MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA554

Total Repeats: 538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017496	AAG	2	6	99	104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836853
2	NC_017496	TAA	2	6	239	244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836854
3	NC_017496	AAT	2	6	260	265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836854
4	NC_017496	CAA	2	6	435	440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836854
5	NC_017496	GAA	2	6	471	476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836854
6	NC_017496	AGA	2	6	560	565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836854
7	NC_017496	AGG	2	6	601	606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385836854
8	NC_017496	ATC	3	9	944	952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836855
9	NC_017496	ATA	2	6	1016	1021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836855
10	NC_017496	ATC	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836855
11	NC_017496	TGT	2	6	1130	1135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836855
12	NC_017496	TGT	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836855
13	NC_017496	TAA	2	6	1429	1434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836855
14	NC_017496	TCA	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836855
15	NC_017496	AAT	2	6	1912	1917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836855
16	NC_017496	AAT	2	6	1955	1960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836855
17	NC_017496	ACA	2	6	2240	2245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836856
18	NC_017496	GTT	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836856
19	NC_017496	TCA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836856
20	NC_017496	GCT	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836856
21	NC_017496	AAT	2	6	2634	2639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836856
22	NC_017496	GTA	2	6	2668	2673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836856
23	NC_017496	TGA	2	6	2709	2714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836856
24	NC_017496	GTC	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836856
25	NC_017496	TTC	2	6	3178	3183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836856
26	NC_017496	CTT	2	6	3193	3198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836856
27	NC_017496	TGA	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836856
28	NC_017496	TAT	2	6	3495	3500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836856
29	NC_017496	AGC	2	6	3504	3509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836856
30	NC_017496	GCC	2	6	3541	3546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836856
31	NC_017496	ATT	2	6	3647	3652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836856
32	NC_017496	CTT	2	6	3660	3665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836856
33	NC_017496	TTC	2	6	3738	3743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836856
34	NC_017496	AAT	2	6	3784	3789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836856
35	NC_017496	ATC	2	6	3826	3831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836856
36	NC_017496	TAA	2	6	3887	3892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836856
37	NC_017496	TTG	2	6	3984	3989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836856
38	NC_017496	ACT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836857
39	NC_017496	TCA	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836857
40	NC_017496	TCA	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836857
41	NC_017496	TCA	2	6	4857	4862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836857
42	NC_017496	ATT	2	6	5040	5045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836858
43	NC_017496	ATT	2	6	5082	5087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836858
44	NC_017496	GAA	2	6	5116	5121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836858
45	NC_017496	ATA	2	6	5131	5136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836858
46	NC_017496	CAA	2	6	5179	5184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836858
47	NC_017496	ATC	2	6	5230	5235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836858
48	NC_017496	CTT	2	6	5252	5257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836858
49	NC_017496	ATT	2	6	5305	5310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836858
50	NC_017496	TGG	2	6	5490	5495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836859
51	NC_017496	ATT	2	6	5642	5647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836860
52	NC_017496	TTC	2	6	5651	5656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836860
53	NC_017496	TCT	2	6	5691	5696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836860
54	NC_017496	ATC	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836860
55	NC_017496	TCA	2	6	6021	6026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836861
56	NC_017496	TCA	2	6	6041	6046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836861
57	NC_017496	AAT	2	6	6087	6092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836861
58	NC_017496	CAT	2	6	6408	6413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836862
59	NC_017496	TGA	2	6	6481	6486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836862
60	NC_017496	ACG	2	6	6646	6651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836862
61	NC_017496	GAG	2	6	6661	6666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385836862
62	NC_017496	AAG	2	6	6689	6694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836862
63	NC_017496	AAG	2	6	6706	6711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836862
64	NC_017496	ATT	2	6	6749	6754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836862
65	NC_017496	AGC	2	6	6816	6821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836862
66	NC_017496	AGC	2	6	6858	6863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836862
67	NC_017496	TCA	2	6	6926	6931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836862
68	NC_017496	TGA	2	6	7071	7076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836863
69	NC_017496	GAC	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836863
70	NC_017496	ATC	2	6	7167	7172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836863
71	NC_017496	GAA	2	6	7331	7336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836863
72	NC_017496	CCA	2	6	7363	7368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836863
73	NC_017496	CAT	2	6	7433	7438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836863
74	NC_017496	AAT	2	6	7556	7561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836863
75	NC_017496	ATT	2	6	7644	7649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836863
76	NC_017496	AGT	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836863
77	NC_017496	TCA	2	6	7738	7743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836863
78	NC_017496	CTT	2	6	7814	7819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836863
79	NC_017496	CAT	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836863
80	NC_017496	AAC	2	6	7941	7946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836863
81	NC_017496	ATT	2	6	7953	7958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836863
82	NC_017496	CAG	2	6	7964	7969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836863
83	NC_017496	CAA	2	6	8051	8056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836863
84	NC_017496	TTG	2	6	8093	8098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836863
85	NC_017496	ACC	2	6	8217	8222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836863
86	NC_017496	CTT	2	6	8399	8404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836863
87	NC_017496	AAC	2	6	8504	8509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836863
88	NC_017496	GAT	2	6	8538	8543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836863
89	NC_017496	ACA	2	6	8646	8651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836863
90	NC_017496	GTA	2	6	8662	8667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836863
91	NC_017496	GAA	2	6	8735	8740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836863
92	NC_017496	CAA	2	6	8972	8977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836863
93	NC_017496	ACT	2	6	9034	9039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836863
94	NC_017496	TCT	2	6	9169	9174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836863
95	NC_017496	ATG	2	6	9654	9659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836864
96	NC_017496	CAT	3	9	9666	9674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836864
97	NC_017496	ATG	2	6	9684	9689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836864
98	NC_017496	ATA	2	6	9727	9732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836864
99	NC_017496	ATG	2	6	9765	9770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836864
100	NC_017496	GGA	2	6	9777	9782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385836864
101	NC_017496	ATG	2	6	9786	9791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836864
102	NC_017496	TCT	2	6	9931	9936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836864
103	NC_017496	ATG	3	9	9999	10007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836864
104	NC_017496	TGA	2	6	10331	10336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836864
105	NC_017496	TGG	2	6	10394	10399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836864
106	NC_017496	TGC	2	6	10553	10558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836864
107	NC_017496	TCT	2	6	10573	10578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836864
108	NC_017496	CTT	2	6	10623	10628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836864
109	NC_017496	TTG	2	6	10684	10689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836864
110	NC_017496	TTA	2	6	10725	10730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836864
111	NC_017496	TGA	2	6	10844	10849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836864
112	NC_017496	GCA	2	6	10872	10877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836864
113	NC_017496	GCT	2	6	10923	10928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836864
114	NC_017496	ATG	2	6	11056	11061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836864
115	NC_017496	AAC	2	6	11119	11124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836864
116	NC_017496	TTA	2	6	11182	11187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836864
117	NC_017496	TTA	2	6	11193	11198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836864
118	NC_017496	ATA	2	6	11233	11238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836864
119	NC_017496	GTC	2	6	11454	11459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836864
120	NC_017496	ATT	2	6	11562	11567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836864
121	NC_017496	GCA	2	6	11631	11636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836864
122	NC_017496	AGA	2	6	11704	11709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836864
123	NC_017496	CCG	2	6	12159	12164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836865
124	NC_017496	ATT	2	6	12244	12249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836865
125	NC_017496	GAA	2	6	12564	12569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836865
126	NC_017496	GAT	2	6	12708	12713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836865
127	NC_017496	AAT	2	6	12803	12808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836865
128	NC_017496	TAT	2	6	12889	12894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836866
129	NC_017496	GCT	2	6	12897	12902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836866
130	NC_017496	ATA	2	6	12929	12934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836866
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133	NC_017496	GTT	2	6	13228	13233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836866
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250	NC_017496	CTG	2	6	24047	24052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836877
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252	NC_017496	CGT	2	6	24324	24329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836878
253	NC_017496	GCT	2	6	24513	24518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836878
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