MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56C

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017484	A	7	7	965	971	100 %	0 %	0 %	0 %	385829560
2	NC_017484	T	7	7	1187	1193	0 %	100 %	0 %	0 %	385829560
3	NC_017484	A	6	6	1240	1245	100 %	0 %	0 %	0 %	385829560
4	NC_017484	A	6	6	1249	1254	100 %	0 %	0 %	0 %	385829560
5	NC_017484	A	6	6	2070	2075	100 %	0 %	0 %	0 %	385829560
6	NC_017484	A	6	6	2189	2194	100 %	0 %	0 %	0 %	385829561
7	NC_017484	A	8	8	2230	2237	100 %	0 %	0 %	0 %	385829561
8	NC_017484	T	8	8	2245	2252	0 %	100 %	0 %	0 %	385829561
9	NC_017484	A	6	6	2277	2282	100 %	0 %	0 %	0 %	385829561
10	NC_017484	T	7	7	2579	2585	0 %	100 %	0 %	0 %	385829561
11	NC_017484	A	6	6	2857	2862	100 %	0 %	0 %	0 %	385829561
12	NC_017484	T	6	6	3234	3239	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
13	NC_017484	T	7	7	3249	3255	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
14	NC_017484	T	6	6	3354	3359	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
15	NC_017484	A	6	6	3801	3806	100 %	0 %	0 %	0 %	385829562
16	NC_017484	T	7	7	3867	3873	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
17	NC_017484	T	7	7	3936	3942	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
18	NC_017484	T	6	6	3981	3986	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
19	NC_017484	T	7	7	4003	4009	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
20	NC_017484	T	6	6	4046	4051	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
21	NC_017484	T	7	7	4509	4515	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
22	NC_017484	T	6	6	4524	4529	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
23	NC_017484	T	6	6	4624	4629	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
24	NC_017484	T	6	6	4720	4725	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
25	NC_017484	T	6	6	4761	4766	0 %	100 %	0 %	0 %	385829563
26	NC_017484	T	6	6	5053	5058	0 %	100 %	0 %	0 %	385829563
27	NC_017484	T	6	6	5323	5328	0 %	100 %	0 %	0 %	385829564
28	NC_017484	T	7	7	5427	5433	0 %	100 %	0 %	0 %	385829564
29	NC_017484	T	6	6	5492	5497	0 %	100 %	0 %	0 %	385829564
30	NC_017484	T	8	8	5515	5522	0 %	100 %	0 %	0 %	385829564
31	NC_017484	T	6	6	5661	5666	0 %	100 %	0 %	0 %	385829565
32	NC_017484	T	6	6	5674	5679	0 %	100 %	0 %	0 %	385829565
33	NC_017484	T	8	8	5684	5691	0 %	100 %	0 %	0 %	385829565
34	NC_017484	T	6	6	5741	5746	0 %	100 %	0 %	0 %	385829565
35	NC_017484	T	6	6	5785	5790	0 %	100 %	0 %	0 %	385829565
36	NC_017484	T	6	6	6347	6352	0 %	100 %	0 %	0 %	385829565
37	NC_017484	T	7	7	6395	6401	0 %	100 %	0 %	0 %	385829565
38	NC_017484	T	8	8	6599	6606	0 %	100 %	0 %	0 %	385829565
39	NC_017484	T	6	6	7028	7033	0 %	100 %	0 %	0 %	385829566
40	NC_017484	T	6	6	7283	7288	0 %	100 %	0 %	0 %	385829566
41	NC_017484	T	6	6	7382	7387	0 %	100 %	0 %	0 %	385829566
42	NC_017484	T	6	6	7445	7450	0 %	100 %	0 %	0 %	385829566
43	NC_017484	T	7	7	7636	7642	0 %	100 %	0 %	0 %	385829566
44	NC_017484	T	6	6	7651	7656	0 %	100 %	0 %	0 %	385829566
45	NC_017484	T	6	6	8208	8213	0 %	100 %	0 %	0 %	385829567
46	NC_017484	T	7	7	8293	8299	0 %	100 %	0 %	0 %	385829567
47	NC_017484	T	8	8	8390	8397	0 %	100 %	0 %	0 %	385829568
48	NC_017484	T	7	7	8432	8438	0 %	100 %	0 %	0 %	385829568
49	NC_017484	T	6	6	8527	8532	0 %	100 %	0 %	0 %	385829568
50	NC_017484	T	6	6	9060	9065	0 %	100 %	0 %	0 %	385829570
51	NC_017484	T	8	8	9114	9121	0 %	100 %	0 %	0 %	385829570
52	NC_017484	T	7	7	9302	9308	0 %	100 %	0 %	0 %	385829570
53	NC_017484	T	6	6	9490	9495	0 %	100 %	0 %	0 %	385829570
54	NC_017484	T	7	7	9528	9534	0 %	100 %	0 %	0 %	385829570
55	NC_017484	A	6	6	9626	9631	100 %	0 %	0 %	0 %	385829570
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57	NC_017484	T	6	6	10242	10247	0 %	100 %	0 %	0 %	385829571
58	NC_017484	C	6	6	10588	10593	0 %	0 %	0 %	100 %	385829571
59	NC_017484	T	6	6	10945	10950	0 %	100 %	0 %	0 %	385829571
60	NC_017484	T	8	8	10989	10996	0 %	100 %	0 %	0 %	385829571
61	NC_017484	T	6	6	11100	11105	0 %	100 %	0 %	0 %	385829571
62	NC_017484	T	8	8	11279	11286	0 %	100 %	0 %	0 %	385829571
63	NC_017484	T	7	7	11382	11388	0 %	100 %	0 %	0 %	385829571
64	NC_017484	A	7	7	13171	13177	100 %	0 %	0 %	0 %	385829572
65	NC_017484	T	6	6	13599	13604	0 %	100 %	0 %	0 %	385829573
66	NC_017484	A	6	6	13673	13678	100 %	0 %	0 %	0 %	385829573
67	NC_017484	A	6	6	13760	13765	100 %	0 %	0 %	0 %	385829573
68	NC_017484	A	6	6	13942	13947	100 %	0 %	0 %	0 %	385829574
69	NC_017484	A	7	7	15008	15014	100 %	0 %	0 %	0 %	385829575
70	NC_017484	A	6	6	15083	15088	100 %	0 %	0 %	0 %	385829575
71	NC_017484	A	7	7	15422	15428	100 %	0 %	0 %	0 %	385829575
72	NC_017484	A	6	6	16094	16099	100 %	0 %	0 %	0 %	385829575
73	NC_017484	A	7	7	16101	16107	100 %	0 %	0 %	0 %	385829575
74	NC_017484	A	6	6	16133	16138	100 %	0 %	0 %	0 %	385829575
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76	NC_017484	A	7	7	16817	16823	100 %	0 %	0 %	0 %	385829575
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82	NC_017484	A	6	6	19771	19776	100 %	0 %	0 %	0 %	385829576
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87	NC_017484	A	6	6	22216	22221	100 %	0 %	0 %	0 %	385829578
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90	NC_017484	A	6	6	23060	23065	100 %	0 %	0 %	0 %	385829578
91	NC_017484	A	6	6	23124	23129	100 %	0 %	0 %	0 %	385829578
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98	NC_017484	T	7	7	25309	25315	0 %	100 %	0 %	0 %	385829580
99	NC_017484	A	6	6	25357	25362	100 %	0 %	0 %	0 %	385829580
100	NC_017484	A	6	6	25364	25369	100 %	0 %	0 %	0 %	385829580
101	NC_017484	T	6	6	25843	25848	0 %	100 %	0 %	0 %	385829581
102	NC_017484	A	6	6	26256	26261	100 %	0 %	0 %	0 %	385829582
103	NC_017484	T	7	7	26440	26446	0 %	100 %	0 %	0 %	385829583
104	NC_017484	T	6	6	26561	26566	0 %	100 %	0 %	0 %	385829583
105	NC_017484	T	6	6	26608	26613	0 %	100 %	0 %	0 %	385829583
106	NC_017484	T	7	7	27211	27217	0 %	100 %	0 %	0 %	385829584
107	NC_017484	A	6	6	28416	28421	100 %	0 %	0 %	0 %	385829586
108	NC_017484	T	6	6	28455	28460	0 %	100 %	0 %	0 %	385829586
109	NC_017484	T	6	6	29129	29134	0 %	100 %	0 %	0 %	385829587
110	NC_017484	T	6	6	29628	29633	0 %	100 %	0 %	0 %	385829587

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.