MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 2

Total Repeats: 5912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017552	TCAA	2	8	334078	334085	50 %	25 %	0 %	25 %	386076311
5502	NC_017552	TCTT	2	8	334144	334151	0 %	75 %	0 %	25 %	386076311
5503	NC_017552	GAA	2	6	334180	334185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076311
5504	NC_017552	ATT	2	6	334355	334360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076312
5505	NC_017552	T	7	7	334359	334365	0 %	100 %	0 %	0 %	386076312
5506	NC_017552	GGA	2	6	334377	334382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076312
5507	NC_017552	TTAAT	2	10	334459	334468	40 %	60 %	0 %	0 %	386076312
5508	NC_017552	T	7	7	334546	334552	0 %	100 %	0 %	0 %	386076312
5509	NC_017552	GCC	2	6	334572	334577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076312
5510	NC_017552	T	7	7	334732	334738	0 %	100 %	0 %	0 %	386076312
5511	NC_017552	TAT	2	6	334743	334748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076312
5512	NC_017552	A	6	6	334749	334754	100 %	0 %	0 %	0 %	386076312
5513	NC_017552	T	8	8	335317	335324	0 %	100 %	0 %	0 %	386076313
5514	NC_017552	AT	3	6	335358	335363	50 %	50 %	0 %	0 %	386076313
5515	NC_017552	GAT	2	6	335440	335445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076313
5516	NC_017552	T	6	6	335449	335454	0 %	100 %	0 %	0 %	386076313
5517	NC_017552	T	6	6	335461	335466	0 %	100 %	0 %	0 %	386076313
5518	NC_017552	ACC	2	6	335500	335505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386076313
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5520	NC_017552	AACCA	2	10	335623	335632	60 %	0 %	0 %	40 %	386076313
5521	NC_017552	GTA	2	6	335635	335640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076313
5522	NC_017552	GAA	2	6	335657	335662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076313
5523	NC_017552	AAG	2	6	335700	335705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076313
5524	NC_017552	ATTCCA	2	12	335711	335722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076313
5525	NC_017552	T	8	8	335756	335763	0 %	100 %	0 %	0 %	386076313
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5527	NC_017552	CTT	2	6	335841	335846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076313
5528	NC_017552	TAAA	2	8	335940	335947	75 %	25 %	0 %	0 %	386076313
5529	NC_017552	GTT	2	6	335976	335981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076313
5530	NC_017552	TCT	2	6	336010	336015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076313
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5534	NC_017552	T	7	7	336117	336123	0 %	100 %	0 %	0 %	386076313
5535	NC_017552	TAA	2	6	336262	336267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386076313
5536	NC_017552	GAGT	2	8	336310	336317	25 %	25 %	50 %	0 %	386076313
5537	NC_017552	AAC	2	6	336334	336339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076313
5538	NC_017552	TTTC	2	8	336349	336356	0 %	75 %	0 %	25 %	386076313
5539	NC_017552	CTT	2	6	336381	336386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076313
5540	NC_017552	TTTCT	2	10	336396	336405	0 %	80 %	0 %	20 %	386076313
5541	NC_017552	TTG	2	6	336478	336483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076313
5542	NC_017552	TGAATA	2	12	336840	336851	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386076314
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5544	NC_017552	A	6	6	336989	336994	100 %	0 %	0 %	0 %	386076314
5545	NC_017552	AGA	2	6	336997	337002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076314
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5547	NC_017552	GGAA	2	8	337059	337066	50 %	0 %	50 %	0 %	386076314
5548	NC_017552	CTGAAA	2	12	337070	337081	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386076314
5549	NC_017552	A	6	6	337099	337104	100 %	0 %	0 %	0 %	386076314
5550	NC_017552	TGAT	2	8	337138	337145	25 %	50 %	25 %	0 %	386076314
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5553	NC_017552	CTT	2	6	338182	338187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076315
5554	NC_017552	GCC	2	6	338208	338213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076315
5555	NC_017552	T	8	8	338310	338317	0 %	100 %	0 %	0 %	386076315
5556	NC_017552	GAT	2	6	338360	338365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076315
5557	NC_017552	TCTT	2	8	338366	338373	0 %	75 %	0 %	25 %	386076315
5558	NC_017552	GAT	2	6	338380	338385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076315
5559	NC_017552	TCG	2	6	339773	339778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076316
5560	NC_017552	CTG	2	6	339780	339785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076316
5561	NC_017552	TG	3	6	339801	339806	0 %	50 %	50 %	0 %	386076316
5562	NC_017552	TGA	2	6	339920	339925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076316
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5566	NC_017552	GAGG	2	8	340275	340282	25 %	0 %	75 %	0 %	386076317
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5570	NC_017552	GTT	2	6	340442	340447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076317
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5583	NC_017552	CTT	2	6	341398	341403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076318
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5589	NC_017552	TCT	2	6	341685	341690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076318
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5593	NC_017552	GAATA	2	10	341771	341780	60 %	20 %	20 %	0 %	386076318
5594	NC_017552	CTA	2	6	341908	341913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076318
5595	NC_017552	GATT	2	8	341917	341924	25 %	50 %	25 %	0 %	386076318
5596	NC_017552	TTC	2	6	342002	342007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076318
5597	NC_017552	TTC	2	6	342011	342016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076318
5598	NC_017552	AAAGGT	2	12	342032	342043	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386076318
5599	NC_017552	GAT	2	6	342064	342069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076318
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5601	NC_017552	GAT	2	6	342290	342295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076318
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5604	NC_017552	GA	3	6	342406	342411	50 %	0 %	50 %	0 %	386076319
5605	NC_017552	T	7	7	342452	342458	0 %	100 %	0 %	0 %	386076319
5606	NC_017552	GAA	2	6	342473	342478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076319
5607	NC_017552	TCCTT	2	10	342494	342503	0 %	60 %	0 %	40 %	386076319
5608	NC_017552	T	6	6	342502	342507	0 %	100 %	0 %	0 %	386076319
5609	NC_017552	AATA	2	8	342576	342583	75 %	25 %	0 %	0 %	386076319
5610	NC_017552	CATC	2	8	342639	342646	25 %	25 %	0 %	50 %	386076319
5611	NC_017552	TTG	2	6	342676	342681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076319
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5613	NC_017552	TTCT	2	8	342714	342721	0 %	75 %	0 %	25 %	386076319
5614	NC_017552	AGT	2	6	342757	342762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076319
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5616	NC_017552	T	7	7	342809	342815	0 %	100 %	0 %	0 %	386076319
5617	NC_017552	TCTTTT	2	12	342833	342844	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386076319
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5619	NC_017552	TAT	2	6	342927	342932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076319
5620	NC_017552	TTGAT	2	10	342938	342947	20 %	60 %	20 %	0 %	386076319
5621	NC_017552	A	7	7	343003	343009	100 %	0 %	0 %	0 %	386076319
5622	NC_017552	CGC	2	6	343150	343155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076319
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