MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 60100

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017545	ATA	2	6	300673	300678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045915
6002	NC_017545	CCG	2	6	300689	300694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386045915
6003	NC_017545	AGGTA	2	10	300730	300739	40 %	20 %	40 %	0 %	386045915
6004	NC_017545	TTGA	2	8	300787	300794	25 %	50 %	25 %	0 %	386045915
6005	NC_017545	AAAT	2	8	300820	300827	75 %	25 %	0 %	0 %	386045915
6006	NC_017545	TCTTTT	2	12	300839	300850	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386045915
6007	NC_017545	CTAG	2	8	300875	300882	25 %	25 %	25 %	25 %	386045915
6008	NC_017545	CAT	2	6	300901	300906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045915
6009	NC_017545	AAT	2	6	300948	300953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045916
6010	NC_017545	TTC	2	6	300959	300964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045916
6011	NC_017545	CAT	2	6	300984	300989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045916
6012	NC_017545	TGCG	2	8	301126	301133	0 %	25 %	50 %	25 %	386045916
6013	NC_017545	ACG	2	6	301246	301251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045916
6014	NC_017545	GTT	2	6	301298	301303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045916
6015	NC_017545	T	6	6	301324	301329	0 %	100 %	0 %	0 %	386045916
6016	NC_017545	TGC	2	6	301359	301364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045916
6017	NC_017545	T	6	6	301366	301371	0 %	100 %	0 %	0 %	386045916
6018	NC_017545	GTT	2	6	301390	301395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045916
6019	NC_017545	TAG	2	6	301442	301447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045916
6020	NC_017545	AGT	2	6	301481	301486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045916
6021	NC_017545	TCT	2	6	301526	301531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045916
6022	NC_017545	CATA	2	8	301569	301576	50 %	25 %	0 %	25 %	386045916
6023	NC_017545	TCCA	2	8	301577	301584	25 %	25 %	0 %	50 %	386045916
6024	NC_017545	TTC	2	6	301600	301605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045916
6025	NC_017545	CAT	2	6	301608	301613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045916
6026	NC_017545	GT	3	6	301659	301664	0 %	50 %	50 %	0 %	386045916
6027	NC_017545	TGG	2	6	301786	301791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045916
6028	NC_017545	CAA	2	6	301818	301823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045916
6029	NC_017545	AAT	2	6	301893	301898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045916
6030	NC_017545	TCA	2	6	301943	301948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045916
6031	NC_017545	AAT	2	6	301949	301954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045916
6032	NC_017545	TCA	2	6	302015	302020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045916
6033	NC_017545	TTCA	2	8	302050	302057	25 %	50 %	0 %	25 %	386045916
6034	NC_017545	TCT	2	6	302144	302149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045916
6035	NC_017545	AGT	2	6	302200	302205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045916
6036	NC_017545	TTTA	2	8	302462	302469	25 %	75 %	0 %	0 %	386045917
6037	NC_017545	TTCT	2	8	302549	302556	0 %	75 %	0 %	25 %	386045917
6038	NC_017545	CTT	2	6	302801	302806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045917
6039	NC_017545	ATA	2	6	302827	302832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045917
6040	NC_017545	ATC	2	6	302943	302948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045917
6041	NC_017545	CTT	2	6	303035	303040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045917
6042	NC_017545	TAA	2	6	303077	303082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045917
6043	NC_017545	AGTTCA	2	12	303103	303114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386045917
6044	NC_017545	AAT	2	6	303119	303124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045917
6045	NC_017545	CAA	2	6	303134	303139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045917
6046	NC_017545	CTT	2	6	303197	303202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045917
6047	NC_017545	TCA	2	6	303208	303213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045917
6048	NC_017545	ATC	2	6	303225	303230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045917
6049	NC_017545	AGT	2	6	303235	303240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045917
6050	NC_017545	ATCAAT	2	12	303246	303257	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386045917
6051	NC_017545	AATT	2	8	303261	303268	50 %	50 %	0 %	0 %	386045917
6052	NC_017545	AAT	2	6	303407	303412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045918
6053	NC_017545	ATT	3	9	303490	303498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045918
6054	NC_017545	ATGAAA	2	12	303604	303615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386045918
6055	NC_017545	TAG	2	6	303628	303633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045918
6056	NC_017545	CTT	2	6	303681	303686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045918
6057	NC_017545	TCA	2	6	303728	303733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045918
6058	NC_017545	CGG	2	6	303758	303763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386045918
6059	NC_017545	T	6	6	303816	303821	0 %	100 %	0 %	0 %	386045918
6060	NC_017545	AGA	2	6	303842	303847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045918
6061	NC_017545	AGCT	2	8	303857	303864	25 %	25 %	25 %	25 %	386045918
6062	NC_017545	AAG	2	6	303880	303885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045918
6063	NC_017545	TAAA	2	8	303908	303915	75 %	25 %	0 %	0 %	386045918
6064	NC_017545	A	7	7	303913	303919	100 %	0 %	0 %	0 %	386045918
6065	NC_017545	TAT	2	6	303962	303967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045919
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6070	NC_017545	CGT	2	6	304098	304103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045919
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6073	NC_017545	GTA	2	6	304224	304229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045919
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6103	NC_017545	T	6	6	305392	305397	0 %	100 %	0 %	0 %	386045921
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6112	NC_017545	T	6	6	305706	305711	0 %	100 %	0 %	0 %	386045921
6113	NC_017545	CTCTT	2	10	305723	305732	0 %	60 %	0 %	40 %	386045922
6114	NC_017545	ATGAA	2	10	305733	305742	60 %	20 %	20 %	0 %	386045922
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6118	NC_017545	T	7	7	305946	305952	0 %	100 %	0 %	0 %	386045922
6119	NC_017545	ATT	2	6	305980	305985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045922
6120	NC_017545	GAA	2	6	305993	305998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045922
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6122	NC_017545	CAT	2	6	306057	306062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045922
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