MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 5728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017486	TGTC	2	8	467	474	0 %	50 %	25 %	25 %	385829590
2	NC_017486	CTTG	2	8	495	502	0 %	50 %	25 %	25 %	385829590
3	NC_017486	AATC	2	8	643	650	50 %	25 %	0 %	25 %	385829590
4	NC_017486	TATT	2	8	818	825	25 %	75 %	0 %	0 %	385829590
5	NC_017486	ATGC	2	8	859	866	25 %	25 %	25 %	25 %	385829590
6	NC_017486	TGAC	2	8	884	891	25 %	25 %	25 %	25 %	385829590
7	NC_017486	GATT	2	8	1299	1306	25 %	50 %	25 %	0 %	385829590
8	NC_017486	TCAA	2	8	2038	2045	50 %	25 %	0 %	25 %	385829591
9	NC_017486	ATCA	2	8	2499	2506	50 %	25 %	0 %	25 %	385829591
10	NC_017486	TTGA	2	8	2611	2618	25 %	50 %	25 %	0 %	385829591
11	NC_017486	TGAT	2	8	2888	2895	25 %	50 %	25 %	0 %	385829591
12	NC_017486	GTAC	2	8	3010	3017	25 %	25 %	25 %	25 %	385829591
13	NC_017486	AATT	2	8	3019	3026	50 %	50 %	0 %	0 %	385829591
14	NC_017486	GAAA	2	8	3258	3265	75 %	0 %	25 %	0 %	385829592
15	NC_017486	AAAT	2	8	3986	3993	75 %	25 %	0 %	0 %	385829592
16	NC_017486	GAAA	2	8	4152	4159	75 %	0 %	25 %	0 %	385829592
17	NC_017486	AATC	2	8	4917	4924	50 %	25 %	0 %	25 %	385829592
18	NC_017486	CTTT	2	8	4996	5003	0 %	75 %	0 %	25 %	385829592
19	NC_017486	AGAC	2	8	5677	5684	50 %	0 %	25 %	25 %	385829592
20	NC_017486	TTTA	2	8	5981	5988	25 %	75 %	0 %	0 %	385829592
21	NC_017486	ATCA	2	8	6022	6029	50 %	25 %	0 %	25 %	385829592
22	NC_017486	TGAA	2	8	6182	6189	50 %	25 %	25 %	0 %	385829592
23	NC_017486	ATGA	2	8	6346	6353	50 %	25 %	25 %	0 %	385829592
24	NC_017486	TATC	2	8	6866	6873	25 %	50 %	0 %	25 %	385829593
25	NC_017486	TTGA	2	8	7421	7428	25 %	50 %	25 %	0 %	385829593
26	NC_017486	TGAT	2	8	7623	7630	25 %	50 %	25 %	0 %	385829593
27	NC_017486	TGGT	2	8	7701	7708	0 %	50 %	50 %	0 %	385829593
28	NC_017486	CAAT	2	8	7718	7725	50 %	25 %	0 %	25 %	385829593
29	NC_017486	GATG	2	8	7879	7886	25 %	25 %	50 %	0 %	385829593
30	NC_017486	TTGA	2	8	8087	8094	25 %	50 %	25 %	0 %	385829593
31	NC_017486	GTTC	2	8	8129	8136	0 %	50 %	25 %	25 %	385829593
32	NC_017486	TCCT	2	8	8437	8444	0 %	50 %	0 %	50 %	385829593
33	NC_017486	ATTT	2	8	9600	9607	25 %	75 %	0 %	0 %	385829593
34	NC_017486	TTTG	2	8	9685	9692	0 %	75 %	25 %	0 %	385829593
35	NC_017486	TTTC	2	8	10625	10632	0 %	75 %	0 %	25 %	385829595
36	NC_017486	CAAT	2	8	10696	10703	50 %	25 %	0 %	25 %	385829595
37	NC_017486	AAAT	2	8	11379	11386	75 %	25 %	0 %	0 %	385829596
38	NC_017486	AATT	2	8	11522	11529	50 %	50 %	0 %	0 %	385829596
39	NC_017486	ACTT	2	8	11983	11990	25 %	50 %	0 %	25 %	385829596
40	NC_017486	TCAG	2	8	12392	12399	25 %	25 %	25 %	25 %	385829597
41	NC_017486	TCAA	2	8	12432	12439	50 %	25 %	0 %	25 %	385829597
42	NC_017486	CTTA	2	8	12489	12496	25 %	50 %	0 %	25 %	385829597
43	NC_017486	AAAT	2	8	13123	13130	75 %	25 %	0 %	0 %	385829598
44	NC_017486	TGGT	2	8	13247	13254	0 %	50 %	50 %	0 %	385829598
45	NC_017486	TATT	2	8	13315	13322	25 %	75 %	0 %	0 %	385829599
46	NC_017486	CTTC	2	8	13419	13426	0 %	50 %	0 %	50 %	385829599
47	NC_017486	TTTA	2	8	13865	13872	25 %	75 %	0 %	0 %	385829599
48	NC_017486	TTTG	2	8	13908	13915	0 %	75 %	25 %	0 %	385829599
49	NC_017486	TCAT	2	8	14370	14377	25 %	50 %	0 %	25 %	385829599
50	NC_017486	ATTT	2	8	14380	14387	25 %	75 %	0 %	0 %	385829599
51	NC_017486	AAAT	2	8	14530	14537	75 %	25 %	0 %	0 %	385829599
52	NC_017486	TTTC	2	8	15067	15074	0 %	75 %	0 %	25 %	385829599
53	NC_017486	ATTT	2	8	15183	15190	25 %	75 %	0 %	0 %	385829599
54	NC_017486	GGAA	2	8	15348	15355	50 %	0 %	50 %	0 %	385829600
55	NC_017486	AAAG	2	8	15733	15740	75 %	0 %	25 %	0 %	385829600
56	NC_017486	GAAA	2	8	15870	15877	75 %	0 %	25 %	0 %	385829600
57	NC_017486	GAAA	2	8	16217	16224	75 %	0 %	25 %	0 %	385829601
58	NC_017486	ATGA	2	8	16789	16796	50 %	25 %	25 %	0 %	385829602
59	NC_017486	CATG	2	8	16860	16867	25 %	25 %	25 %	25 %	385829602
60	NC_017486	GCGT	2	8	16892	16899	0 %	25 %	50 %	25 %	385829602
61	NC_017486	TGAT	2	8	18461	18468	25 %	50 %	25 %	0 %	385829603
62	NC_017486	TCAA	2	8	19003	19010	50 %	25 %	0 %	25 %	385829603
63	NC_017486	AAAC	2	8	19556	19563	75 %	0 %	0 %	25 %	385829603
64	NC_017486	ATGT	2	8	21033	21040	25 %	50 %	25 %	0 %	385829604
65	NC_017486	GGGA	2	8	21095	21102	25 %	0 %	75 %	0 %	385829604
66	NC_017486	AAAT	2	8	23545	23552	75 %	25 %	0 %	0 %	385829608
67	NC_017486	GGTA	2	8	23606	23613	25 %	25 %	50 %	0 %	385829608
68	NC_017486	CAAT	2	8	24488	24495	50 %	25 %	0 %	25 %	385829609
69	NC_017486	TAAT	2	8	24534	24541	50 %	50 %	0 %	0 %	385829609
70	NC_017486	CAAA	2	8	24602	24609	75 %	0 %	0 %	25 %	385829609
71	NC_017486	AAGT	2	8	24663	24670	50 %	25 %	25 %	0 %	385829609
72	NC_017486	ATTG	2	8	25299	25306	25 %	50 %	25 %	0 %	385829610
73	NC_017486	AATC	2	8	25987	25994	50 %	25 %	0 %	25 %	385829611
74	NC_017486	TTGC	2	8	26599	26606	0 %	50 %	25 %	25 %	385829611
75	NC_017486	ATGG	2	8	26845	26852	25 %	25 %	50 %	0 %	385829611
76	NC_017486	AAAC	2	8	27012	27019	75 %	0 %	0 %	25 %	385829611
77	NC_017486	TGAA	2	8	27098	27105	50 %	25 %	25 %	0 %	385829611
78	NC_017486	AAGA	2	8	27196	27203	75 %	0 %	25 %	0 %	385829611
79	NC_017486	TCAA	2	8	27210	27217	50 %	25 %	0 %	25 %	385829611
80	NC_017486	TGCT	2	8	27341	27348	0 %	50 %	25 %	25 %	385829611
81	NC_017486	CAAC	2	8	27370	27377	50 %	0 %	0 %	50 %	385829611
82	NC_017486	TATT	2	8	27569	27576	25 %	75 %	0 %	0 %	385829611
83	NC_017486	TGAT	2	8	27626	27633	25 %	50 %	25 %	0 %	385829611
84	NC_017486	TGCT	2	8	29201	29208	0 %	50 %	25 %	25 %	385829612
85	NC_017486	TGGT	2	8	29273	29280	0 %	50 %	50 %	0 %	385829612
86	NC_017486	TGGT	2	8	29519	29526	0 %	50 %	50 %	0 %	385829612
87	NC_017486	CAAT	2	8	29648	29655	50 %	25 %	0 %	25 %	385829612
88	NC_017486	TGAT	2	8	30110	30117	25 %	50 %	25 %	0 %	385829612
89	NC_017486	ATTA	2	8	30804	30811	50 %	50 %	0 %	0 %	385829612
90	NC_017486	ATCA	2	8	31110	31117	50 %	25 %	0 %	25 %	385829613
91	NC_017486	AGCA	2	8	31382	31389	50 %	0 %	25 %	25 %	385829613
92	NC_017486	TAAA	2	8	31447	31454	75 %	25 %	0 %	0 %	385829613
93	NC_017486	TGAC	2	8	31504	31511	25 %	25 %	25 %	25 %	385829613
94	NC_017486	AAGC	2	8	31608	31615	50 %	0 %	25 %	25 %	385829613
95	NC_017486	ATAA	2	8	31923	31930	75 %	25 %	0 %	0 %	385829613
96	NC_017486	AAGA	2	8	32129	32136	75 %	0 %	25 %	0 %	385829613
97	NC_017486	AAGA	2	8	32509	32516	75 %	0 %	25 %	0 %	385829613
98	NC_017486	TTCA	2	8	32572	32579	25 %	50 %	0 %	25 %	385829613
99	NC_017486	GTTG	2	8	32981	32988	0 %	50 %	50 %	0 %	385829614
100	NC_017486	ATTA	2	8	33328	33335	50 %	50 %	0 %	0 %	385829614
101	NC_017486	AAAT	2	8	33568	33575	75 %	25 %	0 %	0 %	385829615
102	NC_017486	AGTG	2	8	34010	34017	25 %	25 %	50 %	0 %	385829615
103	NC_017486	TTAA	2	8	34286	34293	50 %	50 %	0 %	0 %	385829615
104	NC_017486	GTTT	2	8	37032	37039	0 %	75 %	25 %	0 %	385829617
105	NC_017486	TGAT	2	8	37185	37192	25 %	50 %	25 %	0 %	385829617
106	NC_017486	CGGT	2	8	37918	37925	0 %	25 %	50 %	25 %	385829618
107	NC_017486	CAGC	2	8	38600	38607	25 %	0 %	25 %	50 %	385829618
108	NC_017486	GTTT	2	8	38876	38883	0 %	75 %	25 %	0 %	385829618
109	NC_017486	CCAG	2	8	39133	39140	25 %	0 %	25 %	50 %	385829618
110	NC_017486	TGTC	2	8	40999	41006	0 %	50 %	25 %	25 %	385829622
111	NC_017486	TCCC	2	8	41889	41896	0 %	25 %	0 %	75 %	385829623
112	NC_017486	TTTA	2	8	41913	41920	25 %	75 %	0 %	0 %	385829623
113	NC_017486	CTGT	2	8	41977	41984	0 %	50 %	25 %	25 %	385829623
114	NC_017486	TTTC	2	8	41985	41992	0 %	75 %	0 %	25 %	385829623
115	NC_017486	CGTG	2	8	42038	42045	0 %	25 %	50 %	25 %	385829623
116	NC_017486	CTTT	2	8	42748	42755	0 %	75 %	0 %	25 %	385829625
117	NC_017486	TCTT	2	8	43349	43356	0 %	75 %	0 %	25 %	385829626
118	NC_017486	GATA	2	8	44174	44181	50 %	25 %	25 %	0 %	385829628
119	NC_017486	GCGT	2	8	44588	44595	0 %	25 %	50 %	25 %	385829628
120	NC_017486	TTAG	2	8	45519	45526	25 %	50 %	25 %	0 %	385829630
121	NC_017486	AAGC	2	8	46537	46544	50 %	0 %	25 %	25 %	385829632
122	NC_017486	TCTT	2	8	46560	46567	0 %	75 %	0 %	25 %	385829632
123	NC_017486	GTGA	2	8	48195	48202	25 %	25 %	50 %	0 %	385829634
124	NC_017486	AAAG	2	8	49091	49098	75 %	0 %	25 %	0 %	385829635
125	NC_017486	TGTC	2	8	49279	49286	0 %	50 %	25 %	25 %	385829635
126	NC_017486	AAAT	2	8	50244	50251	75 %	25 %	0 %	0 %	385829636
127	NC_017486	ATTT	2	8	50403	50410	25 %	75 %	0 %	0 %	385829636
128	NC_017486	AACA	2	8	50718	50725	75 %	0 %	0 %	25 %	385829637
129	NC_017486	TTTG	2	8	50726	50733	0 %	75 %	25 %	0 %	385829637
130	NC_017486	ATTT	2	8	51025	51032	25 %	75 %	0 %	0 %	385829638
131	NC_017486	ACCA	2	8	51086	51093	50 %	0 %	0 %	50 %	385829638
132	NC_017486	ATCA	2	8	51191	51198	50 %	25 %	0 %	25 %	385829638
133	NC_017486	AGAA	2	8	51242	51249	75 %	0 %	25 %	0 %	385829638
134	NC_017486	ATAA	2	8	51329	51336	75 %	25 %	0 %	0 %	385829638
135	NC_017486	TTCG	2	8	51376	51383	0 %	50 %	25 %	25 %	385829638
136	NC_017486	ATTT	2	8	51535	51542	25 %	75 %	0 %	0 %	385829638
137	NC_017486	AATA	2	8	52349	52356	75 %	25 %	0 %	0 %	385829638
138	NC_017486	CATT	2	8	52360	52367	25 %	50 %	0 %	25 %	385829638
139	NC_017486	AGGG	2	8	52535	52542	25 %	0 %	75 %	0 %	385829638
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