MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA554

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017496	ATCT	2	8	156	163	25 %	50 %	0 %	25 %	385836853
2	NC_017496	GCTG	2	8	218	225	0 %	25 %	50 %	25 %	385836854
3	NC_017496	AAAC	2	8	611	618	75 %	0 %	0 %	25 %	385836854
4	NC_017496	CTTT	2	8	1611	1618	0 %	75 %	0 %	25 %	385836855
5	NC_017496	GTTT	2	8	1864	1871	0 %	75 %	25 %	0 %	385836855
6	NC_017496	GGAC	2	8	1947	1954	25 %	0 %	50 %	25 %	385836855
7	NC_017496	TTTC	2	8	1996	2003	0 %	75 %	0 %	25 %	385836855
8	NC_017496	ATTT	2	8	2035	2042	25 %	75 %	0 %	0 %	385836855
9	NC_017496	TCTT	2	8	2771	2778	0 %	75 %	0 %	25 %	385836856
10	NC_017496	AAAT	2	8	2802	2809	75 %	25 %	0 %	0 %	385836856
11	NC_017496	TTCT	2	8	3255	3262	0 %	75 %	0 %	25 %	385836856
12	NC_017496	AAAC	2	8	3297	3304	75 %	0 %	0 %	25 %	385836856
13	NC_017496	AGAT	2	8	3320	3327	50 %	25 %	25 %	0 %	385836856
14	NC_017496	ATAG	2	8	3631	3638	50 %	25 %	25 %	0 %	385836856
15	NC_017496	TTCT	2	8	3966	3973	0 %	75 %	0 %	25 %	385836856
16	NC_017496	TGAA	2	8	4795	4802	50 %	25 %	25 %	0 %	385836857
17	NC_017496	TGAT	2	8	5074	5081	25 %	50 %	25 %	0 %	385836858
18	NC_017496	TCAC	2	8	5426	5433	25 %	25 %	0 %	50 %	385836859
19	NC_017496	ATTT	2	8	5731	5738	25 %	75 %	0 %	0 %	385836860
20	NC_017496	TTCT	2	8	5916	5923	0 %	75 %	0 %	25 %	385836861
21	NC_017496	AATT	2	8	5989	5996	50 %	50 %	0 %	0 %	385836861
22	NC_017496	AATT	2	8	6367	6374	50 %	50 %	0 %	0 %	385836862
23	NC_017496	AATG	2	8	7352	7359	50 %	25 %	25 %	0 %	385836863
24	NC_017496	AATT	2	8	8175	8182	50 %	50 %	0 %	0 %	385836863
25	NC_017496	AACC	2	8	8285	8292	50 %	0 %	0 %	50 %	385836863
26	NC_017496	TCAA	2	8	8638	8645	50 %	25 %	0 %	25 %	385836863
27	NC_017496	ATTA	2	8	8847	8854	50 %	50 %	0 %	0 %	385836863
28	NC_017496	TTGA	2	8	8978	8985	25 %	50 %	25 %	0 %	385836863
29	NC_017496	CGTC	2	8	9142	9149	0 %	25 %	25 %	50 %	385836863
30	NC_017496	AGCC	2	8	9991	9998	25 %	0 %	25 %	50 %	385836864
31	NC_017496	GAAA	2	8	10277	10284	75 %	0 %	25 %	0 %	385836864
32	NC_017496	TCAA	2	8	10405	10412	50 %	25 %	0 %	25 %	385836864
33	NC_017496	AACC	2	8	10413	10420	50 %	0 %	0 %	50 %	385836864
34	NC_017496	TCAA	2	8	10462	10469	50 %	25 %	0 %	25 %	385836864
35	NC_017496	GAAG	2	8	10881	10888	50 %	0 %	50 %	0 %	385836864
36	NC_017496	TCAA	2	8	10907	10914	50 %	25 %	0 %	25 %	385836864
37	NC_017496	AAAG	2	8	11336	11343	75 %	0 %	25 %	0 %	385836864
38	NC_017496	TCAA	2	8	11667	11674	50 %	25 %	0 %	25 %	385836864
39	NC_017496	TTTA	2	8	11951	11958	25 %	75 %	0 %	0 %	385836865
40	NC_017496	GTCA	2	8	12506	12513	25 %	25 %	25 %	25 %	385836865
41	NC_017496	GAAA	2	8	12861	12868	75 %	0 %	25 %	0 %	385836866
42	NC_017496	ATTG	3	12	12869	12880	25 %	50 %	25 %	0 %	385836866
43	NC_017496	ATTG	2	8	12974	12981	25 %	50 %	25 %	0 %	385836866
44	NC_017496	ACCA	2	8	13148	13155	50 %	0 %	0 %	50 %	385836866
45	NC_017496	AAAT	2	8	13378	13385	75 %	25 %	0 %	0 %	385836866
46	NC_017496	TCTT	2	8	13491	13498	0 %	75 %	0 %	25 %	385836867
47	NC_017496	AGTT	2	8	14292	14299	25 %	50 %	25 %	0 %	385836868
48	NC_017496	ATTG	2	8	14710	14717	25 %	50 %	25 %	0 %	385836868
49	NC_017496	GATA	2	8	15296	15303	50 %	25 %	25 %	0 %	385836869
50	NC_017496	AATT	2	8	15518	15525	50 %	50 %	0 %	0 %	385836869
51	NC_017496	AATG	2	8	15587	15594	50 %	25 %	25 %	0 %	385836869
52	NC_017496	AGTC	2	8	15675	15682	25 %	25 %	25 %	25 %	385836869
53	NC_017496	ATAA	2	8	16012	16019	75 %	25 %	0 %	0 %	385836870
54	NC_017496	TCCA	2	8	16184	16191	25 %	25 %	0 %	50 %	385836870
55	NC_017496	AATT	2	8	16508	16515	50 %	50 %	0 %	0 %	385836870
56	NC_017496	TGAT	2	8	16520	16527	25 %	50 %	25 %	0 %	385836870
57	NC_017496	AATT	2	8	16550	16557	50 %	50 %	0 %	0 %	385836870
58	NC_017496	TAAA	2	8	16694	16701	75 %	25 %	0 %	0 %	385836870
59	NC_017496	TCAT	2	8	16710	16717	25 %	50 %	0 %	25 %	385836870
60	NC_017496	AAAT	2	8	17103	17110	75 %	25 %	0 %	0 %	385836871
61	NC_017496	AATA	2	8	17523	17530	75 %	25 %	0 %	0 %	385836871
62	NC_017496	TTTA	2	8	17812	17819	25 %	75 %	0 %	0 %	385836872
63	NC_017496	GTCA	2	8	18367	18374	25 %	25 %	25 %	25 %	385836872
64	NC_017496	ATAG	2	8	19317	19324	50 %	25 %	25 %	0 %	385836873
65	NC_017496	TCAT	2	8	19373	19380	25 %	50 %	0 %	25 %	385836873
66	NC_017496	TAAA	2	8	19383	19390	75 %	25 %	0 %	0 %	385836873
67	NC_017496	AAAG	2	8	19441	19448	75 %	0 %	25 %	0 %	385836873
68	NC_017496	AGTG	2	8	19563	19570	25 %	25 %	50 %	0 %	385836873
69	NC_017496	GCAT	2	8	20183	20190	25 %	25 %	25 %	25 %	385836873
70	NC_017496	TTTA	2	8	20638	20645	25 %	75 %	0 %	0 %	385836874
71	NC_017496	AAAT	2	8	21274	21281	75 %	25 %	0 %	0 %	385836875
72	NC_017496	GAAA	2	8	21472	21479	75 %	0 %	25 %	0 %	385836875
73	NC_017496	CTTT	2	8	22227	22234	0 %	75 %	0 %	25 %	385836876
74	NC_017496	AACA	2	8	22481	22488	75 %	0 %	0 %	25 %	385836876
75	NC_017496	TTAT	2	8	22684	22691	25 %	75 %	0 %	0 %	385836876
76	NC_017496	TGTC	2	8	22757	22764	0 %	50 %	25 %	25 %	385836876
77	NC_017496	TGAT	2	8	23150	23157	25 %	50 %	25 %	0 %	385836876
78	NC_017496	ATAA	2	8	23854	23861	75 %	25 %	0 %	0 %	385836877
79	NC_017496	TTTC	2	8	24530	24537	0 %	75 %	0 %	25 %	385836878
80	NC_017496	ATTT	2	8	26201	26208	25 %	75 %	0 %	0 %	385836879
81	NC_017496	ACTT	2	8	26552	26559	25 %	50 %	0 %	25 %	385836879
82	NC_017496	AAAC	2	8	26764	26771	75 %	0 %	0 %	25 %	385836879
83	NC_017496	ATCC	2	8	27267	27274	25 %	25 %	0 %	50 %	385836880
84	NC_017496	ACTT	2	8	27962	27969	25 %	50 %	0 %	25 %	385836881
85	NC_017496	ATGA	3	12	28129	28140	50 %	25 %	25 %	0 %	385836881
86	NC_017496	AGAC	2	8	28327	28334	50 %	0 %	25 %	25 %	385836882
87	NC_017496	ATCA	2	8	28477	28484	50 %	25 %	0 %	25 %	385836882
88	NC_017496	ATCC	2	8	29194	29201	25 %	25 %	0 %	50 %	385836883
89	NC_017496	GGTT	2	8	32041	32048	0 %	50 %	50 %	0 %	385836889
90	NC_017496	CATT	2	8	32176	32183	25 %	50 %	0 %	25 %	385836889
91	NC_017496	TCAA	2	8	32362	32369	50 %	25 %	0 %	25 %	385836890
92	NC_017496	GAAA	2	8	33079	33086	75 %	0 %	25 %	0 %	385836891
93	NC_017496	ATCA	2	8	35344	35351	50 %	25 %	0 %	25 %	385836895
94	NC_017496	GATT	2	8	35454	35461	25 %	50 %	25 %	0 %	385836895
95	NC_017496	GAAA	2	8	35533	35540	75 %	0 %	25 %	0 %	385836895
96	NC_017496	TAAA	2	8	37140	37147	75 %	25 %	0 %	0 %	385836896
97	NC_017496	TGAT	2	8	37341	37348	25 %	50 %	25 %	0 %	385836897
98	NC_017496	GAAA	2	8	37816	37823	75 %	0 %	25 %	0 %	385836898
99	NC_017496	AAAT	2	8	38460	38467	75 %	25 %	0 %	0 %	385836899
100	NC_017496	ATTT	2	8	38582	38589	25 %	75 %	0 %	0 %	385836899
101	NC_017496	ATCA	2	8	38633	38640	50 %	25 %	0 %	25 %	385836899
102	NC_017496	CAAA	2	8	38934	38941	75 %	0 %	0 %	25 %	385836899
103	NC_017496	GAAA	2	8	41715	41722	75 %	0 %	25 %	0 %	385836903
104	NC_017496	TTGC	2	8	42245	42252	0 %	50 %	25 %	25 %	385836904
105	NC_017496	AGAA	2	8	42447	42454	75 %	0 %	25 %	0 %	385836904
106	NC_017496	TTAT	2	8	43039	43046	25 %	75 %	0 %	0 %	385836906
107	NC_017496	ATTC	2	8	43220	43227	25 %	50 %	0 %	25 %	385836907
108	NC_017496	CAAA	2	8	43508	43515	75 %	0 %	0 %	25 %	385836908
109	NC_017496	CTAG	2	8	43825	43832	25 %	25 %	25 %	25 %	385836908
110	NC_017496	CTGA	2	8	43884	43891	25 %	25 %	25 %	25 %	385836908
111	NC_017496	AAAC	2	8	45555	45562	75 %	0 %	0 %	25 %	385836910
112	NC_017496	AGCA	2	8	45825	45832	50 %	0 %	25 %	25 %	385836910
113	NC_017496	TTTC	2	8	46124	46131	0 %	75 %	0 %	25 %	385836911
114	NC_017496	ATCA	2	8	46453	46460	50 %	25 %	0 %	25 %	385836912
115	NC_017496	ATCT	2	8	46539	46546	25 %	50 %	0 %	25 %	385836912
116	NC_017496	TAAA	2	8	46578	46585	75 %	25 %	0 %	0 %	385836912
117	NC_017496	TCAA	2	8	46626	46633	50 %	25 %	0 %	25 %	385836913
118	NC_017496	AGCG	2	8	46965	46972	25 %	0 %	50 %	25 %	385836913
119	NC_017496	CAAT	2	8	47119	47126	50 %	25 %	0 %	25 %	385836913
120	NC_017496	TTGA	2	8	47588	47595	25 %	50 %	25 %	0 %	385836914
121	NC_017496	CAAT	2	8	47712	47719	50 %	25 %	0 %	25 %	385836914
122	NC_017496	TGAA	2	8	47788	47795	50 %	25 %	25 %	0 %	385836914
123	NC_017496	ATCA	2	8	47990	47997	50 %	25 %	0 %	25 %	385836914
124	NC_017496	TTTA	2	8	48116	48123	25 %	75 %	0 %	0 %	385836915
125	NC_017496	TTCT	2	8	48254	48261	0 %	75 %	0 %	25 %	385836915
126	NC_017496	ACCA	2	8	48268	48275	50 %	0 %	0 %	50 %	385836915
127	NC_017496	TAAA	2	8	49478	49485	75 %	25 %	0 %	0 %	385836916
128	NC_017496	AATT	2	8	49671	49678	50 %	50 %	0 %	0 %	385836917
129	NC_017496	TACT	2	8	49685	49692	25 %	50 %	0 %	25 %	385836917
130	NC_017496	TTCA	2	8	49780	49787	25 %	50 %	0 %	25 %	385836917
131	NC_017496	TTTA	2	8	49862	49869	25 %	75 %	0 %	0 %	385836918
132	NC_017496	CATT	2	8	49883	49890	25 %	50 %	0 %	25 %	385836918
133	NC_017496	ATTT	2	8	49979	49986	25 %	75 %	0 %	0 %	385836918
134	NC_017496	ATCA	2	8	50733	50740	50 %	25 %	0 %	25 %	385836918
135	NC_017496	TAAA	2	8	51756	51763	75 %	25 %	0 %	0 %	385836919
136	NC_017496	TTTC	2	8	51851	51858	0 %	75 %	0 %	25 %	385836919
137	NC_017496	TGCT	2	8	52150	52157	0 %	50 %	25 %	25 %	385836919
138	NC_017496	GCTT	2	8	52163	52170	0 %	50 %	25 %	25 %	385836919
139	NC_017496	TAAT	2	8	52244	52251	50 %	50 %	0 %	0 %	385836919
140	NC_017496	TGTT	2	8	52252	52259	0 %	75 %	25 %	0 %	385836919
141	NC_017496	ACTT	2	8	52789	52796	25 %	50 %	0 %	25 %	385836920
142	NC_017496	CTTT	2	8	52959	52966	0 %	75 %	0 %	25 %	385836920

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.