MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes FSL R2-561 chromosome

Total Repeats: 1829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017546	ACCAA	2	10	2107	2116	60 %	0 %	0 %	40 %	386048932
2	NC_017546	TTAAA	2	10	2500	2509	60 %	40 %	0 %	0 %	386048932
3	NC_017546	TTTAT	2	10	4142	4151	20 %	80 %	0 %	0 %	386048933
4	NC_017546	TTTGT	2	10	4263	4272	0 %	80 %	20 %	0 %	386048933
5	NC_017546	CAAAA	2	10	7009	7018	80 %	0 %	0 %	20 %	386048936
6	NC_017546	TTGAT	2	10	11691	11700	20 %	60 %	20 %	0 %	386048938
7	NC_017546	TTTTA	2	10	12364	12373	20 %	80 %	0 %	0 %	386048939
8	NC_017546	GTATG	2	10	13307	13316	20 %	40 %	40 %	0 %	386048940
9	NC_017546	AAAGA	2	10	14322	14331	80 %	0 %	20 %	0 %	386048941
10	NC_017546	ATGAA	2	10	17185	17194	60 %	20 %	20 %	0 %	386048943
11	NC_017546	GAATG	2	10	18927	18936	40 %	20 %	40 %	0 %	386048944
12	NC_017546	TAATT	2	10	20305	20314	40 %	60 %	0 %	0 %	386048946
13	NC_017546	ATTAA	2	10	21822	21831	60 %	40 %	0 %	0 %	386048947
14	NC_017546	AAATC	2	10	22283	22292	60 %	20 %	0 %	20 %	386048947
15	NC_017546	AACAT	2	10	22444	22453	60 %	20 %	0 %	20 %	386048947
16	NC_017546	TTTTA	2	10	23061	23070	20 %	80 %	0 %	0 %	386048948
17	NC_017546	GACCA	2	10	23145	23154	40 %	0 %	20 %	40 %	386048948
18	NC_017546	TGGAT	2	10	23404	23413	20 %	40 %	40 %	0 %	386048948
19	NC_017546	CAAAA	2	10	24405	24414	80 %	0 %	0 %	20 %	386048949
20	NC_017546	ATTAT	2	10	24890	24899	40 %	60 %	0 %	0 %	386048950
21	NC_017546	TCAGG	2	10	26059	26068	20 %	20 %	40 %	20 %	386048952
22	NC_017546	TTTAC	2	10	27059	27068	20 %	60 %	0 %	20 %	386048953
23	NC_017546	GAAAA	2	10	33000	33009	80 %	0 %	20 %	0 %	386048959
24	NC_017546	TGAAA	2	10	34155	34164	60 %	20 %	20 %	0 %	386048960
25	NC_017546	GAATG	2	10	36026	36035	40 %	20 %	40 %	0 %	386048962
26	NC_017546	AAATT	2	10	36153	36162	60 %	40 %	0 %	0 %	386048962
27	NC_017546	ATGGA	2	10	38274	38283	40 %	20 %	40 %	0 %	386048963
28	NC_017546	AAAAC	2	10	40380	40389	80 %	0 %	0 %	20 %	386048964
29	NC_017546	TTATT	2	10	41869	41878	20 %	80 %	0 %	0 %	386048966
30	NC_017546	AAAAG	2	10	43083	43092	80 %	0 %	20 %	0 %	386048966
31	NC_017546	ATAAA	2	10	43907	43916	80 %	20 %	0 %	0 %	386048967
32	NC_017546	ATTTT	2	10	45712	45721	20 %	80 %	0 %	0 %	386048969
33	NC_017546	GAAAC	2	10	46970	46979	60 %	0 %	20 %	20 %	386048970
34	NC_017546	ATTTT	2	10	47296	47305	20 %	80 %	0 %	0 %	386048971
35	NC_017546	AAATG	2	10	48426	48435	60 %	20 %	20 %	0 %	386048972
36	NC_017546	GTAGA	2	10	49512	49521	40 %	20 %	40 %	0 %	386048973
37	NC_017546	TTACT	2	10	50494	50503	20 %	60 %	0 %	20 %	386048975
38	NC_017546	GAAAT	2	10	51152	51161	60 %	20 %	20 %	0 %	386048976
39	NC_017546	CTTAG	2	10	51251	51260	20 %	40 %	20 %	20 %	386048976
40	NC_017546	TGCTA	2	10	52676	52685	20 %	40 %	20 %	20 %	386048979
41	NC_017546	TTTTA	2	10	52844	52853	20 %	80 %	0 %	0 %	386048979
42	NC_017546	AGTTA	2	10	54160	54169	40 %	40 %	20 %	0 %	386048980
43	NC_017546	CGCAA	2	10	57673	57682	40 %	0 %	20 %	40 %	386048983
44	NC_017546	TTTTA	2	10	58621	58630	20 %	80 %	0 %	0 %	386048984
45	NC_017546	AAACG	2	10	63004	63013	60 %	0 %	20 %	20 %	386048988
46	NC_017546	ATTAT	2	10	63972	63981	40 %	60 %	0 %	0 %	386048988
47	NC_017546	CGAAA	2	10	64490	64499	60 %	0 %	20 %	20 %	386048989
48	NC_017546	AAAAC	2	10	64500	64509	80 %	0 %	0 %	20 %	386048989
49	NC_017546	AACAA	2	10	65923	65932	80 %	0 %	0 %	20 %	386048991
50	NC_017546	GAGAG	2	10	70982	70991	40 %	0 %	60 %	0 %	386048993
51	NC_017546	GCAAA	2	10	72164	72173	60 %	0 %	20 %	20 %	386048996
52	NC_017546	CAATA	2	10	72229	72238	60 %	20 %	0 %	20 %	386048996
53	NC_017546	GCCTT	2	10	73029	73038	0 %	40 %	20 %	40 %	386048997
54	NC_017546	CAAAA	2	10	73406	73415	80 %	0 %	0 %	20 %	386048997
55	NC_017546	GAAAT	2	10	75595	75604	60 %	20 %	20 %	0 %	386048999
56	NC_017546	GCTTT	2	10	76393	76402	0 %	60 %	20 %	20 %	386049001
57	NC_017546	AGTAA	2	10	77988	77997	60 %	20 %	20 %	0 %	386049003
58	NC_017546	TTATA	2	10	78237	78246	40 %	60 %	0 %	0 %	386049004
59	NC_017546	TATTT	2	10	78332	78341	20 %	80 %	0 %	0 %	386049005
60	NC_017546	GCTTG	2	10	80311	80320	0 %	40 %	40 %	20 %	386049007
61	NC_017546	AAACT	2	10	80321	80330	60 %	20 %	0 %	20 %	386049007
62	NC_017546	GCGCT	2	10	82366	82375	0 %	20 %	40 %	40 %	386049009
63	NC_017546	TAAAG	2	10	84366	84375	60 %	20 %	20 %	0 %	386049010
64	NC_017546	TCATT	2	10	87558	87567	20 %	60 %	0 %	20 %	386049015
65	NC_017546	CTAAA	2	10	89923	89932	60 %	20 %	0 %	20 %	386049017
66	NC_017546	AAGTT	2	10	90349	90358	40 %	40 %	20 %	0 %	386049017
67	NC_017546	GAAAA	2	10	91266	91275	80 %	0 %	20 %	0 %	386049017
68	NC_017546	TGAAA	2	10	91508	91517	60 %	20 %	20 %	0 %	386049017
69	NC_017546	AAATT	2	10	91852	91861	60 %	40 %	0 %	0 %	386049017
70	NC_017546	AGCGG	2	10	92436	92445	20 %	0 %	60 %	20 %	386049017
71	NC_017546	AGTTA	2	10	93845	93854	40 %	40 %	20 %	0 %	386049017
72	NC_017546	GAAAT	2	10	94932	94941	60 %	20 %	20 %	0 %	386049018
73	NC_017546	AAAAG	2	10	95244	95253	80 %	0 %	20 %	0 %	386049018
74	NC_017546	TGAAA	2	10	96241	96250	60 %	20 %	20 %	0 %	386049018
75	NC_017546	TGCAT	2	10	98901	98910	20 %	40 %	20 %	20 %	386049021
76	NC_017546	TTACT	2	10	99147	99156	20 %	60 %	0 %	20 %	386049021
77	NC_017546	GTTTT	2	10	100745	100754	0 %	80 %	20 %	0 %	386049023
78	NC_017546	GAAGT	2	10	101026	101035	40 %	20 %	40 %	0 %	386049023
79	NC_017546	AGCGG	2	10	102345	102354	20 %	0 %	60 %	20 %	386049024
80	NC_017546	TTCCA	2	10	108934	108943	20 %	40 %	0 %	40 %	386049034
81	NC_017546	AAAAG	2	10	110835	110844	80 %	0 %	20 %	0 %	386049036
82	NC_017546	ACGGT	2	10	112379	112388	20 %	20 %	40 %	20 %	386049037
83	NC_017546	GAAAT	2	10	113618	113627	60 %	20 %	20 %	0 %	386049038
84	NC_017546	GAATT	2	10	114259	114268	40 %	40 %	20 %	0 %	386049038
85	NC_017546	AACCA	2	10	118135	118144	60 %	0 %	0 %	40 %	386049041
86	NC_017546	CTTTA	2	10	118464	118473	20 %	60 %	0 %	20 %	386049041
87	NC_017546	CTCGA	2	10	119815	119824	20 %	20 %	20 %	40 %	386049043
88	NC_017546	TTCCA	2	10	120149	120158	20 %	40 %	0 %	40 %	386049043
89	NC_017546	TCTCT	2	10	120987	120996	0 %	60 %	0 %	40 %	386049044
90	NC_017546	TTTTA	2	10	121347	121356	20 %	80 %	0 %	0 %	386049045
91	NC_017546	AAAAG	2	10	121616	121625	80 %	0 %	20 %	0 %	386049046
92	NC_017546	TTAGT	2	10	123774	123783	20 %	60 %	20 %	0 %	386049050
93	NC_017546	TTTAT	2	10	126774	126783	20 %	80 %	0 %	0 %	386049053
94	NC_017546	AAGTG	2	10	128796	128805	40 %	20 %	40 %	0 %	386049056
95	NC_017546	GTCAG	2	10	129257	129266	20 %	20 %	40 %	20 %	386049057
96	NC_017546	AATTT	2	10	130538	130547	40 %	60 %	0 %	0 %	386049059
97	NC_017546	TTGTT	2	10	132905	132914	0 %	80 %	20 %	0 %	386049061
98	NC_017546	ATTTT	2	10	134709	134718	20 %	80 %	0 %	0 %	386049063
99	NC_017546	AAAAT	2	10	136211	136220	80 %	20 %	0 %	0 %	386049063
100	NC_017546	AACTT	2	10	137537	137546	40 %	40 %	0 %	20 %	386049066
101	NC_017546	ACAAA	2	10	137639	137648	80 %	0 %	0 %	20 %	386049066
102	NC_017546	ACTTG	2	10	138433	138442	20 %	40 %	20 %	20 %	386049066
103	NC_017546	TTGGT	2	10	139229	139238	0 %	60 %	40 %	0 %	386049067
104	NC_017546	TGTTT	2	10	139572	139581	0 %	80 %	20 %	0 %	386049067
105	NC_017546	AGCCA	2	10	141098	141107	40 %	0 %	20 %	40 %	386049069
106	NC_017546	TATGA	2	10	142207	142216	40 %	40 %	20 %	0 %	386049071
107	NC_017546	TTTAT	2	10	145847	145856	20 %	80 %	0 %	0 %	386049077
108	NC_017546	ACTTT	2	10	147644	147653	20 %	60 %	0 %	20 %	386049080
109	NC_017546	ACGGC	2	10	149568	149577	20 %	0 %	40 %	40 %	386049082
110	NC_017546	TTTAA	2	10	149640	149649	40 %	60 %	0 %	0 %	386049082
111	NC_017546	AATTT	2	10	149826	149835	40 %	60 %	0 %	0 %	386049082
112	NC_017546	AATAA	2	10	151099	151108	80 %	20 %	0 %	0 %	386049083
113	NC_017546	GAATA	2	10	153059	153068	60 %	20 %	20 %	0 %	386049086
114	NC_017546	TTTAC	2	10	154258	154267	20 %	60 %	0 %	20 %	386049087
115	NC_017546	AGATG	2	10	154307	154316	40 %	20 %	40 %	0 %	386049087
116	NC_017546	TCTAA	2	10	159607	159616	40 %	40 %	0 %	20 %	386049090
117	NC_017546	AAATC	2	10	160122	160131	60 %	20 %	0 %	20 %	386049090
118	NC_017546	GGCTG	2	10	160159	160168	0 %	20 %	60 %	20 %	386049090
119	NC_017546	CGAAA	2	10	160737	160746	60 %	0 %	20 %	20 %	386049090
120	NC_017546	AAGAT	2	10	163126	163135	60 %	20 %	20 %	0 %	386049092
121	NC_017546	TGCGC	2	10	163247	163256	0 %	20 %	40 %	40 %	386049092
122	NC_017546	GAATT	2	10	163497	163506	40 %	40 %	20 %	0 %	386049093
123	NC_017546	AAATA	2	10	166552	166561	80 %	20 %	0 %	0 %	386049097
124	NC_017546	TTCTT	2	10	167757	167766	0 %	80 %	0 %	20 %	386049099
125	NC_017546	TTCCA	2	10	168308	168317	20 %	40 %	0 %	40 %	386049100
126	NC_017546	AACCT	2	10	170079	170088	40 %	20 %	0 %	40 %	386049101
127	NC_017546	ACTTT	2	10	174084	174093	20 %	60 %	0 %	20 %	386049104
128	NC_017546	AAAAG	2	10	175513	175522	80 %	0 %	20 %	0 %	386049105
129	NC_017546	ATGAA	2	10	177287	177296	60 %	20 %	20 %	0 %	386049106
130	NC_017546	TACTT	2	10	180316	180325	20 %	60 %	0 %	20 %	386049109
131	NC_017546	TGGAA	2	10	185136	185145	40 %	20 %	40 %	0 %	386049111
132	NC_017546	ATGTA	2	10	185231	185240	40 %	40 %	20 %	0 %	386049111
133	NC_017546	GCGTT	2	10	186993	187002	0 %	40 %	40 %	20 %	386049112
134	NC_017546	AAGCG	2	10	187359	187368	40 %	0 %	40 %	20 %	386049112
135	NC_017546	CAAAA	2	10	187636	187645	80 %	0 %	0 %	20 %	386049112
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