MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3

Total Repeats: 4275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017499	TGT	2	6	221	226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839643
2	NC_017499	ATGA	2	8	309	316	50 %	25 %	25 %	0 %	385839643
3	NC_017499	TTC	2	6	333	338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839643
4	NC_017499	GAAA	2	8	369	376	75 %	0 %	25 %	0 %	385839643
5	NC_017499	AGA	2	6	421	426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839643
6	NC_017499	CAAA	2	8	430	437	75 %	0 %	0 %	25 %	385839643
7	NC_017499	ATA	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839643
8	NC_017499	ACA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839643
9	NC_017499	CAA	3	9	504	512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839643
10	NC_017499	ATT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839643
11	NC_017499	TAAC	2	8	628	635	50 %	25 %	0 %	25 %	385839643
12	NC_017499	GAA	2	6	645	650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839643
13	NC_017499	TGT	2	6	725	730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839643
14	NC_017499	ATT	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839643
15	NC_017499	TAAA	2	8	969	976	75 %	25 %	0 %	0 %	385839643
16	NC_017499	CAA	2	6	1306	1311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839644
17	NC_017499	AAAGA	2	10	1368	1377	80 %	0 %	20 %	0 %	385839644
18	NC_017499	TAA	2	6	1530	1535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839644
19	NC_017499	GTT	2	6	1538	1543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839644
20	NC_017499	AAC	2	6	1588	1593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839644
21	NC_017499	AATC	2	8	1703	1710	50 %	25 %	0 %	25 %	385839644
22	NC_017499	AAT	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839644
23	NC_017499	ATT	3	9	1729	1737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839644
24	NC_017499	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	385839644
25	NC_017499	ATCT	2	8	1824	1831	25 %	50 %	0 %	25 %	385839644
26	NC_017499	ATT	2	6	1841	1846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839644
27	NC_017499	A	6	6	1970	1975	100 %	0 %	0 %	0 %	385839644
28	NC_017499	TTA	2	6	1976	1981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839644
29	NC_017499	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	385839644
30	NC_017499	AAG	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839644
31	NC_017499	GTT	2	6	2044	2049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839644
32	NC_017499	TTTA	2	8	2132	2139	25 %	75 %	0 %	0 %	385839644
33	NC_017499	TTAC	2	8	2143	2150	25 %	50 %	0 %	25 %	385839644
34	NC_017499	GAT	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839644
35	NC_017499	TAT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839644
36	NC_017499	A	7	7	2247	2253	100 %	0 %	0 %	0 %	385839644
37	NC_017499	ATC	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839645
38	NC_017499	GTT	2	6	2946	2951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839645
39	NC_017499	TAC	2	6	3018	3023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839645
40	NC_017499	ATTTG	2	10	3026	3035	20 %	60 %	20 %	0 %	385839645
41	NC_017499	TAA	2	6	3055	3060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839645
42	NC_017499	TGA	3	9	3086	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839645
43	NC_017499	AAGT	2	8	3138	3145	50 %	25 %	25 %	0 %	385839645
44	NC_017499	AAT	2	6	3201	3206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839645
45	NC_017499	TAAA	2	8	3228	3235	75 %	25 %	0 %	0 %	385839645
46	NC_017499	TAGA	2	8	3250	3257	50 %	25 %	25 %	0 %	385839645
47	NC_017499	ATT	2	6	3304	3309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839645
48	NC_017499	TCA	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839645
49	NC_017499	ATC	3	9	3412	3420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839645
50	NC_017499	ATTT	2	8	3472	3479	25 %	75 %	0 %	0 %	385839645
51	NC_017499	ATG	2	6	3508	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839645
52	NC_017499	ATTG	2	8	3544	3551	25 %	50 %	25 %	0 %	385839645
53	NC_017499	AG	3	6	3631	3636	50 %	0 %	50 %	0 %	385839645
54	NC_017499	TTTC	2	8	3850	3857	0 %	75 %	0 %	25 %	385839646
55	NC_017499	TAA	2	6	3870	3875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839646
56	NC_017499	T	7	7	3903	3909	0 %	100 %	0 %	0 %	385839646
57	NC_017499	GAAA	2	8	4016	4023	75 %	0 %	25 %	0 %	385839646
58	NC_017499	TGGT	2	8	4064	4071	0 %	50 %	50 %	0 %	385839646
59	NC_017499	AT	3	6	4093	4098	50 %	50 %	0 %	0 %	385839646
60	NC_017499	A	6	6	4106	4111	100 %	0 %	0 %	0 %	385839646
61	NC_017499	AATT	2	8	4164	4171	50 %	50 %	0 %	0 %	385839646
62	NC_017499	TGT	2	6	4188	4193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839646
63	NC_017499	A	6	6	4263	4268	100 %	0 %	0 %	0 %	385839646
64	NC_017499	ATA	2	6	4270	4275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839646
65	NC_017499	ATCA	2	8	4324	4331	50 %	25 %	0 %	25 %	385839646
66	NC_017499	GAA	2	6	4345	4350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839646
67	NC_017499	GAA	2	6	4384	4389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839646
68	NC_017499	ACC	2	6	4399	4404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839646
69	NC_017499	TTG	2	6	4503	4508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839646
70	NC_017499	AAT	2	6	4593	4598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839646
71	NC_017499	CAT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839646
72	NC_017499	TAT	2	6	5509	5514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839647
73	NC_017499	ATAAAG	2	12	5665	5676	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385839647
74	NC_017499	ATC	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839647
75	NC_017499	AGA	2	6	5717	5722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839647
76	NC_017499	ATTGAA	2	12	5742	5753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385839647
77	NC_017499	GTAT	2	8	5791	5798	25 %	50 %	25 %	0 %	385839647
78	NC_017499	T	6	6	5804	5809	0 %	100 %	0 %	0 %	385839647
79	NC_017499	GAAA	2	8	5811	5818	75 %	0 %	25 %	0 %	385839647
80	NC_017499	TTC	2	6	5847	5852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839647
81	NC_017499	AAAG	2	8	5855	5862	75 %	0 %	25 %	0 %	385839647
82	NC_017499	CCA	2	6	5907	5912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839647
83	NC_017499	ATT	2	6	5958	5963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839647
84	NC_017499	TTC	2	6	5968	5973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839647
85	NC_017499	CGTT	2	8	5985	5992	0 %	50 %	25 %	25 %	385839647
86	NC_017499	TTGA	2	8	6009	6016	25 %	50 %	25 %	0 %	385839647
87	NC_017499	TTG	2	6	6034	6039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839647
88	NC_017499	AAG	2	6	6092	6097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839647
89	NC_017499	TGC	2	6	6125	6130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839647
90	NC_017499	AGA	2	6	6134	6139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839647
91	NC_017499	TGA	2	6	6146	6151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839647
92	NC_017499	GAA	2	6	6300	6305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839647
93	NC_017499	TGG	2	6	6313	6318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839647
94	NC_017499	AAG	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839648
95	NC_017499	TAA	2	6	7673	7678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839648
96	NC_017499	CTA	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839648
97	NC_017499	ATG	2	6	7738	7743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839648
98	NC_017499	T	6	6	7761	7766	0 %	100 %	0 %	0 %	385839648
99	NC_017499	GA	3	6	7876	7881	50 %	0 %	50 %	0 %	385839648
100	NC_017499	TTTG	2	8	7949	7956	0 %	75 %	25 %	0 %	385839648
101	NC_017499	AAAT	2	8	8021	8028	75 %	25 %	0 %	0 %	385839648
102	NC_017499	GTT	2	6	8091	8096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839648
103	NC_017499	A	6	6	8148	8153	100 %	0 %	0 %	0 %	385839648
104	NC_017499	AAC	2	6	8275	8280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839648
105	NC_017499	GTTA	2	8	8314	8321	25 %	50 %	25 %	0 %	385839648
106	NC_017499	ACC	2	6	8336	8341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839648
107	NC_017499	ATGCA	2	10	9096	9105	40 %	20 %	20 %	20 %	385839649
108	NC_017499	CAC	2	6	9143	9148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839649
109	NC_017499	GCCATT	2	12	9164	9175	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385839649
110	NC_017499	AATCC	2	10	9183	9192	40 %	20 %	0 %	40 %	385839649
111	NC_017499	GCT	2	6	9196	9201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839649
112	NC_017499	TTG	2	6	9294	9299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839649
113	NC_017499	T	6	6	9313	9318	0 %	100 %	0 %	0 %	385839649
114	NC_017499	TCT	2	6	9379	9384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839649
115	NC_017499	AAT	2	6	9397	9402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839649
116	NC_017499	AGA	2	6	9456	9461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839649
117	NC_017499	TAA	2	6	9468	9473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839649
118	NC_017499	AGC	2	6	9540	9545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839649
119	NC_017499	GTTT	2	8	9657	9664	0 %	75 %	25 %	0 %	385839649
120	NC_017499	ATT	2	6	9699	9704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839649
121	NC_017499	TA	3	6	9713	9718	50 %	50 %	0 %	0 %	385839649
122	NC_017499	TAA	2	6	9762	9767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839649
123	NC_017499	AAG	2	6	9785	9790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839649
124	NC_017499	AAT	2	6	9826	9831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839649
125	NC_017499	TCT	2	6	9877	9882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839649
126	NC_017499	ACA	2	6	9907	9912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839649
127	NC_017499	GCT	2	6	9952	9957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839649
128	NC_017499	TTCT	2	8	9990	9997	0 %	75 %	0 %	25 %	385839649
129	NC_017499	GTAA	2	8	10000	10007	50 %	25 %	25 %	0 %	385839649
130	NC_017499	CTT	2	6	10061	10066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839649
131	NC_017499	GAA	2	6	10080	10085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839649
132	NC_017499	ACT	2	6	10099	10104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839649
133	NC_017499	GTT	2	6	10148	10153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839649
134	NC_017499	ATA	2	6	10168	10173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839649
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136	NC_017499	TAA	2	6	10314	10319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839649
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