MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56B

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017487	A	6	6	395	400	100 %	0 %	0 %	0 %	385831932
2	NC_017487	T	6	6	600	605	0 %	100 %	0 %	0 %	385831932
3	NC_017487	T	6	6	671	676	0 %	100 %	0 %	0 %	385831932
4	NC_017487	A	8	8	688	695	100 %	0 %	0 %	0 %	385831932
5	NC_017487	A	7	7	1058	1064	100 %	0 %	0 %	0 %	385831932
6	NC_017487	A	6	6	1161	1166	100 %	0 %	0 %	0 %	385831932
7	NC_017487	A	6	6	1482	1487	100 %	0 %	0 %	0 %	385831932
8	NC_017487	A	6	6	1602	1607	100 %	0 %	0 %	0 %	385831933
9	NC_017487	A	7	7	1609	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	385831933
10	NC_017487	A	7	7	1648	1654	100 %	0 %	0 %	0 %	385831933
11	NC_017487	T	7	7	1705	1711	0 %	100 %	0 %	0 %	385831933
12	NC_017487	A	6	6	1727	1732	100 %	0 %	0 %	0 %	385831933
13	NC_017487	A	8	8	1845	1852	100 %	0 %	0 %	0 %	385831933
14	NC_017487	A	6	6	1901	1906	100 %	0 %	0 %	0 %	385831933
15	NC_017487	A	6	6	2096	2101	100 %	0 %	0 %	0 %	385831933
16	NC_017487	T	6	6	2357	2362	0 %	100 %	0 %	0 %	385831934
17	NC_017487	A	6	6	2427	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	385831934
18	NC_017487	A	6	6	2583	2588	100 %	0 %	0 %	0 %	385831934
19	NC_017487	T	6	6	2652	2657	0 %	100 %	0 %	0 %	385831934
20	NC_017487	A	7	7	2896	2902	100 %	0 %	0 %	0 %	385831934
21	NC_017487	A	6	6	3245	3250	100 %	0 %	0 %	0 %	385831934
22	NC_017487	A	6	6	3754	3759	100 %	0 %	0 %	0 %	385831934
23	NC_017487	A	7	7	3997	4003	100 %	0 %	0 %	0 %	385831934
24	NC_017487	A	6	6	4422	4427	100 %	0 %	0 %	0 %	385831934
25	NC_017487	A	6	6	5774	5779	100 %	0 %	0 %	0 %	385831935
26	NC_017487	T	6	6	6368	6373	0 %	100 %	0 %	0 %	385831935
27	NC_017487	A	7	7	6468	6474	100 %	0 %	0 %	0 %	385831935
28	NC_017487	A	7	7	6804	6810	100 %	0 %	0 %	0 %	385831935
29	NC_017487	T	6	6	6936	6941	0 %	100 %	0 %	0 %	385831936
30	NC_017487	A	6	6	7356	7361	100 %	0 %	0 %	0 %	385831936
31	NC_017487	A	6	6	7372	7377	100 %	0 %	0 %	0 %	385831936
32	NC_017487	A	6	6	7480	7485	100 %	0 %	0 %	0 %	385831936
33	NC_017487	T	6	6	7536	7541	0 %	100 %	0 %	0 %	385831936
34	NC_017487	A	6	6	7879	7884	100 %	0 %	0 %	0 %	385831936
35	NC_017487	A	6	6	7959	7964	100 %	0 %	0 %	0 %	385831936
36	NC_017487	A	6	6	8200	8205	100 %	0 %	0 %	0 %	385831937
37	NC_017487	A	6	6	8379	8384	100 %	0 %	0 %	0 %	385831937
38	NC_017487	A	6	6	8634	8639	100 %	0 %	0 %	0 %	385831937
39	NC_017487	A	8	8	8774	8781	100 %	0 %	0 %	0 %	385831937
40	NC_017487	A	6	6	8817	8822	100 %	0 %	0 %	0 %	385831937
41	NC_017487	A	6	6	10113	10118	100 %	0 %	0 %	0 %	385831938
42	NC_017487	T	6	6	10319	10324	0 %	100 %	0 %	0 %	385831939
43	NC_017487	A	7	7	10349	10355	100 %	0 %	0 %	0 %	385831939
44	NC_017487	A	6	6	10518	10523	100 %	0 %	0 %	0 %	385831939
45	NC_017487	A	7	7	10665	10671	100 %	0 %	0 %	0 %	385831940
46	NC_017487	T	8	8	10775	10782	0 %	100 %	0 %	0 %	385831940
47	NC_017487	A	7	7	10815	10821	100 %	0 %	0 %	0 %	385831940
48	NC_017487	A	6	6	10918	10923	100 %	0 %	0 %	0 %	385831940
49	NC_017487	T	7	7	11854	11860	0 %	100 %	0 %	0 %	385831941
50	NC_017487	A	6	6	14574	14579	100 %	0 %	0 %	0 %	385831942
51	NC_017487	A	7	7	14979	14985	100 %	0 %	0 %	0 %	385831942
52	NC_017487	A	6	6	15618	15623	100 %	0 %	0 %	0 %	385831942
53	NC_017487	A	6	6	17646	17651	100 %	0 %	0 %	0 %	385831944
54	NC_017487	T	6	6	18909	18914	0 %	100 %	0 %	0 %	385831945
55	NC_017487	A	8	8	19246	19253	100 %	0 %	0 %	0 %	385831946
56	NC_017487	A	7	7	19999	20005	100 %	0 %	0 %	0 %	385831946
57	NC_017487	A	6	6	20168	20173	100 %	0 %	0 %	0 %	385831946
58	NC_017487	A	6	6	20707	20712	100 %	0 %	0 %	0 %	385831946
59	NC_017487	A	6	6	21229	21234	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
60	NC_017487	A	6	6	21243	21248	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
61	NC_017487	A	8	8	21316	21323	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
62	NC_017487	A	8	8	21331	21338	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
63	NC_017487	A	7	7	21340	21346	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
64	NC_017487	T	6	6	21357	21362	0 %	100 %	0 %	0 %	385831947
65	NC_017487	A	6	6	21444	21449	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
66	NC_017487	A	6	6	21537	21542	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
67	NC_017487	A	6	6	21622	21627	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
68	NC_017487	A	6	6	21711	21716	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
69	NC_017487	T	6	6	21829	21834	0 %	100 %	0 %	0 %	385831948
70	NC_017487	T	7	7	21883	21889	0 %	100 %	0 %	0 %	385831948
71	NC_017487	T	8	8	21921	21928	0 %	100 %	0 %	0 %	385831948
72	NC_017487	A	6	6	21933	21938	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
73	NC_017487	T	7	7	22145	22151	0 %	100 %	0 %	0 %	385831948
74	NC_017487	T	8	8	22320	22327	0 %	100 %	0 %	0 %	385831948
75	NC_017487	T	6	6	22400	22405	0 %	100 %	0 %	0 %	385831948
76	NC_017487	A	6	6	22555	22560	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
77	NC_017487	A	8	8	22562	22569	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
78	NC_017487	A	6	6	22651	22656	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
79	NC_017487	A	7	7	22768	22774	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
80	NC_017487	A	6	6	22826	22831	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
81	NC_017487	A	6	6	23094	23099	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
82	NC_017487	A	6	6	23103	23108	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
83	NC_017487	A	7	7	24154	24160	100 %	0 %	0 %	0 %	385831949
84	NC_017487	T	6	6	24208	24213	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
85	NC_017487	T	7	7	24353	24359	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
86	NC_017487	T	6	6	24627	24632	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
87	NC_017487	T	6	6	25038	25043	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
88	NC_017487	T	7	7	25069	25075	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
89	NC_017487	T	6	6	25077	25082	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
90	NC_017487	T	7	7	25748	25754	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
91	NC_017487	T	6	6	26088	26093	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
92	NC_017487	T	7	7	26162	26168	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
93	NC_017487	T	6	6	27229	27234	0 %	100 %	0 %	0 %	385831950
94	NC_017487	T	6	6	27411	27416	0 %	100 %	0 %	0 %	385831951
95	NC_017487	T	6	6	27498	27503	0 %	100 %	0 %	0 %	385831951
96	NC_017487	A	6	6	27572	27577	100 %	0 %	0 %	0 %	385831951
97	NC_017487	T	7	7	27999	28005	0 %	100 %	0 %	0 %	385831952
98	NC_017487	T	6	6	29108	29113	0 %	100 %	0 %	0 %	385831953
99	NC_017487	T	6	6	29397	29402	0 %	100 %	0 %	0 %	385831954
100	NC_017487	A	7	7	29517	29523	100 %	0 %	0 %	0 %	385831954
101	NC_017487	A	7	7	30087	30093	100 %	0 %	0 %	0 %	385831954
102	NC_017487	C	6	6	30329	30334	0 %	0 %	0 %	100 %	385831954
103	NC_017487	T	6	6	30594	30599	0 %	100 %	0 %	0 %	385831954
104	NC_017487	A	6	6	33242	33247	100 %	0 %	0 %	0 %	385831956
105	NC_017487	A	7	7	33268	33274	100 %	0 %	0 %	0 %	385831956
106	NC_017487	A	6	6	33548	33553	100 %	0 %	0 %	0 %	385831957
107	NC_017487	A	6	6	33861	33866	100 %	0 %	0 %	0 %	385831957
108	NC_017487	A	6	6	34825	34830	100 %	0 %	0 %	0 %	385831958
109	NC_017487	A	6	6	34849	34854	100 %	0 %	0 %	0 %	385831958
110	NC_017487	A	6	6	34959	34964	100 %	0 %	0 %	0 %	385831958
111	NC_017487	A	7	7	35306	35312	100 %	0 %	0 %	0 %	385831958
112	NC_017487	A	7	7	35401	35407	100 %	0 %	0 %	0 %	385831959
113	NC_017487	T	7	7	35573	35579	0 %	100 %	0 %	0 %	385831959

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.