MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549

Total Repeats: 793

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017493	GTTA	2	8	30126	30133	25 %	50 %	25 %	0 %	385836954
502	NC_017493	CA	3	6	30204	30209	50 %	0 %	0 %	50 %	385836954
503	NC_017493	ATC	2	6	30250	30255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836954
504	NC_017493	GAAAAA	2	12	30260	30271	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385836954
505	NC_017493	ATCAAA	2	12	30312	30323	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385836954
506	NC_017493	GGAT	2	8	30359	30366	25 %	25 %	50 %	0 %	385836954
507	NC_017493	GCT	2	6	30408	30413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836954
508	NC_017493	TA	3	6	30523	30528	50 %	50 %	0 %	0 %	385836954
509	NC_017493	ACG	2	6	30596	30601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836954
510	NC_017493	GAA	2	6	30685	30690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836954
511	NC_017493	TTTTA	2	10	30827	30836	20 %	80 %	0 %	0 %	385836955
512	NC_017493	TTGT	2	8	30860	30867	0 %	75 %	25 %	0 %	385836955
513	NC_017493	TGC	2	6	30933	30938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836955
514	NC_017493	T	6	6	31011	31016	0 %	100 %	0 %	0 %	385836955
515	NC_017493	AAGT	2	8	31074	31081	50 %	25 %	25 %	0 %	385836955
516	NC_017493	ATA	2	6	31086	31091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836955
517	NC_017493	AGT	2	6	31286	31291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836955
518	NC_017493	CTT	2	6	31334	31339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836955
519	NC_017493	TAA	2	6	31390	31395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836955
520	NC_017493	AAAT	2	8	31425	31432	75 %	25 %	0 %	0 %	385836955
521	NC_017493	T	6	6	31550	31555	0 %	100 %	0 %	0 %	385836955
522	NC_017493	AT	3	6	31615	31620	50 %	50 %	0 %	0 %	385836955
523	NC_017493	GTC	2	6	31648	31653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836955
524	NC_017493	ATA	2	6	31654	31659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836955
525	NC_017493	CGA	2	6	31663	31668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836955
526	NC_017493	ATT	2	6	31689	31694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836955
527	NC_017493	T	7	7	31718	31724	0 %	100 %	0 %	0 %	385836955
528	NC_017493	ATG	2	6	31860	31865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836955
529	NC_017493	ATG	2	6	31878	31883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836955
530	NC_017493	TCAAA	2	10	31904	31913	60 %	20 %	0 %	20 %	385836955
531	NC_017493	AAT	2	6	31935	31940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836955
532	NC_017493	TCA	2	6	32002	32007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836955
533	NC_017493	CAC	2	6	32060	32065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836955
534	NC_017493	TTG	2	6	32071	32076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836955
535	NC_017493	ACC	2	6	32082	32087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836955
536	NC_017493	ATT	2	6	32208	32213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836955
537	NC_017493	CAA	2	6	32249	32254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836955
538	NC_017493	GCT	2	6	32311	32316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836955
539	NC_017493	ATA	2	6	32320	32325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836955
540	NC_017493	ATA	2	6	32329	32334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836955
541	NC_017493	ACTGCA	2	12	32395	32406	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385836955
542	NC_017493	TAA	2	6	32462	32467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836955
543	NC_017493	T	8	8	32470	32477	0 %	100 %	0 %	0 %	385836955
544	NC_017493	CAA	2	6	32480	32485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836955
545	NC_017493	TTC	2	6	32496	32501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836955
546	NC_017493	A	6	6	32810	32815	100 %	0 %	0 %	0 %	385836956
547	NC_017493	ATT	2	6	32822	32827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836956
548	NC_017493	TAC	2	6	32840	32845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836956
549	NC_017493	TAC	2	6	32914	32919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836956
550	NC_017493	GAA	3	9	32968	32976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836956
551	NC_017493	GAAA	2	8	33096	33103	75 %	0 %	25 %	0 %	385836956
552	NC_017493	AGC	2	6	33115	33120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836956
553	NC_017493	TA	3	6	33231	33236	50 %	50 %	0 %	0 %	385836956
554	NC_017493	ACG	2	6	33304	33309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836956
555	NC_017493	AT	3	6	33377	33382	50 %	50 %	0 %	0 %	385836956
556	NC_017493	GAA	2	6	33393	33398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836956
557	NC_017493	T	6	6	34394	34399	0 %	100 %	0 %	0 %	385836957
558	NC_017493	TTA	2	6	34412	34417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836957
559	NC_017493	ATCA	2	8	34476	34483	50 %	25 %	0 %	25 %	385836957
560	NC_017493	ATA	2	6	34538	34543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836957
561	NC_017493	CAA	2	6	34553	34558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836957
562	NC_017493	GCA	2	6	34564	34569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836957
563	NC_017493	CAA	2	6	34677	34682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836957
564	NC_017493	GACA	2	8	34869	34876	50 %	0 %	25 %	25 %	385836957
565	NC_017493	ATAA	2	8	34942	34949	75 %	25 %	0 %	0 %	385836957
566	NC_017493	T	7	7	35032	35038	0 %	100 %	0 %	0 %	385836957
567	NC_017493	AGT	2	6	35055	35060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836957
568	NC_017493	AGC	2	6	35104	35109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836957
569	NC_017493	ATA	2	6	35110	35115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836957
570	NC_017493	AAAAT	2	10	35118	35127	80 %	20 %	0 %	0 %	385836957
571	NC_017493	TGTT	2	8	35145	35152	0 %	75 %	25 %	0 %	385836957
572	NC_017493	TGC	2	6	35202	35207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836957
573	NC_017493	ATA	2	6	35221	35226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836957
574	NC_017493	TAA	2	6	35267	35272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836957
575	NC_017493	TTG	2	6	35273	35278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836957
576	NC_017493	GCC	2	6	35313	35318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836957
577	NC_017493	GA	3	6	35332	35337	50 %	0 %	50 %	0 %	385836957
578	NC_017493	AAAG	2	8	35399	35406	75 %	0 %	25 %	0 %	385836957
579	NC_017493	T	6	6	35438	35443	0 %	100 %	0 %	0 %	385836957
580	NC_017493	GGC	2	6	35463	35468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836957
581	NC_017493	AAG	2	6	35479	35484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836957
582	NC_017493	TTTTG	2	10	35533	35542	0 %	80 %	20 %	0 %	385836957
583	NC_017493	CAA	2	6	35615	35620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836957
584	NC_017493	TCC	2	6	35647	35652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385836957
585	NC_017493	TTC	2	6	35859	35864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836958
586	NC_017493	TA	3	6	35874	35879	50 %	50 %	0 %	0 %	385836958
587	NC_017493	CGT	2	6	35948	35953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836958
588	NC_017493	TA	3	6	36021	36026	50 %	50 %	0 %	0 %	385836958
589	NC_017493	GCT	2	6	36137	36142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836958
590	NC_017493	TTTC	2	8	36154	36161	0 %	75 %	0 %	25 %	385836958
591	NC_017493	TCT	2	6	36282	36287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836958
592	NC_017493	GTA	2	6	36338	36343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836958
593	NC_017493	ATTT	2	8	36352	36359	25 %	75 %	0 %	0 %	385836958
594	NC_017493	GTA	2	6	36412	36417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836958
595	NC_017493	AAT	2	6	36430	36435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836958
596	NC_017493	T	6	6	36442	36447	0 %	100 %	0 %	0 %	385836958
597	NC_017493	T	6	6	36521	36526	0 %	100 %	0 %	0 %	385836959
598	NC_017493	AAT	2	6	36697	36702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836959
599	NC_017493	CGG	2	6	36782	36787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836959
600	NC_017493	TAAA	2	8	36988	36995	75 %	25 %	0 %	0 %	385836959
601	NC_017493	TAT	2	6	37017	37022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836959
602	NC_017493	ACT	2	6	37145	37150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836960
603	NC_017493	TAA	2	6	37151	37156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836960
604	NC_017493	TTG	2	6	37158	37163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836960
605	NC_017493	AATGA	2	10	37185	37194	60 %	20 %	20 %	0 %	385836960
606	NC_017493	TCA	2	6	37214	37219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836960
607	NC_017493	AAGAAA	2	12	37240	37251	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385836960
608	NC_017493	TAT	2	6	37262	37267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836960
609	NC_017493	ATC	2	6	37323	37328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836960
610	NC_017493	ATGC	2	8	37443	37450	25 %	25 %	25 %	25 %	385836960
611	NC_017493	CAG	2	6	37552	37557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836960
612	NC_017493	TGG	2	6	37571	37576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836960
613	NC_017493	ATA	2	6	37618	37623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836960
614	NC_017493	TGA	2	6	37639	37644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836960
615	NC_017493	ATA	2	6	37675	37680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836960
616	NC_017493	ATG	2	6	37762	37767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836960
617	NC_017493	TAG	2	6	37771	37776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836960
618	NC_017493	AAG	2	6	37817	37822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836960
619	NC_017493	AGT	2	6	37901	37906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836960
620	NC_017493	GAT	2	6	37925	37930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836960
621	NC_017493	GAAA	2	8	37931	37938	75 %	0 %	25 %	0 %	385836960
622	NC_017493	TCAC	2	8	38062	38069	25 %	25 %	0 %	50 %	385836960
623	NC_017493	AAT	2	6	38112	38117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836960
624	NC_017493	CTTT	2	8	38185	38192	0 %	75 %	0 %	25 %	385836960
625	NC_017493	CGG	2	6	38216	38221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836960
626	NC_017493	CAT	2	6	38232	38237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836960
627	NC_017493	TTTA	2	8	38243	38250	25 %	75 %	0 %	0 %	385836960
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629	NC_017493	CTAT	2	8	38309	38316	25 %	50 %	0 %	25 %	385836960
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.