MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG

Total Repeats: 47040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_017482	AGA	2	6	3001467	3001472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829551
47002	NC_017482	TTC	2	6	3001619	3001624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829552
47003	NC_017482	CG	3	6	3001661	3001666	0 %	0 %	50 %	50 %	385829552
47004	NC_017482	A	6	6	3001673	3001678	100 %	0 %	0 %	0 %	385829552
47005	NC_017482	T	6	6	3001771	3001776	0 %	100 %	0 %	0 %	385829552
47006	NC_017482	CTT	2	6	3001887	3001892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829552
47007	NC_017482	T	6	6	3001891	3001896	0 %	100 %	0 %	0 %	385829552
47008	NC_017482	ATG	2	6	3001917	3001922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829552
47009	NC_017482	ATA	2	6	3002520	3002525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829553
47010	NC_017482	TTGG	2	8	3002625	3002632	0 %	50 %	50 %	0 %	385829553
47011	NC_017482	GAA	2	6	3002872	3002877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829554
47012	NC_017482	GA	3	6	3002893	3002898	50 %	0 %	50 %	0 %	385829554
47013	NC_017482	AGA	3	9	3002896	3002904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829554
47014	NC_017482	GCA	2	6	3002957	3002962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829554
47015	NC_017482	CAA	2	6	3003067	3003072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829554
47016	NC_017482	TCAT	2	8	3003099	3003106	25 %	50 %	0 %	25 %	385829554
47017	NC_017482	AAAT	2	8	3003115	3003122	75 %	25 %	0 %	0 %	385829554
47018	NC_017482	ACC	2	6	3003161	3003166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829554
47019	NC_017482	A	7	7	3003214	3003220	100 %	0 %	0 %	0 %	385829554
47020	NC_017482	TTCT	2	8	3003225	3003232	0 %	75 %	0 %	25 %	385829554
47021	NC_017482	CCA	2	6	3003249	3003254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829554
47022	NC_017482	CGT	2	6	3003257	3003262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829554
47023	NC_017482	CCCA	2	8	3003363	3003370	25 %	0 %	0 %	75 %	385829554
47024	NC_017482	CGC	2	6	3003460	3003465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385829554
47025	NC_017482	TGA	2	6	3003469	3003474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829554
47026	NC_017482	TGT	2	6	3003487	3003492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829554
47027	NC_017482	CGG	2	6	3003493	3003498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385829554
47028	NC_017482	CAA	2	6	3003509	3003514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829554
47029	NC_017482	A	6	6	3003617	3003622	100 %	0 %	0 %	0 %	385829554
47030	NC_017482	TGCC	2	8	3003667	3003674	0 %	25 %	25 %	50 %	385829554
47031	NC_017482	TTA	2	6	3003828	3003833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829554
47032	NC_017482	CAA	2	6	3003841	3003846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829554
47033	NC_017482	ATT	2	6	3003926	3003931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829554
47034	NC_017482	GCA	2	6	3003942	3003947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829554
47035	NC_017482	CA	3	6	3004026	3004031	50 %	0 %	0 %	50 %	385829554
47036	NC_017482	TCA	2	6	3004044	3004049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829554
47037	NC_017482	GAC	2	6	3004075	3004080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829554
47038	NC_017482	GAC	2	6	3004082	3004087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829554
47039	NC_017482	A	6	6	3004175	3004180	100 %	0 %	0 %	0 %	385829554
47040	NC_017482	CAAAT	2	10	3004265	3004274	60 %	20 %	0 %	20 %	385829554

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.