MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000 chromosome

Total Repeats: 46562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_017949	CAA	2	6	2521250	2521255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855705
46502	NC_017949	CTA	2	6	2521286	2521291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855705
46503	NC_017949	CAG	2	6	2521328	2521333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855705
46504	NC_017949	AGA	2	6	2521334	2521339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855705
46505	NC_017949	A	7	7	2521354	2521360	100 %	0 %	0 %	0 %	389855705
46506	NC_017949	GTA	2	6	2521370	2521375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855705
46507	NC_017949	T	6	6	2521388	2521393	0 %	100 %	0 %	0 %	389855705
46508	NC_017949	AACAA	2	10	2521552	2521561	80 %	0 %	0 %	20 %	389855706
46509	NC_017949	T	6	6	2521587	2521592	0 %	100 %	0 %	0 %	389855706
46510	NC_017949	TTTTC	2	10	2521595	2521604	0 %	80 %	0 %	20 %	389855706
46511	NC_017949	TCC	2	6	2521620	2521625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389855706
46512	NC_017949	ATG	2	6	2521636	2521641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855706
46513	NC_017949	TGAGAA	2	12	2521653	2521664	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	389855706
46514	NC_017949	AGC	2	6	2521689	2521694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855706
46515	NC_017949	CAA	2	6	2521733	2521738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855706
46516	NC_017949	TTA	2	6	2521876	2521881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855706
46517	NC_017949	ACA	2	6	2521897	2521902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855706
46518	NC_017949	CTT	2	6	2521955	2521960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855706
46519	NC_017949	CAA	2	6	2521961	2521966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855706
46520	NC_017949	ACCA	2	8	2522004	2522011	50 %	0 %	0 %	50 %	389855706
46521	NC_017949	TTTGT	2	10	2522051	2522060	0 %	80 %	20 %	0 %	389855706
46522	NC_017949	ACC	2	6	2522091	2522096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855706
46523	NC_017949	GAA	2	6	2522116	2522121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855706
46524	NC_017949	ACC	2	6	2522196	2522201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855706
46525	NC_017949	TGT	2	6	2522302	2522307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855706
46526	NC_017949	CCA	2	6	2522317	2522322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855706
46527	NC_017949	GAA	2	6	2522378	2522383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855706
46528	NC_017949	ATTT	2	8	2522517	2522524	25 %	75 %	0 %	0 %	389855707
46529	NC_017949	T	6	6	2522527	2522532	0 %	100 %	0 %	0 %	389855707
46530	NC_017949	GGC	2	6	2522550	2522555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389855707
46531	NC_017949	AAG	2	6	2522581	2522586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855707
46532	NC_017949	TAA	2	6	2522626	2522631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855707
46533	NC_017949	TCCTC	2	10	2522646	2522655	0 %	40 %	0 %	60 %	389855707
46534	NC_017949	TAA	2	6	2522667	2522672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855707
46535	NC_017949	ACC	2	6	2522690	2522695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855707
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46537	NC_017949	AGC	2	6	2522798	2522803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855707
46538	NC_017949	TAAT	2	8	2522823	2522830	50 %	50 %	0 %	0 %	389855707
46539	NC_017949	TTC	2	6	2522834	2522839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855707
46540	NC_017949	TGG	2	6	2522906	2522911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855707
46541	NC_017949	T	6	6	2522939	2522944	0 %	100 %	0 %	0 %	389855707
46542	NC_017949	A	7	7	2523048	2523054	100 %	0 %	0 %	0 %	389855707
46543	NC_017949	CAT	2	6	2523094	2523099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855707
46544	NC_017949	ATG	2	6	2523108	2523113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855707
46545	NC_017949	TAC	2	6	2523345	2523350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855708
46546	NC_017949	CGT	2	6	2523353	2523358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855708
46547	NC_017949	T	6	6	2523394	2523399	0 %	100 %	0 %	0 %	389855708
46548	NC_017949	AAT	2	6	2523418	2523423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855708
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46550	NC_017949	CAT	2	6	2523646	2523651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855708
46551	NC_017949	TTAA	2	8	2523677	2523684	50 %	50 %	0 %	0 %	389855708
46552	NC_017949	AC	3	6	2523691	2523696	50 %	0 %	0 %	50 %	389855708
46553	NC_017949	T	6	6	2523777	2523782	0 %	100 %	0 %	0 %	389855708
46554	NC_017949	GGT	2	6	2523787	2523792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855708
46555	NC_017949	AATC	2	8	2523804	2523811	50 %	25 %	0 %	25 %	389855708
46556	NC_017949	ACA	2	6	2523851	2523856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855708
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46561	NC_017949	T	6	6	2524196	2524201	0 %	100 %	0 %	0 %	389855708
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.