MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 1898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017545	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	386045636
2	NC_017545	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	386045636
3	NC_017545	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	386045637
4	NC_017545	TTTGT	2	10	4327	4336	0 %	80 %	20 %	0 %	386045637
5	NC_017545	CAAAA	2	10	7073	7082	80 %	0 %	0 %	20 %	386045640
6	NC_017545	TTGAT	2	10	11755	11764	20 %	60 %	20 %	0 %	386045642
7	NC_017545	TTTTA	2	10	12428	12437	20 %	80 %	0 %	0 %	386045643
8	NC_017545	GTATG	2	10	13371	13380	20 %	40 %	40 %	0 %	386045644
9	NC_017545	AAAGA	2	10	14386	14395	80 %	0 %	20 %	0 %	386045645
10	NC_017545	ATGAA	2	10	17249	17258	60 %	20 %	20 %	0 %	386045647
11	NC_017545	GAATG	2	10	18991	19000	40 %	20 %	40 %	0 %	386045648
12	NC_017545	TAATT	2	10	20369	20378	40 %	60 %	0 %	0 %	386045651
13	NC_017545	ATTAA	2	10	21886	21895	60 %	40 %	0 %	0 %	386045652
14	NC_017545	AAATC	2	10	22347	22356	60 %	20 %	0 %	20 %	386045652
15	NC_017545	AACAT	2	10	22508	22517	60 %	20 %	0 %	20 %	386045652
16	NC_017545	TTTTA	2	10	23125	23134	20 %	80 %	0 %	0 %	386045653
17	NC_017545	GACCA	2	10	23209	23218	40 %	0 %	20 %	40 %	386045653
18	NC_017545	TGGAT	2	10	23468	23477	20 %	40 %	40 %	0 %	386045653
19	NC_017545	CAAAA	2	10	24469	24478	80 %	0 %	0 %	20 %	386045654
20	NC_017545	ATTAT	2	10	24954	24963	40 %	60 %	0 %	0 %	386045655
21	NC_017545	TCAGG	2	10	26123	26132	20 %	20 %	40 %	20 %	386045657
22	NC_017545	TTTAC	2	10	27123	27132	20 %	60 %	0 %	20 %	386045658
23	NC_017545	AATAA	2	10	31665	31674	80 %	20 %	0 %	0 %	386045662
24	NC_017545	TTTCT	2	10	32825	32834	0 %	80 %	0 %	20 %	386045664
25	NC_017545	CCATA	2	10	33511	33520	40 %	20 %	0 %	40 %	386045665
26	NC_017545	GAAAA	2	10	34356	34365	80 %	0 %	20 %	0 %	386045666
27	NC_017545	AAGTA	2	10	34820	34829	60 %	20 %	20 %	0 %	386045667
28	NC_017545	TAAAA	2	10	35176	35185	80 %	20 %	0 %	0 %	386045667
29	NC_017545	GAAAA	2	10	37165	37174	80 %	0 %	20 %	0 %	386045670
30	NC_017545	TGAAA	2	10	38320	38329	60 %	20 %	20 %	0 %	386045671
31	NC_017545	GAATG	2	10	40191	40200	40 %	20 %	40 %	0 %	386045673
32	NC_017545	AAATT	2	10	40318	40327	60 %	40 %	0 %	0 %	386045673
33	NC_017545	ATGGA	2	10	42439	42448	40 %	20 %	40 %	0 %	386045674
34	NC_017545	AAAAC	2	10	44545	44554	80 %	0 %	0 %	20 %	386045675
35	NC_017545	TTATT	2	10	46034	46043	20 %	80 %	0 %	0 %	386045677
36	NC_017545	AAAAG	2	10	47248	47257	80 %	0 %	20 %	0 %	386045677
37	NC_017545	ATAAA	2	10	48072	48081	80 %	20 %	0 %	0 %	386045678
38	NC_017545	ATTTT	2	10	49877	49886	20 %	80 %	0 %	0 %	386045680
39	NC_017545	GAAAC	2	10	51135	51144	60 %	0 %	20 %	20 %	386045681
40	NC_017545	ATTTT	2	10	51461	51470	20 %	80 %	0 %	0 %	386045682
41	NC_017545	AAATG	2	10	52591	52600	60 %	20 %	20 %	0 %	386045683
42	NC_017545	GTAGA	2	10	53677	53686	40 %	20 %	40 %	0 %	386045684
43	NC_017545	TTACT	2	10	54659	54668	20 %	60 %	0 %	20 %	386045686
44	NC_017545	GAAAT	2	10	55317	55326	60 %	20 %	20 %	0 %	386045687
45	NC_017545	CTTAG	2	10	55416	55425	20 %	40 %	20 %	20 %	386045687
46	NC_017545	TGCTA	2	10	56841	56850	20 %	40 %	20 %	20 %	386045690
47	NC_017545	TTTTA	2	10	57009	57018	20 %	80 %	0 %	0 %	386045690
48	NC_017545	AGTTA	2	10	58325	58334	40 %	40 %	20 %	0 %	386045691
49	NC_017545	AGTCT	2	10	59790	59799	20 %	40 %	20 %	20 %	386045692
50	NC_017545	CGCAA	2	10	61838	61847	40 %	0 %	20 %	40 %	386045694
51	NC_017545	TTTTA	2	10	62786	62795	20 %	80 %	0 %	0 %	386045695
52	NC_017545	ATTAT	2	10	68137	68146	40 %	60 %	0 %	0 %	386045699
53	NC_017545	CGAAA	2	10	68655	68664	60 %	0 %	20 %	20 %	386045700
54	NC_017545	AAAAC	2	10	68665	68674	80 %	0 %	0 %	20 %	386045700
55	NC_017545	AACAA	2	10	70088	70097	80 %	0 %	0 %	20 %	386045702
56	NC_017545	GATAA	2	10	73645	73654	60 %	20 %	20 %	0 %	386045703
57	NC_017545	GGACT	2	10	74074	74083	20 %	20 %	40 %	20 %	386045703
58	NC_017545	AAAGG	2	10	74275	74284	60 %	0 %	40 %	0 %	386045703
59	NC_017545	ATTTT	2	10	74441	74450	20 %	80 %	0 %	0 %	386045703
60	NC_017545	AGTAT	2	10	75209	75218	40 %	40 %	20 %	0 %	386045704
61	NC_017545	TGTTA	2	10	75532	75541	20 %	60 %	20 %	0 %	386045705
62	NC_017545	TAATT	2	10	75850	75859	40 %	60 %	0 %	0 %	386045706
63	NC_017545	ATTTT	2	10	76362	76371	20 %	80 %	0 %	0 %	386045707
64	NC_017545	GATTT	2	10	76880	76889	20 %	60 %	20 %	0 %	386045707
65	NC_017545	ATGGA	2	10	80822	80831	40 %	20 %	40 %	0 %	386045712
66	NC_017545	AAAAT	2	10	80850	80859	80 %	20 %	0 %	0 %	386045713
67	NC_017545	GTATA	2	10	82237	82246	40 %	40 %	20 %	0 %	386045714
68	NC_017545	TATTT	2	10	82377	82386	20 %	80 %	0 %	0 %	386045715
69	NC_017545	ATATA	2	10	82632	82641	60 %	40 %	0 %	0 %	386045715
70	NC_017545	ATTTT	2	10	84260	84269	20 %	80 %	0 %	0 %	386045717
71	NC_017545	GCTTG	2	10	86246	86255	0 %	40 %	40 %	20 %	386045719
72	NC_017545	AAACT	2	10	86256	86265	60 %	20 %	0 %	20 %	386045719
73	NC_017545	AACGA	2	10	88186	88195	60 %	0 %	20 %	20 %	386045721
74	NC_017545	GCGCT	2	10	88301	88310	0 %	20 %	40 %	40 %	386045721
75	NC_017545	GAATT	2	10	89980	89989	40 %	40 %	20 %	0 %	386045722
76	NC_017545	TCATT	2	10	93255	93264	20 %	60 %	0 %	20 %	386045727
77	NC_017545	CTAAA	2	10	95620	95629	60 %	20 %	0 %	20 %	386045729
78	NC_017545	AAGTT	2	10	96046	96055	40 %	40 %	20 %	0 %	386045729
79	NC_017545	GAAAA	2	10	96963	96972	80 %	0 %	20 %	0 %	386045729
80	NC_017545	TGAAA	2	10	97205	97214	60 %	20 %	20 %	0 %	386045729
81	NC_017545	AAATT	2	10	97549	97558	60 %	40 %	0 %	0 %	386045729
82	NC_017545	AGCGG	2	10	98133	98142	20 %	0 %	60 %	20 %	386045729
83	NC_017545	AGTTA	2	10	99542	99551	40 %	40 %	20 %	0 %	386045729
84	NC_017545	GAAAT	2	10	100629	100638	60 %	20 %	20 %	0 %	386045730
85	NC_017545	AAAAG	2	10	100941	100950	80 %	0 %	20 %	0 %	386045730
86	NC_017545	TGAAA	2	10	101938	101947	60 %	20 %	20 %	0 %	386045730
87	NC_017545	TGCAT	2	10	104598	104607	20 %	40 %	20 %	20 %	386045733
88	NC_017545	TTACT	2	10	104844	104853	20 %	60 %	0 %	20 %	386045733
89	NC_017545	GTTTT	2	10	106442	106451	0 %	80 %	20 %	0 %	386045735
90	NC_017545	GAAGT	2	10	106723	106732	40 %	20 %	40 %	0 %	386045735
91	NC_017545	AGCGG	2	10	108042	108051	20 %	0 %	60 %	20 %	386045736
92	NC_017545	TTCCA	2	10	114634	114643	20 %	40 %	0 %	40 %	386045746
93	NC_017545	AAAAG	2	10	116536	116545	80 %	0 %	20 %	0 %	386045748
94	NC_017545	ACGGT	2	10	118080	118089	20 %	20 %	40 %	20 %	386045749
95	NC_017545	GAAAT	2	10	119319	119328	60 %	20 %	20 %	0 %	386045750
96	NC_017545	GAATT	2	10	119960	119969	40 %	40 %	20 %	0 %	386045750
97	NC_017545	AACCA	2	10	123836	123845	60 %	0 %	0 %	40 %	386045753
98	NC_017545	CTTTA	2	10	124165	124174	20 %	60 %	0 %	20 %	386045753
99	NC_017545	CTCGA	2	10	125516	125525	20 %	20 %	20 %	40 %	386045755
100	NC_017545	TTCCA	2	10	125850	125859	20 %	40 %	0 %	40 %	386045755
101	NC_017545	TCTCT	2	10	126688	126697	0 %	60 %	0 %	40 %	386045756
102	NC_017545	TTTTA	2	10	127048	127057	20 %	80 %	0 %	0 %	386045757
103	NC_017545	AAAAG	2	10	127317	127326	80 %	0 %	20 %	0 %	386045758
104	NC_017545	TTAGT	2	10	129475	129484	20 %	60 %	20 %	0 %	386045762
105	NC_017545	TTTAT	2	10	132475	132484	20 %	80 %	0 %	0 %	386045765
106	NC_017545	AAGTG	2	10	134497	134506	40 %	20 %	40 %	0 %	386045768
107	NC_017545	AGTCT	2	10	134777	134786	20 %	40 %	20 %	20 %	386045768
108	NC_017545	GTCAG	2	10	134958	134967	20 %	20 %	40 %	20 %	386045769
109	NC_017545	AATTT	2	10	136239	136248	40 %	60 %	0 %	0 %	386045771
110	NC_017545	TTGTT	2	10	138606	138615	0 %	80 %	20 %	0 %	386045773
111	NC_017545	ATTTT	2	10	140408	140417	20 %	80 %	0 %	0 %	386045775
112	NC_017545	AAAAT	2	10	141910	141919	80 %	20 %	0 %	0 %	386045775
113	NC_017545	AACTT	2	10	143220	143229	40 %	40 %	0 %	20 %	386045778
114	NC_017545	ACAAA	2	10	143322	143331	80 %	0 %	0 %	20 %	386045778
115	NC_017545	CTTGA	2	10	144117	144126	20 %	40 %	20 %	20 %	386045778
116	NC_017545	TTGGT	2	10	144912	144921	0 %	60 %	40 %	0 %	386045779
117	NC_017545	TATGA	2	10	147890	147899	40 %	40 %	20 %	0 %	386045783
118	NC_017545	ATTAG	2	10	149913	149922	40 %	40 %	20 %	0 %	386045787
119	NC_017545	ATTTA	2	10	149957	149966	40 %	60 %	0 %	0 %	386045787
120	NC_017545	ACGGC	2	10	153204	153213	20 %	0 %	40 %	40 %	386045791
121	NC_017545	TTTAA	2	10	153276	153285	40 %	60 %	0 %	0 %	386045791
122	NC_017545	AATTT	2	10	153462	153471	40 %	60 %	0 %	0 %	386045791
123	NC_017545	ATAAA	2	10	154305	154314	80 %	20 %	0 %	0 %	386045792
124	NC_017545	AATAA	2	10	154735	154744	80 %	20 %	0 %	0 %	386045792
125	NC_017545	GAATA	2	10	156696	156705	60 %	20 %	20 %	0 %	386045795
126	NC_017545	TTTAC	2	10	157895	157904	20 %	60 %	0 %	20 %	386045796
127	NC_017545	AGATG	2	10	157944	157953	40 %	20 %	40 %	0 %	386045796
128	NC_017545	TCTAA	2	10	163229	163238	40 %	40 %	0 %	20 %	386045799
129	NC_017545	AAATC	2	10	163744	163753	60 %	20 %	0 %	20 %	386045799
130	NC_017545	GGCTG	2	10	163781	163790	0 %	20 %	60 %	20 %	386045799
131	NC_017545	CGAAA	2	10	164359	164368	60 %	0 %	20 %	20 %	386045799
132	NC_017545	AAGAT	2	10	166748	166757	60 %	20 %	20 %	0 %	386045801
133	NC_017545	GAATT	2	10	167119	167128	40 %	40 %	20 %	0 %	386045802
134	NC_017545	AAATA	2	10	170175	170184	80 %	20 %	0 %	0 %	386045806
135	NC_017545	TTCTT	2	10	171380	171389	0 %	80 %	0 %	20 %	386045808
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