MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA554

Total Repeats: 895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017496	TAT	2	6	28033	28038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836881
502	NC_017496	TAA	2	6	28049	28054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836881
503	NC_017496	TCC	2	6	28086	28091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385836881
504	NC_017496	AGA	2	6	28118	28123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836881
505	NC_017496	ATGA	3	12	28129	28140	50 %	25 %	25 %	0 %	385836881
506	NC_017496	GAAAT	2	10	28216	28225	60 %	20 %	20 %	0 %	385836882
507	NC_017496	ACA	2	6	28251	28256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836882
508	NC_017496	AGAC	2	8	28327	28334	50 %	0 %	25 %	25 %	385836882
509	NC_017496	TCT	2	6	28364	28369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836882
510	NC_017496	A	6	6	28381	28386	100 %	0 %	0 %	0 %	385836882
511	NC_017496	CAA	2	6	28401	28406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836882
512	NC_017496	AG	3	6	28455	28460	50 %	0 %	50 %	0 %	385836882
513	NC_017496	ATCA	2	8	28477	28484	50 %	25 %	0 %	25 %	385836882
514	NC_017496	AAG	2	6	28558	28563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836882
515	NC_017496	A	6	6	28598	28603	100 %	0 %	0 %	0 %	385836882
516	NC_017496	A	7	7	28634	28640	100 %	0 %	0 %	0 %	385836882
517	NC_017496	CTT	2	6	28795	28800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836882
518	NC_017496	TTC	2	6	28870	28875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836883
519	NC_017496	CGT	2	6	28959	28964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836883
520	NC_017496	TA	3	6	29032	29037	50 %	50 %	0 %	0 %	385836883
521	NC_017496	AGC	2	6	29147	29152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836883
522	NC_017496	ATCC	2	8	29194	29201	25 %	25 %	0 %	50 %	385836883
523	NC_017496	TTTGAT	2	12	29237	29248	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385836883
524	NC_017496	TTTTTC	2	12	29289	29300	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385836883
525	NC_017496	GAT	2	6	29305	29310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836883
526	NC_017496	TG	3	6	29351	29356	0 %	50 %	50 %	0 %	385836883
527	NC_017496	ATA	2	6	29423	29428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836883
528	NC_017496	AAT	2	6	29441	29446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836883
529	NC_017496	T	8	8	29573	29580	0 %	100 %	0 %	0 %	385836884
530	NC_017496	CCA	2	6	29664	29669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836884
531	NC_017496	ACG	2	6	29694	29699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836884
532	NC_017496	CAA	2	6	29758	29763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836884
533	NC_017496	T	6	6	29769	29774	0 %	100 %	0 %	0 %	385836884
534	NC_017496	T	7	7	29782	29788	0 %	100 %	0 %	0 %	385836884
535	NC_017496	CAA	2	6	29973	29978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836885
536	NC_017496	TGC	2	6	29995	30000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836885
537	NC_017496	CTT	2	6	30009	30014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836885
538	NC_017496	AACGTG	2	12	30043	30054	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385836885
539	NC_017496	CA	3	6	30091	30096	50 %	0 %	0 %	50 %	385836885
540	NC_017496	TGA	2	6	30201	30206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836885
541	NC_017496	TCC	2	6	30236	30241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385836885
542	NC_017496	TAT	2	6	30303	30308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836885
543	NC_017496	CAT	2	6	30313	30318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836885
544	NC_017496	ACC	2	6	30331	30336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836885
545	NC_017496	ACG	2	6	30521	30526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836885
546	NC_017496	GAA	2	6	30620	30625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836886
547	NC_017496	T	6	6	30656	30661	0 %	100 %	0 %	0 %	385836886
548	NC_017496	TC	3	6	30682	30687	0 %	50 %	0 %	50 %	385836886
549	NC_017496	CTG	2	6	30735	30740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836886
550	NC_017496	CGT	2	6	30754	30759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836886
551	NC_017496	CAG	2	6	30764	30769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836886
552	NC_017496	T	6	6	30810	30815	0 %	100 %	0 %	0 %	385836886
553	NC_017496	ATT	2	6	30817	30822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836886
554	NC_017496	TAA	2	6	30851	30856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836887
555	NC_017496	AGA	2	6	30906	30911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836887
556	NC_017496	AAT	2	6	30929	30934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836887
557	NC_017496	TGC	2	6	30941	30946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836887
558	NC_017496	CAG	2	6	30965	30970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836887
559	NC_017496	T	9	9	31000	31008	0 %	100 %	0 %	0 %	385836887
560	NC_017496	GTT	2	6	31024	31029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836887
561	NC_017496	GTA	2	6	31097	31102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836887
562	NC_017496	T	9	9	31105	31113	0 %	100 %	0 %	0 %	385836887
563	NC_017496	ATCCA	2	10	31131	31140	40 %	20 %	0 %	40 %	385836887
564	NC_017496	TC	3	6	31173	31178	0 %	50 %	0 %	50 %	385836887
565	NC_017496	CTT	2	6	31246	31251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836887
566	NC_017496	T	7	7	31250	31256	0 %	100 %	0 %	0 %	385836887
567	NC_017496	TAA	2	6	31266	31271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836887
568	NC_017496	T	6	6	31337	31342	0 %	100 %	0 %	0 %	385836887
569	NC_017496	AT	3	6	31343	31348	50 %	50 %	0 %	0 %	385836887
570	NC_017496	A	6	6	31556	31561	100 %	0 %	0 %	0 %	385836888
571	NC_017496	ATA	2	6	31600	31605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836888
572	NC_017496	CAT	2	6	31624	31629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836888
573	NC_017496	T	6	6	31640	31645	0 %	100 %	0 %	0 %	385836888
574	NC_017496	CTT	2	6	31675	31680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836888
575	NC_017496	ATC	2	6	31715	31720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836888
576	NC_017496	ATC	2	6	31730	31735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836888
577	NC_017496	T	7	7	32006	32012	0 %	100 %	0 %	0 %	385836889
578	NC_017496	GGTT	2	8	32041	32048	0 %	50 %	50 %	0 %	385836889
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581	NC_017496	CATT	2	8	32176	32183	25 %	50 %	0 %	25 %	385836889
582	NC_017496	AAT	2	6	32215	32220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836889
583	NC_017496	T	6	6	32235	32240	0 %	100 %	0 %	0 %	385836889
584	NC_017496	GTT	2	6	32251	32256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836889
585	NC_017496	ATT	2	6	32258	32263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836889
586	NC_017496	TAA	2	6	32311	32316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836889
587	NC_017496	CCT	2	6	32322	32327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385836889
588	NC_017496	TCAA	2	8	32362	32369	50 %	25 %	0 %	25 %	385836890
589	NC_017496	ACC	2	6	32381	32386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836890
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592	NC_017496	TCC	2	6	32483	32488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385836890
593	NC_017496	CCT	2	6	32520	32525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385836890
594	NC_017496	ACA	2	6	32554	32559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836890
595	NC_017496	TAT	2	6	32635	32640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836890
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597	NC_017496	TGA	2	6	32803	32808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836891
598	NC_017496	TAC	2	6	32823	32828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836891
599	NC_017496	TAC	2	6	32897	32902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836891
600	NC_017496	TAT	2	6	32940	32945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836891
601	NC_017496	GAA	3	9	32951	32959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836891
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606	NC_017496	AT	3	6	33360	33365	50 %	50 %	0 %	0 %	385836891
607	NC_017496	GAA	2	6	33376	33381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836891
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609	NC_017496	ATT	2	6	34077	34082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836892
610	NC_017496	T	6	6	34120	34125	0 %	100 %	0 %	0 %	385836892
611	NC_017496	TGA	2	6	34170	34175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836892
612	NC_017496	A	6	6	34199	34204	100 %	0 %	0 %	0 %	385836892
613	NC_017496	CAA	2	6	34768	34773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836893
614	NC_017496	AT	3	6	34784	34789	50 %	50 %	0 %	0 %	385836893
615	NC_017496	T	8	8	34789	34796	0 %	100 %	0 %	0 %	385836893
616	NC_017496	TGA	2	6	34829	34834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836894
617	NC_017496	AAT	2	6	34841	34846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836894
618	NC_017496	TCA	3	9	34857	34865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836894
619	NC_017496	TAT	2	6	34877	34882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836894
620	NC_017496	TTA	2	6	35263	35268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836895
621	NC_017496	GAAAA	2	10	35277	35286	80 %	0 %	20 %	0 %	385836895
622	NC_017496	GAA	2	6	35294	35299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836895
623	NC_017496	ATCA	2	8	35344	35351	50 %	25 %	0 %	25 %	385836895
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625	NC_017496	TAC	2	6	35393	35398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836895
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627	NC_017496	AAC	2	6	35500	35505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836895
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