MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 7753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017544	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	386042348
2	NC_017544	CTTA	2	8	944	951	25 %	50 %	0 %	25 %	386042348
3	NC_017544	GACC	2	8	1056	1063	25 %	0 %	25 %	50 %	386042348
4	NC_017544	CGTT	2	8	1418	1425	0 %	50 %	25 %	25 %	386042348
5	NC_017544	TCAA	2	8	2097	2104	50 %	25 %	0 %	25 %	386042349
6	NC_017544	TACT	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	386042349
7	NC_017544	TAAA	2	8	2498	2505	75 %	25 %	0 %	0 %	386042349
8	NC_017544	TGAT	2	8	4703	4710	25 %	50 %	25 %	0 %	386042351
9	NC_017544	AACC	2	8	4977	4984	50 %	0 %	0 %	50 %	386042352
10	NC_017544	TGCT	2	8	5003	5010	0 %	50 %	25 %	25 %	386042352
11	NC_017544	ATTT	2	8	5302	5309	25 %	75 %	0 %	0 %	386042352
12	NC_017544	TTCA	2	8	5464	5471	25 %	50 %	0 %	25 %	386042352
13	NC_017544	AATC	2	8	5612	5619	50 %	25 %	0 %	25 %	386042352
14	NC_017544	TAAA	2	8	6752	6759	75 %	25 %	0 %	0 %	386042353
15	NC_017544	ATTT	2	8	6787	6794	25 %	75 %	0 %	0 %	386042353
16	NC_017544	TAAA	2	8	7136	7143	75 %	25 %	0 %	0 %	386042353
17	NC_017544	ATTA	2	8	7539	7546	50 %	50 %	0 %	0 %	386042353
18	NC_017544	TAAA	2	8	8106	8113	75 %	25 %	0 %	0 %	386042354
19	NC_017544	ATGA	2	8	8222	8229	50 %	25 %	25 %	0 %	386042354
20	NC_017544	AATT	2	8	9249	9256	50 %	50 %	0 %	0 %	386042354
21	NC_017544	ACAA	2	8	9318	9325	75 %	0 %	0 %	25 %	386042354
22	NC_017544	ATTA	2	8	9412	9419	50 %	50 %	0 %	0 %	386042354
23	NC_017544	CTAA	2	8	9593	9600	50 %	25 %	0 %	25 %	386042354
24	NC_017544	ACTT	2	8	9828	9835	25 %	50 %	0 %	25 %	386042354
25	NC_017544	ATCT	2	8	10072	10079	25 %	50 %	0 %	25 %	386042354
26	NC_017544	AAAC	2	8	10226	10233	75 %	0 %	0 %	25 %	386042354
27	NC_017544	AATC	2	8	10791	10798	50 %	25 %	0 %	25 %	386042355
28	NC_017544	ATTA	2	8	11022	11029	50 %	50 %	0 %	0 %	386042355
29	NC_017544	TCCT	2	8	11584	11591	0 %	50 %	0 %	50 %	386042355
30	NC_017544	ATTA	2	8	13668	13675	50 %	50 %	0 %	0 %	386042357
31	NC_017544	ATTT	2	8	14008	14015	25 %	75 %	0 %	0 %	386042358
32	NC_017544	ATGC	2	8	14558	14565	25 %	25 %	25 %	25 %	386042358
33	NC_017544	TGTA	2	8	15297	15304	25 %	50 %	25 %	0 %	386042359
34	NC_017544	ACCG	2	8	16685	16692	25 %	0 %	25 %	50 %	386042360
35	NC_017544	TACA	2	8	16819	16826	50 %	25 %	0 %	25 %	386042360
36	NC_017544	AGCT	2	8	16930	16937	25 %	25 %	25 %	25 %	386042360
37	NC_017544	CAAA	2	8	17279	17286	75 %	0 %	0 %	25 %	386042360
38	NC_017544	CTTG	2	8	17518	17525	0 %	50 %	25 %	25 %	386042361
39	NC_017544	TTTA	2	8	17659	17666	25 %	75 %	0 %	0 %	386042361
40	NC_017544	ATTA	2	8	18019	18026	50 %	50 %	0 %	0 %	386042361
41	NC_017544	GCTT	2	8	18070	18077	0 %	50 %	25 %	25 %	386042361
42	NC_017544	ACCG	2	8	18394	18401	25 %	0 %	25 %	50 %	386042361
43	NC_017544	GTTT	2	8	18719	18726	0 %	75 %	25 %	0 %	386042361
44	NC_017544	TGTC	2	8	19107	19114	0 %	50 %	25 %	25 %	386042361
45	NC_017544	ACTT	2	8	19438	19445	25 %	50 %	0 %	25 %	386042362
46	NC_017544	GGCT	2	8	19458	19465	0 %	25 %	50 %	25 %	386042362
47	NC_017544	TATT	2	8	19835	19842	25 %	75 %	0 %	0 %	386042362
48	NC_017544	TTCA	2	8	20093	20100	25 %	50 %	0 %	25 %	386042363
49	NC_017544	GGAC	2	8	21778	21785	25 %	0 %	50 %	25 %	386042365
50	NC_017544	AATC	2	8	22336	22343	50 %	25 %	0 %	25 %	386042365
51	NC_017544	AAGC	2	8	22680	22687	50 %	0 %	25 %	25 %	386042365
52	NC_017544	AGCC	2	8	23767	23774	25 %	0 %	25 %	50 %	386042366
53	NC_017544	GAAC	2	8	23803	23810	50 %	0 %	25 %	25 %	386042366
54	NC_017544	ATTA	2	8	24239	24246	50 %	50 %	0 %	0 %	386042367
55	NC_017544	GTAA	2	8	24396	24403	50 %	25 %	25 %	0 %	386042367
56	NC_017544	GTTA	2	8	25892	25899	25 %	50 %	25 %	0 %	386042370
57	NC_017544	CAAA	2	8	26576	26583	75 %	0 %	0 %	25 %	386042370
58	NC_017544	GTTG	2	8	26720	26727	0 %	50 %	50 %	0 %	386042371
59	NC_017544	AAAG	2	8	26928	26935	75 %	0 %	25 %	0 %	386042371
60	NC_017544	GTTA	2	8	28366	28373	25 %	50 %	25 %	0 %	386042373
61	NC_017544	TGAT	2	8	28487	28494	25 %	50 %	25 %	0 %	386042373
62	NC_017544	GAAA	2	8	29226	29233	75 %	0 %	25 %	0 %	386042374
63	NC_017544	GAAG	2	8	29362	29369	50 %	0 %	50 %	0 %	386042374
64	NC_017544	TTGG	2	8	29498	29505	0 %	50 %	50 %	0 %	386042374
65	NC_017544	GTAC	2	8	29522	29529	25 %	25 %	25 %	25 %	386042374
66	NC_017544	ATTT	2	8	30210	30217	25 %	75 %	0 %	0 %	386042374
67	NC_017544	CAAT	2	8	30927	30934	50 %	25 %	0 %	25 %	386042374
68	NC_017544	ATTA	2	8	31554	31561	50 %	50 %	0 %	0 %	386042375
69	NC_017544	ACTA	2	8	33894	33901	50 %	25 %	0 %	25 %	386042378
70	NC_017544	AATA	2	8	33933	33940	75 %	25 %	0 %	0 %	386042378
71	NC_017544	AAAC	2	8	34848	34855	75 %	0 %	0 %	25 %	386042379
72	NC_017544	TTGT	2	8	34999	35006	0 %	75 %	25 %	0 %	386042379
73	NC_017544	TTGG	2	8	35029	35036	0 %	50 %	50 %	0 %	386042379
74	NC_017544	AAAC	2	8	35044	35051	75 %	0 %	0 %	25 %	386042379
75	NC_017544	TATT	2	8	35057	35064	25 %	75 %	0 %	0 %	386042379
76	NC_017544	AACT	2	8	35302	35309	50 %	25 %	0 %	25 %	386042379
77	NC_017544	GACT	2	8	36183	36190	25 %	25 %	25 %	25 %	386042380
78	NC_017544	GGCT	2	8	36260	36267	0 %	25 %	50 %	25 %	386042380
79	NC_017544	GATG	2	8	36910	36917	25 %	25 %	50 %	0 %	386042380
80	NC_017544	AACA	2	8	37183	37190	75 %	0 %	0 %	25 %	386042380
81	NC_017544	TTTA	2	8	37359	37366	25 %	75 %	0 %	0 %	386042380
82	NC_017544	AAAC	2	8	37412	37419	75 %	0 %	0 %	25 %	386042380
83	NC_017544	CAAT	2	8	37796	37803	50 %	25 %	0 %	25 %	386042380
84	NC_017544	GCGG	2	8	38444	38451	0 %	0 %	75 %	25 %	386042381
85	NC_017544	TTAG	2	8	38510	38517	25 %	50 %	25 %	0 %	386042381
86	NC_017544	TACC	2	8	39293	39300	25 %	25 %	0 %	50 %	386042381
87	NC_017544	CAAA	2	8	39456	39463	75 %	0 %	0 %	25 %	386042382
88	NC_017544	CAAC	2	8	39946	39953	50 %	0 %	0 %	50 %	386042382
89	NC_017544	AAAT	2	8	40394	40401	75 %	25 %	0 %	0 %	386042382
90	NC_017544	TTCT	2	8	40987	40994	0 %	75 %	0 %	25 %	386042383
91	NC_017544	ATTA	2	8	42072	42079	50 %	50 %	0 %	0 %	386042384
92	NC_017544	TTGT	2	8	42108	42115	0 %	75 %	25 %	0 %	386042384
93	NC_017544	ATTT	2	8	42297	42304	25 %	75 %	0 %	0 %	386042384
94	NC_017544	ATTT	2	8	42380	42387	25 %	75 %	0 %	0 %	386042384
95	NC_017544	ACGT	2	8	43493	43500	25 %	25 %	25 %	25 %	386042385
96	NC_017544	ATTT	2	8	43798	43805	25 %	75 %	0 %	0 %	386042385
97	NC_017544	CGAC	2	8	44064	44071	25 %	0 %	25 %	50 %	386042385
98	NC_017544	ATTA	2	8	44086	44093	50 %	50 %	0 %	0 %	386042385
99	NC_017544	TGGT	2	8	44192	44199	0 %	50 %	50 %	0 %	386042385
100	NC_017544	ATTA	2	8	44610	44617	50 %	50 %	0 %	0 %	386042386
101	NC_017544	ACCA	2	8	44658	44665	50 %	0 %	0 %	50 %	386042386
102	NC_017544	TCTT	2	8	44729	44736	0 %	75 %	0 %	25 %	386042386
103	NC_017544	ATTA	2	8	44998	45005	50 %	50 %	0 %	0 %	386042386
104	NC_017544	AAAG	2	8	45130	45137	75 %	0 %	25 %	0 %	386042386
105	NC_017544	GAAG	2	8	45855	45862	50 %	0 %	50 %	0 %	386042387
106	NC_017544	AAAC	2	8	45961	45968	75 %	0 %	0 %	25 %	386042387
107	NC_017544	TTAA	2	8	46543	46550	50 %	50 %	0 %	0 %	386042388
108	NC_017544	AAAC	2	8	46812	46819	75 %	0 %	0 %	25 %	386042388
109	NC_017544	ATTT	2	8	46825	46832	25 %	75 %	0 %	0 %	386042388
110	NC_017544	TACG	2	8	46980	46987	25 %	25 %	25 %	25 %	386042388
111	NC_017544	CCAG	2	8	48606	48613	25 %	0 %	25 %	50 %	386042390
112	NC_017544	TGAA	2	8	48743	48750	50 %	25 %	25 %	0 %	386042390
113	NC_017544	GAAC	2	8	48775	48782	50 %	0 %	25 %	25 %	386042390
114	NC_017544	TTTA	2	8	48816	48823	25 %	75 %	0 %	0 %	386042390
115	NC_017544	GGCG	2	8	50145	50152	0 %	0 %	75 %	25 %	386042392
116	NC_017544	AGAA	2	8	51808	51815	75 %	0 %	25 %	0 %	386042395
117	NC_017544	TAAT	2	8	51900	51907	50 %	50 %	0 %	0 %	386042395
118	NC_017544	ACTT	2	8	52336	52343	25 %	50 %	0 %	25 %	386042395
119	NC_017544	GCTT	2	8	52464	52471	0 %	50 %	25 %	25 %	386042396
120	NC_017544	ATAA	2	8	52528	52535	75 %	25 %	0 %	0 %	386042396
121	NC_017544	AACA	2	8	52693	52700	75 %	0 %	0 %	25 %	386042397
122	NC_017544	TTTA	2	8	52759	52766	25 %	75 %	0 %	0 %	386042397
123	NC_017544	ATTG	2	8	52798	52805	25 %	50 %	25 %	0 %	386042397
124	NC_017544	TACT	2	8	52881	52888	25 %	50 %	0 %	25 %	386042397
125	NC_017544	ATTG	2	8	53032	53039	25 %	50 %	25 %	0 %	386042397
126	NC_017544	CAAC	2	8	53250	53257	50 %	0 %	0 %	50 %	386042397
127	NC_017544	TAAA	2	8	53451	53458	75 %	25 %	0 %	0 %	386042397
128	NC_017544	TGAA	2	8	55008	55015	50 %	25 %	25 %	0 %	386042398
129	NC_017544	TATT	2	8	55492	55499	25 %	75 %	0 %	0 %	386042398
130	NC_017544	ATGA	2	8	55937	55944	50 %	25 %	25 %	0 %	386042398
131	NC_017544	AATG	2	8	56002	56009	50 %	25 %	25 %	0 %	386042398
132	NC_017544	AATT	2	8	56769	56776	50 %	50 %	0 %	0 %	386042398
133	NC_017544	GAAA	2	8	57018	57025	75 %	0 %	25 %	0 %	386042399
134	NC_017544	ACGG	2	8	58074	58081	25 %	0 %	50 %	25 %	386042400
135	NC_017544	TTTC	2	8	58960	58967	0 %	75 %	0 %	25 %	386042402
136	NC_017544	CAAA	2	8	59261	59268	75 %	0 %	0 %	25 %	386042402
137	NC_017544	ATCA	2	8	59668	59675	50 %	25 %	0 %	25 %	386042402
138	NC_017544	GGTT	2	8	59815	59822	0 %	50 %	50 %	0 %	386042402
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