MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56A

Total Repeats: 484

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017483	TTG	2	6	882	887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831892
2	NC_017483	AGA	2	6	1012	1017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831892
3	NC_017483	AAG	2	6	1068	1073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831892
4	NC_017483	TAC	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831892
5	NC_017483	GAA	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831892
6	NC_017483	GAA	2	6	1588	1593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831892
7	NC_017483	GAT	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831892
8	NC_017483	GAC	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831892
9	NC_017483	AGA	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831892
10	NC_017483	TTA	2	6	1718	1723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831892
11	NC_017483	AAG	2	6	1872	1877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831892
12	NC_017483	GAA	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
13	NC_017483	TAT	2	6	2108	2113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831893
14	NC_017483	TAA	2	6	2132	2137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831893
15	NC_017483	AGA	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
16	NC_017483	AAG	2	6	2168	2173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
17	NC_017483	AGA	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
18	NC_017483	AAG	2	6	2201	2206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
19	NC_017483	AGA	2	6	2223	2228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
20	NC_017483	AAG	2	6	2234	2239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
21	NC_017483	AGA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
22	NC_017483	AAG	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
23	NC_017483	AGA	2	6	2289	2294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
24	NC_017483	AAG	2	6	2300	2305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
25	NC_017483	AGA	2	6	2322	2327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
26	NC_017483	AAG	2	6	2333	2338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
27	NC_017483	AGA	2	6	2355	2360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
28	NC_017483	AAG	2	6	2366	2371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
29	NC_017483	AGA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
30	NC_017483	AAG	2	6	2399	2404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
31	NC_017483	CAA	2	6	2500	2505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831893
32	NC_017483	CAA	3	9	2524	2532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831893
33	NC_017483	AGA	2	6	2562	2567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
34	NC_017483	GGA	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831893
35	NC_017483	TCG	2	6	2632	2637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831893
36	NC_017483	GAA	2	6	2656	2661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
37	NC_017483	AGA	3	9	2694	2702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
38	NC_017483	TGG	2	6	2752	2757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831893
39	NC_017483	GAA	2	6	2765	2770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
40	NC_017483	GAC	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831894
41	NC_017483	CAA	2	6	2863	2868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831894
42	NC_017483	CTG	3	9	2969	2977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831894
43	NC_017483	ATT	2	6	3066	3071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831894
44	NC_017483	AAC	2	6	3179	3184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831894
45	NC_017483	TAG	2	6	3324	3329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831894
46	NC_017483	GAA	2	6	3376	3381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831894
47	NC_017483	TGA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831894
48	NC_017483	GAT	2	6	3463	3468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831894
49	NC_017483	ATA	2	6	3475	3480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831894
50	NC_017483	GAT	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831894
51	NC_017483	ATT	2	6	3562	3567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831895
52	NC_017483	TAT	2	6	3687	3692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831895
53	NC_017483	ATT	2	6	3891	3896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831895
54	NC_017483	CAG	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831895
55	NC_017483	TGA	3	9	4063	4071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
56	NC_017483	AAG	2	6	4338	4343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
57	NC_017483	TGA	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
58	NC_017483	AGA	2	6	4633	4638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
59	NC_017483	TGG	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831895
60	NC_017483	TGA	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
61	NC_017483	ACA	2	6	4842	4847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831895
62	NC_017483	GAT	2	6	5051	5056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
63	NC_017483	ATA	2	6	5142	5147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831895
64	NC_017483	TTA	2	6	5225	5230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831895
65	NC_017483	AAG	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
66	NC_017483	TGT	2	6	5311	5316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831895
67	NC_017483	GAT	2	6	5321	5326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
68	NC_017483	CAA	2	6	5349	5354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831895
69	NC_017483	GAA	3	9	5560	5568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
70	NC_017483	ACA	2	6	5662	5667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831895
71	NC_017483	AAG	2	6	5670	5675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
72	NC_017483	ATG	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
73	NC_017483	TGA	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
74	NC_017483	TAA	2	6	5869	5874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831895
75	NC_017483	TTG	2	6	5886	5891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831895
76	NC_017483	AAG	2	6	5987	5992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
77	NC_017483	AGA	2	6	6010	6015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
78	NC_017483	ATT	2	6	6023	6028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831895
79	NC_017483	GAT	3	9	6103	6111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
80	NC_017483	TAT	2	6	6242	6247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831895
81	NC_017483	GAA	2	6	6273	6278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
82	NC_017483	ATG	2	6	6303	6308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
83	NC_017483	GTT	2	6	6401	6406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831895
84	NC_017483	TGA	2	6	6448	6453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
85	NC_017483	AAG	2	6	6519	6524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
86	NC_017483	GAT	2	6	6629	6634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
87	NC_017483	TGA	2	6	6658	6663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
88	NC_017483	ATA	2	6	6671	6676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831895
89	NC_017483	AAG	2	6	6678	6683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
90	NC_017483	ACA	2	6	6770	6775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831895
91	NC_017483	GAA	2	6	6791	6796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
92	NC_017483	AGA	2	6	6835	6840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
93	NC_017483	AAG	2	6	6900	6905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
94	NC_017483	ATT	2	6	6946	6951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831895
95	NC_017483	TGA	2	6	7060	7065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
96	NC_017483	GAA	2	6	7235	7240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
97	NC_017483	ATT	2	6	7372	7377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831895
98	NC_017483	AGA	2	6	7460	7465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
99	NC_017483	ATT	2	6	7467	7472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831895
100	NC_017483	TTA	2	6	7506	7511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831895
101	NC_017483	GAG	2	6	7850	7855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831895
102	NC_017483	AAT	2	6	8092	8097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831896
103	NC_017483	CTC	2	6	8122	8127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385831896
104	NC_017483	AAT	2	6	8728	8733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831897
105	NC_017483	CTA	2	6	8751	8756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831897
106	NC_017483	ATA	2	6	8854	8859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831897
107	NC_017483	ATC	2	6	8875	8880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831897
108	NC_017483	TGT	2	6	8915	8920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831897
109	NC_017483	CAT	2	6	9046	9051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831897
110	NC_017483	GTT	2	6	9126	9131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831897
111	NC_017483	ATT	2	6	9226	9231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831897
112	NC_017483	ATA	2	6	9777	9782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831898
113	NC_017483	TAT	2	6	9804	9809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831898
114	NC_017483	TCT	2	6	9977	9982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831898
115	NC_017483	TAA	2	6	10147	10152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831898
116	NC_017483	CTA	2	6	10263	10268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831898
117	NC_017483	AAT	2	6	10279	10284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831898
118	NC_017483	TTG	2	6	10308	10313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831898
119	NC_017483	CTA	2	6	10335	10340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831898
120	NC_017483	AAT	2	6	10414	10419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831898
121	NC_017483	AAC	2	6	10435	10440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831898
122	NC_017483	ATA	2	6	10454	10459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831898
123	NC_017483	GTG	2	6	10491	10496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831898
124	NC_017483	CTC	2	6	10578	10583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385831898
125	NC_017483	GAA	2	6	10637	10642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831898
126	NC_017483	TTG	2	6	10677	10682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831898
127	NC_017483	GCT	2	6	10776	10781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831898
128	NC_017483	TGA	2	6	11293	11298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831899
129	NC_017483	ACG	2	6	11346	11351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831899
130	NC_017483	AGC	2	6	11370	11375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831899
131	NC_017483	AGC	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831899
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