MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG

Total Repeats: 47040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017482	GGT	2	6	322365	322370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385827028
5002	NC_017482	ATT	2	6	322586	322591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385827029
5003	NC_017482	ATGG	2	8	322738	322745	25 %	25 %	50 %	0 %	385827029
5004	NC_017482	ATG	2	6	322756	322761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385827029
5005	NC_017482	GAA	2	6	322831	322836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385827029
5006	NC_017482	CCGG	2	8	322841	322848	0 %	0 %	50 %	50 %	385827029
5007	NC_017482	AGC	2	6	322907	322912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827029
5008	NC_017482	GCA	2	6	323024	323029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827029
5009	NC_017482	GAT	2	6	323236	323241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385827029
5010	NC_017482	GGATG	2	10	323265	323274	20 %	20 %	60 %	0 %	385827029
5011	NC_017482	GCC	2	6	323287	323292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385827029
5012	NC_017482	CGATG	2	10	323340	323349	20 %	20 %	40 %	20 %	385827029
5013	NC_017482	ACC	2	6	323402	323407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385827029
5014	NC_017482	TTG	2	6	323419	323424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385827029
5015	NC_017482	GCG	2	6	323433	323438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385827029
5016	NC_017482	CG	3	6	323504	323509	0 %	0 %	50 %	50 %	385827029
5017	NC_017482	CCA	2	6	323594	323599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385827029
5018	NC_017482	TCA	2	6	323784	323789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385827030
5019	NC_017482	TGT	2	6	323830	323835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385827030
5020	NC_017482	AT	3	6	323866	323871	50 %	50 %	0 %	0 %	385827030
5021	NC_017482	T	6	6	323881	323886	0 %	100 %	0 %	0 %	385827030
5022	NC_017482	GGGGAT	2	12	323974	323985	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385827030
5023	NC_017482	TTCAAT	2	12	323989	324000	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385827030
5024	NC_017482	ATC	2	6	324112	324117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385827030
5025	NC_017482	GACA	2	8	324118	324125	50 %	0 %	25 %	25 %	385827030
5026	NC_017482	GCA	2	6	324126	324131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827030
5027	NC_017482	GCA	2	6	324200	324205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827030
5028	NC_017482	TCT	2	6	324346	324351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385827030
5029	NC_017482	GAA	2	6	324416	324421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385827030
5030	NC_017482	TACA	2	8	324689	324696	50 %	25 %	0 %	25 %	385827031
5031	NC_017482	TGC	2	6	324743	324748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385827031
5032	NC_017482	GGC	2	6	324755	324760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385827031
5033	NC_017482	ACC	2	6	324825	324830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385827031
5034	NC_017482	CAT	2	6	324844	324849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385827031
5035	NC_017482	GCA	2	6	325017	325022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827031
5036	NC_017482	CTG	2	6	325030	325035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385827031
5037	NC_017482	CAAGC	2	10	325066	325075	40 %	0 %	20 %	40 %	385827031
5038	NC_017482	GCA	2	6	325095	325100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827031
5039	NC_017482	CAG	2	6	325156	325161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827031
5040	NC_017482	CAG	2	6	325242	325247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827031
5041	NC_017482	CGG	2	6	325283	325288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385827031
5042	NC_017482	GCT	2	6	325410	325415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385827031
5043	NC_017482	TGC	2	6	325451	325456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385827031
5044	NC_017482	CAG	3	9	325465	325473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827031
5045	NC_017482	GCA	2	6	325479	325484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827031
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5047	NC_017482	GCT	2	6	325530	325535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385827031
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5049	NC_017482	GCA	2	6	325593	325598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827031
5050	NC_017482	GGC	2	6	325619	325624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385827031
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5052	NC_017482	AGC	2	6	325679	325684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827031
5053	NC_017482	TGC	2	6	325691	325696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385827031
5054	NC_017482	CAG	2	6	325698	325703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827031
5055	NC_017482	ACA	3	9	325728	325736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385827031
5056	NC_017482	CAG	2	6	325783	325788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827031
5057	NC_017482	CGG	2	6	325807	325812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385827031
5058	NC_017482	ATTGCC	2	12	325851	325862	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385827031
5059	NC_017482	AAC	2	6	325864	325869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385827031
5060	NC_017482	TGG	2	6	325970	325975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385827031
5061	NC_017482	GGC	2	6	326094	326099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385827031
5062	NC_017482	GAT	2	6	326102	326107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385827031
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5064	NC_017482	GCC	2	6	326384	326389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385827032
5065	NC_017482	CCT	2	6	326543	326548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385827032
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5068	NC_017482	CAG	2	6	326871	326876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827032
5069	NC_017482	AT	3	6	326903	326908	50 %	50 %	0 %	0 %	385827032
5070	NC_017482	CGGA	2	8	326971	326978	25 %	0 %	50 %	25 %	385827032
5071	NC_017482	CTT	2	6	327186	327191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385827032
5072	NC_017482	GTA	2	6	327401	327406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385827032
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5075	NC_017482	GTT	2	6	327595	327600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385827032
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5085	NC_017482	GC	3	6	328226	328231	0 %	0 %	50 %	50 %	385827033
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5089	NC_017482	TG	4	8	328351	328358	0 %	50 %	50 %	0 %	385827033
5090	NC_017482	TAAA	2	8	328381	328388	75 %	25 %	0 %	0 %	385827033
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5101	NC_017482	GAT	2	6	328904	328909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385827034
5102	NC_017482	CGTT	2	8	328926	328933	0 %	50 %	25 %	25 %	385827034
5103	NC_017482	TGCTT	2	10	328990	328999	0 %	60 %	20 %	20 %	385827034
5104	NC_017482	GAC	2	6	329001	329006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827034
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5106	NC_017482	TCT	2	6	329047	329052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385827034
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5110	NC_017482	CGGCA	2	10	329115	329124	20 %	0 %	40 %	40 %	385827034
5111	NC_017482	GGC	2	6	329136	329141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385827034
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5119	NC_017482	TCA	2	6	329576	329581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385827035
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5121	NC_017482	CAAT	2	8	329769	329776	50 %	25 %	0 %	25 %	385827035
5122	NC_017482	GCC	2	6	329812	329817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385827035
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5244	NC_017482	GAA	2	6	337571	337576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385827040
5245	NC_017482	GAC	2	6	337583	337588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827040
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5357	NC_017482	GTTTG	2	10	344418	344427	0 %	60 %	40 %	0 %	385827048
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5472	NC_017482	A	6	6	352733	352738	100 %	0 %	0 %	0 %	385827055
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5484	NC_017482	ATC	2	6	353173	353178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385827056
5485	NC_017482	GAT	2	6	353192	353197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385827056
5486	NC_017482	TGA	2	6	353252	353257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385827056
5487	NC_017482	ACT	2	6	353278	353283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385827056
5488	NC_017482	TTC	2	6	353314	353319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385827056
5489	NC_017482	ACC	2	6	353377	353382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385827056
5490	NC_017482	TGTCGC	2	12	353527	353538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385827056
5491	NC_017482	ATA	2	6	353554	353559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385827056
5492	NC_017482	GGC	2	6	353593	353598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385827056
5493	NC_017482	TAA	2	6	353615	353620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385827056
5494	NC_017482	TTGA	2	8	353661	353668	25 %	50 %	25 %	0 %	385827056
5495	NC_017482	GAT	2	6	353703	353708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385827056
5496	NC_017482	GCA	2	6	353714	353719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385827056
5497	NC_017482	AAT	2	6	353727	353732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385827056
5498	NC_017482	AAG	2	6	353758	353763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385827056
5499	NC_017482	AAT	2	6	353898	353903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385827056
5500	NC_017482	ATG	2	6	353974	353979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385827056

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