MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 1036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017544	GAAATT	2	12	6232	6243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386042353
2	NC_017544	TCGTAC	2	12	6621	6632	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386042353
3	NC_017544	TGAAGA	2	12	9550	9561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386042354
4	NC_017544	TTATTT	2	12	10919	10930	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386042355
5	NC_017544	CACATT	2	12	11200	11211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042355
6	NC_017544	GCAAAA	2	12	14090	14101	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386042358
7	NC_017544	ATTTTC	2	12	19879	19890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386042362
8	NC_017544	CTTCAT	2	12	20896	20907	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386042364
9	NC_017544	TTTTGG	2	12	21260	21271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042364
10	NC_017544	AGTTGC	2	12	23649	23660	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386042366
11	NC_017544	TAAAGC	2	12	23702	23713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386042366
12	NC_017544	ATTGAA	2	12	24909	24920	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386042367
13	NC_017544	TCGATT	2	12	32439	32450	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386042376
14	NC_017544	TCACCA	2	12	32721	32732	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386042377
15	NC_017544	CGATTA	2	12	38151	38162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386042381
16	NC_017544	TTATGT	2	12	42637	42648	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386042384
17	NC_017544	AAAGAT	2	12	46290	46301	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386042387
18	NC_017544	TGAAAT	2	12	47127	47138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386042388
19	NC_017544	TGGCGG	2	12	50262	50273	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386042392
20	NC_017544	TCAAAA	2	12	50382	50393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386042392
21	NC_017544	ACAGTG	2	12	51965	51976	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386042395
22	NC_017544	AAAAAT	2	12	52829	52840	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386042397
23	NC_017544	TTTATA	2	12	55306	55317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042398
24	NC_017544	GCAGAA	2	12	56753	56764	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386042398
25	NC_017544	AGGTAA	2	12	56844	56855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386042399
26	NC_017544	TGATCG	2	12	58232	58243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386042400
27	NC_017544	TGATTT	2	12	63577	63588	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386042405
28	NC_017544	TTTTGC	2	12	64182	64193	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386042406
29	NC_017544	TAAATT	2	12	76486	76497	50 %	50 %	0 %	0 %	386042418
30	NC_017544	ATTATA	2	12	81261	81272	50 %	50 %	0 %	0 %	386042423
31	NC_017544	ATCACT	2	12	86288	86299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042429
32	NC_017544	AAACAC	2	12	86721	86732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042429
33	NC_017544	AAGATA	2	12	89720	89731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386042429
34	NC_017544	TATAAA	2	12	91938	91949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042430
35	NC_017544	TATTAG	2	12	102169	102180	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386042440
36	NC_017544	TAAAAT	2	12	112004	112015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042451
37	NC_017544	CAAAAT	2	12	112145	112156	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386042451
38	NC_017544	GTCCGC	2	12	112277	112288	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386042451
39	NC_017544	GTTTTA	2	12	118912	118923	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386042459
40	NC_017544	TGATTT	2	12	120926	120937	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386042463
41	NC_017544	AAGTAA	2	12	124897	124908	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386042466
42	NC_017544	TAGAAA	2	12	131118	131129	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386042474
43	NC_017544	CAACTG	2	12	138168	138179	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386042482
44	NC_017544	GTTGCA	2	12	147072	147083	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386042494
45	NC_017544	GATTGC	2	12	147134	147145	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386042494
46	NC_017544	TTAAAA	2	12	147808	147819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042495
47	NC_017544	GGCGGT	2	12	152785	152796	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386042498
48	NC_017544	CGAATT	2	12	155436	155447	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386042499
49	NC_017544	GTAAAA	2	12	158588	158599	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386042502
50	NC_017544	TTTTAC	2	12	160635	160646	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386042506
51	NC_017544	TTTTTA	2	12	161673	161684	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386042508
52	NC_017544	AAAGTG	2	12	162885	162896	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386042509
53	NC_017544	TACTAG	2	12	167898	167909	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386042512
54	NC_017544	AAGCGA	2	12	170402	170413	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386042514
55	NC_017544	CAATCC	2	12	173718	173729	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386042516
56	NC_017544	AAAGAT	2	12	175729	175740	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386042518
57	NC_017544	ATGGCT	2	12	176854	176865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386042519
58	NC_017544	CAGAAA	2	12	177528	177539	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386042519
59	NC_017544	AAAAGA	2	12	177604	177615	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386042519
60	NC_017544	AAAAAC	2	12	177934	177945	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386042519
61	NC_017544	TGAAGT	2	12	179974	179985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042519
62	NC_017544	CATTGA	2	12	188107	188118	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386042526
63	NC_017544	TGCAGC	2	12	188762	188773	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386042527
64	NC_017544	TAAAAA	2	12	191000	191011	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386042529
65	NC_017544	TCCGGT	2	12	192100	192111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042531
66	NC_017544	CGTTTG	2	12	199770	199781	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386042538
67	NC_017544	AAAGCA	2	12	204208	204219	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386042541
68	NC_017544	TTCTTT	2	12	209012	209023	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386042547
69	NC_017544	GAAAAA	2	12	211101	211112	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386042549
70	NC_017544	AGGAAA	2	12	211420	211431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042549
71	NC_017544	GAAAAA	2	12	212326	212337	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386042551
72	NC_017544	AAGGAG	2	12	216263	216274	50 %	0 %	50 %	0 %	386042552
73	NC_017544	GCAAGT	2	12	218153	218164	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386042554
74	NC_017544	TTAAAG	2	12	220096	220107	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386042556
75	NC_017544	TGTCGG	2	12	222072	222083	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386042557
76	NC_017544	GCAGAA	2	12	225101	225112	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386042559
77	NC_017544	TCTCCA	2	12	225939	225950	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386042560
78	NC_017544	ATTGAT	2	12	228597	228608	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386042562
79	NC_017544	CAGAAC	2	12	229622	229633	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386042563
80	NC_017544	TTTACC	2	12	243400	243411	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386042565
81	NC_017544	AGTAAA	2	12	250657	250668	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386042571
82	NC_017544	AAAGGA	2	12	253917	253928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042574
83	NC_017544	ACAGTA	2	12	258084	258095	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386042581
84	NC_017544	AAAACA	2	12	258459	258470	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386042582
85	NC_017544	GCATGG	2	12	258640	258651	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386042582
86	NC_017544	CTGTAG	2	12	261584	261595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386042587
87	NC_017544	GACAAT	2	12	263402	263413	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386042590
88	NC_017544	AAGAAA	2	12	265985	265996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386042591
89	NC_017544	TACACT	2	12	270229	270240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042592
90	NC_017544	TTCGTG	2	12	271741	271752	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386042592
91	NC_017544	CCAAAT	2	12	277729	277740	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386042596
92	NC_017544	GAATTA	2	12	280337	280348	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386042598
93	NC_017544	CGAAAT	2	12	284637	284648	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386042602
94	NC_017544	TCTTTT	2	12	287600	287611	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386042604
95	NC_017544	AGTTCA	2	12	289864	289875	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386042606
96	NC_017544	ATCAAT	2	12	290007	290018	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386042606
97	NC_017544	ATGAAA	2	12	290365	290376	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386042607
98	NC_017544	CTTTTA	2	12	292238	292249	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386042609
99	NC_017544	TAGAAA	2	12	293184	293195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386042610
100	NC_017544	ACGTTG	2	12	295115	295126	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386042612
101	NC_017544	GAAAAC	2	12	297022	297033	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386042613
102	NC_017544	TCAATT	2	12	298857	298868	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386042615
103	NC_017544	GCTGCG	2	12	305110	305121	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386042624
104	NC_017544	TTTTGA	2	12	305510	305521	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386042624
105	NC_017544	AAATAA	2	12	308817	308828	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386042627
106	NC_017544	GAAGGG	2	12	310614	310625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042628
107	NC_017544	GATTCA	2	12	314258	314269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386042631
108	NC_017544	GCAATT	2	12	314288	314299	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386042631
109	NC_017544	TCTTTA	2	12	318039	318050	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386042634
110	NC_017544	AGTAAC	2	12	319185	319196	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386042635
111	NC_017544	TCATAA	2	12	320419	320430	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386042635
112	NC_017544	TTTTCA	2	12	325074	325085	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386042637
113	NC_017544	GAACCA	2	12	329604	329615	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386042641
114	NC_017544	TCCATT	2	12	332212	332223	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386042644
115	NC_017544	GTAGAT	2	12	337399	337410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042650
116	NC_017544	TTTTAC	2	12	340558	340569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386042653
117	NC_017544	ATTATA	2	12	340703	340714	50 %	50 %	0 %	0 %	386042653
118	NC_017544	TAGTAT	2	12	340949	340960	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386042653
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