MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 29175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017486	ATT	2	6	521	526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829590
2	NC_017486	CGG	2	6	554	559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385829590
3	NC_017486	GAT	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829590
4	NC_017486	ATG	2	6	605	610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829590
5	NC_017486	AGC	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829590
6	NC_017486	TGG	2	6	828	833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385829590
7	NC_017486	TTC	2	6	918	923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829590
8	NC_017486	AAT	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829590
9	NC_017486	ACT	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829590
10	NC_017486	ATT	2	6	1481	1486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829590
11	NC_017486	TTG	2	6	1508	1513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829590
12	NC_017486	GGC	2	6	1615	1620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385829590
13	NC_017486	TAA	2	6	1899	1904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829591
14	NC_017486	ATA	2	6	2063	2068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829591
15	NC_017486	GCT	2	6	2116	2121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829591
16	NC_017486	AGA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829591
17	NC_017486	ATG	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829591
18	NC_017486	AAG	2	6	2537	2542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829591
19	NC_017486	TTA	2	6	2598	2603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829591
20	NC_017486	TGC	2	6	2688	2693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829591
21	NC_017486	TTG	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829591
22	NC_017486	GTA	2	6	2782	2787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829591
23	NC_017486	GAA	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829591
24	NC_017486	AAG	2	6	2846	2851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829591
25	NC_017486	GAA	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829591
26	NC_017486	GAA	2	6	3193	3198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
27	NC_017486	TTA	2	6	3219	3224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829592
28	NC_017486	CTT	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829592
29	NC_017486	GCA	2	6	3295	3300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829592
30	NC_017486	TTA	2	6	3339	3344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829592
31	NC_017486	ACA	2	6	3367	3372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829592
32	NC_017486	CAG	2	6	3389	3394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829592
33	NC_017486	GAG	2	6	3423	3428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385829592
34	NC_017486	AGA	2	6	3438	3443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
35	NC_017486	CTG	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829592
36	NC_017486	GAA	2	6	3595	3600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
37	NC_017486	ACT	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829592
38	NC_017486	GTC	2	6	3650	3655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829592
39	NC_017486	GAA	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
40	NC_017486	TGA	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
41	NC_017486	ACA	2	6	3923	3928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829592
42	NC_017486	CTG	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829592
43	NC_017486	TAG	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
44	NC_017486	GCT	2	6	4132	4137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829592
45	NC_017486	AAG	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
46	NC_017486	GAT	2	6	4276	4281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
47	NC_017486	TCT	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829592
48	NC_017486	GAA	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
49	NC_017486	TGA	2	6	4692	4697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
50	NC_017486	TTA	2	6	4729	4734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829592
51	NC_017486	TGT	2	6	4782	4787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829592
52	NC_017486	TTG	2	6	4808	4813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829592
53	NC_017486	TAA	2	6	4824	4829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829592
54	NC_017486	TGA	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
55	NC_017486	TGT	2	6	4962	4967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829592
56	NC_017486	ATT	2	6	5088	5093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829592
57	NC_017486	TTC	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829592
58	NC_017486	AAG	2	6	5132	5137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
59	NC_017486	TTG	2	6	5216	5221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829592
60	NC_017486	GAA	2	6	5227	5232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
61	NC_017486	TGA	2	6	5238	5243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
62	NC_017486	TAT	2	6	5309	5314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829592
63	NC_017486	AAG	3	9	5540	5548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
64	NC_017486	TGA	2	6	5568	5573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
65	NC_017486	ATG	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
66	NC_017486	AGA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
67	NC_017486	TGA	2	6	5715	5720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
68	NC_017486	AGT	2	6	5743	5748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
69	NC_017486	GAA	2	6	5807	5812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
70	NC_017486	TCT	2	6	5833	5838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829592
71	NC_017486	ATT	2	6	5840	5845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829592
72	NC_017486	AAG	2	6	5945	5950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
73	NC_017486	ATG	2	6	6071	6076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
74	NC_017486	AAG	2	6	6155	6160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
75	NC_017486	AGC	2	6	6167	6172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829592
76	NC_017486	GCA	2	6	6602	6607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829593
77	NC_017486	TGA	2	6	6664	6669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829593
78	NC_017486	AAG	2	6	6837	6842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829593
79	NC_017486	AGA	2	6	6874	6879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829593
80	NC_017486	GAA	2	6	6911	6916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829593
81	NC_017486	AGT	2	6	6964	6969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829593
82	NC_017486	CAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829593
83	NC_017486	ATA	2	6	7200	7205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829593
84	NC_017486	TTC	2	6	7294	7299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829593
85	NC_017486	ATG	2	6	7611	7616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829593
86	NC_017486	GTG	2	6	7836	7841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385829593
87	NC_017486	AGA	2	6	7915	7920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829593
88	NC_017486	CTT	2	6	7985	7990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829593
89	NC_017486	TGA	2	6	8011	8016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829593
90	NC_017486	AGC	2	6	8065	8070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829593
91	NC_017486	ATA	3	9	8145	8153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829593
92	NC_017486	GTT	2	6	8189	8194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829593
93	NC_017486	TGA	2	6	8197	8202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829593
94	NC_017486	TAA	2	6	8404	8409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829593
95	NC_017486	AAG	2	6	8471	8476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829593
96	NC_017486	CTA	2	6	8548	8553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829593
97	NC_017486	ATT	2	6	8656	8661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829593
98	NC_017486	CAA	2	6	8680	8685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829593
99	NC_017486	AAT	2	6	8699	8704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829593
100	NC_017486	TGA	2	6	8751	8756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829593
101	NC_017486	AGA	2	6	8839	8844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829593
102	NC_017486	AGC	2	6	8989	8994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829593
103	NC_017486	AGA	2	6	9001	9006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829593
104	NC_017486	AGA	2	6	9136	9141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829593
105	NC_017486	AAG	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829593
106	NC_017486	GAA	2	6	9296	9301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829593
107	NC_017486	ATA	2	6	9315	9320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829593
108	NC_017486	TGA	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829593
109	NC_017486	AGC	2	6	9385	9390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829593
110	NC_017486	CTG	2	6	9537	9542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829593
111	NC_017486	TGA	2	6	9625	9630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829593
112	NC_017486	TGA	2	6	9640	9645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829593
113	NC_017486	AAG	2	6	9741	9746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829593
114	NC_017486	TTC	2	6	9877	9882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829593
115	NC_017486	AGG	2	6	9991	9996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385829593
116	NC_017486	TTG	2	6	10011	10016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829593
117	NC_017486	GAT	2	6	10025	10030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829593
118	NC_017486	GAA	2	6	10105	10110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829594
119	NC_017486	TGA	3	9	10218	10226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829594
120	NC_017486	TAA	2	6	10240	10245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829594
121	NC_017486	TAA	2	6	10318	10323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829595
122	NC_017486	ACC	2	6	10411	10416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829595
123	NC_017486	ATA	2	6	10488	10493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829595
124	NC_017486	AGT	2	6	10550	10555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829595
125	NC_017486	CTA	2	6	10755	10760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829595
126	NC_017486	CTT	3	9	10780	10788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829595
127	NC_017486	CAG	2	6	11129	11134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829596
128	NC_017486	CAA	2	6	11222	11227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829596
129	NC_017486	CAT	2	6	11415	11420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829596
130	NC_017486	GTT	2	6	11425	11430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829596
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