MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG

Total Repeats: 47040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017482	GGCG	2	8	95454	95461	0 %	0 %	75 %	25 %	385826810
1502	NC_017482	CAT	2	6	95478	95483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826810
1503	NC_017482	A	6	6	95521	95526	100 %	0 %	0 %	0 %	385826810
1504	NC_017482	CTG	2	6	95542	95547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826810
1505	NC_017482	AAC	2	6	95680	95685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826810
1506	NC_017482	AGC	2	6	95856	95861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826810
1507	NC_017482	TGGGA	2	10	95955	95964	20 %	20 %	60 %	0 %	385826811
1508	NC_017482	TTG	2	6	95996	96001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826811
1509	NC_017482	TCT	2	6	96023	96028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826811
1510	NC_017482	TGGT	2	8	96035	96042	0 %	50 %	50 %	0 %	385826811
1511	NC_017482	GGT	2	6	96055	96060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826811
1512	NC_017482	TAG	2	6	96062	96067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826811
1513	NC_017482	CGG	2	6	96090	96095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826811
1514	NC_017482	TTA	2	6	96149	96154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826811
1515	NC_017482	CCG	2	6	96188	96193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826811
1516	NC_017482	CAAA	2	8	96216	96223	75 %	0 %	0 %	25 %	385826811
1517	NC_017482	AAG	2	6	96308	96313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826812
1518	NC_017482	TGA	2	6	96339	96344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826812
1519	NC_017482	CAA	2	6	96350	96355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826812
1520	NC_017482	GAA	2	6	96361	96366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826812
1521	NC_017482	TGA	2	6	96414	96419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826812
1522	NC_017482	ACC	2	6	96463	96468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826812
1523	NC_017482	AGC	2	6	96505	96510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826812
1524	NC_017482	GAT	2	6	96706	96711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826812
1525	NC_017482	GAAAA	2	10	96769	96778	80 %	0 %	20 %	0 %	385826813
1526	NC_017482	CATC	2	8	96787	96794	25 %	25 %	0 %	50 %	385826813
1527	NC_017482	TGA	2	6	96934	96939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826813
1528	NC_017482	CAG	2	6	97187	97192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826813
1529	NC_017482	GGCA	2	8	97248	97255	25 %	0 %	50 %	25 %	385826813
1530	NC_017482	TGA	2	6	97327	97332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826813
1531	NC_017482	CGG	2	6	97396	97401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826813
1532	NC_017482	AGA	2	6	97477	97482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826813
1533	NC_017482	T	6	6	97499	97504	0 %	100 %	0 %	0 %	385826813
1534	NC_017482	CAA	2	6	97530	97535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826813
1535	NC_017482	ATTT	2	8	97546	97553	25 %	75 %	0 %	0 %	385826813
1536	NC_017482	TGATGG	2	12	97659	97670	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385826813
1537	NC_017482	GCT	2	6	97723	97728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826813
1538	NC_017482	CGG	2	6	97756	97761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826813
1539	NC_017482	ATC	2	6	97787	97792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826813
1540	NC_017482	GC	3	6	97796	97801	0 %	0 %	50 %	50 %	385826813
1541	NC_017482	GAC	2	6	97918	97923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826813
1542	NC_017482	GAATC	2	10	98024	98033	40 %	20 %	20 %	20 %	385826813
1543	NC_017482	AAG	2	6	98049	98054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826813
1544	NC_017482	TTA	2	6	98077	98082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826813
1545	NC_017482	ATT	2	6	98092	98097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826813
1546	NC_017482	GCC	2	6	98113	98118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826813
1547	NC_017482	GGT	2	6	98140	98145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826813
1548	NC_017482	A	7	7	98148	98154	100 %	0 %	0 %	0 %	385826813
1549	NC_017482	ATG	2	6	98208	98213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826813
1550	NC_017482	ATCG	2	8	98252	98259	25 %	25 %	25 %	25 %	385826813
1551	NC_017482	ATT	2	6	98328	98333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826813
1552	NC_017482	GAT	2	6	98348	98353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826813
1553	NC_017482	ATT	2	6	98420	98425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826813
1554	NC_017482	TTGA	2	8	98588	98595	25 %	50 %	25 %	0 %	385826813
1555	NC_017482	AGCG	2	8	98649	98656	25 %	0 %	50 %	25 %	385826813
1556	NC_017482	CAA	2	6	98684	98689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826813
1557	NC_017482	GAA	2	6	98702	98707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826813
1558	NC_017482	ATG	2	6	98748	98753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826813
1559	NC_017482	GTT	2	6	98836	98841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826813
1560	NC_017482	GGTT	2	8	98848	98855	0 %	50 %	50 %	0 %	385826813
1561	NC_017482	CGGC	2	8	98860	98867	0 %	0 %	50 %	50 %	385826813
1562	NC_017482	CAGC	2	8	98990	98997	25 %	0 %	25 %	50 %	385826813
1563	NC_017482	CAG	2	6	99031	99036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826813
1564	NC_017482	ACG	2	6	99183	99188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826813
1565	NC_017482	CGG	2	6	99241	99246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826813
1566	NC_017482	GAT	2	6	99323	99328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826813
1567	NC_017482	GAG	2	6	99387	99392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385826813
1568	NC_017482	AGA	2	6	99405	99410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826814
1569	NC_017482	TATTTT	2	12	99411	99422	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385826814
1570	NC_017482	CTG	2	6	99449	99454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826814
1571	NC_017482	AAC	2	6	99488	99493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826814
1572	NC_017482	AAG	2	6	99562	99567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826814
1573	NC_017482	TCTT	2	8	99596	99603	0 %	75 %	0 %	25 %	385826814
1574	NC_017482	ATT	2	6	99698	99703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826814
1575	NC_017482	TCAT	2	8	99752	99759	25 %	50 %	0 %	25 %	385826814
1576	NC_017482	T	7	7	99759	99765	0 %	100 %	0 %	0 %	385826814
1577	NC_017482	TGA	2	6	99846	99851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826814
1578	NC_017482	TGG	2	6	99902	99907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826814
1579	NC_017482	GCT	2	6	99933	99938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826814
1580	NC_017482	AGC	2	6	99959	99964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826814
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1582	NC_017482	TGC	2	6	100038	100043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826814
1583	NC_017482	AGA	2	6	100056	100061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826814
1584	NC_017482	CAC	2	6	100079	100084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826814
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1587	NC_017482	CCA	2	6	100290	100295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826815
1588	NC_017482	CAA	2	6	100340	100345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826815
1589	NC_017482	ATC	2	6	100541	100546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826815
1590	NC_017482	GTG	2	6	100587	100592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826815
1591	NC_017482	GCC	2	6	100616	100621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826815
1592	NC_017482	CAT	2	6	100641	100646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826815
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1594	NC_017482	A	6	6	100670	100675	100 %	0 %	0 %	0 %	385826815
1595	NC_017482	GTATCA	2	12	100723	100734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385826815
1596	NC_017482	CTTG	2	8	100786	100793	0 %	50 %	25 %	25 %	385826815
1597	NC_017482	AGC	2	6	100801	100806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826815
1598	NC_017482	GAT	2	6	100976	100981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826815
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1600	NC_017482	ATT	2	6	101079	101084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826815
1601	NC_017482	GCCG	2	8	101137	101144	0 %	0 %	50 %	50 %	385826815
1602	NC_017482	ATG	3	9	101234	101242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826815
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1604	NC_017482	GAC	2	6	101339	101344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826815
1605	NC_017482	ATCGC	2	10	101346	101355	20 %	20 %	20 %	40 %	385826815
1606	NC_017482	GCA	2	6	101403	101408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826815
1607	NC_017482	GAA	2	6	101521	101526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826815
1608	NC_017482	CAG	2	6	101642	101647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826816
1609	NC_017482	TGA	2	6	101686	101691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826816
1610	NC_017482	TCA	2	6	101821	101826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826816
1611	NC_017482	TGA	2	6	101839	101844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826816
1612	NC_017482	AAC	2	6	101850	101855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826816
1613	NC_017482	ATG	2	6	101883	101888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826816
1614	NC_017482	TGT	2	6	101953	101958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826816
1615	NC_017482	GGC	2	6	101975	101980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826816
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1617	NC_017482	CTG	2	6	102041	102046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826816
1618	NC_017482	AGTCAG	2	12	102050	102061	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385826816
1619	NC_017482	AC	3	6	102171	102176	50 %	0 %	0 %	50 %	385826816
1620	NC_017482	A	6	6	102217	102222	100 %	0 %	0 %	0 %	385826816
1621	NC_017482	GGC	3	9	102269	102277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826816
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1623	NC_017482	AGC	2	6	102298	102303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826816
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1988	NC_017482	GATT	2	8	126863	126870	25 %	50 %	25 %	0 %	385826840
1989	NC_017482	GAA	2	6	126872	126877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826840
1990	NC_017482	AAT	2	6	126883	126888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826840
1991	NC_017482	CTT	2	6	126923	126928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826840
1992	NC_017482	T	6	6	126927	126932	0 %	100 %	0 %	0 %	385826840
1993	NC_017482	TTG	2	6	127003	127008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826840
1994	NC_017482	ATTGT	2	10	127103	127112	20 %	60 %	20 %	0 %	385826840
1995	NC_017482	TTTTTG	2	12	127131	127142	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385826840
1996	NC_017482	A	7	7	127152	127158	100 %	0 %	0 %	0 %	385826840
1997	NC_017482	AGA	2	6	127169	127174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826840
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1999	NC_017482	CAA	3	9	127336	127344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826840
2000	NC_017482	T	6	6	127366	127371	0 %	100 %	0 %	0 %	385826840

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