MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56D

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017485	TAT	2	6	961	966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831961
2	NC_017485	GAA	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831961
3	NC_017485	GGT	2	6	997	1002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831961
4	NC_017485	GTG	2	6	1034	1039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831961
5	NC_017485	ATA	2	6	1143	1148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831961
6	NC_017485	TAG	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831961
7	NC_017485	AAG	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831961
8	NC_017485	ATG	2	6	1338	1343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831961
9	NC_017485	AGA	2	6	1651	1656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831961
10	NC_017485	GAA	2	6	1741	1746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831961
11	NC_017485	AGA	2	6	1813	1818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831961
12	NC_017485	GTT	2	6	1867	1872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831961
13	NC_017485	TAT	2	6	1903	1908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831961
14	NC_017485	AAG	2	6	2025	2030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831961
15	NC_017485	GAA	2	6	2062	2067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831961
16	NC_017485	GAA	2	6	2251	2256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831962
17	NC_017485	TTA	2	6	2377	2382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831962
18	NC_017485	AAT	2	6	2410	2415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831962
19	NC_017485	AGA	2	6	2719	2724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831963
20	NC_017485	AGA	2	6	2878	2883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831963
21	NC_017485	TGG	2	6	2903	2908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831963
22	NC_017485	GAT	2	6	2926	2931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831963
23	NC_017485	GAT	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831964
24	NC_017485	ATC	2	6	3027	3032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831964
25	NC_017485	ATA	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831964
26	NC_017485	TGA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831964
27	NC_017485	ACA	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831964
28	NC_017485	GAA	2	6	3348	3353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831964
29	NC_017485	TCA	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831964
30	NC_017485	TTA	2	6	3500	3505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831965
31	NC_017485	ATT	2	6	3517	3522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831965
32	NC_017485	ATA	2	6	3552	3557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831965
33	NC_017485	AAT	2	6	3574	3579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831965
34	NC_017485	AAC	2	6	3660	3665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831965
35	NC_017485	TTA	2	6	3669	3674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831965
36	NC_017485	AAT	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831966
37	NC_017485	TTG	2	6	3954	3959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831966
38	NC_017485	TTA	2	6	3960	3965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831966
39	NC_017485	TAA	2	6	3975	3980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831966
40	NC_017485	GTT	2	6	4073	4078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831966
41	NC_017485	TAT	2	6	4237	4242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831966
42	NC_017485	TTA	2	6	4265	4270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831966
43	NC_017485	TTC	2	6	4518	4523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831967
44	NC_017485	ACT	2	6	4564	4569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831967
45	NC_017485	GTC	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831967
46	NC_017485	CAA	2	6	4760	4765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831967
47	NC_017485	CAA	2	6	4796	4801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831967
48	NC_017485	TTA	2	6	4997	5002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831967
49	NC_017485	GAA	3	9	5295	5303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831968
50	NC_017485	CTT	2	6	5320	5325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831968
51	NC_017485	TGT	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831968

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.