MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 57954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017544	TTA	2	6	47959	47964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042389
1003	NC_017544	AAT	2	6	47992	47997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042389
1004	NC_017544	TGA	2	6	48074	48079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042390
1005	NC_017544	TAT	2	6	48191	48196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042390
1006	NC_017544	TGA	2	6	48198	48203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042390
1007	NC_017544	ATG	2	6	48220	48225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042390
1008	NC_017544	T	7	7	48240	48246	0 %	100 %	0 %	0 %	386042390
1009	NC_017544	GA	3	6	48258	48263	50 %	0 %	50 %	0 %	386042390
1010	NC_017544	ATT	2	6	48398	48403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042390
1011	NC_017544	GAA	2	6	48421	48426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042390
1012	NC_017544	A	6	6	48454	48459	100 %	0 %	0 %	0 %	386042390
1013	NC_017544	AAATG	2	10	48492	48501	60 %	20 %	20 %	0 %	386042390
1014	NC_017544	T	6	6	48519	48524	0 %	100 %	0 %	0 %	386042390
1015	NC_017544	CAG	2	6	48563	48568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042390
1016	NC_017544	CCAG	2	8	48606	48613	25 %	0 %	25 %	50 %	386042390
1017	NC_017544	CAT	2	6	48655	48660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042390
1018	NC_017544	TGAA	2	8	48743	48750	50 %	25 %	25 %	0 %	386042390
1019	NC_017544	GAAC	2	8	48775	48782	50 %	0 %	25 %	25 %	386042390
1020	NC_017544	TTTA	2	8	48816	48823	25 %	75 %	0 %	0 %	386042390
1021	NC_017544	CAA	2	6	48952	48957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042390
1022	NC_017544	AT	6	12	48968	48979	50 %	50 %	0 %	0 %	386042390
1023	NC_017544	A	6	6	48983	48988	100 %	0 %	0 %	0 %	386042390
1024	NC_017544	ATG	2	6	49121	49126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042390
1025	NC_017544	AAG	2	6	49200	49205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042390
1026	NC_017544	GTAGA	2	10	49578	49587	40 %	20 %	40 %	0 %	386042391
1027	NC_017544	CAT	2	6	49613	49618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042391
1028	NC_017544	GAA	2	6	49632	49637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042391
1029	NC_017544	A	6	6	49644	49649	100 %	0 %	0 %	0 %	386042391
1030	NC_017544	TGT	2	6	49652	49657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042391
1031	NC_017544	ATC	2	6	49698	49703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042391
1032	NC_017544	TGA	2	6	49838	49843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042391
1033	NC_017544	AGA	2	6	49868	49873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042391
1034	NC_017544	ATG	2	6	49936	49941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042392
1035	NC_017544	GTA	2	6	49948	49953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042392
1036	NC_017544	CAA	2	6	50053	50058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042392
1037	NC_017544	TTA	2	6	50078	50083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042392
1038	NC_017544	TGT	2	6	50088	50093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042392
1039	NC_017544	GAA	2	6	50130	50135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042392
1040	NC_017544	GGCG	2	8	50145	50152	0 %	0 %	75 %	25 %	386042392
1041	NC_017544	ACG	2	6	50189	50194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042392
1042	NC_017544	AG	3	6	50226	50231	50 %	0 %	50 %	0 %	386042392
1043	NC_017544	TGGCGG	2	12	50262	50273	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386042392
1044	NC_017544	AAC	2	6	50296	50301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042392
1045	NC_017544	AAT	2	6	50302	50307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042392
1046	NC_017544	CAA	2	6	50374	50379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042392
1047	NC_017544	TCAAAA	2	12	50382	50393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386042392
1048	NC_017544	TAA	2	6	50406	50411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042392
1049	NC_017544	TGA	2	6	50451	50456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042392
1050	NC_017544	GGA	2	6	50522	50527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042393
1051	NC_017544	A	6	6	50549	50554	100 %	0 %	0 %	0 %	386042393
1052	NC_017544	TTACT	2	10	50560	50569	20 %	60 %	0 %	20 %	386042393
1053	NC_017544	CTT	2	6	50609	50614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042393
1054	NC_017544	A	6	6	50615	50620	100 %	0 %	0 %	0 %	386042393
1055	NC_017544	TCG	2	6	50650	50655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042393
1056	NC_017544	TAC	2	6	50727	50732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042393
1057	NC_017544	GAA	2	6	50744	50749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042393
1058	NC_017544	A	6	6	50915	50920	100 %	0 %	0 %	0 %	386042394
1059	NC_017544	TAT	2	6	50943	50948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042394
1060	NC_017544	TAG	2	6	50949	50954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042394
1061	NC_017544	ATG	2	6	50979	50984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042394
1062	NC_017544	CAT	2	6	50994	50999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042394
1063	NC_017544	ATA	2	6	51003	51008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042394
1064	NC_017544	CAA	2	6	51010	51015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042394
1065	NC_017544	ACT	2	6	51020	51025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042394
1066	NC_017544	TAA	2	6	51040	51045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042394
1067	NC_017544	TCA	2	6	51053	51058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042394
1068	NC_017544	GAAAT	2	10	51218	51227	60 %	20 %	20 %	0 %	386042394
1069	NC_017544	AAC	2	6	51246	51251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042394
1070	NC_017544	TGA	2	6	51256	51261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042394
1071	NC_017544	CTTAG	2	10	51317	51326	20 %	40 %	20 %	20 %	386042394
1072	NC_017544	AAG	2	6	51345	51350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042394
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1074	NC_017544	ATA	2	6	51450	51455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042394
1075	NC_017544	TTC	2	6	51495	51500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042394
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1080	NC_017544	TAAT	2	8	51900	51907	50 %	50 %	0 %	0 %	386042395
1081	NC_017544	ACAGTG	2	12	51965	51976	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386042395
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1083	NC_017544	TAA	2	6	52102	52107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042395
1084	NC_017544	GAA	2	6	52196	52201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042395
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1089	NC_017544	TTC	2	6	52448	52453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042396
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1091	NC_017544	A	7	7	52516	52522	100 %	0 %	0 %	0 %	386042396
1092	NC_017544	ATAA	2	8	52528	52535	75 %	25 %	0 %	0 %	386042396
1093	NC_017544	AACA	2	8	52693	52700	75 %	0 %	0 %	25 %	386042397
1094	NC_017544	T	6	6	52704	52709	0 %	100 %	0 %	0 %	386042397
1095	NC_017544	TGCTA	2	10	52741	52750	20 %	40 %	20 %	20 %	386042397
1096	NC_017544	TTTA	2	8	52759	52766	25 %	75 %	0 %	0 %	386042397
1097	NC_017544	GAT	2	6	52786	52791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042397
1098	NC_017544	ATTG	2	8	52798	52805	25 %	50 %	25 %	0 %	386042397
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1102	NC_017544	TACT	2	8	52881	52888	25 %	50 %	0 %	25 %	386042397
1103	NC_017544	TAG	2	6	52902	52907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042397
1104	NC_017544	TTTTA	2	10	52909	52918	20 %	80 %	0 %	0 %	386042397
1105	NC_017544	ATG	2	6	52941	52946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042397
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1107	NC_017544	TCT	2	6	53020	53025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042397
1108	NC_017544	ATTG	2	8	53032	53039	25 %	50 %	25 %	0 %	386042397
1109	NC_017544	TTG	2	6	53061	53066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042397
1110	NC_017544	TAT	2	6	53086	53091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042397
1111	NC_017544	T	6	6	53091	53096	0 %	100 %	0 %	0 %	386042397
1112	NC_017544	GTT	2	6	53234	53239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042397
1113	NC_017544	CAAC	2	8	53250	53257	50 %	0 %	0 %	50 %	386042397
1114	NC_017544	TAC	2	6	53311	53316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042397
1115	NC_017544	TTG	2	6	53382	53387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042397
1116	NC_017544	AT	3	6	53389	53394	50 %	50 %	0 %	0 %	386042397
1117	NC_017544	ATA	2	6	53397	53402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042397
1118	NC_017544	ATA	2	6	53436	53441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042397
1119	NC_017544	TAAA	2	8	53451	53458	75 %	25 %	0 %	0 %	386042397
1120	NC_017544	AAC	2	6	53471	53476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042397
1121	NC_017544	AGT	2	6	53581	53586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042397
1122	NC_017544	GCG	2	6	53666	53671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042397
1123	NC_017544	A	6	6	53711	53716	100 %	0 %	0 %	0 %	386042397
1124	NC_017544	ATT	2	6	53729	53734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042397
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1126	NC_017544	GAA	2	6	53851	53856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042397
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1246	NC_017544	T	6	6	60293	60298	0 %	100 %	0 %	0 %	386042403
1247	NC_017544	TA	3	6	60358	60363	50 %	50 %	0 %	0 %	386042403
1248	NC_017544	TGT	2	6	60368	60373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042403
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