MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56C

Total Repeats: 601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017484	T	7	7	25309	25315	0 %	100 %	0 %	0 %	385829580
502	NC_017484	AT	3	6	25324	25329	50 %	50 %	0 %	0 %	385829580
503	NC_017484	ATA	2	6	25344	25349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829580
504	NC_017484	A	6	6	25357	25362	100 %	0 %	0 %	0 %	385829580
505	NC_017484	A	6	6	25364	25369	100 %	0 %	0 %	0 %	385829580
506	NC_017484	TAT	2	6	25473	25478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829581
507	NC_017484	TAA	2	6	25565	25570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829581
508	NC_017484	TTG	2	6	25766	25771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829581
509	NC_017484	CATG	2	8	25779	25786	25 %	25 %	25 %	25 %	385829581
510	NC_017484	TTG	2	6	25802	25807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829581
511	NC_017484	T	6	6	25843	25848	0 %	100 %	0 %	0 %	385829581
512	NC_017484	GTTT	2	8	25866	25873	0 %	75 %	25 %	0 %	385829581
513	NC_017484	CGA	2	6	25974	25979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829581
514	NC_017484	AGT	2	6	25998	26003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829581
515	NC_017484	ATAAAG	2	12	26042	26053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385829581
516	NC_017484	CAA	2	6	26137	26142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829582
517	NC_017484	ATT	2	6	26148	26153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829582
518	NC_017484	TACT	2	8	26204	26211	25 %	50 %	0 %	25 %	385829582
519	NC_017484	A	6	6	26256	26261	100 %	0 %	0 %	0 %	385829582
520	NC_017484	AT	3	6	26317	26322	50 %	50 %	0 %	0 %	385829582
521	NC_017484	T	7	7	26440	26446	0 %	100 %	0 %	0 %	385829583
522	NC_017484	AAG	2	6	26490	26495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829583
523	NC_017484	AAT	2	6	26521	26526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829583
524	NC_017484	TCT	2	6	26530	26535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829583
525	NC_017484	T	6	6	26561	26566	0 %	100 %	0 %	0 %	385829583
526	NC_017484	AT	3	6	26575	26580	50 %	50 %	0 %	0 %	385829583
527	NC_017484	T	6	6	26608	26613	0 %	100 %	0 %	0 %	385829583
528	NC_017484	AT	3	6	26620	26625	50 %	50 %	0 %	0 %	385829583
529	NC_017484	AATTA	2	10	26661	26670	60 %	40 %	0 %	0 %	385829583
530	NC_017484	TTG	2	6	26709	26714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829583
531	NC_017484	T	7	7	27211	27217	0 %	100 %	0 %	0 %	385829584
532	NC_017484	CAA	2	6	27839	27844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829585
533	NC_017484	GAA	3	9	28026	28034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829585
534	NC_017484	AC	4	8	28042	28049	50 %	0 %	0 %	50 %	385829586
535	NC_017484	TTA	2	6	28148	28153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829586
536	NC_017484	AAC	2	6	28166	28171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829586
537	NC_017484	CTG	2	6	28353	28358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829586
538	NC_017484	A	6	6	28416	28421	100 %	0 %	0 %	0 %	385829586
539	NC_017484	TATC	2	8	28422	28429	25 %	50 %	0 %	25 %	385829586
540	NC_017484	T	6	6	28455	28460	0 %	100 %	0 %	0 %	385829586
541	NC_017484	AGA	2	6	28552	28557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829586
542	NC_017484	CTT	2	6	28616	28621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829586
543	NC_017484	TCG	2	6	28741	28746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829586
544	NC_017484	CTTT	2	8	28837	28844	0 %	75 %	0 %	25 %	385829587
545	NC_017484	GA	3	6	28868	28873	50 %	0 %	50 %	0 %	385829587
546	NC_017484	AAT	2	6	28949	28954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829587
547	NC_017484	TACGG	2	10	28982	28991	20 %	20 %	40 %	20 %	385829587
548	NC_017484	TCA	2	6	29064	29069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829587
549	NC_017484	T	6	6	29129	29134	0 %	100 %	0 %	0 %	385829587
550	NC_017484	AAGT	2	8	29150	29157	50 %	25 %	25 %	0 %	385829587
551	NC_017484	TCCC	2	8	29182	29189	0 %	25 %	0 %	75 %	385829587
552	NC_017484	AATCC	2	10	29238	29247	40 %	20 %	0 %	40 %	385829587
553	NC_017484	GTT	2	6	29286	29291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829587
554	NC_017484	CGG	2	6	29306	29311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385829587
555	NC_017484	CAT	2	6	29347	29352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829587
556	NC_017484	AAT	2	6	29355	29360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829587
557	NC_017484	CAT	2	6	29365	29370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829587
558	NC_017484	TA	3	6	29374	29379	50 %	50 %	0 %	0 %	385829587
559	NC_017484	CATT	2	8	29428	29435	25 %	50 %	0 %	25 %	385829587
560	NC_017484	AACC	2	8	29552	29559	50 %	0 %	0 %	50 %	385829587
561	NC_017484	TACA	2	8	29579	29586	50 %	25 %	0 %	25 %	385829587
562	NC_017484	ATT	2	6	29603	29608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829587
563	NC_017484	T	6	6	29628	29633	0 %	100 %	0 %	0 %	385829587
564	NC_017484	TTGC	2	8	29635	29642	0 %	50 %	25 %	25 %	385829587
565	NC_017484	CTT	2	6	29729	29734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829587
566	NC_017484	GTCAA	2	10	29775	29784	40 %	20 %	20 %	20 %	385829587
567	NC_017484	TAG	2	6	29844	29849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829587
568	NC_017484	TTAT	2	8	29850	29857	25 %	75 %	0 %	0 %	385829587
569	NC_017484	TGT	2	6	29909	29914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829587
570	NC_017484	AAG	2	6	29927	29932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829587
571	NC_017484	AGC	2	6	29975	29980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829587
572	NC_017484	GAA	2	6	30033	30038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829587
573	NC_017484	TCA	2	6	30055	30060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829587
574	NC_017484	CAT	2	6	30092	30097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829587
575	NC_017484	GTC	2	6	30137	30142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829587
576	NC_017484	TCAGTT	2	12	30201	30212	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385829587
577	NC_017484	TA	3	6	30268	30273	50 %	50 %	0 %	0 %	385829587
578	NC_017484	TCC	2	6	30323	30328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385829587
579	NC_017484	CCA	2	6	30381	30386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829587
580	NC_017484	CCAA	2	8	30392	30399	50 %	0 %	0 %	50 %	385829587
581	NC_017484	TAA	2	6	30403	30408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829587
582	NC_017484	CCA	2	6	30414	30419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829587
583	NC_017484	ATG	2	6	30463	30468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829587
584	NC_017484	TGT	2	6	30473	30478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829587
585	NC_017484	TTG	2	6	30504	30509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829587
586	NC_017484	GTG	2	6	30529	30534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385829587
587	NC_017484	ATA	2	6	30550	30555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829587
588	NC_017484	TTG	2	6	30660	30665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829587
589	NC_017484	TTC	3	9	30704	30712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829587
590	NC_017484	GAAT	2	8	30720	30727	50 %	25 %	25 %	0 %	385829587
591	NC_017484	TTA	2	6	30750	30755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829587
592	NC_017484	TCTT	2	8	30820	30827	0 %	75 %	0 %	25 %	385829587
593	NC_017484	ATTCT	2	10	30894	30903	20 %	60 %	0 %	20 %	385829587
594	NC_017484	CTT	2	6	30924	30929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829587
595	NC_017484	CTGC	2	8	30952	30959	0 %	25 %	25 %	50 %	385829587
596	NC_017484	CTT	3	9	31199	31207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829588
597	NC_017484	TCT	2	6	31286	31291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829588
598	NC_017484	GAA	3	9	31331	31339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829588
599	NC_017484	GT	3	6	31340	31345	0 %	50 %	50 %	0 %	385829588
600	NC_017484	GTT	2	6	31353	31358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829588
601	NC_017484	ATC	2	6	31362	31367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829588

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