC_017949	TGATT	2	10	197723	197732	20 %	60 %	20 %	0 %	389853412
112	NC_017949	GCAAA	2	10	200211	200220	60 %	0 %	20 %	20 %	389853414
113	NC_017949	ACAAA	2	10	200577	200586	80 %	0 %	0 %	20 %	389853414
114	NC_017949	ATTTA	2	10	202459	202468	40 %	60 %	0 %	0 %	389853416
115	NC_017949	TAATT	2	10	204105	204114	40 %	60 %	0 %	0 %	389853418
116	NC_017949	CAATT	2	10	204200	204209	40 %	40 %	0 %	20 %	389853418
117	NC_017949	TCTTA	2	10	204677	204686	20 %	60 %	0 %	20 %	389853418
118	NC_017949	GATTG	2	10	207165	207174	20 %	40 %	40 %	0 %	389853420
119	NC_017949	TAAAT	2	10	209761	209770	60 %	40 %	0 %	0 %	389853423
120	NC_017949	TAAAT	2	10	210996	211005	60 %	40 %	0 %	0 %	389853425
121	NC_017949	AATTA	2	10	211070	211079	60 %	40 %	0 %	0 %	389853425
122	NC_017949	AAAGA	2	10	214196	214205	80 %	0 %	20 %	0 %	389853428
123	NC_017949	AGAAA	2	10	217332	217341	80 %	0 %	20 %	0 %	389853430
124	NC_017949	TATCC	2	10	217383	217392	20 %	40 %	0 %	40 %	389853430
125	NC_017949	TTTTG	2	10	218391	218400	0 %	80 %	20 %	0 %	389853430
126	NC_017949	ATTTA	4	20	218782	218801	40 %	60 %	0 %	0 %	389853431
127	NC_017949	GGGAT	2	10	221815	221824	20 %	20 %	60 %	0 %	389853432
128	NC_017949	TGAGA	2	10	227510	227519	40 %	20 %	40 %	0 %	389853440
129	NC_017949	AGTAA	2	10	229283	229292	60 %	20 %	20 %	0 %	389853442
130	NC_017949	GCGAG	2	10	229453	229462	20 %	0 %	60 %	20 %	389853443
131	NC_017949	CTTGT	2	10	229501	229510	0 %	60 %	20 %	20 %	389853443
132	NC_017949	GGCTT	2	10	232261	232270	0 %	40 %	40 %	20 %	389853445
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134	NC_017949	TTTTA	2	10	233957	233966	20 %	80 %	0 %	0 %	389853447
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