MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 chromosome

Total Repeats: 894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017492	TTGCTG	2	12	762	773	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385836970
2	NC_017492	TTGAAG	2	12	1971	1982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836971
3	NC_017492	TGAAAG	2	12	2274	2285	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385836971
4	NC_017492	ATGTTG	2	12	4758	4769	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385836972
5	NC_017492	TCAAAA	2	12	7347	7358	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385836973
6	NC_017492	AAAATG	2	12	7498	7509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385836973
7	NC_017492	AAAGAT	2	12	11574	11585	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385836976
8	NC_017492	TAAAAA	2	12	13042	13053	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385836978
9	NC_017492	TTGACA	2	12	16885	16896	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385836980
10	NC_017492	AAATCA	2	12	20258	20269	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385836985
11	NC_017492	GCGTGA	2	12	24231	24242	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385836988
12	NC_017492	ATCTTC	2	12	24392	24403	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385836988
13	NC_017492	TGTTTG	2	12	39796	39807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385837004
14	NC_017492	TCAGAG	2	12	41613	41624	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385837005
15	NC_017492	AAGGAA	2	12	41672	41683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385837005
16	NC_017492	TTCACC	2	12	46333	46344	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385837009
17	NC_017492	CTTCAA	2	12	50593	50604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385837012
18	NC_017492	TATAAA	2	12	51493	51504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385837013
19	NC_017492	TTTATA	2	12	53426	53437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385837016
20	NC_017492	AAGTTC	2	12	53770	53781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385837017
21	NC_017492	GGTCAG	2	12	57290	57301	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385837022
22	NC_017492	TTGCTT	2	12	59244	59255	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385837025
23	NC_017492	TTGTTT	2	12	59553	59564	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385837025
24	NC_017492	TCCAAG	2	12	62820	62831	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385837028
25	NC_017492	ACAAGA	2	12	64988	64999	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385837029
26	NC_017492	TAGGCT	2	12	65117	65128	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385837030
27	NC_017492	AAGTTC	2	12	75790	75801	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385837041
28	NC_017492	TTAGTT	2	12	78508	78519	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385837044
29	NC_017492	CCTAAA	2	12	88305	88316	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385837053
30	NC_017492	CAAAAA	2	12	89170	89181	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385837054
31	NC_017492	TATAGG	2	12	91169	91180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385837056
32	NC_017492	ATTACT	2	12	97046	97057	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385837062
33	NC_017492	AGATGA	2	12	102657	102668	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385837068
34	NC_017492	AAAAAG	2	12	105808	105819	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385837072
35	NC_017492	TAAGTG	2	12	106392	106403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385837072
36	NC_017492	ATCAAT	2	12	108423	108434	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385837075
37	NC_017492	AATATA	2	12	108609	108620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385837075
38	NC_017492	TTAAAT	2	12	108686	108697	50 %	50 %	0 %	0 %	385837075
39	NC_017492	TTTATA	2	12	111667	111678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385837078
40	NC_017492	AAGTTC	2	12	112011	112022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385837079
41	NC_017492	AATAAA	2	12	116862	116873	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385837085
42	NC_017492	ATTTGC	2	12	120390	120401	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385837090
43	NC_017492	AAGCAA	2	12	120494	120505	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385837090
44	NC_017492	ATCAAA	2	12	123630	123641	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385837094
45	NC_017492	TTTTCG	2	12	124619	124630	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385837095
46	NC_017492	AAAACC	2	12	126267	126278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385837097
47	NC_017492	TGGACG	2	12	126758	126769	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385837097
48	NC_017492	TGGGAC	2	12	128973	128984	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385837101
49	NC_017492	CAGTTG	2	12	129835	129846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385837102
50	NC_017492	AGCTGA	2	12	133230	133241	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385837104
51	NC_017492	TTTATC	2	12	136020	136031	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385837108
52	NC_017492	TGAACT	2	12	141372	141383	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385837115
53	NC_017492	TATGGG	2	12	146750	146761	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385837118
54	NC_017492	TTCATA	2	12	163120	163131	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385837136
55	NC_017492	ATTGCT	2	12	165148	165159	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385837138
56	NC_017492	TGCAGC	2	12	165231	165242	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385837138
57	NC_017492	TCATAA	2	12	168626	168637	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385837144
58	NC_017492	CAAAAG	2	12	169162	169173	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385837145
59	NC_017492	GTTTAA	2	12	169853	169864	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385837146
60	NC_017492	ATTAAT	2	12	176870	176881	50 %	50 %	0 %	0 %	385837154
61	NC_017492	TATAAT	2	12	177305	177316	50 %	50 %	0 %	0 %	385837154
62	NC_017492	GTGACT	2	12	182925	182936	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385837155
63	NC_017492	TAACTT	2	12	183296	183307	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385837155
64	NC_017492	ACCTGG	2	12	184250	184261	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385837157
65	NC_017492	TTTTTC	2	12	193338	193349	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385837169
66	NC_017492	ATAATT	2	12	194166	194177	50 %	50 %	0 %	0 %	385837170
67	NC_017492	TTGCTT	2	12	200517	200528	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385837178
68	NC_017492	GCTTAT	2	12	201890	201901	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385837179
69	NC_017492	GTAAAG	2	12	205799	205810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385837181
70	NC_017492	GAATAC	2	12	208616	208627	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385837187
71	NC_017492	ATGAAA	2	12	208744	208755	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385837187
72	NC_017492	TTTGAA	2	12	209067	209078	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385837187
73	NC_017492	TTCAGC	2	12	213389	213400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385837192
74	NC_017492	ATTGGG	2	12	214390	214401	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385837192
75	NC_017492	AAATAG	2	12	216724	216735	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385837194
76	NC_017492	AATCGA	2	12	217179	217190	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385837195
77	NC_017492	TACCAT	2	12	221076	221087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385837199
78	NC_017492	ATGTTT	2	12	221127	221138	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385837199
79	NC_017492	CGAAGT	2	12	224380	224391	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385837202
80	NC_017492	AGAAGT	2	12	226321	226332	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385837204
81	NC_017492	TTGGAA	2	12	228746	228757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385837207
82	NC_017492	GAAGGT	2	12	231743	231754	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385837212
83	NC_017492	GAAAAC	2	12	232286	232297	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385837212
84	NC_017492	TAAAAG	2	12	235631	235642	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385837215
85	NC_017492	CTGAAT	2	12	238363	238374	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385837216
86	NC_017492	AGCAAA	2	12	238733	238744	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385837216
87	NC_017492	AAAAGC	2	12	238775	238786	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385837216
88	NC_017492	ATTTTT	2	12	240511	240522	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385837218
89	NC_017492	TAAAAA	2	12	241127	241138	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385837218
90	NC_017492	AAATTA	2	12	243040	243051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385837220
91	NC_017492	TCAAAG	2	12	247849	247860	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385837225
92	NC_017492	TCTTTT	2	12	251776	251787	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385837230
93	NC_017492	TGTTAT	2	12	253207	253218	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385837232
94	NC_017492	TATTAA	2	12	254220	254231	50 %	50 %	0 %	0 %	385837233
95	NC_017492	ACAGCA	2	12	256281	256292	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385837234
96	NC_017492	TGATGG	2	12	256316	256327	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385837234
97	NC_017492	TAAAAA	2	12	258982	258993	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385837235
98	NC_017492	CTTGTT	2	12	260416	260427	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385837237
99	NC_017492	TGAAAA	2	12	262592	262603	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385837239
100	NC_017492	GAGTTA	2	12	265517	265528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385837241
101	NC_017492	TGAAGA	2	12	266979	266990	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385837244
102	NC_017492	CTGACC	2	12	271378	271389	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385837250
103	NC_017492	GATGAC	2	12	271623	271634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385837250
104	NC_017492	ACGTAA	2	12	277012	277023	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385837257
105	NC_017492	ACGTAA	2	12	277036	277047	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385837257
106	NC_017492	TAAAAA	2	12	277987	277998	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385837259
107	NC_017492	TGGAAT	2	12	280068	280079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385837261
108	NC_017492	AAGCTC	2	12	287228	287239	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385837271
109	NC_017492	TGATTG	2	12	290080	290091	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385837272
110	NC_017492	GTCATT	2	12	292186	292197	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385837274
111	NC_017492	AAGGCC	2	12	297387	297398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385837278
112	NC_017492	TAACGA	2	12	298743	298754	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385837279
113	NC_017492	TGGCAT	2	12	299653	299664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385837281
114	NC_017492	TTTGAT	2	12	301292	301303	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385837283
115	NC_017492	CTTAAC	2	12	303475	303486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385837287
116	NC_017492	GAAAAA	2	12	304678	304689	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385837288
117	NC_017492	ATCAAA	2	12	304730	304741	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385837288
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232	NC_017492	GATGAA	2	12	607785	607796	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385837598
233	NC_017492	GTATCG	2	12	609633	609644	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385837599
234	NC_017492	ACTCGT	2	12	610985	610996	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385837599
235	NC_017492	TCAGGT	2	12	612035	612046	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385837600
236	NC_017492	CGGAAA	2	12	615347	615358	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385837604
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340	NC_017492	AGTTGA	2	12	897496	897507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385837908
341	NC_017492	CTTGAA	2	12	904124	904135	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385837916
342	NC_017492	AGAAAA	2	12	905808	905819	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385837918
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345	NC_017492	GAATTA	2	12	909774	909785	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385837924
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452	NC_017492	TGAAAA	2	12	1185236	1185247	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385838246
453	NC_017492	ATTGAT	2	12	1188361	1188372	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385838251
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