MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56A

Total Repeats: 918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017483	TAAAC	2	10	23823	23832	60 %	20 %	0 %	20 %	385831909
502	NC_017483	CTAT	2	8	23850	23857	25 %	50 %	0 %	25 %	385831909
503	NC_017483	GTT	2	6	23861	23866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831909
504	NC_017483	TAT	2	6	23890	23895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831909
505	NC_017483	CATAT	2	10	23912	23921	40 %	40 %	0 %	20 %	385831909
506	NC_017483	ATG	2	6	24017	24022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831909
507	NC_017483	TAT	2	6	24038	24043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831909
508	NC_017483	ATTA	2	8	24082	24089	50 %	50 %	0 %	0 %	385831909
509	NC_017483	A	7	7	24096	24102	100 %	0 %	0 %	0 %	385831909
510	NC_017483	TTA	2	6	24124	24129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831909
511	NC_017483	AAG	2	6	24137	24142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831909
512	NC_017483	GAAA	2	8	24531	24538	75 %	0 %	25 %	0 %	385831910
513	NC_017483	GTA	2	6	24563	24568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831910
514	NC_017483	A	6	6	24568	24573	100 %	0 %	0 %	0 %	385831910
515	NC_017483	A	7	7	24708	24714	100 %	0 %	0 %	0 %	385831910
516	NC_017483	ACAAA	2	10	24755	24764	80 %	0 %	0 %	20 %	385831910
517	NC_017483	T	6	6	24777	24782	0 %	100 %	0 %	0 %	385831910
518	NC_017483	AATT	2	8	24811	24818	50 %	50 %	0 %	0 %	385831910
519	NC_017483	TTTC	2	8	24928	24935	0 %	75 %	0 %	25 %	385831911
520	NC_017483	T	6	6	25003	25008	0 %	100 %	0 %	0 %	385831911
521	NC_017483	AAT	2	6	25053	25058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831911
522	NC_017483	AAG	2	6	25154	25159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831911
523	NC_017483	CTT	2	6	25225	25230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831911
524	NC_017483	AGG	2	6	25284	25289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831911
525	NC_017483	AAT	2	6	25292	25297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831911
526	NC_017483	AGA	3	9	25305	25313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831912
527	NC_017483	TTA	2	6	25429	25434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831912
528	NC_017483	A	6	6	25633	25638	100 %	0 %	0 %	0 %	385831912
529	NC_017483	A	6	6	25666	25671	100 %	0 %	0 %	0 %	385831912
530	NC_017483	AAC	2	6	25712	25717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831912
531	NC_017483	CAA	2	6	25752	25757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831912
532	NC_017483	AGGGAA	2	12	25764	25775	50 %	0 %	50 %	0 %	385831912
533	NC_017483	GTT	2	6	25852	25857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831913
534	NC_017483	A	6	6	25909	25914	100 %	0 %	0 %	0 %	385831913
535	NC_017483	GGTCT	2	10	26007	26016	0 %	40 %	40 %	20 %	385831913
536	NC_017483	GAA	2	6	26111	26116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831913
537	NC_017483	ATA	2	6	26140	26145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831913
538	NC_017483	T	6	6	26152	26157	0 %	100 %	0 %	0 %	385831913
539	NC_017483	AGA	2	6	26159	26164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831913
540	NC_017483	ACA	2	6	26181	26186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831913
541	NC_017483	GTG	2	6	26242	26247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831913
542	NC_017483	ATGT	2	8	26262	26269	25 %	50 %	25 %	0 %	385831913
543	NC_017483	AT	3	6	26278	26283	50 %	50 %	0 %	0 %	385831913
544	NC_017483	GAT	2	6	26348	26353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831913
545	NC_017483	AT	3	6	26429	26434	50 %	50 %	0 %	0 %	385831913
546	NC_017483	ATG	2	6	26437	26442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831913
547	NC_017483	TAT	2	6	26471	26476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831913
548	NC_017483	AGA	2	6	26531	26536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831913
549	NC_017483	TAC	2	6	26568	26573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831913
550	NC_017483	TACAGG	2	12	26603	26614	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385831913
551	NC_017483	TCAAT	2	10	26750	26759	40 %	40 %	0 %	20 %	385831913
552	NC_017483	AAG	2	6	26786	26791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831913
553	NC_017483	AT	3	6	26851	26856	50 %	50 %	0 %	0 %	385831913
554	NC_017483	GAT	3	9	26859	26867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831913
555	NC_017483	A	7	7	26895	26901	100 %	0 %	0 %	0 %	385831913
556	NC_017483	TCTA	2	8	26908	26915	25 %	50 %	0 %	25 %	385831913
557	NC_017483	A	7	7	27215	27221	100 %	0 %	0 %	0 %	385831914
558	NC_017483	AT	3	6	27272	27277	50 %	50 %	0 %	0 %	385831914
559	NC_017483	ATG	2	6	27398	27403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831914
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561	NC_017483	GTT	2	6	27578	27583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831915
562	NC_017483	ATA	2	6	27597	27602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831915
563	NC_017483	AATAAA	2	12	27605	27616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385831915
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600	NC_017483	TTTA	2	8	29356	29363	25 %	75 %	0 %	0 %	385831917
601	NC_017483	ATA	2	6	29407	29412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831917
602	NC_017483	CAAT	2	8	29421	29428	50 %	25 %	0 %	25 %	385831917
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614	NC_017483	ATTA	2	8	29774	29781	50 %	50 %	0 %	0 %	385831917
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616	NC_017483	AAAC	2	8	29798	29805	75 %	0 %	0 %	25 %	385831917
617	NC_017483	TC	3	6	29856	29861	0 %	50 %	0 %	50 %	385831917
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623	NC_017483	A	6	6	30138	30143	100 %	0 %	0 %	0 %	385831917
624	NC_017483	A	7	7	30145	30151	100 %	0 %	0 %	0 %	385831917
625	NC_017483	GAA	2	6	30159	30164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831917
626	NC_017483	A	6	6	30177	30182	100 %	0 %	0 %	0 %	385831917
627	NC_017483	CCA	2	6	30277	30282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385831917
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